Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LNT9

Protein Details
Accession A0A517LNT9    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-92IKLSEPRTKARFRRDKKDLDIKLBasic
409-450KDEKDEKEKKGSKHPFREGSKKNPRKQHNKKQWSGRRDSDSLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
75-85PRTKARFRRDK
414-446EKEKKGSKHPFREGSKKNPRKQHNKKQWSGRRD
Subcellular Location(s) nucl 18.5, mito_nucl 13.5, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MNGTLRRAIEYAFKIHRPVDMATPKGPVVEGIFAIHKPPSMTSFDVIRILQPLFKKSKLFAPLLARERNIKLSEPRTKARFRRDKKDLDIKLGHGGTLDPIATGVLIIGVGRGTKVLGRFLECTKKYETTVLFGAATDSYDRVGKVVGRAPYDHITKEQVEEALGQFRGHIMQKPSIFSALRVNGKRMYEYAREGGEIPELKERPVEVEELELVKFLESGTHDFKLPGEQASKEEKEIADKVLHIKDLAKDSDSSLKRKREEDSIQDAPPEKVPRSSPQPEATERAANELEVVDSKESGDPMMSGALQPTQSRESSPASKEEPPAAVLTMTVSSGFYVRSLCHDLGTAVGSLGLMSTLVRSRQAQFELGKNVLEYEDLSKGEEVWGPKIEAMLKDWQEKEGNQSSDDEKDEKDEKEKKGSKHPFREGSKKNPRKQHNKKQWSGRRDSDSLPAERSRRRNTSSAEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.39
3 0.4
4 0.36
5 0.35
6 0.37
7 0.38
8 0.4
9 0.38
10 0.4
11 0.37
12 0.34
13 0.32
14 0.23
15 0.18
16 0.17
17 0.15
18 0.14
19 0.16
20 0.16
21 0.18
22 0.17
23 0.16
24 0.15
25 0.16
26 0.18
27 0.2
28 0.23
29 0.23
30 0.26
31 0.26
32 0.28
33 0.27
34 0.24
35 0.22
36 0.21
37 0.22
38 0.22
39 0.27
40 0.3
41 0.33
42 0.35
43 0.34
44 0.41
45 0.43
46 0.43
47 0.42
48 0.45
49 0.5
50 0.55
51 0.57
52 0.5
53 0.49
54 0.5
55 0.5
56 0.43
57 0.39
58 0.4
59 0.45
60 0.54
61 0.55
62 0.59
63 0.6
64 0.67
65 0.71
66 0.74
67 0.75
68 0.74
69 0.79
70 0.81
71 0.83
72 0.83
73 0.85
74 0.77
75 0.75
76 0.7
77 0.62
78 0.59
79 0.5
80 0.41
81 0.3
82 0.27
83 0.19
84 0.16
85 0.14
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.04
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.04
100 0.04
101 0.06
102 0.08
103 0.12
104 0.13
105 0.16
106 0.19
107 0.23
108 0.33
109 0.32
110 0.34
111 0.35
112 0.36
113 0.34
114 0.37
115 0.34
116 0.27
117 0.27
118 0.25
119 0.21
120 0.18
121 0.18
122 0.12
123 0.12
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.11
133 0.16
134 0.18
135 0.19
136 0.2
137 0.24
138 0.27
139 0.28
140 0.26
141 0.23
142 0.24
143 0.23
144 0.23
145 0.2
146 0.16
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.1
154 0.1
155 0.12
156 0.12
157 0.16
158 0.15
159 0.2
160 0.22
161 0.23
162 0.24
163 0.24
164 0.23
165 0.2
166 0.23
167 0.24
168 0.29
169 0.29
170 0.3
171 0.31
172 0.31
173 0.31
174 0.26
175 0.26
176 0.22
177 0.24
178 0.24
179 0.21
180 0.21
181 0.2
182 0.19
183 0.17
184 0.15
185 0.14
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.11
198 0.1
199 0.08
200 0.07
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.09
207 0.12
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.13
215 0.12
216 0.12
217 0.14
218 0.2
219 0.2
220 0.18
221 0.19
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.17
226 0.12
227 0.12
228 0.15
229 0.15
230 0.15
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.16
235 0.17
236 0.14
237 0.13
238 0.15
239 0.23
240 0.24
241 0.28
242 0.32
243 0.37
244 0.39
245 0.41
246 0.42
247 0.42
248 0.44
249 0.45
250 0.46
251 0.44
252 0.41
253 0.41
254 0.4
255 0.32
256 0.31
257 0.27
258 0.2
259 0.18
260 0.21
261 0.23
262 0.3
263 0.34
264 0.35
265 0.37
266 0.41
267 0.41
268 0.42
269 0.4
270 0.36
271 0.31
272 0.3
273 0.25
274 0.2
275 0.18
276 0.14
277 0.12
278 0.09
279 0.1
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.1
297 0.12
298 0.13
299 0.14
300 0.16
301 0.2
302 0.24
303 0.26
304 0.27
305 0.29
306 0.32
307 0.33
308 0.32
309 0.28
310 0.24
311 0.23
312 0.19
313 0.15
314 0.11
315 0.1
316 0.08
317 0.07
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.11
327 0.16
328 0.16
329 0.16
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.12
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.03
342 0.03
343 0.04
344 0.06
345 0.07
346 0.1
347 0.12
348 0.15
349 0.2
350 0.22
351 0.25
352 0.27
353 0.31
354 0.34
355 0.33
356 0.31
357 0.26
358 0.24
359 0.2
360 0.17
361 0.13
362 0.11
363 0.13
364 0.13
365 0.14
366 0.14
367 0.14
368 0.15
369 0.17
370 0.16
371 0.16
372 0.18
373 0.17
374 0.18
375 0.19
376 0.2
377 0.18
378 0.2
379 0.25
380 0.26
381 0.32
382 0.32
383 0.34
384 0.35
385 0.34
386 0.39
387 0.39
388 0.38
389 0.32
390 0.35
391 0.34
392 0.34
393 0.36
394 0.3
395 0.22
396 0.27
397 0.3
398 0.29
399 0.36
400 0.4
401 0.42
402 0.51
403 0.58
404 0.57
405 0.64
406 0.73
407 0.74
408 0.77
409 0.82
410 0.81
411 0.82
412 0.87
413 0.84
414 0.85
415 0.86
416 0.85
417 0.84
418 0.85
419 0.87
420 0.88
421 0.91
422 0.91
423 0.91
424 0.92
425 0.93
426 0.94
427 0.93
428 0.92
429 0.9
430 0.87
431 0.84
432 0.77
433 0.7
434 0.68
435 0.65
436 0.58
437 0.54
438 0.52
439 0.51
440 0.55
441 0.61
442 0.62
443 0.64
444 0.66
445 0.69