Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LR06

Protein Details
Accession A0A517LR06    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-44ADFSVKRERSRSPRRRSRSPRHRRSYSPRSRSRSRGAEYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-52KRERSRSPRRRSRSPRHRRSYSPRSRSRSRGAEYRRSDRRSR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MQAAAADFSVKRERSRSPRRRSRSPRHRRSYSPRSRSRSRGAEYRRSDRRSRSPANTAAATAGGYSSSSRPALRGGSDERSQQKEQPGMQGMRENSQQDRRVYVGNLSYDVKWHHLKDFMRQAGEVLIVEYQTRDQAQNAVNTLSNQNLMGRLVYVREDREAEPRFSQPAPMMGGGMAPRGGGFGGGMGGMRGGGFGGGFGGAPGGGNNQLYISNLPYTVGWQDLKDLFRQATQVGNIVRADVHLGPDGRPKGSGIVVFDNADDARNAIGQFNGYEWQGRTLEVREDRFANAPPGGGRGGFGGGRGGFGGGFGRGGGGFGGGFGGRGGGFGGGRGGFGGGYAGGGSYAGSASGMDAPAVPQAPNPFTDHATYGGERGPIIHVRNLPWSTSNEDLVDLFTTIGPVKKAEIQYEANGRSRGTGVVEFDTAENAETAITKFSGYQYGGRPLGLTFVRYGNVAASNGDAMDTGDIGDQIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.61
3 0.67
4 0.7
5 0.79
6 0.84
7 0.91
8 0.92
9 0.93
10 0.93
11 0.94
12 0.94
13 0.93
14 0.92
15 0.91
16 0.91
17 0.91
18 0.91
19 0.9
20 0.89
21 0.87
22 0.87
23 0.85
24 0.85
25 0.83
26 0.78
27 0.77
28 0.76
29 0.78
30 0.77
31 0.79
32 0.79
33 0.76
34 0.77
35 0.76
36 0.78
37 0.78
38 0.78
39 0.76
40 0.75
41 0.75
42 0.73
43 0.65
44 0.55
45 0.45
46 0.37
47 0.28
48 0.2
49 0.13
50 0.08
51 0.07
52 0.08
53 0.08
54 0.11
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.17
59 0.19
60 0.19
61 0.23
62 0.25
63 0.29
64 0.31
65 0.37
66 0.41
67 0.44
68 0.45
69 0.45
70 0.47
71 0.47
72 0.46
73 0.47
74 0.49
75 0.44
76 0.44
77 0.45
78 0.39
79 0.37
80 0.39
81 0.34
82 0.32
83 0.38
84 0.42
85 0.37
86 0.39
87 0.37
88 0.36
89 0.35
90 0.33
91 0.29
92 0.25
93 0.25
94 0.25
95 0.23
96 0.22
97 0.22
98 0.23
99 0.23
100 0.24
101 0.24
102 0.28
103 0.3
104 0.36
105 0.44
106 0.43
107 0.4
108 0.38
109 0.36
110 0.3
111 0.3
112 0.21
113 0.12
114 0.09
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.15
124 0.17
125 0.2
126 0.21
127 0.2
128 0.2
129 0.2
130 0.21
131 0.16
132 0.14
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.13
145 0.16
146 0.17
147 0.24
148 0.27
149 0.27
150 0.27
151 0.28
152 0.29
153 0.27
154 0.27
155 0.19
156 0.19
157 0.18
158 0.16
159 0.15
160 0.11
161 0.12
162 0.11
163 0.1
164 0.07
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.02
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.02
190 0.02
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.1
211 0.12
212 0.13
213 0.13
214 0.14
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.11
220 0.11
221 0.13
222 0.12
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.11
227 0.09
228 0.1
229 0.07
230 0.08
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.14
235 0.15
236 0.14
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.14
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.06
252 0.05
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.08
261 0.07
262 0.08
263 0.08
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.12
268 0.12
269 0.18
270 0.2
271 0.22
272 0.2
273 0.21
274 0.22
275 0.23
276 0.22
277 0.19
278 0.16
279 0.14
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.1
284 0.09
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.03
306 0.03
307 0.04
308 0.03
309 0.04
310 0.03
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.08
345 0.09
346 0.08
347 0.09
348 0.12
349 0.13
350 0.15
351 0.18
352 0.18
353 0.19
354 0.21
355 0.2
356 0.19
357 0.21
358 0.2
359 0.18
360 0.18
361 0.17
362 0.15
363 0.14
364 0.16
365 0.17
366 0.19
367 0.23
368 0.23
369 0.25
370 0.33
371 0.33
372 0.31
373 0.29
374 0.3
375 0.3
376 0.3
377 0.3
378 0.22
379 0.22
380 0.21
381 0.19
382 0.17
383 0.12
384 0.1
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.18
393 0.21
394 0.22
395 0.26
396 0.28
397 0.32
398 0.39
399 0.41
400 0.4
401 0.39
402 0.36
403 0.33
404 0.3
405 0.27
406 0.22
407 0.21
408 0.19
409 0.2
410 0.2
411 0.19
412 0.18
413 0.18
414 0.15
415 0.13
416 0.1
417 0.08
418 0.07
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.1
425 0.12
426 0.17
427 0.17
428 0.22
429 0.25
430 0.32
431 0.33
432 0.32
433 0.31
434 0.26
435 0.3
436 0.26
437 0.23
438 0.17
439 0.18
440 0.19
441 0.19
442 0.19
443 0.16
444 0.17
445 0.16
446 0.15
447 0.14
448 0.14
449 0.13
450 0.13
451 0.1
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.07