Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LEC3

Protein Details
Accession A0A517LEC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
152-184EKVHTMHMEEQKKKKRRDKEKNKKLSKYGFEGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-176KKKKRRDKEKNKKL
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034104  Lsm1  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR044642  PTHR15588  
Gene Ontology GO:0000932  C:P-body  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000956  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process  
CDD cd01728  LSm1  
Amino Acid Sequences MQNPSLQDLPEGPQPGMQQPLQMGPMPIAQLPPQMFTTAAQLLDLTDKKLMVALRDGKTLFGVLRSWDQFGIFPLLLHVSDSSLKIPSLLTTHDPGNLMTQDTIERIYCKNVFCDIPRGIFVIRGENVEMIGEIDLDKEDDIPPGYTKEDPEKVHTMHMEEQKKKKRRDKEKNKKLSKYGFEGDLDLAAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.28
4 0.25
5 0.21
6 0.2
7 0.23
8 0.22
9 0.21
10 0.19
11 0.15
12 0.17
13 0.16
14 0.15
15 0.14
16 0.13
17 0.17
18 0.17
19 0.18
20 0.17
21 0.17
22 0.16
23 0.16
24 0.19
25 0.16
26 0.15
27 0.13
28 0.12
29 0.11
30 0.16
31 0.16
32 0.13
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.14
37 0.15
38 0.11
39 0.17
40 0.23
41 0.24
42 0.27
43 0.27
44 0.24
45 0.24
46 0.24
47 0.17
48 0.11
49 0.1
50 0.09
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.14
55 0.14
56 0.13
57 0.14
58 0.16
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.1
63 0.09
64 0.1
65 0.08
66 0.06
67 0.07
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.1
79 0.11
80 0.12
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.11
85 0.1
86 0.08
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.12
95 0.14
96 0.14
97 0.15
98 0.17
99 0.18
100 0.18
101 0.24
102 0.21
103 0.2
104 0.2
105 0.2
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.16
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.13
114 0.13
115 0.11
116 0.1
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.07
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.14
133 0.14
134 0.16
135 0.22
136 0.27
137 0.28
138 0.33
139 0.37
140 0.35
141 0.39
142 0.38
143 0.35
144 0.36
145 0.43
146 0.46
147 0.49
148 0.58
149 0.64
150 0.72
151 0.78
152 0.8
153 0.82
154 0.85
155 0.88
156 0.9
157 0.91
158 0.93
159 0.94
160 0.96
161 0.94
162 0.92
163 0.9
164 0.85
165 0.82
166 0.75
167 0.68
168 0.58
169 0.51
170 0.42