Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LC01

Protein Details
Accession A0A517LC01    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
199-223DKSLRMKWTEKEKKKIAKLTREAKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-213KKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.333, cyto 7, cyto_mito 6.833, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001611  Leu-rich_rpt  
IPR032675  LRR_dom_sf  
IPR044640  RU2A  
Gene Ontology GO:0030620  F:U2 snRNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF14580  LRR_9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51450  LRR  
Amino Acid Sequences MRLTADLIQGSLSYINPLKERELDLRGHKIPHIENLGAARDNDCIDFTDNDIAQLANFPLSPRLRTLLLARNRVASIQPTLHKSIPNLTTLVLTNNRFAELADLDPLKNFASLTHLSLVENPVTRKENYRFWILWRCRALRFLDFQKVKVAEREKADELFGTYEEPTALAQKILNIKSRSTFDLPSTNGDTSNAAATTDKSLRMKWTEKEKKKIAKLTREAKSMQEINALEKALAEGRIPANADSDDEMEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.16
3 0.18
4 0.2
5 0.23
6 0.25
7 0.29
8 0.3
9 0.32
10 0.35
11 0.39
12 0.45
13 0.45
14 0.44
15 0.41
16 0.41
17 0.39
18 0.4
19 0.39
20 0.31
21 0.3
22 0.31
23 0.32
24 0.28
25 0.26
26 0.2
27 0.16
28 0.17
29 0.15
30 0.14
31 0.12
32 0.14
33 0.14
34 0.15
35 0.18
36 0.17
37 0.17
38 0.17
39 0.15
40 0.12
41 0.12
42 0.11
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.13
47 0.15
48 0.16
49 0.17
50 0.19
51 0.19
52 0.21
53 0.26
54 0.28
55 0.34
56 0.38
57 0.37
58 0.37
59 0.36
60 0.35
61 0.31
62 0.25
63 0.21
64 0.2
65 0.22
66 0.23
67 0.27
68 0.28
69 0.28
70 0.26
71 0.3
72 0.27
73 0.25
74 0.22
75 0.19
76 0.18
77 0.17
78 0.2
79 0.18
80 0.17
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.07
97 0.05
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.13
102 0.13
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.11
107 0.12
108 0.11
109 0.12
110 0.14
111 0.15
112 0.19
113 0.21
114 0.26
115 0.27
116 0.32
117 0.29
118 0.31
119 0.4
120 0.37
121 0.41
122 0.39
123 0.39
124 0.35
125 0.38
126 0.37
127 0.3
128 0.33
129 0.3
130 0.35
131 0.33
132 0.33
133 0.35
134 0.33
135 0.31
136 0.33
137 0.32
138 0.27
139 0.29
140 0.32
141 0.29
142 0.28
143 0.27
144 0.22
145 0.19
146 0.16
147 0.13
148 0.1
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.1
159 0.17
160 0.19
161 0.26
162 0.25
163 0.26
164 0.29
165 0.32
166 0.34
167 0.31
168 0.3
169 0.26
170 0.3
171 0.31
172 0.31
173 0.33
174 0.28
175 0.25
176 0.24
177 0.22
178 0.17
179 0.17
180 0.13
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.14
185 0.15
186 0.19
187 0.19
188 0.2
189 0.24
190 0.3
191 0.35
192 0.37
193 0.47
194 0.54
195 0.61
196 0.7
197 0.74
198 0.78
199 0.81
200 0.84
201 0.82
202 0.82
203 0.82
204 0.82
205 0.8
206 0.75
207 0.68
208 0.61
209 0.6
210 0.52
211 0.43
212 0.4
213 0.34
214 0.33
215 0.34
216 0.31
217 0.23
218 0.2
219 0.2
220 0.16
221 0.16
222 0.12
223 0.13
224 0.14
225 0.16
226 0.18
227 0.17
228 0.18
229 0.17
230 0.19
231 0.17