Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LB56

Protein Details
Accession A0A517LB56    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
319-344QDTRPEDEFNKKRKKRKAVTGTEEVAHydrophilic
351-374QDGQPPAKKSKTKKEKSEKDLEEAHydrophilic
400-420AGDTGKDVKKTKKVKRSAITAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-216AGKLKRKREK
329-335KKRKKRK
356-416PAKKSKTKKEKSEKDLEEAREAAERKQKLKEEKAAARKEAEKVEAGDTGKDVKKTKKVKRS
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12, nucl 10.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MSKGEVAVTVRQESGTPYALNPNQTLRAAVALLKAIEKTQKEIDTTKQQLLADDEADENSTESPIWLVMTAKKHITDKARLKPGKIHLPHPLWTSDELRICLITADPPAENVKAYKDLVKNVAFPDALKPRIAKVVAVSKLKTKYKPYEARRKLLAEYDIFLADDRVINLLPGLLGKVFYKNTTKRPIPVSLTGHEKWHGQGRQGEAGKLKRKREKDSGGPTMIGRPEHVGEDIEKALHGTLVHLAPSVTTAVRVAWGAWTPEKIAANTAAVVDGMASKYIPKGWRGIKSIHIKGPDTIALPIWLADELWVDEDQVLDQDTRPEDEFNKKRKKRKAVTGTEEVAEPVKALQDGQPPAKKSKTKKEKSEKDLEEAREAAERKQKLKEEKAAARKEAEKVEAGDTGKDVKKTKKVKRSAITA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.2
4 0.19
5 0.28
6 0.3
7 0.33
8 0.32
9 0.33
10 0.34
11 0.33
12 0.33
13 0.24
14 0.23
15 0.21
16 0.2
17 0.17
18 0.15
19 0.15
20 0.15
21 0.15
22 0.15
23 0.21
24 0.2
25 0.23
26 0.28
27 0.3
28 0.33
29 0.36
30 0.41
31 0.45
32 0.49
33 0.48
34 0.46
35 0.43
36 0.41
37 0.42
38 0.36
39 0.27
40 0.23
41 0.21
42 0.17
43 0.17
44 0.15
45 0.12
46 0.1
47 0.09
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.09
55 0.13
56 0.18
57 0.21
58 0.22
59 0.25
60 0.27
61 0.32
62 0.38
63 0.43
64 0.48
65 0.55
66 0.63
67 0.63
68 0.63
69 0.65
70 0.66
71 0.67
72 0.61
73 0.56
74 0.55
75 0.56
76 0.58
77 0.52
78 0.46
79 0.37
80 0.37
81 0.35
82 0.31
83 0.3
84 0.27
85 0.25
86 0.23
87 0.21
88 0.18
89 0.15
90 0.12
91 0.1
92 0.11
93 0.1
94 0.12
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.13
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.22
103 0.22
104 0.25
105 0.3
106 0.31
107 0.31
108 0.28
109 0.31
110 0.24
111 0.22
112 0.26
113 0.26
114 0.25
115 0.25
116 0.24
117 0.22
118 0.28
119 0.27
120 0.21
121 0.19
122 0.26
123 0.3
124 0.32
125 0.32
126 0.33
127 0.39
128 0.44
129 0.44
130 0.43
131 0.46
132 0.53
133 0.62
134 0.66
135 0.7
136 0.72
137 0.73
138 0.7
139 0.65
140 0.56
141 0.51
142 0.45
143 0.34
144 0.29
145 0.25
146 0.2
147 0.17
148 0.16
149 0.12
150 0.08
151 0.08
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.03
162 0.04
163 0.05
164 0.08
165 0.08
166 0.1
167 0.18
168 0.22
169 0.28
170 0.36
171 0.37
172 0.39
173 0.42
174 0.45
175 0.42
176 0.44
177 0.41
178 0.35
179 0.4
180 0.37
181 0.34
182 0.3
183 0.26
184 0.21
185 0.25
186 0.24
187 0.21
188 0.23
189 0.24
190 0.3
191 0.3
192 0.3
193 0.27
194 0.32
195 0.37
196 0.39
197 0.44
198 0.44
199 0.49
200 0.55
201 0.59
202 0.6
203 0.61
204 0.64
205 0.63
206 0.57
207 0.52
208 0.46
209 0.4
210 0.35
211 0.25
212 0.17
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.05
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.13
250 0.14
251 0.13
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.08
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.05
267 0.09
268 0.11
269 0.12
270 0.19
271 0.24
272 0.31
273 0.34
274 0.36
275 0.41
276 0.48
277 0.52
278 0.49
279 0.47
280 0.42
281 0.39
282 0.39
283 0.33
284 0.25
285 0.2
286 0.17
287 0.14
288 0.12
289 0.12
290 0.1
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.06
305 0.07
306 0.1
307 0.11
308 0.13
309 0.14
310 0.16
311 0.18
312 0.29
313 0.37
314 0.44
315 0.55
316 0.6
317 0.69
318 0.77
319 0.85
320 0.84
321 0.87
322 0.87
323 0.87
324 0.87
325 0.86
326 0.78
327 0.68
328 0.58
329 0.47
330 0.37
331 0.26
332 0.18
333 0.1
334 0.09
335 0.08
336 0.09
337 0.12
338 0.18
339 0.23
340 0.31
341 0.36
342 0.38
343 0.44
344 0.51
345 0.54
346 0.56
347 0.63
348 0.67
349 0.72
350 0.79
351 0.85
352 0.88
353 0.89
354 0.91
355 0.83
356 0.8
357 0.78
358 0.7
359 0.63
360 0.53
361 0.45
362 0.4
363 0.38
364 0.36
365 0.36
366 0.37
367 0.37
368 0.45
369 0.52
370 0.55
371 0.63
372 0.67
373 0.68
374 0.74
375 0.79
376 0.79
377 0.74
378 0.7
379 0.66
380 0.62
381 0.57
382 0.5
383 0.43
384 0.38
385 0.37
386 0.36
387 0.32
388 0.28
389 0.24
390 0.28
391 0.29
392 0.32
393 0.35
394 0.38
395 0.47
396 0.57
397 0.66
398 0.69
399 0.76
400 0.81