Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LCD3

Protein Details
Accession A0A517LCD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-372RSETREEKKLRMQRQREAMAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-196GRHRPSGMKKGEIKRRKR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039355  Transcription_factor_GATA  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Amino Acid Sequences MSTTFSSAGAAASTPTSAKDRIPRHTTQEDLATAELLQNFNQQTERLDTNAQRARRQDERLSEGERDSSAEQARVSRSPVPEYHSLDDAASYARNMETSSQSSSEQRFSSSSQPPNAPSTGQICSLLQVHVLAQGWVLLDVSDIAGATSQMAGAPWTLKTPHLINLINPLAGLYFKLHGRHRPSGMKKGEIKRRKRVIPAMSSQAGEDPVMTNEQQSSASPDPPQSHPQQLNLPHHDRPPNTRGQEHLLEPPTSSYGPPPVDFTSYSSSQITQRDPAVVIFPSVNTSSEARNNKKRTLSAANRDMPQPEGSSQAPSTTASSRSPGEAAIDPSLSTYASGSSGSHGQSTNGDTRSETREEKKLRMQRQREAMAAELKRMDEDLQAMEDGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.11
3 0.14
4 0.15
5 0.2
6 0.28
7 0.35
8 0.43
9 0.5
10 0.53
11 0.57
12 0.62
13 0.6
14 0.54
15 0.53
16 0.45
17 0.4
18 0.35
19 0.27
20 0.21
21 0.21
22 0.19
23 0.14
24 0.14
25 0.17
26 0.18
27 0.18
28 0.2
29 0.18
30 0.19
31 0.23
32 0.24
33 0.22
34 0.27
35 0.28
36 0.36
37 0.42
38 0.43
39 0.43
40 0.46
41 0.5
42 0.51
43 0.56
44 0.53
45 0.54
46 0.57
47 0.57
48 0.56
49 0.52
50 0.46
51 0.41
52 0.33
53 0.29
54 0.23
55 0.23
56 0.21
57 0.2
58 0.2
59 0.21
60 0.24
61 0.23
62 0.26
63 0.26
64 0.27
65 0.3
66 0.31
67 0.33
68 0.37
69 0.4
70 0.39
71 0.36
72 0.34
73 0.29
74 0.27
75 0.22
76 0.16
77 0.11
78 0.09
79 0.08
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.1
84 0.13
85 0.15
86 0.18
87 0.18
88 0.2
89 0.24
90 0.26
91 0.27
92 0.24
93 0.23
94 0.22
95 0.23
96 0.3
97 0.34
98 0.36
99 0.37
100 0.39
101 0.4
102 0.41
103 0.4
104 0.32
105 0.26
106 0.24
107 0.22
108 0.2
109 0.19
110 0.15
111 0.16
112 0.16
113 0.14
114 0.11
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.1
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.1
147 0.11
148 0.15
149 0.19
150 0.19
151 0.19
152 0.24
153 0.25
154 0.22
155 0.21
156 0.16
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.05
161 0.06
162 0.08
163 0.12
164 0.14
165 0.2
166 0.27
167 0.31
168 0.35
169 0.42
170 0.46
171 0.51
172 0.52
173 0.52
174 0.53
175 0.57
176 0.63
177 0.63
178 0.66
179 0.66
180 0.72
181 0.7
182 0.68
183 0.68
184 0.64
185 0.61
186 0.57
187 0.52
188 0.46
189 0.41
190 0.35
191 0.28
192 0.21
193 0.15
194 0.12
195 0.07
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.13
205 0.13
206 0.15
207 0.15
208 0.18
209 0.2
210 0.23
211 0.28
212 0.25
213 0.31
214 0.3
215 0.32
216 0.35
217 0.39
218 0.43
219 0.45
220 0.47
221 0.42
222 0.45
223 0.48
224 0.44
225 0.44
226 0.42
227 0.43
228 0.42
229 0.4
230 0.38
231 0.38
232 0.39
233 0.35
234 0.36
235 0.3
236 0.28
237 0.27
238 0.25
239 0.22
240 0.19
241 0.17
242 0.12
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.19
247 0.18
248 0.2
249 0.2
250 0.22
251 0.22
252 0.22
253 0.23
254 0.2
255 0.21
256 0.22
257 0.25
258 0.24
259 0.22
260 0.21
261 0.21
262 0.21
263 0.2
264 0.18
265 0.15
266 0.14
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.13
274 0.15
275 0.22
276 0.31
277 0.36
278 0.45
279 0.5
280 0.54
281 0.58
282 0.57
283 0.57
284 0.59
285 0.61
286 0.61
287 0.65
288 0.64
289 0.6
290 0.6
291 0.54
292 0.46
293 0.38
294 0.3
295 0.22
296 0.21
297 0.2
298 0.22
299 0.21
300 0.19
301 0.18
302 0.17
303 0.19
304 0.18
305 0.2
306 0.18
307 0.2
308 0.21
309 0.21
310 0.21
311 0.18
312 0.19
313 0.19
314 0.2
315 0.19
316 0.18
317 0.17
318 0.17
319 0.17
320 0.13
321 0.11
322 0.08
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.1
328 0.14
329 0.14
330 0.16
331 0.16
332 0.16
333 0.18
334 0.22
335 0.27
336 0.25
337 0.25
338 0.24
339 0.27
340 0.32
341 0.34
342 0.36
343 0.35
344 0.43
345 0.48
346 0.53
347 0.59
348 0.63
349 0.69
350 0.74
351 0.76
352 0.76
353 0.81
354 0.78
355 0.71
356 0.65
357 0.59
358 0.57
359 0.5
360 0.45
361 0.37
362 0.32
363 0.3
364 0.28
365 0.25
366 0.17
367 0.19
368 0.17
369 0.16