FuNGI

A0A517LBN5

Protein Details

Accession

A0A517LBN5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
215-235	VDVASKKRKKRWDVSTTDSTM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
221-224	KRKK

Subcellular Location(s)

plas 18, cyto_nucl 4, nucl 3.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDADFDAVKKAQQERNALTAGKKGSKAFDPASQRTDTSTKASLTETFDTDLYEKSSVDKFAGYNTSIAVNEDEEMEDAPASRRSLIGQYTATKEQMNEFAHGTTEEADILMTREIQAQISSREDSYQKRRHDRGVLTPTRADPFAANRQSGAEDEGATYAETMRLREIEREEQRVMQAIAEKEKNGEAGIMEHRASLRNGDTSEKENGESGAAVDVASKKRKKRWDVSTTDSTMPDAEDSAAVATKAKKSRWDETPAPGEAPKRNRWDQAPAVGATPMGNAGLSTPIHPSQVVTFGNDLSGRNAPLSDEELDELFPATGYKILTPPPGYEPLRAPKHRVAPAATPSSLSGGFMMQEPVNPNMMGKQLPTEIPGVGDLQFFKAEDMQYFSKLVDGADETDMSVEELKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDSARQFGAGPLFNQILPLLMEKTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYTHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLSKAAGLAHMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWQARHTGVKIVQQIPILMGCAILPHLKGLVECIGENLNDEQTKVRTVTSLAIAALAEAANPYGIESFDTILNPLWTGARKQRGKGLTGFLKAVGYIIPLMDEEYANYYTSQIMEILLREFASPDEEMKKTVLKVISQCAGTDGVTAGYLKDKVMSEFFKAFWVRRMALDKRNYRQVVDTTVDLGQKVGVSEILGRLVSNLKDESEPYRKMTLETVEKVVAGLGAADIGERLEERLVDGVLFAFQEQSVEDVIVLNGFGTVVNALGSRTKPYLPQIVSTILWRLNNKSPTVRQQAADLISRVAPVIKACEADDMLARLGSTLYEYLGEEYPEVLGSILGALRSIVTVVGIKQMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGAEDVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMIHLLNLLTPNLFETSPHVIDRIIEAIDAIRMAVGTGPVMNYVFSGLFHPARKVRTPYWRLYNDAYVQSADAMVPYYPNLTDLDEKPLVRDDLYIVI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.47
3	0.51
4	0.53
5	0.49
6	0.43
7	0.44
8	0.44
9	0.41
10	0.4
11	0.38
12	0.39
13	0.41
14	0.45
15	0.42
16	0.44
17	0.47
18	0.49
19	0.51
20	0.49
21	0.45
22	0.44
23	0.44
24	0.39
25	0.35
26	0.34
27	0.31
28	0.3
29	0.32
30	0.31
31	0.33
32	0.33
33	0.3
34	0.27
35	0.26
36	0.27
37	0.25
38	0.23
39	0.2
40	0.18
41	0.16
42	0.18
43	0.21
44	0.2
45	0.2
46	0.2
47	0.17
48	0.21
49	0.26
50	0.23
51	0.21
52	0.2
53	0.22
54	0.2
55	0.21
56	0.17
57	0.13
58	0.13
59	0.13
60	0.13
61	0.11
62	0.11
63	0.1
64	0.09
65	0.09
66	0.11
67	0.14
68	0.14
69	0.14
70	0.14
71	0.16
72	0.21
73	0.23
74	0.25
75	0.26
76	0.29
77	0.34
78	0.37
79	0.36
80	0.32
81	0.31
82	0.29
83	0.33
84	0.31
85	0.28
86	0.26
87	0.25
88	0.24
89	0.24
90	0.21
91	0.15
92	0.13
93	0.11
94	0.09
95	0.09
96	0.08
97	0.09
98	0.09
99	0.08
100	0.08
101	0.11
102	0.12
103	0.13
104	0.14
105	0.15
106	0.18
107	0.21
108	0.23
109	0.2
110	0.23
111	0.26
112	0.33
113	0.41
114	0.46
115	0.53
116	0.61
117	0.66
118	0.7
119	0.75
120	0.72
121	0.72
122	0.75
123	0.72
124	0.66
125	0.64
126	0.59
127	0.53
128	0.47
129	0.38
130	0.29
131	0.29
132	0.35
133	0.36
134	0.34
135	0.31
136	0.32
137	0.32
138	0.31
139	0.26
140	0.17
141	0.13
142	0.14
143	0.13
144	0.13
145	0.11
146	0.11
147	0.08
148	0.11
149	0.11
150	0.11
151	0.13
152	0.15
153	0.16
154	0.21
155	0.26
156	0.32
157	0.37
158	0.42
159	0.42
160	0.42
161	0.41
162	0.4
163	0.35
164	0.27
165	0.27
166	0.24
167	0.29
168	0.28
169	0.28
170	0.26
171	0.26
172	0.25
173	0.19
174	0.17
175	0.11
176	0.12
177	0.15
178	0.16
179	0.16
180	0.16
181	0.17
182	0.18
183	0.19
184	0.18
185	0.18
186	0.18
187	0.2
188	0.23
189	0.25
190	0.26
191	0.31
192	0.29
193	0.27
194	0.24
195	0.23
196	0.2
197	0.17
198	0.14
199	0.09
200	0.08
201	0.07
202	0.08
203	0.12
204	0.17
205	0.25
206	0.31
207	0.37
208	0.45
209	0.55
210	0.63
211	0.69
212	0.75
213	0.77
214	0.79
215	0.8
216	0.8
217	0.75
218	0.67
219	0.58
220	0.47
221	0.37
222	0.3
223	0.22
224	0.14
225	0.1
226	0.08
227	0.07
228	0.07
229	0.08
230	0.07
231	0.09
232	0.11
233	0.17
234	0.22
235	0.24
236	0.32
237	0.38
238	0.46
239	0.5
240	0.56
241	0.54
242	0.56
243	0.6
244	0.53
245	0.49
246	0.44
247	0.41
248	0.4
249	0.42
250	0.43
251	0.44
252	0.48
253	0.51
254	0.52
255	0.56
256	0.53
257	0.52
258	0.49
259	0.41
260	0.38
261	0.32
262	0.29
263	0.21
264	0.16
265	0.1
266	0.06
267	0.05
268	0.04
269	0.05
270	0.07
271	0.07
272	0.08
273	0.11
274	0.12
275	0.13
276	0.13
277	0.14
278	0.12
279	0.18
280	0.18
281	0.16
282	0.16
283	0.15
284	0.17
285	0.17
286	0.16
287	0.13
288	0.14
289	0.13
290	0.13
291	0.13
292	0.12
293	0.12
294	0.15
295	0.13
296	0.12
297	0.12
298	0.12
299	0.12
300	0.12
301	0.11
302	0.08
303	0.06
304	0.06
305	0.05
306	0.07
307	0.07
308	0.08
309	0.09
310	0.11
311	0.15
312	0.16
313	0.18
314	0.2
315	0.27
316	0.28
317	0.29
318	0.32
319	0.37
320	0.46
321	0.46
322	0.48
323	0.46
324	0.53
325	0.55
326	0.53
327	0.48
328	0.44
329	0.49
330	0.47
331	0.41
332	0.33
333	0.29
334	0.28
335	0.24
336	0.18
337	0.12
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.1
342	0.08
343	0.1
344	0.12
345	0.13
346	0.14
347	0.13
348	0.13
349	0.13
350	0.14
351	0.13
352	0.11
353	0.12
354	0.12
355	0.12
356	0.14
357	0.13
358	0.12
359	0.12
360	0.12
361	0.11
362	0.1
363	0.1
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.14
373	0.14
374	0.15
375	0.16
376	0.15
377	0.14
378	0.14
379	0.13
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.1
384	0.1
385	0.09
386	0.08
387	0.09
388	0.08
389	0.08
390	0.06
391	0.08
392	0.1
393	0.1
394	0.14
395	0.15
396	0.17
397	0.2
398	0.25
399	0.27
400	0.34
401	0.41
402	0.43
403	0.49
404	0.49
405	0.47
406	0.49
407	0.48
408	0.45
409	0.45
410	0.42
411	0.42
412	0.45
413	0.44
414	0.42
415	0.48
416	0.5
417	0.45
418	0.43
419	0.41
420	0.41
421	0.47
422	0.44
423	0.36
424	0.27
425	0.25
426	0.24
427	0.22
428	0.2
429	0.14
430	0.13
431	0.13
432	0.14
433	0.13
434	0.13
435	0.11
436	0.09
437	0.08
438	0.09
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.1
444	0.12
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.16
449	0.17
450	0.18
451	0.16
452	0.15
453	0.14
454	0.18
455	0.2
456	0.17
457	0.18
458	0.18
459	0.18
460	0.18
461	0.18
462	0.13
463	0.13
464	0.14
465	0.14
466	0.15
467	0.17
468	0.17
469	0.19
470	0.21
471	0.21
472	0.19
473	0.18
474	0.17
475	0.16
476	0.16
477	0.16
478	0.14
479	0.11
480	0.1
481	0.1
482	0.09
483	0.07
484	0.05
485	0.04
486	0.04
487	0.05
488	0.05
489	0.06
490	0.06
491	0.06
492	0.07
493	0.09
494	0.1
495	0.12
496	0.12
497	0.14
498	0.14
499	0.14
500	0.14
501	0.12
502	0.1
503	0.08
504	0.07
505	0.06
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.06
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.06
517	0.08
518	0.1
519	0.11
520	0.1
521	0.13
522	0.14
523	0.15
524	0.15
525	0.14
526	0.11
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.1
531	0.1
532	0.09
533	0.08
534	0.09
535	0.08
536	0.07
537	0.06
538	0.05
539	0.04
540	0.04
541	0.03
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.02
546	0.03
547	0.03
548	0.04
549	0.06
550	0.08
551	0.11
552	0.16
553	0.2
554	0.23
555	0.28
556	0.37
557	0.45
558	0.53
559	0.55
560	0.58
561	0.61
562	0.65
563	0.62
564	0.57
565	0.5
566	0.45
567	0.44
568	0.37
569	0.33
570	0.26
571	0.24
572	0.19
573	0.17
574	0.13
575	0.08
576	0.06
577	0.04
578	0.04
579	0.04
580	0.05
581	0.05
582	0.04
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.06
587	0.07
588	0.07
589	0.07
590	0.08
591	0.08
592	0.08
593	0.09
594	0.08
595	0.08
596	0.07
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.1
601	0.09
602	0.09
603	0.08
604	0.09
605	0.1
606	0.1
607	0.1
608	0.08
609	0.08
610	0.08
611	0.07
612	0.06
613	0.05
614	0.04
615	0.03
616	0.03
617	0.02
618	0.03
619	0.03
620	0.03
621	0.03
622	0.04
623	0.04
624	0.05
625	0.06
626	0.06
627	0.06
628	0.06
629	0.07
630	0.06
631	0.06
632	0.06
633	0.06
634	0.09
635	0.14
636	0.23
637	0.25
638	0.26
639	0.32
640	0.34
641	0.36
642	0.36
643	0.37
644	0.32
645	0.31
646	0.31
647	0.24
648	0.22
649	0.19
650	0.17
651	0.1
652	0.06
653	0.04
654	0.04
655	0.04
656	0.04
657	0.04
658	0.05
659	0.05
660	0.04
661	0.07
662	0.08
663	0.08
664	0.08
665	0.08
666	0.08
667	0.08
668	0.08
669	0.06
670	0.06
671	0.06
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.06
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.07
680	0.07
681	0.08
682	0.12
683	0.12
684	0.13
685	0.13
686	0.15
687	0.13
688	0.17
689	0.16
690	0.15
691	0.17
692	0.19
693	0.21
694	0.2
695	0.2
696	0.17
697	0.16
698	0.14
699	0.12
700	0.09
701	0.06
702	0.06
703	0.06
704	0.05
705	0.06
706	0.06
707	0.06
708	0.08
709	0.08
710	0.09
711	0.12
712	0.13
713	0.15
714	0.16
715	0.16
716	0.19
717	0.2
718	0.19
719	0.21
720	0.24
721	0.21
722	0.23
723	0.29
724	0.3
725	0.37
726	0.45
727	0.47
728	0.47
729	0.56
730	0.53
731	0.48
732	0.46
733	0.4
734	0.36
735	0.31
736	0.27
737	0.2
738	0.21
739	0.2
740	0.16
741	0.15
742	0.1
743	0.09
744	0.08
745	0.07
746	0.05
747	0.05
748	0.05
749	0.06
750	0.06
751	0.06
752	0.06
753	0.06
754	0.09
755	0.09
756	0.1
757	0.1
758	0.1
759	0.11
760	0.13
761	0.18
762	0.22
763	0.24
764	0.25
765	0.27
766	0.26
767	0.27
768	0.28
769	0.28
770	0.27
771	0.27
772	0.26
773	0.23
774	0.23
775	0.22
776	0.19
777	0.13
778	0.07
779	0.05
780	0.03
781	0.03
782	0.03
783	0.03
784	0.03
785	0.02
786	0.03
787	0.03
788	0.04
789	0.04
790	0.04
791	0.05
792	0.06
793	0.06
794	0.05
795	0.05
796	0.05
797	0.05
798	0.05
799	0.05
800	0.04
801	0.04
802	0.04
803	0.04
804	0.05
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.05
809	0.05
810	0.05
811	0.05
812	0.04
813	0.03
814	0.03
815	0.03
816	0.03
817	0.03
818	0.03
819	0.04
820	0.04
821	0.04
822	0.07
823	0.08
824	0.1
825	0.12
826	0.13
827	0.15
828	0.18
829	0.26
830	0.24
831	0.26
832	0.25
833	0.27
834	0.26
835	0.25
836	0.24
837	0.19
838	0.21
839	0.2
840	0.23
841	0.27
842	0.3
843	0.32
844	0.35
845	0.38
846	0.44
847	0.5
848	0.48
849	0.41
850	0.4
851	0.42
852	0.39
853	0.36
854	0.28
855	0.21
856	0.18
857	0.18
858	0.16
859	0.12
860	0.1
861	0.08
862	0.1
863	0.1
864	0.11
865	0.11
866	0.13
867	0.12
868	0.12
869	0.13
870	0.11
871	0.11
872	0.1
873	0.09
874	0.07
875	0.07
876	0.06
877	0.06
878	0.05
879	0.05
880	0.06
881	0.07
882	0.09
883	0.09
884	0.1
885	0.09
886	0.09
887	0.09
888	0.08
889	0.08
890	0.05
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.05
895	0.04
896	0.04
897	0.04
898	0.04
899	0.04
900	0.04
901	0.04
902	0.04
903	0.05
904	0.05
905	0.1
906	0.1
907	0.11
908	0.15
909	0.2
910	0.23
911	0.24
912	0.26
913	0.26
914	0.28
915	0.31
916	0.29
917	0.3
918	0.29
919	0.3
920	0.3
921	0.3
922	0.33
923	0.37
924	0.45
925	0.45
926	0.5
927	0.53
928	0.59
929	0.62
930	0.64
931	0.61
932	0.61
933	0.57
934	0.53
935	0.5
936	0.42
937	0.35
938	0.28
939	0.23
940	0.14
941	0.11
942	0.08
943	0.07
944	0.06
945	0.06
946	0.08
947	0.08
948	0.08
949	0.09
950	0.1
951	0.11
952	0.15
953	0.15
954	0.15
955	0.16
956	0.17
957	0.2
958	0.19
959	0.19
960	0.15
961	0.15
962	0.19
963	0.18
964	0.19
965	0.15
966	0.18
967	0.22
968	0.22
969	0.24
970	0.22
971	0.27
972	0.33
973	0.43
974	0.49
975	0.5
976	0.59
977	0.65
978	0.72
979	0.67
980	0.6
981	0.51
982	0.41
983	0.36
984	0.28
985	0.2
986	0.11
987	0.13
988	0.12
989	0.12
990	0.11
991	0.11
992	0.11
993	0.1
994	0.1
995	0.07
996	0.07
997	0.08
998	0.1
999	0.12
1000	0.12
1001	0.13
1002	0.14
1003	0.16
1004	0.19
1005	0.26
1006	0.31
1007	0.35
1008	0.38
1009	0.41
1010	0.41
1011	0.41
1012	0.37
1013	0.29
1014	0.25
1015	0.19
1016	0.15
1017	0.11
1018	0.09
1019	0.08
1020	0.07
1021	0.06
1022	0.04
1023	0.04
1024	0.04
1025	0.05
1026	0.05
1027	0.06
1028	0.09
1029	0.1
1030	0.1
1031	0.11
1032	0.16
1033	0.16
1034	0.18
1035	0.18
1036	0.17
1037	0.18
1038	0.18
1039	0.19
1040	0.2
1041	0.23
1042	0.25
1043	0.26
1044	0.24
1045	0.27
1046	0.26
1047	0.26
1048	0.2
1049	0.17
1050	0.14
1051	0.14
1052	0.15
1053	0.11
1054	0.11
1055	0.11
1056	0.11
1057	0.13
1058	0.12
1059	0.12
1060	0.11
1061	0.11
1062	0.11
1063	0.1
1064	0.1
1065	0.09
1066	0.08
1067	0.07
1068	0.08
1069	0.08
1070	0.08
1071	0.08
1072	0.08
1073	0.08
1074	0.07
1075	0.06
1076	0.07
1077	0.1
1078	0.1
1079	0.1
1080	0.11
1081	0.14
1082	0.19
1083	0.21
1084	0.22
1085	0.2
1086	0.2
1087	0.22
1088	0.27
1089	0.3
1090	0.26
1091	0.27
1092	0.26
1093	0.25
1094	0.25
1095	0.23
1096	0.18
1097	0.11
1098	0.1
1099	0.08
1100	0.06
1101	0.05
1102	0.05
1103	0.05
1104	0.04
1105	0.04
1106	0.04
1107	0.03
1108	0.04
1109	0.05
1110	0.05
1111	0.06
1112	0.06
1113	0.07
1114	0.09
1115	0.09
1116	0.08
1117	0.08
1118	0.1
1119	0.11
1120	0.11
1121	0.1
1122	0.14
1123	0.21
1124	0.23
1125	0.24
1126	0.23
1127	0.21
1128	0.22
1129	0.23
1130	0.21
1131	0.14
1132	0.11
1133	0.11
1134	0.11
1135	0.11
1136	0.1
1137	0.08
1138	0.06
1139	0.05
1140	0.06
1141	0.06
1142	0.06
1143	0.06
1144	0.07
1145	0.07
1146	0.08
1147	0.09
1148	0.09
1149	0.08
1150	0.09
1151	0.09
1152	0.09
1153	0.11
1154	0.14
1155	0.19
1156	0.21
1157	0.27
1158	0.3
1159	0.35
1160	0.42
1161	0.47
1162	0.51
1163	0.57
1164	0.63
1165	0.66
1166	0.71
1167	0.7
1168	0.68
1169	0.66
1170	0.65
1171	0.6
1172	0.56
1173	0.48
1174	0.39
1175	0.34
1176	0.29
1177	0.25
1178	0.17
1179	0.12
1180	0.1
1181	0.08
1182	0.08
1183	0.09
1184	0.1
1185	0.1
1186	0.11
1187	0.12
1188	0.14
1189	0.2
1190	0.21
1191	0.28
1192	0.31
1193	0.31
1194	0.32
1195	0.35
1196	0.33
1197	0.28
1198	0.27

A0A517LBN5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer