Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LJR3

Protein Details
Accession A0A517LJR3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
167-194DVKSQGQARRDKRPPRRRPRHVVIPGESBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-186ARRDKRPPRRRPR
Subcellular Location(s) nucl 14, cysk 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012675  Beta-grasp_dom_sf  
IPR016155  Mopterin_synth/thiamin_S_b  
IPR015221  Urm1  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0032447  P:protein urmylation  
GO:0034227  P:tRNA thio-modification  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF09138  Urm1  
CDD cd01764  Ubl_Urm1  
Amino Acid Sequences MSASANAEEPKVEVVSRDVQAVPITVEFTGGLEMLFSHKRKHEISIPLKEKSGSKPTVQDLVQYLCDNLMKDTRKELFVLDDSVRPGILVLINDADWELEGEASYELQKGDNILFKAIIRIPLSLESMEYLLGPVDCQIQKIWPAFIMSIFGSTRAPASAIQLTSEDVKSQGQARRDKRPPRRRPRHVVIPGESDPIIAHHIAEMIEFLASYDDLIPGFYQKYTPTVYGNDDEDRPISVVQRLWILRCIVVGEYDCLTVTEMRSCFRQHFDEQVLEDKQALVQSSLLDLVDYFKMLSREAKQKLNTTIDLEIVSKHHKVLWGSKFDIPDLLVDTSRYTSPTEEPSKDARTRVSSSTTDVHRSGLFNESRLAIALGSPALTARHSPGSGEIPNLPTPPPRVHVPDQPLQATLLDPTGALFWPI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.21
3 0.21
4 0.23
5 0.21
6 0.22
7 0.22
8 0.22
9 0.19
10 0.14
11 0.14
12 0.11
13 0.11
14 0.1
15 0.1
16 0.09
17 0.08
18 0.07
19 0.05
20 0.06
21 0.1
22 0.16
23 0.17
24 0.22
25 0.26
26 0.32
27 0.34
28 0.4
29 0.45
30 0.49
31 0.57
32 0.63
33 0.65
34 0.61
35 0.61
36 0.57
37 0.52
38 0.49
39 0.49
40 0.42
41 0.4
42 0.43
43 0.45
44 0.5
45 0.46
46 0.42
47 0.36
48 0.36
49 0.35
50 0.29
51 0.26
52 0.2
53 0.22
54 0.19
55 0.17
56 0.22
57 0.23
58 0.24
59 0.3
60 0.32
61 0.32
62 0.32
63 0.3
64 0.28
65 0.26
66 0.29
67 0.24
68 0.23
69 0.23
70 0.22
71 0.21
72 0.16
73 0.14
74 0.11
75 0.11
76 0.09
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.04
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.07
95 0.08
96 0.08
97 0.1
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.14
103 0.18
104 0.18
105 0.2
106 0.17
107 0.16
108 0.17
109 0.18
110 0.19
111 0.16
112 0.14
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.08
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.1
123 0.1
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.17
128 0.18
129 0.18
130 0.13
131 0.14
132 0.14
133 0.14
134 0.14
135 0.1
136 0.11
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.07
143 0.08
144 0.07
145 0.1
146 0.12
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.13
151 0.14
152 0.14
153 0.11
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.15
158 0.18
159 0.23
160 0.31
161 0.36
162 0.45
163 0.54
164 0.63
165 0.68
166 0.76
167 0.81
168 0.84
169 0.9
170 0.9
171 0.91
172 0.9
173 0.89
174 0.86
175 0.82
176 0.73
177 0.68
178 0.59
179 0.51
180 0.42
181 0.31
182 0.22
183 0.16
184 0.15
185 0.08
186 0.07
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.09
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.16
215 0.17
216 0.18
217 0.18
218 0.16
219 0.16
220 0.15
221 0.13
222 0.12
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.17
232 0.16
233 0.14
234 0.14
235 0.14
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.11
248 0.11
249 0.12
250 0.14
251 0.15
252 0.17
253 0.2
254 0.24
255 0.21
256 0.26
257 0.28
258 0.29
259 0.28
260 0.32
261 0.29
262 0.24
263 0.23
264 0.17
265 0.15
266 0.14
267 0.13
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.08
281 0.09
282 0.1
283 0.14
284 0.18
285 0.27
286 0.31
287 0.37
288 0.39
289 0.44
290 0.49
291 0.5
292 0.46
293 0.4
294 0.37
295 0.31
296 0.29
297 0.23
298 0.18
299 0.16
300 0.17
301 0.15
302 0.15
303 0.15
304 0.18
305 0.2
306 0.28
307 0.33
308 0.36
309 0.39
310 0.42
311 0.41
312 0.38
313 0.37
314 0.28
315 0.22
316 0.18
317 0.16
318 0.13
319 0.13
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.15
324 0.13
325 0.14
326 0.16
327 0.24
328 0.3
329 0.3
330 0.33
331 0.38
332 0.44
333 0.45
334 0.45
335 0.42
336 0.41
337 0.43
338 0.42
339 0.42
340 0.36
341 0.37
342 0.41
343 0.4
344 0.39
345 0.35
346 0.34
347 0.3
348 0.3
349 0.27
350 0.29
351 0.27
352 0.23
353 0.24
354 0.23
355 0.21
356 0.21
357 0.19
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.07
364 0.07
365 0.08
366 0.09
367 0.1
368 0.12
369 0.17
370 0.17
371 0.17
372 0.21
373 0.26
374 0.26
375 0.28
376 0.27
377 0.27
378 0.29
379 0.3
380 0.28
381 0.26
382 0.3
383 0.31
384 0.31
385 0.33
386 0.39
387 0.43
388 0.5
389 0.53
390 0.56
391 0.57
392 0.54
393 0.5
394 0.43
395 0.38
396 0.3
397 0.24
398 0.17
399 0.12
400 0.1
401 0.1
402 0.1