Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517L2F9

Protein Details
Accession A0A517L2F9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
262-288EAAAKRKQDLHRRERGRKDRRHQAEYDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
266-282KRKQDLHRRERGRKDRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.833, cyto 9, mito_nucl 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR002121  HRDC_dom  
IPR044876  HRDC_dom_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50967  HRDC  
Amino Acid Sequences MENTGSHQPLETRLTSEPVARLSYKEYRNPGGECIPLYYCASPEAAEHGGQQLLIALEHNELQVVGVDGIGFGEEKSGVSLSSIQFTALGPRGCIVIIHLPRPEPFGPEGSLPTSIRCLLSSTKVLKVGHGVVDLGDYIHKYFRVQGHSFYDLGHTHSRIQEKSICHLDDNTWFGLNQLVLSYLGRRLDREAEEMTIPMTDKLVDYAASRSLAVALIFEAMFNFQELPPPYKAISTDPRRHPVVGLPIHSENVHIFTVEEIEAAAKRKQDLHRRERGRKDRRHQAEYDELNLDSQDLYKSLMIVRDRILESTGLPPHKVSDTKNIYLLALKKPTTVEALKEIKLRIKATQGQYAYDFVNVVRLHLGLEVLVEPLQYQRECREEQDAAMLAKQMNGLRNGGVSPAQKVTTVRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.31
4 0.29
5 0.26
6 0.29
7 0.26
8 0.26
9 0.29
10 0.37
11 0.4
12 0.44
13 0.48
14 0.5
15 0.54
16 0.54
17 0.52
18 0.47
19 0.43
20 0.37
21 0.34
22 0.3
23 0.27
24 0.28
25 0.23
26 0.2
27 0.18
28 0.18
29 0.14
30 0.14
31 0.16
32 0.15
33 0.15
34 0.15
35 0.16
36 0.15
37 0.14
38 0.14
39 0.11
40 0.09
41 0.09
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.03
60 0.04
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.11
68 0.11
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.13
73 0.13
74 0.17
75 0.18
76 0.18
77 0.15
78 0.15
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.17
84 0.19
85 0.22
86 0.23
87 0.24
88 0.25
89 0.3
90 0.28
91 0.23
92 0.22
93 0.22
94 0.22
95 0.21
96 0.23
97 0.19
98 0.22
99 0.19
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.16
104 0.14
105 0.15
106 0.14
107 0.18
108 0.23
109 0.24
110 0.26
111 0.3
112 0.3
113 0.28
114 0.29
115 0.27
116 0.22
117 0.19
118 0.16
119 0.11
120 0.12
121 0.11
122 0.08
123 0.06
124 0.05
125 0.06
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.12
130 0.16
131 0.24
132 0.25
133 0.28
134 0.32
135 0.34
136 0.33
137 0.29
138 0.27
139 0.2
140 0.23
141 0.21
142 0.18
143 0.18
144 0.22
145 0.26
146 0.23
147 0.25
148 0.27
149 0.26
150 0.3
151 0.33
152 0.3
153 0.26
154 0.27
155 0.25
156 0.23
157 0.24
158 0.2
159 0.14
160 0.13
161 0.13
162 0.13
163 0.11
164 0.08
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.12
175 0.16
176 0.17
177 0.19
178 0.18
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.14
183 0.1
184 0.1
185 0.07
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.04
212 0.09
213 0.11
214 0.14
215 0.15
216 0.16
217 0.17
218 0.16
219 0.18
220 0.18
221 0.26
222 0.31
223 0.39
224 0.43
225 0.47
226 0.48
227 0.48
228 0.44
229 0.38
230 0.38
231 0.33
232 0.29
233 0.28
234 0.27
235 0.27
236 0.26
237 0.23
238 0.15
239 0.14
240 0.12
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.09
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.19
255 0.26
256 0.36
257 0.45
258 0.52
259 0.61
260 0.69
261 0.78
262 0.82
263 0.86
264 0.87
265 0.87
266 0.87
267 0.87
268 0.86
269 0.83
270 0.74
271 0.69
272 0.68
273 0.6
274 0.54
275 0.45
276 0.36
277 0.3
278 0.27
279 0.21
280 0.12
281 0.1
282 0.07
283 0.06
284 0.08
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.14
289 0.14
290 0.16
291 0.17
292 0.2
293 0.21
294 0.21
295 0.21
296 0.16
297 0.17
298 0.2
299 0.24
300 0.21
301 0.21
302 0.2
303 0.22
304 0.25
305 0.27
306 0.25
307 0.3
308 0.36
309 0.37
310 0.39
311 0.38
312 0.34
313 0.36
314 0.36
315 0.32
316 0.31
317 0.29
318 0.28
319 0.29
320 0.3
321 0.31
322 0.29
323 0.25
324 0.27
325 0.32
326 0.33
327 0.36
328 0.36
329 0.36
330 0.39
331 0.39
332 0.34
333 0.37
334 0.42
335 0.43
336 0.49
337 0.45
338 0.42
339 0.42
340 0.41
341 0.34
342 0.26
343 0.22
344 0.13
345 0.19
346 0.16
347 0.16
348 0.14
349 0.14
350 0.14
351 0.14
352 0.14
353 0.07
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.09
361 0.14
362 0.14
363 0.16
364 0.19
365 0.25
366 0.28
367 0.31
368 0.36
369 0.33
370 0.33
371 0.36
372 0.34
373 0.29
374 0.28
375 0.28
376 0.21
377 0.2
378 0.23
379 0.21
380 0.22
381 0.23
382 0.24
383 0.22
384 0.23
385 0.22
386 0.21
387 0.22
388 0.2
389 0.21
390 0.23
391 0.23
392 0.24