Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LHN4

Protein Details
Accession A0A517LHN4    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MTKNDKKSKARAVKPTAPSSAHydrophilic
44-63ESFDKWQKRKQEASVKAKEEHydrophilic
302-328EPEVKVVKKAKKTKTIKKERQNSDSSDHydrophilic
394-421LVVTKGKGFTKEKNKKKRGAYKGGYLDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
309-319KKAKKTKTIKK
400-412KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MTKNDKKSKARAVKPTAPSSAKQLPLPQFSELSDFYKENPSVQESFDKWQKRKQEASVKAKEEAEDSDDESSDSDSSSSDSDSESDSDSSSDSSSDSGSGEPAKSSVKKTKVVKTPGKIALPESSSSNSSSSSDSNSSGSSAIVPPVKVTIANPNKRKASVSSSSSSSSSSSSSSDSSSSSDSSGDSGIDSAIAQPTKVTAKPNLKRKATSSGSDSDSSSDSSDDEPKQKKVKTTTTTKVIEVTSSSSSSDGSSSDSSSDSDSGNSSDPDEDMADAKSSSSSSDSDSSSDSSSSSDSSSESEPEVKVVKKAKKTKTIKKERQNSDSSDTIAPTSPVHASQPESSATLKTETPVSGKKERPVPFSRIPSDQKVDPRFSSNAYVPNDYSNKAYDDLVVTKGKGFTKEKNKKKRGAYKGGYLDTEAVRGIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.81
3 0.79
4 0.72
5 0.64
6 0.62
7 0.6
8 0.54
9 0.48
10 0.5
11 0.49
12 0.51
13 0.53
14 0.47
15 0.4
16 0.38
17 0.4
18 0.33
19 0.3
20 0.27
21 0.25
22 0.24
23 0.31
24 0.3
25 0.28
26 0.29
27 0.31
28 0.29
29 0.31
30 0.35
31 0.3
32 0.36
33 0.42
34 0.47
35 0.46
36 0.52
37 0.59
38 0.61
39 0.65
40 0.68
41 0.71
42 0.73
43 0.8
44 0.82
45 0.76
46 0.72
47 0.65
48 0.56
49 0.47
50 0.39
51 0.32
52 0.24
53 0.22
54 0.19
55 0.18
56 0.17
57 0.16
58 0.15
59 0.11
60 0.1
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.11
70 0.12
71 0.13
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.12
76 0.12
77 0.11
78 0.1
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.09
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.11
90 0.15
91 0.17
92 0.23
93 0.3
94 0.33
95 0.41
96 0.47
97 0.55
98 0.6
99 0.67
100 0.7
101 0.66
102 0.7
103 0.68
104 0.64
105 0.56
106 0.49
107 0.44
108 0.37
109 0.33
110 0.27
111 0.23
112 0.21
113 0.21
114 0.2
115 0.16
116 0.15
117 0.16
118 0.15
119 0.16
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.16
124 0.16
125 0.14
126 0.13
127 0.11
128 0.1
129 0.11
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.11
137 0.19
138 0.27
139 0.35
140 0.4
141 0.45
142 0.47
143 0.48
144 0.49
145 0.42
146 0.4
147 0.38
148 0.38
149 0.35
150 0.35
151 0.35
152 0.34
153 0.31
154 0.24
155 0.18
156 0.15
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.08
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.07
184 0.09
185 0.11
186 0.13
187 0.18
188 0.28
189 0.35
190 0.45
191 0.52
192 0.52
193 0.53
194 0.54
195 0.56
196 0.49
197 0.45
198 0.39
199 0.34
200 0.34
201 0.33
202 0.3
203 0.22
204 0.2
205 0.18
206 0.14
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.13
211 0.14
212 0.2
213 0.22
214 0.26
215 0.32
216 0.34
217 0.37
218 0.4
219 0.47
220 0.47
221 0.52
222 0.54
223 0.56
224 0.56
225 0.51
226 0.47
227 0.38
228 0.32
229 0.24
230 0.21
231 0.14
232 0.13
233 0.13
234 0.1
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.1
270 0.13
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.16
275 0.15
276 0.14
277 0.12
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.14
289 0.13
290 0.14
291 0.17
292 0.16
293 0.2
294 0.27
295 0.33
296 0.4
297 0.5
298 0.56
299 0.64
300 0.73
301 0.79
302 0.82
303 0.86
304 0.87
305 0.88
306 0.9
307 0.88
308 0.86
309 0.81
310 0.75
311 0.69
312 0.61
313 0.54
314 0.45
315 0.37
316 0.3
317 0.25
318 0.2
319 0.15
320 0.15
321 0.13
322 0.12
323 0.13
324 0.14
325 0.16
326 0.17
327 0.19
328 0.18
329 0.19
330 0.19
331 0.19
332 0.18
333 0.18
334 0.16
335 0.15
336 0.16
337 0.16
338 0.19
339 0.24
340 0.29
341 0.35
342 0.39
343 0.44
344 0.51
345 0.54
346 0.58
347 0.58
348 0.6
349 0.6
350 0.63
351 0.62
352 0.61
353 0.62
354 0.61
355 0.6
356 0.57
357 0.58
358 0.56
359 0.57
360 0.51
361 0.51
362 0.46
363 0.44
364 0.44
365 0.38
366 0.4
367 0.38
368 0.4
369 0.35
370 0.4
371 0.4
372 0.36
373 0.34
374 0.29
375 0.27
376 0.25
377 0.25
378 0.19
379 0.2
380 0.21
381 0.23
382 0.23
383 0.21
384 0.23
385 0.27
386 0.28
387 0.32
388 0.34
389 0.4
390 0.49
391 0.6
392 0.67
393 0.74
394 0.81
395 0.83
396 0.89
397 0.9
398 0.89
399 0.89
400 0.85
401 0.84
402 0.84
403 0.79
404 0.69
405 0.6
406 0.54
407 0.43
408 0.37
409 0.28
410 0.2
411 0.16