Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LN35

Protein Details
Accession A0A517LN35    Localization Confidence High Confidence Score 27
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-31AVKSSGKTENRPRRAKPVEPHydrophilic
307-332KSKAREARIVREHRREERKRVEQGKGBasic
352-381GMKGRQRDKVIERRRKKLTAKERRGMPEERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-25NRPRR
117-158KARRKRKRGVEDEEGERKLRALRERLRELKEKGLEKKGRVED
162-163KK
207-217KKKGRTSKHAP
223-225KRA
228-229RR
307-383KSKAREARIVREHRREERKRVEQGKGVWHVKKSVVRQEALRERFEGMKGRQRDKVIERRRKKLTAKERRGMPEERRG
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MARTNNPKPREAVKSSGKTENRPRRAKPVEPDPDPASDEVEDEDHGYSSPSVLETGDADADGADIGSDLDDEDEDGSSSEEDEEEETTDDEATATALQSRMSFGTLAKVQDTLGDDKARRKRKRGVEDEEGERKLRALRERLRELKEKGLEKKGRVEDTAMKKAVKGSRDTAGTKGIDRPISSADSSSDDSDEEEEEDDTENGQPTKKKGRTSKHAPTEMSSKRAVTRRRSAVEMKKSTVRDPRFDPLSGAVDHHVLSKKYAFLDEYRASELATLKQAMKNKKLKDEEREAMKRQVVSMESKIAFEKSKAREARIVREHRREERKRVEQGKGVWHVKKSVVRQEALRERFEGMKGRQRDKVIERRRKKLTAKERRGMPEERRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.66
3 0.71
4 0.68
5 0.68
6 0.73
7 0.75
8 0.75
9 0.76
10 0.75
11 0.77
12 0.8
13 0.8
14 0.77
15 0.77
16 0.77
17 0.72
18 0.73
19 0.65
20 0.6
21 0.53
22 0.45
23 0.36
24 0.27
25 0.23
26 0.18
27 0.16
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.05
50 0.03
51 0.03
52 0.03
53 0.03
54 0.03
55 0.03
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.09
76 0.08
77 0.07
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.05
82 0.06
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.09
91 0.13
92 0.15
93 0.16
94 0.15
95 0.15
96 0.14
97 0.16
98 0.18
99 0.16
100 0.17
101 0.2
102 0.21
103 0.29
104 0.38
105 0.46
106 0.49
107 0.54
108 0.6
109 0.67
110 0.76
111 0.78
112 0.77
113 0.76
114 0.75
115 0.75
116 0.72
117 0.63
118 0.53
119 0.43
120 0.35
121 0.29
122 0.28
123 0.27
124 0.3
125 0.37
126 0.44
127 0.53
128 0.59
129 0.61
130 0.63
131 0.6
132 0.59
133 0.57
134 0.55
135 0.52
136 0.55
137 0.54
138 0.49
139 0.55
140 0.52
141 0.48
142 0.42
143 0.4
144 0.38
145 0.41
146 0.46
147 0.39
148 0.34
149 0.33
150 0.37
151 0.37
152 0.31
153 0.27
154 0.23
155 0.25
156 0.29
157 0.29
158 0.25
159 0.26
160 0.24
161 0.22
162 0.23
163 0.22
164 0.19
165 0.18
166 0.18
167 0.16
168 0.17
169 0.16
170 0.14
171 0.12
172 0.13
173 0.14
174 0.13
175 0.11
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.1
192 0.13
193 0.24
194 0.27
195 0.34
196 0.42
197 0.5
198 0.58
199 0.66
200 0.72
201 0.71
202 0.72
203 0.66
204 0.6
205 0.6
206 0.53
207 0.47
208 0.38
209 0.3
210 0.3
211 0.35
212 0.4
213 0.38
214 0.45
215 0.49
216 0.5
217 0.53
218 0.56
219 0.59
220 0.62
221 0.59
222 0.53
223 0.52
224 0.51
225 0.51
226 0.52
227 0.47
228 0.41
229 0.41
230 0.45
231 0.42
232 0.41
233 0.37
234 0.3
235 0.3
236 0.26
237 0.22
238 0.17
239 0.14
240 0.14
241 0.17
242 0.17
243 0.14
244 0.15
245 0.16
246 0.17
247 0.17
248 0.18
249 0.16
250 0.15
251 0.22
252 0.23
253 0.23
254 0.24
255 0.23
256 0.22
257 0.22
258 0.22
259 0.16
260 0.16
261 0.16
262 0.16
263 0.19
264 0.26
265 0.31
266 0.38
267 0.44
268 0.47
269 0.54
270 0.61
271 0.65
272 0.67
273 0.69
274 0.67
275 0.69
276 0.71
277 0.65
278 0.62
279 0.59
280 0.51
281 0.42
282 0.39
283 0.31
284 0.3
285 0.28
286 0.29
287 0.26
288 0.26
289 0.27
290 0.25
291 0.24
292 0.22
293 0.28
294 0.26
295 0.35
296 0.37
297 0.39
298 0.44
299 0.47
300 0.55
301 0.57
302 0.63
303 0.62
304 0.69
305 0.74
306 0.76
307 0.83
308 0.81
309 0.81
310 0.82
311 0.82
312 0.83
313 0.83
314 0.79
315 0.75
316 0.72
317 0.71
318 0.7
319 0.68
320 0.62
321 0.57
322 0.53
323 0.53
324 0.54
325 0.52
326 0.53
327 0.51
328 0.5
329 0.51
330 0.58
331 0.61
332 0.59
333 0.54
334 0.46
335 0.42
336 0.43
337 0.43
338 0.41
339 0.37
340 0.43
341 0.48
342 0.52
343 0.55
344 0.56
345 0.61
346 0.62
347 0.67
348 0.69
349 0.72
350 0.76
351 0.79
352 0.84
353 0.85
354 0.85
355 0.85
356 0.85
357 0.85
358 0.87
359 0.86
360 0.86
361 0.85
362 0.82
363 0.79