Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A507CN54

Protein Details
Accession A0A507CN54    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
398-424DDDTSEKAKKKKCKNVGKRKNDDDEMLBasic
433-469SIVSGARKGKKQNAKQLNKKAKKNRAKVRSTNGGKGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
391-417SSKKRRHDDDTSEKAKKKKCKNVGKRK
438-463ARKGKKQNAKQLNKKAKKNRAKVRST
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.833, cyto 11, cyto_mito 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR000504  RRM_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MEIDIADNNGFTAAVNPLPAPPSLCNIDPKQMLANSILSLLHTYASKTESKSLLGQARSSPTYYDPSLLDGYIPISLLLSLNRMKKLTKDLNVIAQIASTSPMLQVHPDGTKIRRTPILEPSADPQQPVSLKSTGCVLARKFTSDIVKHEISLYFSQFGPVAAVEFISPGVAGIKFMDDGGIAKTMVQAQSITGLRFRGDVLHVEWAASSDFDMLEESIKGLSLSSSNKVKSRPGKYPRKMAGPYKYTVNRILHVDLSGLKWALNDGTDDNEDVISEIEKAPAILKRLFEPYAHVVNVSIEQTTSAYVRFQQPVASELLPVIEKSCGIRYPDYDVALPIRRVNGDEERIYWHVCCARENAVGVAVGSNLHSSCGSRKWEFVRGGASSGGPSSKKRRHDDDTSEKAKKKKCKNVGKRKNDDDEMLVGTVVPAVSIVSGARKGKKQNAKQLNKKAKKNRAKVRSTNGGKGESKEMDLADMFSQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.11
3 0.11
4 0.12
5 0.14
6 0.15
7 0.16
8 0.15
9 0.2
10 0.23
11 0.25
12 0.3
13 0.32
14 0.39
15 0.37
16 0.37
17 0.38
18 0.35
19 0.34
20 0.3
21 0.28
22 0.21
23 0.21
24 0.19
25 0.14
26 0.14
27 0.13
28 0.12
29 0.1
30 0.11
31 0.12
32 0.15
33 0.18
34 0.19
35 0.24
36 0.25
37 0.27
38 0.3
39 0.35
40 0.39
41 0.37
42 0.37
43 0.35
44 0.39
45 0.39
46 0.36
47 0.31
48 0.27
49 0.3
50 0.29
51 0.27
52 0.22
53 0.23
54 0.24
55 0.22
56 0.19
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.11
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.07
66 0.1
67 0.15
68 0.19
69 0.22
70 0.23
71 0.24
72 0.27
73 0.37
74 0.42
75 0.43
76 0.46
77 0.46
78 0.51
79 0.53
80 0.49
81 0.39
82 0.3
83 0.24
84 0.17
85 0.16
86 0.09
87 0.07
88 0.07
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.12
94 0.13
95 0.16
96 0.19
97 0.2
98 0.28
99 0.29
100 0.31
101 0.34
102 0.37
103 0.39
104 0.44
105 0.48
106 0.41
107 0.41
108 0.41
109 0.43
110 0.4
111 0.35
112 0.27
113 0.24
114 0.24
115 0.24
116 0.25
117 0.2
118 0.19
119 0.19
120 0.22
121 0.2
122 0.21
123 0.24
124 0.2
125 0.23
126 0.24
127 0.26
128 0.24
129 0.25
130 0.3
131 0.28
132 0.31
133 0.32
134 0.32
135 0.29
136 0.3
137 0.28
138 0.24
139 0.23
140 0.21
141 0.16
142 0.15
143 0.16
144 0.14
145 0.13
146 0.1
147 0.08
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.03
157 0.05
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.04
166 0.05
167 0.06
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.11
178 0.13
179 0.12
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.09
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.14
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.11
195 0.09
196 0.08
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.04
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.04
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.06
211 0.07
212 0.11
213 0.14
214 0.16
215 0.19
216 0.2
217 0.27
218 0.33
219 0.37
220 0.43
221 0.5
222 0.6
223 0.62
224 0.7
225 0.67
226 0.67
227 0.65
228 0.62
229 0.6
230 0.53
231 0.49
232 0.46
233 0.45
234 0.4
235 0.42
236 0.36
237 0.3
238 0.28
239 0.28
240 0.22
241 0.2
242 0.18
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.09
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.05
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.07
269 0.09
270 0.12
271 0.13
272 0.13
273 0.15
274 0.19
275 0.2
276 0.18
277 0.2
278 0.21
279 0.23
280 0.22
281 0.2
282 0.17
283 0.16
284 0.18
285 0.14
286 0.1
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.09
295 0.13
296 0.14
297 0.14
298 0.15
299 0.16
300 0.17
301 0.2
302 0.18
303 0.14
304 0.12
305 0.13
306 0.11
307 0.1
308 0.09
309 0.06
310 0.06
311 0.08
312 0.1
313 0.12
314 0.14
315 0.16
316 0.17
317 0.24
318 0.26
319 0.26
320 0.24
321 0.23
322 0.24
323 0.26
324 0.25
325 0.19
326 0.18
327 0.17
328 0.18
329 0.22
330 0.24
331 0.24
332 0.24
333 0.24
334 0.28
335 0.29
336 0.28
337 0.24
338 0.21
339 0.21
340 0.21
341 0.22
342 0.2
343 0.22
344 0.23
345 0.24
346 0.21
347 0.18
348 0.17
349 0.16
350 0.13
351 0.09
352 0.07
353 0.06
354 0.07
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.11
360 0.17
361 0.22
362 0.23
363 0.28
364 0.32
365 0.39
366 0.4
367 0.39
368 0.38
369 0.33
370 0.34
371 0.3
372 0.25
373 0.18
374 0.17
375 0.18
376 0.15
377 0.19
378 0.27
379 0.34
380 0.43
381 0.49
382 0.56
383 0.61
384 0.69
385 0.74
386 0.74
387 0.77
388 0.77
389 0.78
390 0.75
391 0.75
392 0.73
393 0.73
394 0.73
395 0.74
396 0.76
397 0.8
398 0.86
399 0.9
400 0.93
401 0.94
402 0.94
403 0.92
404 0.9
405 0.82
406 0.73
407 0.65
408 0.57
409 0.48
410 0.38
411 0.29
412 0.19
413 0.15
414 0.14
415 0.1
416 0.07
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.05
421 0.05
422 0.07
423 0.13
424 0.18
425 0.23
426 0.29
427 0.37
428 0.47
429 0.57
430 0.64
431 0.7
432 0.76
433 0.82
434 0.87
435 0.91
436 0.92
437 0.91
438 0.92
439 0.92
440 0.92
441 0.92
442 0.92
443 0.91
444 0.9
445 0.91
446 0.9
447 0.89
448 0.89
449 0.85
450 0.83
451 0.77
452 0.74
453 0.66
454 0.6
455 0.58
456 0.49
457 0.44
458 0.38
459 0.33
460 0.28
461 0.25
462 0.24