Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A507C393

Protein Details
Accession A0A507C393    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-149VSTSAASKPPHRKAPPNRKSPRRTTKNNADPVVHydrophilic
172-196DPFTSAQRKRKSKSKPKSPKDGDLLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-28AKKRA
124-139KPPHRKAPPNRKSPRR
179-191RKRKSKSKPKSPK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006935  Helicase/UvrB_N  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR001161  XPB/Ssl2  
IPR032830  XPB/Ssl2_N  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003678  F:DNA helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF13625  Helicase_C_3  
PF04851  ResIII  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
CDD cd18029  DEXHc_XPB  
Amino Acid Sequences MASKRRIEDDHAQDSEEAQLRSRAKKRARINIAAAAAAAPSETRPRPRVSYGVRSKVIDLTIDDYDDGSQSQTSDDLDDNYVDDRASQEDADTSGCESDPASILSASDAESPASAKVSTSAASKPPHRKAPPNRKSPRRTTKNNADPVVSSSPDDDIEDDLDKDTSTCIGSDPFTSAQRKRKSKSKPKSPKDGDLLLDQVTALFAQNNGDYTHLLMKQDHDLRPLYITNDNLIILEAFSPIADQAQDFLAAIAEPVSRPSHVHEYRLTEYSLYAAVSVGLETNNIIDVLNRLSKLQVPKPVEQFIKKYTLSYGKIKLLLQHNRYYVESRFPAVLEKLLRDDLIKEAVLDATLVDTVGRSDAIVFPTSPTVSKKPPTSTATGTVTGISTSLSVLPTASSDVNAAASEWADQQPQQVGWMADVMNEDADTENTKSFEIDPAKAEQVRKRCSDLTYPMLEEYDFRNDDRNPNTMIDLKPSTLVRPYQAKALSKMFGNGRARSGIIVLPCGAGKTLTGVAAACTIKKSVLVLCWSAVSVAQWIREFHHWSTALDADLGRFDSEVKKPFTTKAGILVSTYSMVAYTGNRAYDAQKMMKMIDSQEWGLLILDEVTRRAC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.43
3 0.38
4 0.29
5 0.22
6 0.28
7 0.31
8 0.41
9 0.47
10 0.5
11 0.54
12 0.63
13 0.71
14 0.75
15 0.8
16 0.79
17 0.77
18 0.75
19 0.68
20 0.59
21 0.49
22 0.38
23 0.29
24 0.2
25 0.14
26 0.06
27 0.07
28 0.13
29 0.18
30 0.25
31 0.29
32 0.35
33 0.41
34 0.45
35 0.53
36 0.54
37 0.61
38 0.64
39 0.68
40 0.67
41 0.63
42 0.6
43 0.54
44 0.47
45 0.38
46 0.29
47 0.24
48 0.21
49 0.21
50 0.19
51 0.15
52 0.15
53 0.14
54 0.12
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.11
62 0.11
63 0.12
64 0.13
65 0.13
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.11
70 0.11
71 0.1
72 0.1
73 0.12
74 0.11
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.08
97 0.09
98 0.09
99 0.09
100 0.1
101 0.09
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.11
106 0.13
107 0.15
108 0.2
109 0.25
110 0.33
111 0.41
112 0.47
113 0.56
114 0.6
115 0.68
116 0.73
117 0.8
118 0.82
119 0.83
120 0.86
121 0.86
122 0.89
123 0.9
124 0.9
125 0.88
126 0.88
127 0.87
128 0.88
129 0.87
130 0.87
131 0.77
132 0.68
133 0.59
134 0.55
135 0.48
136 0.38
137 0.28
138 0.21
139 0.2
140 0.18
141 0.18
142 0.13
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.12
160 0.13
161 0.18
162 0.24
163 0.29
164 0.37
165 0.46
166 0.54
167 0.56
168 0.63
169 0.7
170 0.75
171 0.8
172 0.82
173 0.84
174 0.84
175 0.9
176 0.87
177 0.85
178 0.79
179 0.73
180 0.63
181 0.54
182 0.47
183 0.36
184 0.29
185 0.2
186 0.14
187 0.1
188 0.08
189 0.06
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.13
200 0.13
201 0.14
202 0.14
203 0.15
204 0.21
205 0.27
206 0.26
207 0.25
208 0.25
209 0.24
210 0.26
211 0.25
212 0.21
213 0.18
214 0.17
215 0.15
216 0.15
217 0.15
218 0.12
219 0.11
220 0.09
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.08
246 0.11
247 0.21
248 0.22
249 0.25
250 0.26
251 0.31
252 0.33
253 0.34
254 0.31
255 0.21
256 0.2
257 0.18
258 0.15
259 0.09
260 0.07
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.04
275 0.06
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.12
281 0.16
282 0.19
283 0.25
284 0.28
285 0.31
286 0.34
287 0.39
288 0.38
289 0.36
290 0.35
291 0.31
292 0.32
293 0.28
294 0.26
295 0.24
296 0.27
297 0.28
298 0.3
299 0.31
300 0.27
301 0.29
302 0.29
303 0.31
304 0.33
305 0.38
306 0.37
307 0.38
308 0.37
309 0.36
310 0.37
311 0.35
312 0.28
313 0.25
314 0.22
315 0.19
316 0.18
317 0.16
318 0.17
319 0.14
320 0.16
321 0.12
322 0.12
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.11
327 0.11
328 0.1
329 0.11
330 0.1
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.06
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.04
347 0.05
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.1
353 0.1
354 0.11
355 0.13
356 0.15
357 0.19
358 0.24
359 0.27
360 0.3
361 0.36
362 0.38
363 0.39
364 0.38
365 0.39
366 0.38
367 0.34
368 0.31
369 0.24
370 0.21
371 0.17
372 0.14
373 0.09
374 0.06
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.07
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.09
398 0.11
399 0.11
400 0.11
401 0.12
402 0.11
403 0.11
404 0.12
405 0.11
406 0.1
407 0.1
408 0.1
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.06
413 0.06
414 0.08
415 0.08
416 0.09
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.11
421 0.17
422 0.18
423 0.19
424 0.2
425 0.22
426 0.25
427 0.28
428 0.31
429 0.31
430 0.36
431 0.4
432 0.41
433 0.43
434 0.42
435 0.43
436 0.45
437 0.46
438 0.43
439 0.4
440 0.38
441 0.34
442 0.32
443 0.28
444 0.22
445 0.19
446 0.2
447 0.18
448 0.18
449 0.22
450 0.23
451 0.3
452 0.32
453 0.32
454 0.28
455 0.28
456 0.3
457 0.3
458 0.29
459 0.28
460 0.27
461 0.24
462 0.25
463 0.24
464 0.23
465 0.22
466 0.24
467 0.22
468 0.28
469 0.28
470 0.32
471 0.36
472 0.38
473 0.38
474 0.41
475 0.38
476 0.32
477 0.36
478 0.31
479 0.35
480 0.37
481 0.34
482 0.32
483 0.32
484 0.32
485 0.27
486 0.26
487 0.2
488 0.16
489 0.15
490 0.13
491 0.13
492 0.12
493 0.12
494 0.11
495 0.08
496 0.07
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.14
504 0.14
505 0.12
506 0.12
507 0.13
508 0.12
509 0.13
510 0.14
511 0.12
512 0.16
513 0.19
514 0.2
515 0.2
516 0.2
517 0.2
518 0.18
519 0.16
520 0.12
521 0.13
522 0.13
523 0.16
524 0.17
525 0.18
526 0.21
527 0.27
528 0.31
529 0.28
530 0.35
531 0.33
532 0.31
533 0.34
534 0.32
535 0.27
536 0.23
537 0.22
538 0.14
539 0.14
540 0.15
541 0.11
542 0.1
543 0.11
544 0.16
545 0.21
546 0.27
547 0.3
548 0.33
549 0.35
550 0.38
551 0.42
552 0.41
553 0.36
554 0.38
555 0.37
556 0.34
557 0.33
558 0.31
559 0.27
560 0.23
561 0.22
562 0.14
563 0.09
564 0.09
565 0.09
566 0.09
567 0.13
568 0.15
569 0.15
570 0.16
571 0.18
572 0.2
573 0.25
574 0.3
575 0.29
576 0.29
577 0.3
578 0.3
579 0.33
580 0.33
581 0.3
582 0.29
583 0.29
584 0.27
585 0.27
586 0.26
587 0.22
588 0.2
589 0.17
590 0.12
591 0.09
592 0.1
593 0.1