Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517L1T2

Protein Details
Accession A0A517L1T2    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
148-169DESEKWDKRMNKKSKHKEDTAFBasic
255-280DLKKAEENRLKKRKERLKASENEDGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
261-271ENRLKKRKERL
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, cyto 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MAPKRKTDATDAVEEESVKRRFVESEDAQPLPDMPAETPTAEQRQQEGADPVEEQPESASAPAPANSAAAKAAERQARFKALQARQNAGRKQNLKESQLESHRLSTDPTLLTALNRKRDIAAHKLLKADTEADGEDFERKRAWDWTVDESEKWDKRMNKKSKHKEDTAFKDYTNEARKVYKRQMRDFKPDVAAYKKSKWEAMEKAAQKGQLELQETETGDLIAFDTDGNTWSMAEEDKPWDNKPDKEAVDRLVADLKKAEENRLKKRKERLKASENEDGDVTYINVKNKQFNEKLKRFYDKYTGDIRESFERGTAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.35
3 0.34
4 0.3
5 0.25
6 0.24
7 0.23
8 0.23
9 0.26
10 0.34
11 0.29
12 0.37
13 0.41
14 0.41
15 0.4
16 0.38
17 0.35
18 0.26
19 0.24
20 0.16
21 0.11
22 0.13
23 0.15
24 0.15
25 0.16
26 0.2
27 0.24
28 0.26
29 0.26
30 0.26
31 0.29
32 0.29
33 0.31
34 0.29
35 0.25
36 0.23
37 0.23
38 0.21
39 0.19
40 0.18
41 0.15
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.08
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.1
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.16
60 0.2
61 0.22
62 0.25
63 0.27
64 0.32
65 0.32
66 0.35
67 0.39
68 0.4
69 0.45
70 0.45
71 0.47
72 0.49
73 0.57
74 0.57
75 0.53
76 0.55
77 0.54
78 0.53
79 0.58
80 0.57
81 0.52
82 0.52
83 0.5
84 0.49
85 0.49
86 0.5
87 0.42
88 0.38
89 0.36
90 0.31
91 0.29
92 0.23
93 0.21
94 0.17
95 0.15
96 0.14
97 0.13
98 0.13
99 0.2
100 0.23
101 0.26
102 0.26
103 0.26
104 0.26
105 0.3
106 0.34
107 0.33
108 0.37
109 0.35
110 0.37
111 0.38
112 0.37
113 0.33
114 0.3
115 0.24
116 0.16
117 0.13
118 0.11
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.15
129 0.16
130 0.16
131 0.19
132 0.23
133 0.27
134 0.27
135 0.26
136 0.26
137 0.32
138 0.28
139 0.27
140 0.27
141 0.29
142 0.37
143 0.48
144 0.54
145 0.58
146 0.68
147 0.77
148 0.83
149 0.84
150 0.81
151 0.78
152 0.77
153 0.75
154 0.7
155 0.6
156 0.49
157 0.44
158 0.39
159 0.38
160 0.35
161 0.28
162 0.23
163 0.28
164 0.32
165 0.36
166 0.44
167 0.43
168 0.45
169 0.53
170 0.62
171 0.62
172 0.68
173 0.65
174 0.6
175 0.58
176 0.52
177 0.46
178 0.41
179 0.4
180 0.35
181 0.36
182 0.36
183 0.34
184 0.35
185 0.34
186 0.36
187 0.35
188 0.36
189 0.4
190 0.37
191 0.4
192 0.39
193 0.38
194 0.31
195 0.28
196 0.25
197 0.21
198 0.22
199 0.19
200 0.2
201 0.21
202 0.21
203 0.2
204 0.17
205 0.13
206 0.1
207 0.09
208 0.07
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.12
224 0.17
225 0.19
226 0.21
227 0.28
228 0.32
229 0.34
230 0.36
231 0.4
232 0.38
233 0.41
234 0.43
235 0.38
236 0.38
237 0.36
238 0.33
239 0.32
240 0.29
241 0.25
242 0.24
243 0.23
244 0.24
245 0.25
246 0.32
247 0.34
248 0.43
249 0.53
250 0.61
251 0.66
252 0.67
253 0.76
254 0.78
255 0.8
256 0.82
257 0.81
258 0.82
259 0.84
260 0.83
261 0.81
262 0.72
263 0.63
264 0.53
265 0.43
266 0.33
267 0.25
268 0.18
269 0.15
270 0.17
271 0.19
272 0.25
273 0.27
274 0.34
275 0.38
276 0.47
277 0.5
278 0.57
279 0.65
280 0.67
281 0.73
282 0.73
283 0.78
284 0.72
285 0.7
286 0.69
287 0.62
288 0.59
289 0.6
290 0.57
291 0.51
292 0.5
293 0.48
294 0.45
295 0.44
296 0.39