Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LPL0

Protein Details
Accession A0A517LPL0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
422-448ADKEAEKKRLERRKKRDKERQNSVISDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
427-440EKKRLERRKKRDKE
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 9, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MASPPGPGPQRTHPIQTSGIALPPAKRQRLSPGPSPLSAPTNYGQASPTYTGSAPFANAPYASSPSAPGQYMTQPPYDNHLYSFNQPSPVQPPHQQQHMDGLSRNVTGAMGPPEKPKAEKATDINDLNDMVTASGIDLREEENYLAATYRNRHAETSFVSQSNSTLSANTSFNQWSQESYGNHPGFQSHGPLSQPAVSQKSLEEIQREKHRLEVHNYNARKQKHLNDPFLQTGCVRERLERKTLEYQVRLDSKGFYEQAPPKPPPQNPQNLHASTMTGVNGTGIIVAKASGMLEQGAPLVDLLSLLSLAANERLRGLLEDAHAISRARQFGSQGVVPPEWADIAEGRGKPQQTEARSQSIMRTAWDQVPDSAVSPKTVLPSTLDSTDPTRMPTPPQEPEQAPKPTIAFSSSLPTQLRSIADADKEAEKKRLERRKKRDKERQNSVISDTASPMTATAVGPGTPGMETAVKITKKQAAKESKQTVTDEAQRKQANQTAAMALGGMGKKYSWMTAAAPKPAGGLQAGVGLGRGAGTPGSSKSGNGSAPAQPQEDVGLRSRGYYKKLGSWREDGPTGRGIQIRDWITVLERDGIEKKSLAKSYARLSSGDKER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.5
3 0.46
4 0.42
5 0.35
6 0.34
7 0.29
8 0.28
9 0.26
10 0.33
11 0.4
12 0.41
13 0.41
14 0.41
15 0.49
16 0.57
17 0.61
18 0.6
19 0.61
20 0.6
21 0.6
22 0.6
23 0.53
24 0.47
25 0.42
26 0.37
27 0.27
28 0.28
29 0.28
30 0.26
31 0.23
32 0.2
33 0.23
34 0.22
35 0.22
36 0.19
37 0.19
38 0.19
39 0.2
40 0.19
41 0.16
42 0.16
43 0.16
44 0.15
45 0.15
46 0.15
47 0.16
48 0.18
49 0.18
50 0.17
51 0.18
52 0.19
53 0.22
54 0.21
55 0.19
56 0.19
57 0.23
58 0.29
59 0.29
60 0.29
61 0.29
62 0.29
63 0.35
64 0.37
65 0.32
66 0.28
67 0.31
68 0.3
69 0.34
70 0.4
71 0.35
72 0.35
73 0.35
74 0.36
75 0.37
76 0.4
77 0.39
78 0.4
79 0.47
80 0.47
81 0.55
82 0.53
83 0.47
84 0.51
85 0.51
86 0.46
87 0.38
88 0.36
89 0.31
90 0.29
91 0.28
92 0.19
93 0.14
94 0.12
95 0.13
96 0.16
97 0.17
98 0.18
99 0.22
100 0.26
101 0.28
102 0.29
103 0.31
104 0.33
105 0.34
106 0.39
107 0.4
108 0.42
109 0.47
110 0.47
111 0.43
112 0.36
113 0.32
114 0.26
115 0.22
116 0.16
117 0.09
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.11
135 0.14
136 0.19
137 0.23
138 0.24
139 0.26
140 0.26
141 0.28
142 0.3
143 0.34
144 0.32
145 0.28
146 0.27
147 0.26
148 0.26
149 0.24
150 0.21
151 0.14
152 0.11
153 0.11
154 0.14
155 0.15
156 0.15
157 0.16
158 0.15
159 0.15
160 0.18
161 0.17
162 0.15
163 0.17
164 0.23
165 0.22
166 0.26
167 0.35
168 0.32
169 0.32
170 0.31
171 0.28
172 0.25
173 0.24
174 0.22
175 0.14
176 0.16
177 0.16
178 0.17
179 0.18
180 0.17
181 0.18
182 0.18
183 0.2
184 0.18
185 0.18
186 0.17
187 0.19
188 0.19
189 0.2
190 0.21
191 0.2
192 0.26
193 0.34
194 0.37
195 0.34
196 0.37
197 0.41
198 0.41
199 0.45
200 0.46
201 0.45
202 0.52
203 0.52
204 0.54
205 0.55
206 0.52
207 0.51
208 0.47
209 0.48
210 0.5
211 0.58
212 0.58
213 0.55
214 0.58
215 0.56
216 0.52
217 0.44
218 0.33
219 0.29
220 0.24
221 0.25
222 0.22
223 0.23
224 0.29
225 0.32
226 0.38
227 0.36
228 0.38
229 0.41
230 0.47
231 0.48
232 0.43
233 0.41
234 0.41
235 0.41
236 0.38
237 0.31
238 0.25
239 0.21
240 0.22
241 0.21
242 0.16
243 0.2
244 0.26
245 0.31
246 0.35
247 0.36
248 0.38
249 0.44
250 0.46
251 0.46
252 0.47
253 0.51
254 0.48
255 0.51
256 0.53
257 0.47
258 0.46
259 0.39
260 0.32
261 0.23
262 0.21
263 0.17
264 0.08
265 0.08
266 0.06
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.04
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.03
278 0.03
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.02
292 0.02
293 0.02
294 0.02
295 0.03
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.08
304 0.07
305 0.07
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.1
312 0.11
313 0.12
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.13
318 0.16
319 0.15
320 0.15
321 0.16
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.12
326 0.09
327 0.08
328 0.07
329 0.04
330 0.06
331 0.1
332 0.1
333 0.12
334 0.15
335 0.15
336 0.15
337 0.2
338 0.25
339 0.23
340 0.31
341 0.33
342 0.34
343 0.35
344 0.35
345 0.31
346 0.3
347 0.27
348 0.2
349 0.19
350 0.17
351 0.19
352 0.2
353 0.19
354 0.15
355 0.16
356 0.15
357 0.14
358 0.15
359 0.13
360 0.11
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.13
366 0.12
367 0.15
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.16
372 0.18
373 0.2
374 0.19
375 0.18
376 0.17
377 0.17
378 0.19
379 0.25
380 0.28
381 0.28
382 0.31
383 0.34
384 0.34
385 0.37
386 0.41
387 0.38
388 0.34
389 0.31
390 0.29
391 0.25
392 0.24
393 0.21
394 0.15
395 0.12
396 0.16
397 0.16
398 0.19
399 0.19
400 0.19
401 0.18
402 0.19
403 0.19
404 0.16
405 0.17
406 0.16
407 0.16
408 0.16
409 0.17
410 0.19
411 0.22
412 0.22
413 0.26
414 0.26
415 0.32
416 0.41
417 0.5
418 0.56
419 0.64
420 0.73
421 0.79
422 0.87
423 0.92
424 0.93
425 0.94
426 0.93
427 0.93
428 0.91
429 0.86
430 0.78
431 0.7
432 0.63
433 0.53
434 0.43
435 0.34
436 0.25
437 0.19
438 0.17
439 0.13
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.06
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.1
455 0.17
456 0.17
457 0.18
458 0.22
459 0.28
460 0.31
461 0.35
462 0.42
463 0.46
464 0.52
465 0.61
466 0.65
467 0.62
468 0.62
469 0.59
470 0.53
471 0.48
472 0.5
473 0.48
474 0.43
475 0.46
476 0.45
477 0.44
478 0.46
479 0.46
480 0.39
481 0.33
482 0.33
483 0.26
484 0.25
485 0.23
486 0.18
487 0.12
488 0.13
489 0.12
490 0.09
491 0.08
492 0.08
493 0.1
494 0.11
495 0.11
496 0.09
497 0.11
498 0.14
499 0.23
500 0.27
501 0.29
502 0.29
503 0.28
504 0.28
505 0.27
506 0.25
507 0.16
508 0.13
509 0.09
510 0.11
511 0.11
512 0.09
513 0.09
514 0.07
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.04
519 0.04
520 0.05
521 0.07
522 0.09
523 0.13
524 0.13
525 0.13
526 0.16
527 0.21
528 0.21
529 0.21
530 0.23
531 0.24
532 0.3
533 0.33
534 0.31
535 0.27
536 0.26
537 0.27
538 0.27
539 0.24
540 0.22
541 0.23
542 0.22
543 0.24
544 0.3
545 0.31
546 0.33
547 0.38
548 0.38
549 0.43
550 0.52
551 0.57
552 0.56
553 0.57
554 0.57
555 0.55
556 0.57
557 0.5
558 0.45
559 0.42
560 0.38
561 0.37
562 0.35
563 0.31
564 0.29
565 0.35
566 0.33
567 0.3
568 0.28
569 0.25
570 0.25
571 0.26
572 0.25
573 0.22
574 0.19
575 0.22
576 0.26
577 0.27
578 0.27
579 0.27
580 0.3
581 0.33
582 0.36
583 0.36
584 0.37
585 0.4
586 0.45
587 0.51
588 0.47
589 0.42
590 0.43