Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517L402

Protein Details
Accession A0A517L402    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-55NPKSALPYKSANKDRRRDFHIKQKKARDQLQREKRFARKKLEDKNPELREAHydrophilic
372-391IFFRRHRYAFREKRAREQAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-49NKDRRRDFHIKQKKARDQLQREKRFARKKLEDKN
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MPSINPKSALPYKSANKDRRRDFHIKQKKARDQLQREKRFARKKLEDKNPELREARLAANKPITIDSKRKYDDEGEEGDNIFGRSVDLSALAKRRRLEELQELDDAAEANAEEEENDEDEDIEAADEVERSQKADQEEGGDNNSEADSMLGDSDEEEESAFKKPSIPMRPRAGSTAASVASTARTDLTPEAIAAKFPTLFAEQTDNPKVLITTSINSTLHKVWLSESAMGFAFNHDQEAEMLEELIPNSAYVRRSNHRFGHKFSVREIAKFASNRNFTTMVVLMEDQKRPAGLDIIRLPEGPHLHYSLSNWIDGKKLPGHGKAMDFYPEIILNNFTTALGLVTGRIFQQLFPIKPELQGRQVVTLHNQRDFIFFRRHRYAFREKRAREQAVLGPDGKPLPGVEDIKAGLQELGPRFTLKLRRVDKGIQRASGQEWEWKGKTDRVRTKFQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.67
3 0.69
4 0.77
5 0.83
6 0.82
7 0.83
8 0.82
9 0.8
10 0.82
11 0.83
12 0.84
13 0.83
14 0.87
15 0.87
16 0.87
17 0.88
18 0.88
19 0.88
20 0.88
21 0.9
22 0.88
23 0.86
24 0.85
25 0.86
26 0.85
27 0.82
28 0.82
29 0.81
30 0.82
31 0.85
32 0.88
33 0.87
34 0.85
35 0.87
36 0.81
37 0.77
38 0.69
39 0.6
40 0.53
41 0.46
42 0.44
43 0.41
44 0.39
45 0.37
46 0.4
47 0.39
48 0.36
49 0.37
50 0.36
51 0.34
52 0.4
53 0.39
54 0.44
55 0.46
56 0.46
57 0.46
58 0.47
59 0.47
60 0.43
61 0.43
62 0.36
63 0.34
64 0.33
65 0.3
66 0.25
67 0.19
68 0.14
69 0.1
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.13
77 0.21
78 0.24
79 0.27
80 0.29
81 0.31
82 0.36
83 0.37
84 0.39
85 0.41
86 0.45
87 0.44
88 0.43
89 0.4
90 0.34
91 0.31
92 0.25
93 0.15
94 0.09
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.04
114 0.04
115 0.08
116 0.08
117 0.1
118 0.1
119 0.14
120 0.15
121 0.17
122 0.17
123 0.18
124 0.21
125 0.2
126 0.21
127 0.18
128 0.16
129 0.15
130 0.14
131 0.1
132 0.07
133 0.06
134 0.05
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.07
146 0.1
147 0.1
148 0.08
149 0.11
150 0.14
151 0.23
152 0.32
153 0.37
154 0.42
155 0.49
156 0.52
157 0.5
158 0.5
159 0.44
160 0.35
161 0.31
162 0.26
163 0.19
164 0.16
165 0.15
166 0.12
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.09
179 0.1
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.09
188 0.13
189 0.14
190 0.19
191 0.2
192 0.19
193 0.18
194 0.18
195 0.17
196 0.12
197 0.13
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.13
202 0.13
203 0.14
204 0.16
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.12
209 0.1
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.08
219 0.09
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.07
227 0.05
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.07
237 0.08
238 0.11
239 0.15
240 0.2
241 0.26
242 0.33
243 0.39
244 0.46
245 0.48
246 0.51
247 0.57
248 0.56
249 0.52
250 0.47
251 0.5
252 0.41
253 0.38
254 0.35
255 0.26
256 0.26
257 0.26
258 0.27
259 0.26
260 0.28
261 0.28
262 0.3
263 0.29
264 0.25
265 0.26
266 0.24
267 0.16
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.16
272 0.17
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.13
277 0.13
278 0.14
279 0.11
280 0.16
281 0.18
282 0.21
283 0.22
284 0.22
285 0.21
286 0.21
287 0.21
288 0.18
289 0.17
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.17
294 0.21
295 0.2
296 0.2
297 0.18
298 0.18
299 0.19
300 0.18
301 0.21
302 0.17
303 0.22
304 0.25
305 0.27
306 0.31
307 0.32
308 0.33
309 0.31
310 0.29
311 0.26
312 0.22
313 0.19
314 0.17
315 0.15
316 0.14
317 0.13
318 0.13
319 0.11
320 0.11
321 0.11
322 0.09
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.09
333 0.09
334 0.08
335 0.16
336 0.23
337 0.23
338 0.26
339 0.31
340 0.29
341 0.33
342 0.39
343 0.35
344 0.33
345 0.37
346 0.34
347 0.35
348 0.36
349 0.33
350 0.35
351 0.4
352 0.38
353 0.36
354 0.37
355 0.32
356 0.35
357 0.37
358 0.35
359 0.37
360 0.37
361 0.43
362 0.5
363 0.52
364 0.52
365 0.57
366 0.63
367 0.63
368 0.71
369 0.73
370 0.67
371 0.75
372 0.8
373 0.77
374 0.68
375 0.63
376 0.57
377 0.53
378 0.53
379 0.44
380 0.34
381 0.32
382 0.3
383 0.24
384 0.19
385 0.13
386 0.13
387 0.18
388 0.19
389 0.18
390 0.2
391 0.21
392 0.22
393 0.22
394 0.19
395 0.14
396 0.12
397 0.18
398 0.17
399 0.19
400 0.19
401 0.2
402 0.2
403 0.26
404 0.34
405 0.34
406 0.42
407 0.45
408 0.49
409 0.54
410 0.62
411 0.65
412 0.67
413 0.68
414 0.62
415 0.58
416 0.55
417 0.53
418 0.5
419 0.43
420 0.39
421 0.37
422 0.41
423 0.41
424 0.43
425 0.44
426 0.45
427 0.53
428 0.57
429 0.63
430 0.61