Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LE03

Protein Details
Accession A0A517LE03    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-152AGSVEPSKPKKGKRKSAGSERRMNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
124-146ETPKAGSVEPSKPKKGKRKSAGS
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 11, nucl 9.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045183  Ebi-like  
IPR006594  LisH  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003714  F:transcription corepressor activity  
GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
Amino Acid Sequences MSAHQPEGPDLPERLSSNVMNYLVWRYLQEAGYGKTAKQLQYQWVGTTETPESLPFVANIKKGCLIHLAQDGLFLDQLQAEVKKTQRQYNFGFDHGPKFSVPAEEPRTSSGRDTSRKPNHSERETPKAGSVEPSKPKKGKRKSAGSERRMNGDMMDVDVGGIGPTSIMDPTVAEAESPRPAVEEPIEPTLSIGLSQEVATEAPRDLNPDTSFLPHEGTTLEFVKWCPDNSTALLVAGENHMRAYRVASDVSEQQAESNNWNIHVDEEDYRVQAFCWTEKSSAVFSTAREYTNEIGDSIPQNRLFGFTDYGTEPSSMQLVDPLAGTIVALRYNAASKLLLSISHGEQAVIKIWRYSQAEPEAGSKLKEASFEFLLDKVVGAEIYDAAWTTNYRFLVCGMNTLQLYEVGEDIDLIKAFGTEQDWFRMQYDPLCEVAALSDDEMHALGVVKLDGDLKIHNETFQNTTLTDFAFQPIVNKDSYQEGSPRLLATSSANGQVRIWNALGPLVCLHELSLGVQAAAMVVSFSPDGFLLAAAGYDTLHVWKADEGGEPKAVWHMPAPNDRWNSVPQEEPEEKEPLAWLHTLSWDSDGKKIAFGLKDQVAVIRLRPTESDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.28
3 0.27
4 0.26
5 0.3
6 0.28
7 0.24
8 0.24
9 0.25
10 0.23
11 0.23
12 0.2
13 0.17
14 0.21
15 0.21
16 0.24
17 0.24
18 0.25
19 0.31
20 0.32
21 0.29
22 0.31
23 0.35
24 0.34
25 0.36
26 0.39
27 0.39
28 0.46
29 0.47
30 0.43
31 0.4
32 0.4
33 0.34
34 0.33
35 0.28
36 0.21
37 0.2
38 0.18
39 0.18
40 0.16
41 0.16
42 0.13
43 0.17
44 0.2
45 0.22
46 0.23
47 0.24
48 0.28
49 0.28
50 0.28
51 0.29
52 0.26
53 0.28
54 0.31
55 0.31
56 0.25
57 0.27
58 0.26
59 0.21
60 0.2
61 0.15
62 0.1
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.16
69 0.19
70 0.27
71 0.32
72 0.39
73 0.43
74 0.49
75 0.52
76 0.58
77 0.57
78 0.51
79 0.53
80 0.47
81 0.46
82 0.41
83 0.37
84 0.27
85 0.26
86 0.26
87 0.23
88 0.23
89 0.26
90 0.31
91 0.32
92 0.33
93 0.35
94 0.37
95 0.34
96 0.34
97 0.32
98 0.34
99 0.37
100 0.42
101 0.49
102 0.57
103 0.62
104 0.66
105 0.69
106 0.7
107 0.72
108 0.77
109 0.72
110 0.72
111 0.69
112 0.63
113 0.56
114 0.48
115 0.42
116 0.38
117 0.37
118 0.36
119 0.42
120 0.47
121 0.52
122 0.57
123 0.65
124 0.7
125 0.75
126 0.77
127 0.78
128 0.82
129 0.83
130 0.89
131 0.9
132 0.88
133 0.87
134 0.78
135 0.73
136 0.63
137 0.54
138 0.43
139 0.35
140 0.27
141 0.18
142 0.16
143 0.11
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.05
148 0.04
149 0.03
150 0.02
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.09
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.12
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.18
173 0.19
174 0.17
175 0.17
176 0.16
177 0.14
178 0.11
179 0.08
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.11
192 0.11
193 0.16
194 0.16
195 0.17
196 0.18
197 0.18
198 0.19
199 0.17
200 0.18
201 0.13
202 0.13
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.1
209 0.11
210 0.14
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.15
215 0.17
216 0.17
217 0.19
218 0.16
219 0.15
220 0.14
221 0.11
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.12
236 0.14
237 0.15
238 0.14
239 0.12
240 0.11
241 0.14
242 0.15
243 0.14
244 0.17
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.16
249 0.12
250 0.13
251 0.13
252 0.09
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.09
262 0.12
263 0.14
264 0.14
265 0.15
266 0.17
267 0.15
268 0.15
269 0.17
270 0.14
271 0.12
272 0.16
273 0.17
274 0.15
275 0.15
276 0.16
277 0.14
278 0.15
279 0.15
280 0.11
281 0.1
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.13
286 0.12
287 0.12
288 0.11
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.1
294 0.12
295 0.12
296 0.13
297 0.12
298 0.11
299 0.1
300 0.08
301 0.09
302 0.07
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.05
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.1
328 0.09
329 0.11
330 0.11
331 0.1
332 0.1
333 0.11
334 0.13
335 0.12
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.16
340 0.18
341 0.19
342 0.21
343 0.23
344 0.24
345 0.24
346 0.26
347 0.23
348 0.2
349 0.2
350 0.15
351 0.13
352 0.13
353 0.14
354 0.13
355 0.13
356 0.13
357 0.14
358 0.14
359 0.13
360 0.13
361 0.11
362 0.1
363 0.07
364 0.06
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.06
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.11
380 0.12
381 0.16
382 0.16
383 0.18
384 0.15
385 0.18
386 0.17
387 0.17
388 0.16
389 0.12
390 0.12
391 0.09
392 0.08
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.06
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.04
402 0.05
403 0.05
404 0.07
405 0.08
406 0.09
407 0.13
408 0.14
409 0.15
410 0.16
411 0.18
412 0.17
413 0.18
414 0.2
415 0.18
416 0.18
417 0.18
418 0.16
419 0.14
420 0.13
421 0.11
422 0.08
423 0.07
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.09
441 0.13
442 0.14
443 0.15
444 0.16
445 0.18
446 0.2
447 0.22
448 0.2
449 0.17
450 0.18
451 0.17
452 0.16
453 0.16
454 0.13
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.13
459 0.16
460 0.17
461 0.16
462 0.15
463 0.15
464 0.19
465 0.21
466 0.2
467 0.2
468 0.21
469 0.22
470 0.23
471 0.22
472 0.18
473 0.17
474 0.16
475 0.15
476 0.16
477 0.16
478 0.21
479 0.21
480 0.21
481 0.21
482 0.23
483 0.23
484 0.21
485 0.2
486 0.15
487 0.14
488 0.16
489 0.16
490 0.14
491 0.13
492 0.12
493 0.12
494 0.11
495 0.11
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.12
500 0.1
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.08
505 0.07
506 0.06
507 0.03
508 0.03
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.05
513 0.05
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.04
523 0.04
524 0.05
525 0.06
526 0.08
527 0.08
528 0.09
529 0.09
530 0.11
531 0.12
532 0.16
533 0.18
534 0.19
535 0.21
536 0.2
537 0.2
538 0.23
539 0.22
540 0.18
541 0.19
542 0.22
543 0.27
544 0.35
545 0.39
546 0.43
547 0.47
548 0.47
549 0.46
550 0.45
551 0.44
552 0.39
553 0.4
554 0.34
555 0.39
556 0.41
557 0.42
558 0.41
559 0.39
560 0.36
561 0.3
562 0.3
563 0.23
564 0.22
565 0.19
566 0.17
567 0.14
568 0.18
569 0.18
570 0.17
571 0.2
572 0.22
573 0.22
574 0.25
575 0.29
576 0.26
577 0.27
578 0.28
579 0.3
580 0.28
581 0.28
582 0.32
583 0.29
584 0.31
585 0.3
586 0.3
587 0.27
588 0.26
589 0.26
590 0.26
591 0.24
592 0.25