Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LB93

Protein Details
Accession A0A517LB93    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-39LNATRAPGNTTRRPRNRHRSRGGRANTEHGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-32RRPRNRHRSRGG
66-79RGGGGRRRGGRGRG
138-153RGPKARAPLQPRKRRM
Subcellular Location(s) plas 20, E.R. 3, nucl 1, cyto 1, cyto_nucl 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
CDD cd16492  RING-CH-C4HC3_NFX1-like  
Amino Acid Sequences MSDEPAPSALNATRAPGNTTRRPRNRHRSRGGRANTEHGASVAGPPLLPATVTPNIESSNQASNGRGGGGRRRGGRGRGGEQSGDLRSQAARAVPGGRRFGGQLTTGDDDSSSQSGTPQLYAGASEFVPGQPVVIPPRGPKARAPLQPRKRRMSKSTAPDIGTRIHEDVDNGNYECAVCTNEIYRNSKIWSCRTCWSIFHLSCIKKWSSSEGSAMARAQAEDGIPFRRRSPAGVKKRQNQDLYLVFHLSVVARLALVGTCCQKSVRTAAPMSVMLENVSLARRWALSKVVSVVVNLPHAAVLTRITRMVGHAVQYVESSCLAVNIFAADFVTKACAAPVKSQLKLDATAARWKTKSSVPIRPMYEQAGNGLIYTTTRMPRRNGLAYLAADTIAIVCLIAGSIIAKSVVILKML
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.29
3 0.33
4 0.39
5 0.45
6 0.55
7 0.63
8 0.69
9 0.77
10 0.83
11 0.86
12 0.89
13 0.9
14 0.91
15 0.91
16 0.91
17 0.93
18 0.9
19 0.88
20 0.81
21 0.77
22 0.69
23 0.59
24 0.5
25 0.39
26 0.32
27 0.23
28 0.2
29 0.16
30 0.13
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.1
35 0.09
36 0.08
37 0.12
38 0.16
39 0.18
40 0.18
41 0.19
42 0.21
43 0.22
44 0.24
45 0.21
46 0.22
47 0.24
48 0.25
49 0.24
50 0.23
51 0.23
52 0.22
53 0.21
54 0.18
55 0.23
56 0.3
57 0.34
58 0.36
59 0.42
60 0.46
61 0.49
62 0.55
63 0.53
64 0.5
65 0.52
66 0.51
67 0.45
68 0.41
69 0.4
70 0.34
71 0.28
72 0.23
73 0.17
74 0.14
75 0.14
76 0.15
77 0.12
78 0.11
79 0.12
80 0.17
81 0.21
82 0.26
83 0.28
84 0.27
85 0.27
86 0.27
87 0.27
88 0.24
89 0.21
90 0.17
91 0.18
92 0.2
93 0.19
94 0.18
95 0.16
96 0.15
97 0.15
98 0.14
99 0.1
100 0.08
101 0.09
102 0.11
103 0.12
104 0.11
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.09
120 0.12
121 0.13
122 0.15
123 0.15
124 0.24
125 0.26
126 0.27
127 0.28
128 0.33
129 0.4
130 0.46
131 0.54
132 0.56
133 0.64
134 0.73
135 0.77
136 0.78
137 0.78
138 0.78
139 0.76
140 0.75
141 0.72
142 0.71
143 0.71
144 0.67
145 0.6
146 0.55
147 0.49
148 0.42
149 0.36
150 0.29
151 0.21
152 0.17
153 0.15
154 0.15
155 0.14
156 0.13
157 0.14
158 0.12
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.07
165 0.05
166 0.06
167 0.08
168 0.12
169 0.16
170 0.2
171 0.21
172 0.22
173 0.23
174 0.26
175 0.28
176 0.31
177 0.3
178 0.3
179 0.32
180 0.34
181 0.33
182 0.31
183 0.33
184 0.35
185 0.31
186 0.32
187 0.36
188 0.33
189 0.33
190 0.36
191 0.31
192 0.23
193 0.24
194 0.25
195 0.21
196 0.22
197 0.22
198 0.21
199 0.21
200 0.21
201 0.21
202 0.16
203 0.12
204 0.11
205 0.1
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.1
211 0.12
212 0.13
213 0.14
214 0.18
215 0.18
216 0.21
217 0.3
218 0.37
219 0.46
220 0.55
221 0.63
222 0.67
223 0.75
224 0.78
225 0.7
226 0.61
227 0.56
228 0.51
229 0.47
230 0.4
231 0.32
232 0.24
233 0.22
234 0.21
235 0.15
236 0.1
237 0.07
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.11
250 0.13
251 0.17
252 0.2
253 0.22
254 0.22
255 0.23
256 0.25
257 0.25
258 0.24
259 0.2
260 0.15
261 0.11
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.08
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.1
272 0.13
273 0.13
274 0.15
275 0.17
276 0.18
277 0.18
278 0.17
279 0.18
280 0.16
281 0.15
282 0.14
283 0.12
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.12
295 0.16
296 0.14
297 0.15
298 0.17
299 0.17
300 0.17
301 0.17
302 0.16
303 0.13
304 0.12
305 0.1
306 0.07
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.11
323 0.13
324 0.18
325 0.27
326 0.31
327 0.33
328 0.34
329 0.37
330 0.36
331 0.35
332 0.34
333 0.3
334 0.27
335 0.34
336 0.36
337 0.38
338 0.36
339 0.36
340 0.37
341 0.36
342 0.43
343 0.42
344 0.49
345 0.49
346 0.56
347 0.59
348 0.59
349 0.57
350 0.52
351 0.48
352 0.38
353 0.34
354 0.29
355 0.24
356 0.21
357 0.19
358 0.14
359 0.1
360 0.13
361 0.15
362 0.19
363 0.25
364 0.3
365 0.33
366 0.41
367 0.48
368 0.51
369 0.49
370 0.47
371 0.47
372 0.44
373 0.42
374 0.35
375 0.28
376 0.21
377 0.19
378 0.15
379 0.09
380 0.08
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.03
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.05
392 0.06
393 0.11