Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A507CSC3

Protein Details
Accession A0A507CSC3    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-121MFKPPPTRKPSHPPKPKVSAIHydrophilic
253-274DVLHRAHRDRRRKSRHSGTDASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-267RDRRRKSR
285-289RRRRE
297-299RHR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR034653  SPF45_RRM  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
CDD cd12647  RRM_UHM_SPF45  
Amino Acid Sequences MRIATAVTRAIYCTSEHSFNIKMGLFDDLPDVDGPKAGTGQVLKPFGAGLSTTKTAESTSSITKNATAPNGAQVSESSSSSNKDCADKKPSVTSWSATAIMFKPPPTRKPSHPPKPKVSAIAAASTTIKTTIVSVPENVTPIEADPPSFRGNIPTTSGATKKWSISSSSLKRKQASGKGANKKGALAPPSFTDDYDPLRPNEYQYSKDELRRLKHEKDAANSRRNDHSSRKKRSHSQDSHEDDNNNQSGDESDVLHRAHRDRRRKSRHSGTDASDDDRDSKTSSRRRRESSPVSSHRHRRSPSKEVNPAVAPKSLINLGESGDDAYLRRLQMSQQQGQLAPAPLPPVKVNSTAHSGPDVHQRSAALATKEGTMPAASPMPISHVVLLKNMVGPGEVDDTLQDETADECKKYGEVDSCLIYEVPNGLVPDEQAVRIFLKFKSLDGAQKALLDLNGRFFGGRQVVAESYDEAAFAKFDLARGLVLNRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.26
4 0.28
5 0.28
6 0.28
7 0.32
8 0.27
9 0.23
10 0.2
11 0.24
12 0.2
13 0.18
14 0.2
15 0.15
16 0.16
17 0.16
18 0.16
19 0.11
20 0.13
21 0.12
22 0.11
23 0.12
24 0.1
25 0.13
26 0.14
27 0.19
28 0.24
29 0.26
30 0.25
31 0.24
32 0.24
33 0.21
34 0.2
35 0.16
36 0.11
37 0.15
38 0.17
39 0.17
40 0.17
41 0.18
42 0.17
43 0.18
44 0.18
45 0.16
46 0.21
47 0.23
48 0.24
49 0.25
50 0.26
51 0.28
52 0.29
53 0.28
54 0.24
55 0.22
56 0.27
57 0.27
58 0.25
59 0.23
60 0.19
61 0.21
62 0.21
63 0.21
64 0.16
65 0.16
66 0.18
67 0.19
68 0.23
69 0.2
70 0.25
71 0.29
72 0.33
73 0.39
74 0.41
75 0.43
76 0.48
77 0.48
78 0.46
79 0.45
80 0.4
81 0.35
82 0.34
83 0.32
84 0.24
85 0.25
86 0.21
87 0.23
88 0.23
89 0.23
90 0.29
91 0.33
92 0.4
93 0.44
94 0.49
95 0.52
96 0.61
97 0.7
98 0.72
99 0.77
100 0.79
101 0.8
102 0.82
103 0.79
104 0.73
105 0.64
106 0.59
107 0.5
108 0.44
109 0.36
110 0.29
111 0.26
112 0.21
113 0.18
114 0.12
115 0.11
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.13
120 0.14
121 0.15
122 0.17
123 0.18
124 0.18
125 0.16
126 0.14
127 0.11
128 0.11
129 0.13
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.14
134 0.15
135 0.16
136 0.15
137 0.16
138 0.19
139 0.2
140 0.22
141 0.21
142 0.21
143 0.23
144 0.24
145 0.21
146 0.22
147 0.23
148 0.21
149 0.22
150 0.22
151 0.22
152 0.26
153 0.35
154 0.4
155 0.49
156 0.54
157 0.57
158 0.57
159 0.59
160 0.61
161 0.6
162 0.6
163 0.59
164 0.61
165 0.66
166 0.69
167 0.68
168 0.6
169 0.54
170 0.47
171 0.41
172 0.35
173 0.26
174 0.22
175 0.2
176 0.25
177 0.24
178 0.21
179 0.19
180 0.17
181 0.2
182 0.24
183 0.24
184 0.2
185 0.22
186 0.22
187 0.22
188 0.28
189 0.27
190 0.25
191 0.26
192 0.33
193 0.33
194 0.36
195 0.4
196 0.37
197 0.39
198 0.44
199 0.48
200 0.44
201 0.47
202 0.5
203 0.48
204 0.49
205 0.55
206 0.54
207 0.56
208 0.54
209 0.51
210 0.5
211 0.5
212 0.48
213 0.47
214 0.51
215 0.54
216 0.62
217 0.67
218 0.67
219 0.73
220 0.78
221 0.8
222 0.76
223 0.72
224 0.72
225 0.7
226 0.68
227 0.61
228 0.52
229 0.42
230 0.38
231 0.32
232 0.22
233 0.17
234 0.12
235 0.1
236 0.1
237 0.11
238 0.08
239 0.08
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.13
244 0.15
245 0.23
246 0.31
247 0.4
248 0.47
249 0.58
250 0.68
251 0.74
252 0.8
253 0.82
254 0.83
255 0.81
256 0.76
257 0.69
258 0.66
259 0.59
260 0.52
261 0.42
262 0.33
263 0.27
264 0.22
265 0.2
266 0.14
267 0.16
268 0.22
269 0.3
270 0.4
271 0.47
272 0.54
273 0.59
274 0.63
275 0.7
276 0.71
277 0.71
278 0.72
279 0.7
280 0.7
281 0.73
282 0.76
283 0.73
284 0.71
285 0.65
286 0.65
287 0.65
288 0.68
289 0.7
290 0.7
291 0.71
292 0.65
293 0.65
294 0.58
295 0.53
296 0.45
297 0.36
298 0.27
299 0.19
300 0.19
301 0.17
302 0.14
303 0.12
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.08
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.12
318 0.19
319 0.26
320 0.28
321 0.29
322 0.31
323 0.31
324 0.31
325 0.32
326 0.26
327 0.19
328 0.15
329 0.15
330 0.14
331 0.16
332 0.15
333 0.16
334 0.18
335 0.22
336 0.23
337 0.22
338 0.28
339 0.27
340 0.27
341 0.26
342 0.25
343 0.22
344 0.3
345 0.32
346 0.26
347 0.26
348 0.26
349 0.24
350 0.28
351 0.3
352 0.21
353 0.19
354 0.19
355 0.19
356 0.2
357 0.18
358 0.15
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.13
367 0.15
368 0.15
369 0.15
370 0.16
371 0.17
372 0.18
373 0.19
374 0.16
375 0.15
376 0.15
377 0.13
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.12
382 0.11
383 0.1
384 0.1
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.1
389 0.07
390 0.08
391 0.13
392 0.16
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.15
397 0.16
398 0.19
399 0.19
400 0.21
401 0.23
402 0.25
403 0.24
404 0.25
405 0.24
406 0.19
407 0.15
408 0.12
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.11
414 0.11
415 0.14
416 0.14
417 0.13
418 0.12
419 0.13
420 0.14
421 0.15
422 0.18
423 0.15
424 0.21
425 0.21
426 0.21
427 0.25
428 0.27
429 0.32
430 0.33
431 0.36
432 0.3
433 0.3
434 0.3
435 0.26
436 0.24
437 0.2
438 0.17
439 0.19
440 0.19
441 0.18
442 0.17
443 0.16
444 0.21
445 0.21
446 0.21
447 0.18
448 0.2
449 0.21
450 0.22
451 0.23
452 0.18
453 0.17
454 0.16
455 0.15
456 0.12
457 0.12
458 0.11
459 0.1
460 0.11
461 0.1
462 0.1
463 0.12
464 0.12
465 0.13
466 0.15