Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LH99

Protein Details
Accession A0A517LH99    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
560-579QKEWDEYKRQGGKRRKLDLSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
571-574GKRR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 9.5, cyto_mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR027079  Tfb1/GTF2H1  
IPR013876  TFIIH_BTF_p62_N  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF08567  PH_TFIIH  
CDD cd13229  PH_TFIIH  
Amino Acid Sequences MELHNRIQNIAKQRVAREFIITTVIMSGSVRVAASYLKKPGTLEISADRKTLSWRPAGSTTAALTIVTESIDNLKQTPVTAPKAILNVVVKAKDGTLGDNKLTFTSPNARSDLTSILDPLKEVIAARGAEVAAALLKANASTRNGSKPPAAELDDASLIADRGLQKEVLEENPAIGELFASAIKDAPDKAAFDKNFWAARIGLLRAKQIAKNQHQGETNVLSEIKPSVGVDGKPSLKMSTEQRDTIFNQHPLVETVFKELVEKTKQYTEIEFWQNFWVSHLVKKLKGEKITDLDPEIPMIDKFALNFDEKANLPKRMEMAHTPRFLDLDGNDQDFSQQKGNAPDWTMKPNFHGKVQLLHILNNTSERLMYNVAASDTAAHGPVGMDEDTFNELQLRDLERAAKDNRIMLNVNTQKQLTAAEINGNAMAQKENRTKALKALQADMRVQVELPTELEEDDEVQAQHATKDILKSVKLRATSSMSGLSLEPKLDPAMSDSVRMTHSTTVEFLRYFWTTYFSGDDRKAHELQQWSKAVTDSLGRIEAIADKAEEKRKLEVANKQKEWDEYKRQGGKRRKLDLSTVSGGRKAVEDMMAPTRRAVLKASGDYARVYSEQLAQAARQGPPVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.57
3 0.52
4 0.48
5 0.41
6 0.37
7 0.35
8 0.3
9 0.22
10 0.18
11 0.17
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.08
16 0.09
17 0.08
18 0.07
19 0.08
20 0.12
21 0.17
22 0.21
23 0.27
24 0.27
25 0.29
26 0.29
27 0.34
28 0.35
29 0.31
30 0.3
31 0.32
32 0.38
33 0.38
34 0.38
35 0.34
36 0.29
37 0.34
38 0.37
39 0.33
40 0.33
41 0.34
42 0.38
43 0.41
44 0.43
45 0.39
46 0.34
47 0.3
48 0.25
49 0.23
50 0.18
51 0.15
52 0.13
53 0.11
54 0.09
55 0.08
56 0.07
57 0.1
58 0.13
59 0.13
60 0.13
61 0.14
62 0.15
63 0.16
64 0.21
65 0.24
66 0.26
67 0.28
68 0.28
69 0.3
70 0.32
71 0.31
72 0.29
73 0.24
74 0.24
75 0.26
76 0.25
77 0.23
78 0.21
79 0.21
80 0.2
81 0.19
82 0.19
83 0.21
84 0.24
85 0.24
86 0.26
87 0.26
88 0.24
89 0.24
90 0.2
91 0.18
92 0.24
93 0.27
94 0.29
95 0.31
96 0.3
97 0.3
98 0.32
99 0.31
100 0.23
101 0.2
102 0.18
103 0.17
104 0.16
105 0.16
106 0.14
107 0.12
108 0.1
109 0.1
110 0.09
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.04
123 0.04
124 0.05
125 0.06
126 0.09
127 0.11
128 0.14
129 0.18
130 0.25
131 0.27
132 0.29
133 0.31
134 0.29
135 0.31
136 0.31
137 0.31
138 0.25
139 0.24
140 0.24
141 0.21
142 0.2
143 0.17
144 0.12
145 0.09
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.11
151 0.11
152 0.1
153 0.13
154 0.15
155 0.14
156 0.15
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.1
162 0.08
163 0.06
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.15
177 0.22
178 0.22
179 0.23
180 0.26
181 0.27
182 0.28
183 0.27
184 0.26
185 0.18
186 0.19
187 0.2
188 0.19
189 0.18
190 0.17
191 0.18
192 0.2
193 0.22
194 0.23
195 0.26
196 0.34
197 0.37
198 0.45
199 0.46
200 0.47
201 0.47
202 0.45
203 0.43
204 0.36
205 0.3
206 0.22
207 0.2
208 0.15
209 0.13
210 0.13
211 0.09
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.12
218 0.16
219 0.17
220 0.18
221 0.19
222 0.17
223 0.16
224 0.19
225 0.22
226 0.26
227 0.28
228 0.29
229 0.29
230 0.32
231 0.33
232 0.37
233 0.36
234 0.29
235 0.27
236 0.26
237 0.25
238 0.23
239 0.23
240 0.18
241 0.13
242 0.15
243 0.14
244 0.13
245 0.14
246 0.13
247 0.17
248 0.18
249 0.18
250 0.17
251 0.2
252 0.22
253 0.22
254 0.23
255 0.21
256 0.24
257 0.3
258 0.27
259 0.25
260 0.25
261 0.25
262 0.23
263 0.22
264 0.19
265 0.13
266 0.16
267 0.21
268 0.21
269 0.22
270 0.27
271 0.32
272 0.34
273 0.37
274 0.36
275 0.34
276 0.34
277 0.35
278 0.31
279 0.26
280 0.22
281 0.18
282 0.16
283 0.12
284 0.1
285 0.07
286 0.07
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.09
295 0.11
296 0.11
297 0.17
298 0.19
299 0.2
300 0.2
301 0.2
302 0.21
303 0.2
304 0.22
305 0.22
306 0.27
307 0.3
308 0.31
309 0.31
310 0.3
311 0.28
312 0.27
313 0.22
314 0.15
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.15
321 0.14
322 0.16
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.16
327 0.18
328 0.18
329 0.19
330 0.21
331 0.21
332 0.26
333 0.25
334 0.22
335 0.24
336 0.3
337 0.29
338 0.27
339 0.29
340 0.24
341 0.27
342 0.28
343 0.31
344 0.24
345 0.24
346 0.24
347 0.2
348 0.2
349 0.17
350 0.16
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.12
382 0.13
383 0.12
384 0.13
385 0.16
386 0.15
387 0.2
388 0.21
389 0.22
390 0.21
391 0.24
392 0.24
393 0.24
394 0.25
395 0.2
396 0.28
397 0.31
398 0.32
399 0.3
400 0.29
401 0.26
402 0.25
403 0.25
404 0.17
405 0.13
406 0.11
407 0.12
408 0.12
409 0.12
410 0.12
411 0.11
412 0.09
413 0.08
414 0.09
415 0.08
416 0.15
417 0.2
418 0.22
419 0.27
420 0.31
421 0.31
422 0.35
423 0.41
424 0.39
425 0.35
426 0.39
427 0.37
428 0.37
429 0.37
430 0.33
431 0.26
432 0.22
433 0.21
434 0.16
435 0.14
436 0.11
437 0.11
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.09
452 0.1
453 0.1
454 0.12
455 0.15
456 0.17
457 0.19
458 0.22
459 0.26
460 0.29
461 0.3
462 0.29
463 0.3
464 0.33
465 0.32
466 0.31
467 0.28
468 0.24
469 0.23
470 0.22
471 0.2
472 0.15
473 0.14
474 0.12
475 0.11
476 0.12
477 0.11
478 0.1
479 0.11
480 0.16
481 0.16
482 0.18
483 0.17
484 0.18
485 0.2
486 0.2
487 0.19
488 0.16
489 0.17
490 0.17
491 0.18
492 0.18
493 0.2
494 0.19
495 0.17
496 0.18
497 0.18
498 0.18
499 0.16
500 0.19
501 0.17
502 0.18
503 0.22
504 0.19
505 0.24
506 0.26
507 0.29
508 0.29
509 0.34
510 0.34
511 0.32
512 0.36
513 0.39
514 0.41
515 0.46
516 0.45
517 0.4
518 0.4
519 0.38
520 0.33
521 0.26
522 0.24
523 0.17
524 0.16
525 0.17
526 0.15
527 0.15
528 0.15
529 0.17
530 0.15
531 0.14
532 0.12
533 0.13
534 0.19
535 0.27
536 0.3
537 0.29
538 0.32
539 0.35
540 0.41
541 0.45
542 0.5
543 0.53
544 0.6
545 0.61
546 0.6
547 0.59
548 0.59
549 0.6
550 0.59
551 0.59
552 0.55
553 0.63
554 0.69
555 0.72
556 0.76
557 0.79
558 0.8
559 0.8
560 0.82
561 0.79
562 0.74
563 0.76
564 0.73
565 0.7
566 0.65
567 0.6
568 0.53
569 0.47
570 0.43
571 0.36
572 0.3
573 0.24
574 0.2
575 0.16
576 0.16
577 0.18
578 0.26
579 0.29
580 0.28
581 0.27
582 0.31
583 0.31
584 0.31
585 0.3
586 0.28
587 0.32
588 0.35
589 0.39
590 0.36
591 0.36
592 0.36
593 0.33
594 0.29
595 0.23
596 0.21
597 0.19
598 0.21
599 0.22
600 0.24
601 0.24
602 0.21
603 0.26
604 0.29
605 0.27