Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LEX6

Protein Details
Accession A0A517LEX6    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-54KDEDDEPQKPSRKTRKRQSSIEDETSKHydrophilic
75-104VSPPSTPKAKKRTPKKSTPKDLQSRKLKSYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-43KTRK
81-94PKAKKRTPKKSTPK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MARATRSSRSAASKPVSMKQEDEKPVIKDEDDEPQKPSRKTRKRQSSIEDETSKKKIKAEDGTALPSPSLSDEDVSPPSTPKAKKRTPKKSTPKDLQSRKLKSYSQYANTSPFPDFSHPTPEECKLAHKILIQMHGARTRPKEVVASTTRAGCGDSPSVLDALVRTILSQNTSDTNSTRAKLSMDDEYGGSDKWDAIVEGGAAKLQEAIKCGGLSQIKSKVIISILQQTHEKYGKYSLDHLHDATNEVAMQEMLSFQGVGPKTASCVLLFCLQREDFAVDTHVHRITGLLGWRPKTASREETYAHLNIKIPDEDKYGLHILLVSHGKKCPECRAGGRNSGKCELRKAFRKGKLEGEAGEGVKEEEEECAKKEEETEKVKAED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.53
3 0.53
4 0.48
5 0.48
6 0.47
7 0.53
8 0.52
9 0.53
10 0.51
11 0.47
12 0.5
13 0.48
14 0.41
15 0.35
16 0.31
17 0.36
18 0.38
19 0.37
20 0.36
21 0.42
22 0.49
23 0.5
24 0.58
25 0.59
26 0.64
27 0.73
28 0.8
29 0.84
30 0.85
31 0.9
32 0.88
33 0.88
34 0.85
35 0.84
36 0.79
37 0.72
38 0.69
39 0.67
40 0.64
41 0.55
42 0.51
43 0.47
44 0.49
45 0.53
46 0.54
47 0.54
48 0.51
49 0.54
50 0.51
51 0.46
52 0.37
53 0.28
54 0.22
55 0.16
56 0.14
57 0.1
58 0.1
59 0.11
60 0.14
61 0.16
62 0.18
63 0.17
64 0.16
65 0.19
66 0.25
67 0.29
68 0.34
69 0.43
70 0.51
71 0.6
72 0.7
73 0.78
74 0.8
75 0.86
76 0.89
77 0.89
78 0.91
79 0.91
80 0.9
81 0.9
82 0.9
83 0.88
84 0.87
85 0.83
86 0.78
87 0.74
88 0.67
89 0.6
90 0.6
91 0.59
92 0.54
93 0.53
94 0.49
95 0.48
96 0.46
97 0.44
98 0.35
99 0.29
100 0.25
101 0.23
102 0.24
103 0.21
104 0.29
105 0.27
106 0.29
107 0.31
108 0.31
109 0.29
110 0.27
111 0.3
112 0.25
113 0.26
114 0.26
115 0.24
116 0.27
117 0.28
118 0.31
119 0.28
120 0.26
121 0.27
122 0.28
123 0.28
124 0.28
125 0.28
126 0.27
127 0.27
128 0.26
129 0.26
130 0.22
131 0.28
132 0.27
133 0.28
134 0.25
135 0.25
136 0.24
137 0.21
138 0.21
139 0.14
140 0.13
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.06
149 0.05
150 0.06
151 0.05
152 0.05
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.11
160 0.12
161 0.11
162 0.15
163 0.16
164 0.16
165 0.16
166 0.15
167 0.14
168 0.15
169 0.16
170 0.15
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.09
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.16
203 0.2
204 0.2
205 0.21
206 0.21
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.16
211 0.2
212 0.19
213 0.21
214 0.22
215 0.21
216 0.25
217 0.26
218 0.24
219 0.17
220 0.22
221 0.22
222 0.23
223 0.27
224 0.26
225 0.28
226 0.29
227 0.29
228 0.25
229 0.23
230 0.23
231 0.19
232 0.15
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.06
237 0.06
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.14
251 0.15
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.2
259 0.19
260 0.2
261 0.21
262 0.21
263 0.15
264 0.15
265 0.16
266 0.13
267 0.14
268 0.18
269 0.17
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.12
274 0.14
275 0.15
276 0.18
277 0.21
278 0.23
279 0.25
280 0.26
281 0.28
282 0.29
283 0.32
284 0.33
285 0.33
286 0.35
287 0.35
288 0.36
289 0.38
290 0.37
291 0.32
292 0.27
293 0.27
294 0.25
295 0.27
296 0.26
297 0.23
298 0.22
299 0.25
300 0.25
301 0.22
302 0.24
303 0.23
304 0.2
305 0.19
306 0.18
307 0.14
308 0.18
309 0.24
310 0.21
311 0.22
312 0.25
313 0.28
314 0.31
315 0.36
316 0.39
317 0.39
318 0.43
319 0.49
320 0.55
321 0.58
322 0.65
323 0.7
324 0.66
325 0.65
326 0.67
327 0.64
328 0.58
329 0.6
330 0.58
331 0.58
332 0.62
333 0.66
334 0.69
335 0.72
336 0.76
337 0.72
338 0.73
339 0.7
340 0.64
341 0.56
342 0.51
343 0.47
344 0.4
345 0.36
346 0.27
347 0.21
348 0.17
349 0.17
350 0.11
351 0.1
352 0.14
353 0.16
354 0.17
355 0.22
356 0.22
357 0.22
358 0.28
359 0.31
360 0.35
361 0.39
362 0.43