Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LBK1

Protein Details
Accession A0A517LBK1    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-30TSTQVSTETKERRKSKKSKTSSIPTAQPEHydrophilic
33-58EYVAVPKPEKKGKRSKKSEVIEKLVPHydrophilic
70-105AISDSKTKEAKKEKKEKKVKKEKTERKYKSSNLPSEBasic
114-136SEEDEDKPSKKRKRPESTEDEIEAcidic
422-453ETATTLKQRLEKSKKKKRKVHKWYVNKMFGRAHydrophilic
462-481AGVRYKKRYGKEAQKKDSEDBasic
494-530IDAKEGWKKSDKKVEKPSTAHERRKEARRAAARKEFGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-19RRKSKKS
39-49KPEKKGKRSKK
76-97TKEAKKEKKEKKVKKEKTERKY
122-127SKKRKR
147-157KKAARKAKKAK
430-443RLEKSKKKKRKVHK
500-527WKKSDKKVEKPSTAHERRKEARRAAARK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTSTQVSTETKERRKSKKSKTSSIPTAQPETEEYVAVPKPEKKGKRSKKSEVIEKLVPEPTSEALLGEEAISDSKTKEAKKEKKEKKVKKEKTERKYKSSNLPSEELATLAALSEEDEDKPSKKRKRPESTEDEIEIDVTLPEPLSKKAARKAKKAKTSDLSRTTVEAPDTEVKPIAASSGPKEKKERRTAWGIWIGNLPWSASKADVKEFLCKHAKLEPHEITRIHMPVPSNAPARNGEKPKNKGFAYLDFDSAEALEAAMNVSETQFNNDQRKVLIKKSSSFEGRPEPKTEEDAKKDDNGLSTLTTDKMNTQKPPSKRVFVGNLGFDTTKDDLQNHFGQCGEIADIFMATFEDSGKCKGFAWVTFTDEEAGIAAVRGWIIKGKEQDADSESEPEAEAPAKDDALIAELQVEGYENVDNQETATTLKQRLEKSKKKKRKVHKWYVNKMFGRALRCEFAEDAGVRYKKRYGKEAQKKDSEDVVMADAGANADAIDAKEGWKKSDKKVEKPSTAHERRKEARRAAARKEFGAPVAASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.84
3 0.87
4 0.88
5 0.89
6 0.9
7 0.91
8 0.91
9 0.9
10 0.87
11 0.83
12 0.78
13 0.74
14 0.64
15 0.56
16 0.48
17 0.43
18 0.36
19 0.29
20 0.23
21 0.22
22 0.23
23 0.23
24 0.25
25 0.25
26 0.32
27 0.41
28 0.49
29 0.53
30 0.63
31 0.72
32 0.79
33 0.84
34 0.87
35 0.88
36 0.89
37 0.9
38 0.88
39 0.84
40 0.77
41 0.7
42 0.63
43 0.58
44 0.48
45 0.39
46 0.32
47 0.25
48 0.23
49 0.2
50 0.16
51 0.12
52 0.12
53 0.11
54 0.09
55 0.08
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.12
62 0.17
63 0.19
64 0.28
65 0.38
66 0.48
67 0.58
68 0.69
69 0.75
70 0.81
71 0.9
72 0.92
73 0.92
74 0.94
75 0.93
76 0.93
77 0.95
78 0.94
79 0.94
80 0.94
81 0.91
82 0.88
83 0.87
84 0.82
85 0.82
86 0.81
87 0.78
88 0.72
89 0.67
90 0.59
91 0.53
92 0.46
93 0.36
94 0.25
95 0.17
96 0.12
97 0.09
98 0.08
99 0.04
100 0.04
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.1
105 0.12
106 0.14
107 0.22
108 0.31
109 0.39
110 0.46
111 0.56
112 0.65
113 0.74
114 0.81
115 0.84
116 0.83
117 0.81
118 0.79
119 0.71
120 0.61
121 0.5
122 0.41
123 0.3
124 0.22
125 0.14
126 0.08
127 0.07
128 0.05
129 0.06
130 0.08
131 0.09
132 0.13
133 0.17
134 0.22
135 0.29
136 0.39
137 0.45
138 0.54
139 0.64
140 0.69
141 0.76
142 0.76
143 0.76
144 0.76
145 0.77
146 0.76
147 0.71
148 0.65
149 0.56
150 0.53
151 0.46
152 0.39
153 0.31
154 0.22
155 0.19
156 0.22
157 0.21
158 0.2
159 0.18
160 0.16
161 0.16
162 0.15
163 0.12
164 0.09
165 0.09
166 0.11
167 0.22
168 0.24
169 0.27
170 0.36
171 0.43
172 0.51
173 0.6
174 0.63
175 0.58
176 0.64
177 0.63
178 0.62
179 0.62
180 0.53
181 0.43
182 0.4
183 0.34
184 0.27
185 0.25
186 0.18
187 0.1
188 0.11
189 0.1
190 0.1
191 0.12
192 0.12
193 0.14
194 0.19
195 0.19
196 0.25
197 0.25
198 0.3
199 0.33
200 0.32
201 0.32
202 0.32
203 0.35
204 0.32
205 0.4
206 0.39
207 0.37
208 0.4
209 0.39
210 0.36
211 0.35
212 0.31
213 0.23
214 0.2
215 0.17
216 0.16
217 0.19
218 0.22
219 0.2
220 0.2
221 0.22
222 0.23
223 0.26
224 0.3
225 0.33
226 0.37
227 0.43
228 0.48
229 0.52
230 0.55
231 0.51
232 0.49
233 0.45
234 0.43
235 0.41
236 0.37
237 0.32
238 0.26
239 0.26
240 0.21
241 0.18
242 0.13
243 0.06
244 0.04
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.05
253 0.05
254 0.08
255 0.12
256 0.16
257 0.2
258 0.21
259 0.21
260 0.2
261 0.26
262 0.26
263 0.27
264 0.3
265 0.28
266 0.31
267 0.33
268 0.37
269 0.34
270 0.33
271 0.31
272 0.34
273 0.38
274 0.36
275 0.37
276 0.35
277 0.33
278 0.36
279 0.4
280 0.36
281 0.35
282 0.36
283 0.35
284 0.33
285 0.33
286 0.3
287 0.24
288 0.19
289 0.15
290 0.12
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.11
297 0.16
298 0.19
299 0.22
300 0.28
301 0.34
302 0.37
303 0.46
304 0.48
305 0.46
306 0.45
307 0.47
308 0.45
309 0.43
310 0.43
311 0.36
312 0.32
313 0.29
314 0.27
315 0.22
316 0.2
317 0.16
318 0.14
319 0.13
320 0.14
321 0.14
322 0.18
323 0.23
324 0.2
325 0.19
326 0.18
327 0.17
328 0.16
329 0.15
330 0.12
331 0.07
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.04
338 0.03
339 0.03
340 0.04
341 0.06
342 0.07
343 0.1
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.14
348 0.16
349 0.16
350 0.21
351 0.2
352 0.22
353 0.22
354 0.22
355 0.2
356 0.17
357 0.16
358 0.1
359 0.08
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.07
368 0.09
369 0.13
370 0.16
371 0.18
372 0.21
373 0.22
374 0.24
375 0.23
376 0.25
377 0.22
378 0.22
379 0.2
380 0.17
381 0.17
382 0.14
383 0.13
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.04
401 0.05
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.08
406 0.08
407 0.07
408 0.08
409 0.07
410 0.09
411 0.12
412 0.15
413 0.17
414 0.21
415 0.27
416 0.32
417 0.43
418 0.52
419 0.59
420 0.66
421 0.75
422 0.82
423 0.87
424 0.91
425 0.92
426 0.93
427 0.94
428 0.94
429 0.93
430 0.94
431 0.94
432 0.95
433 0.93
434 0.84
435 0.75
436 0.7
437 0.64
438 0.57
439 0.51
440 0.44
441 0.37
442 0.35
443 0.35
444 0.29
445 0.26
446 0.26
447 0.22
448 0.2
449 0.26
450 0.29
451 0.26
452 0.29
453 0.35
454 0.36
455 0.4
456 0.46
457 0.48
458 0.57
459 0.67
460 0.75
461 0.78
462 0.8
463 0.8
464 0.75
465 0.7
466 0.6
467 0.5
468 0.4
469 0.32
470 0.24
471 0.19
472 0.16
473 0.11
474 0.1
475 0.08
476 0.07
477 0.04
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.1
484 0.16
485 0.17
486 0.21
487 0.3
488 0.35
489 0.43
490 0.54
491 0.61
492 0.65
493 0.75
494 0.81
495 0.81
496 0.8
497 0.8
498 0.81
499 0.82
500 0.81
501 0.78
502 0.77
503 0.77
504 0.83
505 0.83
506 0.8
507 0.8
508 0.81
509 0.82
510 0.82
511 0.83
512 0.77
513 0.7
514 0.68
515 0.59
516 0.5
517 0.46