Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517L4I0

Protein Details
Accession A0A517L4I0    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
275-297EEFSKFKKDTKSKPAQKRLEMQDHydrophilic
399-422GNHSTVGKKRVRKGKPQSGLEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
309-315GRKKKRK
406-413KKRVRKGK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPSKKVFDKKNATTFSLVYRAQNDPRIHDVEASDMVFTEKSNLNQTKGKAKHRFELEEEFGSKVRENEGEAANHGIYYDDSTYDYMQHMRDLGAGGGQFVEAPGDKKGKGKMTLEDQLRNMDMGSDAGVSQASSMASTAESFFSEDLLPSQFVRPTTYQSQQNVPDAIAGFKPDMDPRLREVLEALDDEAYVEDDEDIFEALAADGEEIHPEEFEDSLYWDEEDDEGWESDRTIKADHASPPLDGEGPGGVPLMPALNTDAHPNTDDHGDGAWMEEFSKFKKDTKSKPAQKRLEMQDSVITGASSLASGRKKKRKGALTSASGYSMTSSVLARTEGQTMLDAKFDKIEEEYADDEEMDDSASMMSGMTGISQFSKASTSSQAPSLLRSDFNNIMNDFLGNHSTVGKKRVRKGKPQSGLEQLDEVRQGLGAPRVKASWY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.53
3 0.5
4 0.43
5 0.36
6 0.35
7 0.38
8 0.4
9 0.46
10 0.44
11 0.42
12 0.46
13 0.46
14 0.43
15 0.4
16 0.35
17 0.3
18 0.31
19 0.26
20 0.2
21 0.16
22 0.16
23 0.14
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.17
28 0.26
29 0.29
30 0.33
31 0.38
32 0.41
33 0.47
34 0.52
35 0.6
36 0.6
37 0.62
38 0.66
39 0.69
40 0.7
41 0.65
42 0.66
43 0.6
44 0.55
45 0.51
46 0.45
47 0.38
48 0.34
49 0.31
50 0.23
51 0.21
52 0.17
53 0.18
54 0.21
55 0.23
56 0.23
57 0.23
58 0.25
59 0.21
60 0.2
61 0.17
62 0.13
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.09
67 0.1
68 0.12
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.06
86 0.05
87 0.07
88 0.05
89 0.07
90 0.1
91 0.13
92 0.14
93 0.18
94 0.23
95 0.28
96 0.33
97 0.35
98 0.37
99 0.41
100 0.48
101 0.49
102 0.48
103 0.43
104 0.4
105 0.37
106 0.32
107 0.25
108 0.17
109 0.13
110 0.09
111 0.08
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.08
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.16
141 0.16
142 0.2
143 0.25
144 0.3
145 0.34
146 0.34
147 0.39
148 0.38
149 0.4
150 0.35
151 0.3
152 0.26
153 0.2
154 0.19
155 0.13
156 0.11
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.16
165 0.22
166 0.21
167 0.2
168 0.2
169 0.18
170 0.17
171 0.16
172 0.13
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.06
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.05
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.14
224 0.17
225 0.19
226 0.18
227 0.18
228 0.18
229 0.17
230 0.16
231 0.13
232 0.1
233 0.07
234 0.06
235 0.06
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.03
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.11
253 0.11
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.06
262 0.07
263 0.07
264 0.09
265 0.14
266 0.15
267 0.18
268 0.28
269 0.36
270 0.44
271 0.54
272 0.64
273 0.69
274 0.78
275 0.85
276 0.83
277 0.8
278 0.81
279 0.78
280 0.75
281 0.65
282 0.56
283 0.48
284 0.41
285 0.36
286 0.27
287 0.19
288 0.1
289 0.1
290 0.08
291 0.05
292 0.05
293 0.09
294 0.14
295 0.21
296 0.31
297 0.4
298 0.47
299 0.54
300 0.63
301 0.68
302 0.71
303 0.75
304 0.74
305 0.71
306 0.68
307 0.61
308 0.53
309 0.44
310 0.35
311 0.25
312 0.17
313 0.11
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.11
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.14
325 0.15
326 0.14
327 0.16
328 0.16
329 0.14
330 0.16
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.15
335 0.13
336 0.15
337 0.16
338 0.15
339 0.15
340 0.13
341 0.13
342 0.11
343 0.1
344 0.07
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.05
357 0.06
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.1
362 0.1
363 0.12
364 0.17
365 0.2
366 0.21
367 0.24
368 0.29
369 0.27
370 0.29
371 0.3
372 0.27
373 0.25
374 0.25
375 0.28
376 0.28
377 0.31
378 0.33
379 0.3
380 0.29
381 0.28
382 0.26
383 0.21
384 0.18
385 0.17
386 0.12
387 0.13
388 0.14
389 0.19
390 0.22
391 0.29
392 0.35
393 0.41
394 0.5
395 0.6
396 0.65
397 0.72
398 0.8
399 0.83
400 0.85
401 0.84
402 0.82
403 0.81
404 0.77
405 0.68
406 0.61
407 0.51
408 0.44
409 0.38
410 0.32
411 0.22
412 0.18
413 0.16
414 0.15
415 0.22
416 0.23
417 0.24
418 0.25