Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LFB3

Protein Details
Accession A0A517LFB3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-124ATKVVKKKPATKARAKTPAKKKTAAKPAAKTKSKAKSKTKAPAAKKKAPARKAVKKKKVVAKPKKKVPSEAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
58-135VKKKPATKARAKTPAKKKTAAKPAAKTKSKAKSKTKAPAAKKKAPARKAVKKKKVVAKPKKKVPSEAQKLKASNAKAK
243-262TRKGMKGLIKKIKDERQPKR
Subcellular Location(s) mito 22, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR044601  HMGB6/HMGB13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MLRCNALTRVAAGAVQASSNKHVAHLTRTLNHLSLSSKLAPVSVCSNPLARTFATKVVKKKPATKARAKTPAKKKTAAKPAAKTKSKAKSKTKAPAAKKKAPARKAVKKKKVVAKPKKKVPSEAQKLKASNAKAKAEITNLKKTALIGTAPKFLPDSAWTVFVAEKATGSSSARDRMKDASAEYKALSAPELEHYNHIANQNKTANEKAYSAWVNSHTPEQIRVANAARNLLKRRLAAGAYSTRKGMKGLIKKIKDERQPKRPMSAYLAFSMDRRASGDFKNITLLESAKLITDEWKALSPAETKKYTDLQEANKARYAREYQTIYGHPAPKVSTAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.16
6 0.19
7 0.18
8 0.18
9 0.22
10 0.23
11 0.27
12 0.33
13 0.35
14 0.35
15 0.39
16 0.41
17 0.38
18 0.36
19 0.32
20 0.26
21 0.24
22 0.25
23 0.23
24 0.21
25 0.2
26 0.21
27 0.19
28 0.2
29 0.22
30 0.19
31 0.19
32 0.19
33 0.22
34 0.22
35 0.24
36 0.24
37 0.2
38 0.23
39 0.24
40 0.31
41 0.36
42 0.4
43 0.45
44 0.52
45 0.61
46 0.6
47 0.67
48 0.7
49 0.73
50 0.76
51 0.79
52 0.78
53 0.8
54 0.85
55 0.84
56 0.83
57 0.83
58 0.84
59 0.8
60 0.79
61 0.76
62 0.75
63 0.79
64 0.78
65 0.75
66 0.74
67 0.78
68 0.8
69 0.79
70 0.72
71 0.71
72 0.72
73 0.73
74 0.74
75 0.73
76 0.72
77 0.76
78 0.82
79 0.83
80 0.82
81 0.82
82 0.83
83 0.83
84 0.82
85 0.82
86 0.81
87 0.81
88 0.77
89 0.77
90 0.77
91 0.78
92 0.81
93 0.83
94 0.83
95 0.83
96 0.86
97 0.85
98 0.85
99 0.86
100 0.86
101 0.86
102 0.86
103 0.87
104 0.87
105 0.81
106 0.78
107 0.76
108 0.76
109 0.75
110 0.74
111 0.71
112 0.67
113 0.65
114 0.61
115 0.56
116 0.48
117 0.44
118 0.41
119 0.37
120 0.33
121 0.34
122 0.32
123 0.32
124 0.36
125 0.34
126 0.35
127 0.34
128 0.33
129 0.31
130 0.3
131 0.27
132 0.21
133 0.17
134 0.14
135 0.15
136 0.19
137 0.18
138 0.18
139 0.17
140 0.16
141 0.15
142 0.13
143 0.14
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.11
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.16
160 0.17
161 0.17
162 0.18
163 0.2
164 0.21
165 0.2
166 0.2
167 0.2
168 0.2
169 0.2
170 0.19
171 0.17
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.13
182 0.14
183 0.16
184 0.19
185 0.23
186 0.21
187 0.26
188 0.28
189 0.28
190 0.29
191 0.28
192 0.27
193 0.22
194 0.23
195 0.18
196 0.19
197 0.19
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.2
204 0.17
205 0.16
206 0.17
207 0.18
208 0.17
209 0.16
210 0.18
211 0.18
212 0.19
213 0.19
214 0.21
215 0.22
216 0.25
217 0.29
218 0.31
219 0.32
220 0.3
221 0.32
222 0.31
223 0.28
224 0.24
225 0.25
226 0.29
227 0.3
228 0.3
229 0.29
230 0.27
231 0.27
232 0.27
233 0.27
234 0.27
235 0.32
236 0.41
237 0.49
238 0.51
239 0.57
240 0.65
241 0.68
242 0.69
243 0.7
244 0.7
245 0.71
246 0.78
247 0.75
248 0.75
249 0.7
250 0.64
251 0.61
252 0.58
253 0.5
254 0.42
255 0.41
256 0.34
257 0.31
258 0.31
259 0.24
260 0.18
261 0.17
262 0.17
263 0.18
264 0.2
265 0.28
266 0.25
267 0.25
268 0.29
269 0.28
270 0.26
271 0.24
272 0.23
273 0.16
274 0.15
275 0.15
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.17
284 0.17
285 0.17
286 0.2
287 0.22
288 0.27
289 0.32
290 0.33
291 0.33
292 0.37
293 0.42
294 0.42
295 0.44
296 0.44
297 0.43
298 0.51
299 0.55
300 0.54
301 0.54
302 0.51
303 0.44
304 0.45
305 0.45
306 0.39
307 0.42
308 0.43
309 0.4
310 0.46
311 0.47
312 0.46
313 0.48
314 0.48
315 0.4
316 0.38
317 0.38
318 0.34