Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LQQ9

Protein Details
Accession A0A517LQQ9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-65LAPSTRKKTAPSSKPKKKAAPRVKEEVVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-60RKKTAPSSKPKKKAAPRVK
Subcellular Location(s) cyto 10, mito 6, pero 6, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006974  P:DNA damage response  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
Amino Acid Sequences MPPKQALSDYERKRQETIAKNQALLRNLALDAAQTGLAPSTRKKTAPSSKPKKKAAPRVKEEVVPLRTSSRLKGIVADSEVHKRKAEDESAALQQAEQFKRQRVSGDLNVSDILVSGKGWNAIGGVGPAVPYERTFTAQDVKETTDKELRALRERMSGLQLWQDVEPNRIKMTPERIYSMAFHPTAEKALVFAGDKKGNLGIFDSSQTTTVKAEDDEDEDSFEAAITTLKPHTGAIAAFQFSQTDPNAVFMASHDSSIRRLDLAKGVAVEVYAPADSKSDEGLTGLQINPQDPNILYFTSLYGTFGIHDIREGKAPTQTFELSEKKIGGFTLHPAYPHFIVTASLDRYMRLWDLRKISGKAGEKMPALVGEHLSRLSVSHAAFNGAGQVATSSYDDTIKVYDFSECKSWPAGHQVQEEEMEPKTVIKHNNQTGRWVTILRPQWHERPSDGIQKLCIGNMNRFVDIYTSKGEQLAQLGGEGITAVPAVAQFHPTNDWVAAGSASGKLCFWQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.61
3 0.61
4 0.64
5 0.65
6 0.61
7 0.61
8 0.64
9 0.63
10 0.55
11 0.47
12 0.38
13 0.3
14 0.27
15 0.24
16 0.19
17 0.14
18 0.12
19 0.11
20 0.1
21 0.07
22 0.07
23 0.08
24 0.09
25 0.11
26 0.15
27 0.21
28 0.25
29 0.27
30 0.31
31 0.41
32 0.5
33 0.58
34 0.66
35 0.71
36 0.77
37 0.85
38 0.9
39 0.9
40 0.9
41 0.9
42 0.9
43 0.89
44 0.86
45 0.85
46 0.8
47 0.73
48 0.69
49 0.67
50 0.59
51 0.5
52 0.44
53 0.38
54 0.39
55 0.37
56 0.34
57 0.31
58 0.31
59 0.29
60 0.32
61 0.31
62 0.31
63 0.3
64 0.31
65 0.27
66 0.34
67 0.38
68 0.35
69 0.34
70 0.31
71 0.32
72 0.36
73 0.37
74 0.3
75 0.3
76 0.32
77 0.33
78 0.34
79 0.3
80 0.23
81 0.23
82 0.27
83 0.26
84 0.28
85 0.29
86 0.34
87 0.37
88 0.38
89 0.38
90 0.35
91 0.4
92 0.41
93 0.44
94 0.39
95 0.37
96 0.36
97 0.33
98 0.28
99 0.2
100 0.14
101 0.07
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.06
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.09
120 0.1
121 0.13
122 0.14
123 0.16
124 0.23
125 0.24
126 0.25
127 0.24
128 0.26
129 0.27
130 0.27
131 0.29
132 0.27
133 0.25
134 0.26
135 0.29
136 0.3
137 0.34
138 0.35
139 0.33
140 0.33
141 0.34
142 0.33
143 0.31
144 0.29
145 0.22
146 0.23
147 0.23
148 0.18
149 0.17
150 0.2
151 0.17
152 0.21
153 0.22
154 0.2
155 0.2
156 0.2
157 0.21
158 0.22
159 0.29
160 0.31
161 0.3
162 0.32
163 0.32
164 0.32
165 0.33
166 0.3
167 0.27
168 0.21
169 0.19
170 0.17
171 0.17
172 0.17
173 0.15
174 0.12
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.14
184 0.16
185 0.15
186 0.14
187 0.14
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.1
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.1
201 0.09
202 0.11
203 0.12
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.08
210 0.06
211 0.04
212 0.05
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.08
229 0.1
230 0.08
231 0.08
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.06
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.1
254 0.1
255 0.09
256 0.08
257 0.05
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.05
264 0.05
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.06
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.16
302 0.16
303 0.16
304 0.18
305 0.18
306 0.17
307 0.21
308 0.24
309 0.21
310 0.23
311 0.22
312 0.19
313 0.19
314 0.18
315 0.14
316 0.12
317 0.13
318 0.16
319 0.16
320 0.16
321 0.17
322 0.19
323 0.18
324 0.18
325 0.14
326 0.1
327 0.1
328 0.12
329 0.15
330 0.13
331 0.15
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.16
336 0.16
337 0.16
338 0.19
339 0.22
340 0.26
341 0.31
342 0.36
343 0.36
344 0.37
345 0.4
346 0.41
347 0.4
348 0.38
349 0.37
350 0.32
351 0.31
352 0.29
353 0.22
354 0.19
355 0.16
356 0.15
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.1
362 0.09
363 0.1
364 0.12
365 0.12
366 0.13
367 0.14
368 0.15
369 0.15
370 0.15
371 0.14
372 0.11
373 0.1
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.07
378 0.08
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.14
389 0.14
390 0.16
391 0.2
392 0.19
393 0.2
394 0.23
395 0.23
396 0.21
397 0.3
398 0.33
399 0.34
400 0.37
401 0.36
402 0.35
403 0.35
404 0.34
405 0.27
406 0.21
407 0.17
408 0.14
409 0.13
410 0.15
411 0.19
412 0.24
413 0.3
414 0.39
415 0.46
416 0.54
417 0.54
418 0.58
419 0.56
420 0.53
421 0.47
422 0.4
423 0.33
424 0.32
425 0.41
426 0.39
427 0.42
428 0.45
429 0.5
430 0.53
431 0.54
432 0.48
433 0.46
434 0.47
435 0.5
436 0.48
437 0.42
438 0.39
439 0.41
440 0.39
441 0.33
442 0.34
443 0.27
444 0.29
445 0.36
446 0.37
447 0.33
448 0.32
449 0.32
450 0.29
451 0.28
452 0.25
453 0.2
454 0.19
455 0.19
456 0.2
457 0.2
458 0.18
459 0.19
460 0.18
461 0.14
462 0.12
463 0.13
464 0.11
465 0.1
466 0.09
467 0.07
468 0.05
469 0.05
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.07
474 0.08
475 0.13
476 0.13
477 0.15
478 0.18
479 0.19
480 0.21
481 0.19
482 0.19
483 0.15
484 0.15
485 0.13
486 0.11
487 0.11
488 0.12
489 0.13
490 0.13