FuNGI

A0A517LFS0

Protein Details

Accession

A0A517LFS0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
168-188	RAPSKGRGKGRGKKSDKSDEA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
168-182	RAPSKGRGKGRGKKS
373-376	GRGG

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR006607 DM15 IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd07323 LAM

Amino Acid Sequences

MATNQKSSLGDGPAPAIPFSYAQAAKGIPSSHASAQSSRVASGAITPVTQAKDSSSPALKSELAPGANWADDVESSSKEKEKESHSSATTVVDPQQSPKSASPVIQAAQSQPNGAVSPPSPYFGSASTSTLAREDDAASGPVSSTDTAWESKSQESSVPEKRQISSDRAPSKGRGKGRGKKSDKSDEAETWSQPALPLHEAPLPTRNPWKIMPVVPKAAPMLARSSTVPMESSKETPVPGSTDTDASKSERNKSVSTTTTGNDGTRTNSNPRKEGEARVNPRREPRAGTKTTEKSTVDSQVSSITSPPIDQDSWPTPDTVAERVHDKTEKSQNIQAEAVPAPAPKGKSAWAKVDFTPTVVFNTPLPSASRRGGRGGSRGGRESAGRQPGTAGDKASTNPQSTMATGENASRGRSSTSPRSSSPAKGKRASSTETAVKREVPPRTLREVRPVDANVSAESRAHKPEEGSKANGISQEQRNGNSSRVKTTRRIDPPLTNGEKSKEGEEAGKDSESIVASRRASINSTLIENIDRRYSPPIDLMLGSRYPPSERKSGNYGSFSGRDRTEGGQRGGRGGSRGGSRGNGAHSYGQPGYTNGQIPGNPGYSPRSPTGHQQESYFGHQPTHSRNFRGTNRNQAIPQVLDTYRSYPSGYAASGLPQLNTFVGPPGVYDYSNMMAMSAAPYPQQPYADPMPLVSMVANQLEFYFSDQNIFGDVFLRRNMDSQGFILLSVIANFKRLRGLTNDLELIKYVCQQSPNIEHRLGQDGLDRLRLREGWEKFIYTMDQREPSARNDGPGALLMPPPATPQLYLTRDQQMRHTSLPLPNSSAAPMSAPPIPYQSLNGFAAAYGGFSAGGINDNHSQTSPISATNEAAPMVQPPSSQLTSPSVSQTGLANGTIEHEADSFPDGAVPNLRIVLRDQVSSAAAPPTGPQRTFSNGSLDGNNAAEDLGIPAVSSAASETRASQAPVDRMSAFRNQNARATSNGSTAEAPTSDPTQCVFWMKDQSSPSHVLAPGSESELYLVQHERALEVRRASDPLHCPHEMQVLYQFWSHFLIRNFNYKMYSEFRQLALEDLQERNLGGRKHLVKFYSEALKHKDQPVRLEVAKGFVDLVMDESTDPDRYAFEELQRVWRDGAMPLNNRKRTKQFVGPELDRKLS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.23
3	0.19
4	0.16
5	0.15
6	0.16
7	0.2
8	0.18
9	0.18
10	0.21
11	0.2
12	0.2
13	0.22
14	0.22
15	0.16
16	0.19
17	0.23
18	0.24
19	0.29
20	0.31
21	0.3
22	0.33
23	0.37
24	0.35
25	0.31
26	0.28
27	0.22
28	0.19
29	0.21
30	0.2
31	0.15
32	0.14
33	0.14
34	0.18
35	0.2
36	0.21
37	0.18
38	0.18
39	0.21
40	0.24
41	0.29
42	0.31
43	0.3
44	0.31
45	0.34
46	0.32
47	0.29
48	0.32
49	0.31
50	0.26
51	0.25
52	0.26
53	0.24
54	0.23
55	0.22
56	0.16
57	0.12
58	0.11
59	0.14
60	0.14
61	0.14
62	0.16
63	0.2
64	0.24
65	0.25
66	0.28
67	0.31
68	0.35
69	0.42
70	0.45
71	0.49
72	0.47
73	0.47
74	0.44
75	0.41
76	0.36
77	0.29
78	0.27
79	0.25
80	0.24
81	0.27
82	0.33
83	0.32
84	0.35
85	0.35
86	0.37
87	0.34
88	0.35
89	0.34
90	0.33
91	0.31
92	0.3
93	0.29
94	0.27
95	0.31
96	0.3
97	0.27
98	0.22
99	0.23
100	0.2
101	0.2
102	0.18
103	0.12
104	0.18
105	0.18
106	0.2
107	0.19
108	0.19
109	0.21
110	0.18
111	0.23
112	0.18
113	0.2
114	0.19
115	0.19
116	0.18
117	0.18
118	0.17
119	0.13
120	0.13
121	0.12
122	0.13
123	0.14
124	0.14
125	0.13
126	0.12
127	0.12
128	0.11
129	0.11
130	0.1
131	0.08
132	0.1
133	0.12
134	0.13
135	0.15
136	0.18
137	0.19
138	0.21
139	0.23
140	0.22
141	0.23
142	0.26
143	0.33
144	0.39
145	0.43
146	0.46
147	0.48
148	0.48
149	0.51
150	0.51
151	0.52
152	0.5
153	0.53
154	0.53
155	0.53
156	0.55
157	0.55
158	0.58
159	0.58
160	0.57
161	0.57
162	0.62
163	0.67
164	0.74
165	0.79
166	0.78
167	0.79
168	0.81
169	0.81
170	0.76
171	0.72
172	0.68
173	0.6
174	0.6
175	0.56
176	0.47
177	0.39
178	0.34
179	0.28
180	0.24
181	0.22
182	0.18
183	0.17
184	0.17
185	0.17
186	0.2
187	0.21
188	0.21
189	0.27
190	0.25
191	0.26
192	0.34
193	0.33
194	0.34
195	0.35
196	0.38
197	0.37
198	0.41
199	0.46
200	0.43
201	0.47
202	0.43
203	0.44
204	0.39
205	0.36
206	0.3
207	0.23
208	0.22
209	0.18
210	0.19
211	0.18
212	0.2
213	0.19
214	0.18
215	0.18
216	0.15
217	0.18
218	0.19
219	0.2
220	0.2
221	0.21
222	0.21
223	0.21
224	0.21
225	0.19
226	0.18
227	0.2
228	0.18
229	0.2
230	0.2
231	0.21
232	0.21
233	0.21
234	0.25
235	0.26
236	0.32
237	0.35
238	0.38
239	0.38
240	0.41
241	0.44
242	0.42
243	0.41
244	0.36
245	0.3
246	0.3
247	0.3
248	0.26
249	0.22
250	0.2
251	0.2
252	0.22
253	0.25
254	0.3
255	0.36
256	0.39
257	0.41
258	0.42
259	0.47
260	0.47
261	0.5
262	0.51
263	0.54
264	0.59
265	0.65
266	0.68
267	0.64
268	0.68
269	0.67
270	0.6
271	0.56
272	0.57
273	0.57
274	0.55
275	0.56
276	0.58
277	0.59
278	0.58
279	0.58
280	0.49
281	0.42
282	0.42
283	0.43
284	0.35
285	0.29
286	0.27
287	0.24
288	0.23
289	0.21
290	0.18
291	0.12
292	0.11
293	0.11
294	0.12
295	0.12
296	0.12
297	0.12
298	0.17
299	0.2
300	0.24
301	0.24
302	0.23
303	0.2
304	0.22
305	0.23
306	0.21
307	0.19
308	0.16
309	0.19
310	0.2
311	0.24
312	0.24
313	0.24
314	0.28
315	0.36
316	0.39
317	0.4
318	0.43
319	0.42
320	0.42
321	0.41
322	0.34
323	0.27
324	0.23
325	0.2
326	0.16
327	0.14
328	0.12
329	0.14
330	0.15
331	0.12
332	0.13
333	0.18
334	0.24
335	0.28
336	0.34
337	0.36
338	0.38
339	0.38
340	0.43
341	0.38
342	0.32
343	0.3
344	0.22
345	0.21
346	0.19
347	0.19
348	0.13
349	0.15
350	0.14
351	0.14
352	0.16
353	0.15
354	0.18
355	0.21
356	0.24
357	0.23
358	0.26
359	0.29
360	0.3
361	0.32
362	0.36
363	0.37
364	0.36
365	0.36
366	0.34
367	0.31
368	0.3
369	0.29
370	0.28
371	0.3
372	0.27
373	0.25
374	0.25
375	0.27
376	0.3
377	0.27
378	0.21
379	0.14
380	0.16
381	0.16
382	0.22
383	0.21
384	0.19
385	0.18
386	0.19
387	0.19
388	0.19
389	0.21
390	0.16
391	0.14
392	0.13
393	0.13
394	0.15
395	0.14
396	0.15
397	0.12
398	0.12
399	0.14
400	0.16
401	0.21
402	0.27
403	0.33
404	0.35
405	0.36
406	0.41
407	0.41
408	0.45
409	0.5
410	0.49
411	0.5
412	0.51
413	0.52
414	0.53
415	0.54
416	0.5
417	0.43
418	0.39
419	0.39
420	0.38
421	0.38
422	0.34
423	0.32
424	0.33
425	0.36
426	0.35
427	0.32
428	0.34
429	0.36
430	0.43
431	0.47
432	0.44
433	0.48
434	0.49
435	0.45
436	0.44
437	0.4
438	0.33
439	0.29
440	0.28
441	0.19
442	0.16
443	0.15
444	0.12
445	0.13
446	0.14
447	0.15
448	0.15
449	0.15
450	0.15
451	0.22
452	0.29
453	0.3
454	0.3
455	0.29
456	0.29
457	0.29
458	0.29
459	0.23
460	0.21
461	0.21
462	0.25
463	0.25
464	0.25
465	0.27
466	0.27
467	0.3
468	0.3
469	0.29
470	0.3
471	0.34
472	0.37
473	0.4
474	0.43
475	0.49
476	0.49
477	0.54
478	0.51
479	0.5
480	0.51
481	0.53
482	0.52
483	0.44
484	0.39
485	0.35
486	0.34
487	0.3
488	0.27
489	0.19
490	0.16
491	0.17
492	0.17
493	0.17
494	0.14
495	0.14
496	0.12
497	0.11
498	0.12
499	0.1
500	0.09
501	0.09
502	0.11
503	0.11
504	0.13
505	0.14
506	0.13
507	0.14
508	0.15
509	0.16
510	0.13
511	0.14
512	0.13
513	0.12
514	0.13
515	0.12
516	0.12
517	0.11
518	0.11
519	0.11
520	0.15
521	0.15
522	0.15
523	0.16
524	0.15
525	0.14
526	0.15
527	0.14
528	0.12
529	0.11
530	0.11
531	0.1
532	0.1
533	0.11
534	0.14
535	0.17
536	0.21
537	0.22
538	0.24
539	0.3
540	0.34
541	0.35
542	0.33
543	0.32
544	0.28
545	0.29
546	0.28
547	0.25
548	0.2
549	0.18
550	0.18
551	0.18
552	0.22
553	0.23
554	0.23
555	0.23
556	0.23
557	0.23
558	0.22
559	0.2
560	0.15
561	0.12
562	0.12
563	0.11
564	0.12
565	0.11
566	0.11
567	0.12
568	0.12
569	0.13
570	0.11
571	0.11
572	0.12
573	0.12
574	0.15
575	0.14
576	0.14
577	0.12
578	0.12
579	0.12
580	0.12
581	0.13
582	0.1
583	0.11
584	0.1
585	0.12
586	0.13
587	0.13
588	0.11
589	0.11
590	0.14
591	0.15
592	0.17
593	0.18
594	0.18
595	0.18
596	0.26
597	0.33
598	0.34
599	0.34
600	0.32
601	0.34
602	0.34
603	0.37
604	0.34
605	0.26
606	0.21
607	0.22
608	0.23
609	0.26
610	0.33
611	0.31
612	0.28
613	0.32
614	0.38
615	0.44
616	0.51
617	0.47
618	0.49
619	0.5
620	0.51
621	0.48
622	0.42
623	0.37
624	0.28
625	0.26
626	0.18
627	0.15
628	0.15
629	0.16
630	0.16
631	0.15
632	0.16
633	0.15
634	0.12
635	0.13
636	0.11
637	0.11
638	0.1
639	0.09
640	0.09
641	0.12
642	0.12
643	0.11
644	0.1
645	0.11
646	0.1
647	0.1
648	0.09
649	0.06
650	0.06
651	0.05
652	0.05
653	0.08
654	0.08
655	0.08
656	0.09
657	0.09
658	0.1
659	0.11
660	0.1
661	0.07
662	0.06
663	0.06
664	0.07
665	0.06
666	0.06
667	0.05
668	0.06
669	0.08
670	0.09
671	0.1
672	0.09
673	0.13
674	0.16
675	0.17
676	0.16
677	0.15
678	0.15
679	0.14
680	0.14
681	0.09
682	0.07
683	0.06
684	0.07
685	0.07
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.06
690	0.08
691	0.1
692	0.09
693	0.11
694	0.11
695	0.11
696	0.11
697	0.11
698	0.08
699	0.08
700	0.09
701	0.09
702	0.1
703	0.12
704	0.11
705	0.12
706	0.14
707	0.13
708	0.13
709	0.12
710	0.13
711	0.12
712	0.11
713	0.1
714	0.09
715	0.07
716	0.07
717	0.08
718	0.06
719	0.09
720	0.09
721	0.1
722	0.13
723	0.14
724	0.15
725	0.18
726	0.24
727	0.23
728	0.26
729	0.28
730	0.24
731	0.24
732	0.22
733	0.19
734	0.13
735	0.14
736	0.13
737	0.12
738	0.14
739	0.14
740	0.19
741	0.26
742	0.3
743	0.31
744	0.3
745	0.3
746	0.3
747	0.35
748	0.31
749	0.23
750	0.21
751	0.2
752	0.21
753	0.25
754	0.24
755	0.19
756	0.21
757	0.21
758	0.22
759	0.27
760	0.29
761	0.29
762	0.3
763	0.31
764	0.29
765	0.3
766	0.27
767	0.21
768	0.23
769	0.19
770	0.2
771	0.2
772	0.23
773	0.24
774	0.25
775	0.3
776	0.26
777	0.24
778	0.23
779	0.23
780	0.2
781	0.18
782	0.16
783	0.1
784	0.1
785	0.09
786	0.08
787	0.08
788	0.09
789	0.1
790	0.1
791	0.09
792	0.11
793	0.19
794	0.22
795	0.24
796	0.26
797	0.33
798	0.36
799	0.36
800	0.39
801	0.37
802	0.37
803	0.37
804	0.37
805	0.33
806	0.34
807	0.37
808	0.32
809	0.29
810	0.27
811	0.26
812	0.23
813	0.19
814	0.15
815	0.13
816	0.12
817	0.11
818	0.12
819	0.12
820	0.12
821	0.14
822	0.15
823	0.14
824	0.17
825	0.15
826	0.17
827	0.17
828	0.17
829	0.14
830	0.13
831	0.13
832	0.1
833	0.09
834	0.05
835	0.05
836	0.04
837	0.04
838	0.04
839	0.04
840	0.06
841	0.06
842	0.09
843	0.12
844	0.13
845	0.14
846	0.14
847	0.15
848	0.13
849	0.16
850	0.14
851	0.12
852	0.14
853	0.14
854	0.15
855	0.15
856	0.15
857	0.12
858	0.12
859	0.1
860	0.1
861	0.1
862	0.1
863	0.09
864	0.1
865	0.16
866	0.16
867	0.16
868	0.17
869	0.2
870	0.22
871	0.23
872	0.23
873	0.18
874	0.18
875	0.18
876	0.17
877	0.14
878	0.13
879	0.12
880	0.1
881	0.09
882	0.11
883	0.11
884	0.1
885	0.08
886	0.08
887	0.08
888	0.08
889	0.1
890	0.08
891	0.08
892	0.1
893	0.09
894	0.1
895	0.12
896	0.12
897	0.11
898	0.13
899	0.13
900	0.12
901	0.14
902	0.2
903	0.2
904	0.19
905	0.19
906	0.18
907	0.19
908	0.19
909	0.19
910	0.12
911	0.11
912	0.1
913	0.11
914	0.17
915	0.21
916	0.21
917	0.22
918	0.24
919	0.3
920	0.35
921	0.35
922	0.34
923	0.31
924	0.33
925	0.31
926	0.29
927	0.24
928	0.2
929	0.19
930	0.12
931	0.1
932	0.08
933	0.07
934	0.06
935	0.05
936	0.05
937	0.04
938	0.04
939	0.05
940	0.04
941	0.04
942	0.04
943	0.05
944	0.07
945	0.08
946	0.09
947	0.13
948	0.15
949	0.15
950	0.17
951	0.21
952	0.23
953	0.25
954	0.26
955	0.24
956	0.24
957	0.26
958	0.32
959	0.3
960	0.32
961	0.37
962	0.36
963	0.41
964	0.43
965	0.41
966	0.36
967	0.38
968	0.34
969	0.31
970	0.29
971	0.26
972	0.23
973	0.22
974	0.21
975	0.16
976	0.15
977	0.14
978	0.16
979	0.15
980	0.15
981	0.15
982	0.15
983	0.16
984	0.19
985	0.19
986	0.21
987	0.29
988	0.3
989	0.34
990	0.35
991	0.37
992	0.38
993	0.4
994	0.37
995	0.33
996	0.33
997	0.28
998	0.26
999	0.25
1000	0.21
1001	0.2
1002	0.19
1003	0.13
1004	0.14
1005	0.14
1006	0.14
1007	0.14
1008	0.15
1009	0.12
1010	0.14
1011	0.14
1012	0.14
1013	0.17
1014	0.21
1015	0.23
1016	0.24
1017	0.26
1018	0.27
1019	0.29
1020	0.29
1021	0.32
1022	0.34
1023	0.36
1024	0.4
1025	0.38
1026	0.37
1027	0.37
1028	0.44
1029	0.37
1030	0.32
1031	0.32
1032	0.28
1033	0.29
1034	0.3
1035	0.27
1036	0.21
1037	0.24
1038	0.23
1039	0.22
1040	0.22
1041	0.3
1042	0.3
1043	0.39
1044	0.41
1045	0.4
1046	0.41
1047	0.37
1048	0.39
1049	0.36
1050	0.38
1051	0.35
1052	0.35
1053	0.34
1054	0.34
1055	0.33
1056	0.31
1057	0.28
1058	0.26
1059	0.24
1060	0.22
1061	0.22
1062	0.2
1063	0.2
1064	0.2
1065	0.23
1066	0.21
1067	0.2
1068	0.28
1069	0.34
1070	0.39
1071	0.44
1072	0.43
1073	0.4
1074	0.42
1075	0.45
1076	0.46
1077	0.43
1078	0.44
1079	0.46
1080	0.52
1081	0.55
1082	0.61
1083	0.61
1084	0.56
1085	0.59
1086	0.58
1087	0.58
1088	0.51
1089	0.51
1090	0.43
1091	0.41
1092	0.38
1093	0.31
1094	0.26
1095	0.19
1096	0.18
1097	0.12
1098	0.14
1099	0.1
1100	0.1
1101	0.09
1102	0.11
1103	0.13
1104	0.13
1105	0.14
1106	0.11
1107	0.12
1108	0.13
1109	0.19
1110	0.19
1111	0.21
1112	0.28
1113	0.29
1114	0.38
1115	0.41
1116	0.41
1117	0.36
1118	0.35
1119	0.33
1120	0.28
1121	0.35
1122	0.34
1123	0.39
1124	0.47
1125	0.57
1126	0.64
1127	0.67
1128	0.71
1129	0.72
1130	0.73
1131	0.73
1132	0.72
1133	0.71
1134	0.71
1135	0.76
1136	0.76
1137	0.76

A0A517LFS0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer