Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A517LJ42

Protein Details
Accession A0A517LJ42    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-259SEIQSGRPVKRRKVSSRKEVRADSHydrophilic
305-333TAPAPKPKRGAKSKPIKRKKTPREEEGGEBasic
351-374ARFRTWCKKRSAARRKAQVRQQGNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-248KRRK
308-327APKPKRGAKSKPIKRKKTPR
522-532KPRSKNHKAAK
1192-1212RGSGRGRRGGGGRARTGRAKW
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, pero 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038718  SNF2-like_sf  
IPR000330  SNF2_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0140658  F:ATP-dependent chromatin remodeler activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00271  Helicase_C  
PF00176  SNF2-rel_dom  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd22254  CSB_WHD  
cd18000  DEXHc_ERCC6  
cd18793  SF2_C_SNF  
Amino Acid Sequences MDGTSAQDMVREEQGDLDVPALPTENTEGMDEEAVLNMFATAKDQDELERDIGRQADQLLNEQADEREKKRIDKTIASQDRIKGQLRKIDQRLAGPGGSATKLLLRDEKANLEAQLKSLDTDLEQIHARISQRQNAEDVPEEEALQGRNPNESRRDFLIRTGKITPFSRMPQTARQSSNLADVMLEAEESEDADAEEAEALAAGPQSHQVLRKPGFAEEEFDASSVAESRADDNASEIQSGRPVKRRKVSSRKEVRADSEEFEDSVTADSDASDAFVPNLTNRQLATLGESDDESADDRILAAATAPAPKPKRGAKSKPIKRKKTPREEEGGEDEEDLEGLDDGNEDLYQARFRTWCKKRSAARRKAQVRQQGNALIDVDEDEEECYKPHPTLADTDLGDGFRVPGDIFPSLYDYQKTGVRWLYELYSQQVGGIIGDEMGLGKTIQAIAFLAGLHYSKMITKPIIIVCPATLLKQWVNEFHRWWPPLRVSILHTSGSGMINLGREEALEDGLEEEEYYEHRKPRSKNHKAAKGIVDRVRRDGHVLVTTYSGLQSYADLLTDVPWEYAVLDEGHKIRNPNTSITMYCKELQTANRIILSGTPMQNNLTELWSLFDFVFPMRLGTLVSFRQQFEAPIKFGGYANASNLQVETANKCAETLKEAISPYLLQRWKADVAADLPKKTERVLFCKLTALQRKAYKDFLKSDDMSSILAGKRQALYGIDILRKICNHPDLVQHKRDSKNSGYGEDAKSGKMQVVKALLEMWKKAGHKTLLFAQHRIMLDILQKTIGSMEGFNVRRMDGNTSIKDRQNMVDEFNRDPSLHVFLLTTKVGGLGVNLTGANRVIIYDPDWNPSTDVQARERAWRLGQTREVEIYRLMTAGTIEEKIYHRQVFKQILTNKVLRDPKQRQTFQLKELHDLFTLGDEVTSTETGSLFKGTEIRFSDKGKAKTLEPSIPTPPTDNEQEQRTNLSTITGVSRDEHFEDGSGKPAGAQNGEGEDRVLSAIFSKSGVHSAHEHDAIVGSSIVKRKVTADPEMIQREARRVAALAARELQRSGEIARTITPGVPTWTGQFGSSGRPEERPIASIRGAARGGRGGSRGGISSSSVLSNLASRQAGPATPASRNLTPDHQPRGREWMAMIRDFIKAQGGSCVTQMLIDHFNRYCGTEQRTQEFRAMLKEIAMMEVLPESSGRGSGRGRRGGGGRARTGRAKWILKPEYRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.17
4 0.15
5 0.14
6 0.13
7 0.13
8 0.13
9 0.11
10 0.11
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.14
15 0.15
16 0.15
17 0.15
18 0.14
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.09
23 0.08
24 0.07
25 0.07
26 0.06
27 0.09
28 0.09
29 0.1
30 0.11
31 0.12
32 0.14
33 0.17
34 0.21
35 0.21
36 0.22
37 0.21
38 0.24
39 0.25
40 0.23
41 0.21
42 0.21
43 0.22
44 0.21
45 0.25
46 0.25
47 0.25
48 0.24
49 0.24
50 0.22
51 0.26
52 0.3
53 0.28
54 0.34
55 0.37
56 0.44
57 0.5
58 0.57
59 0.56
60 0.6
61 0.65
62 0.67
63 0.73
64 0.7
65 0.68
66 0.62
67 0.62
68 0.59
69 0.58
70 0.54
71 0.5
72 0.55
73 0.58
74 0.64
75 0.63
76 0.66
77 0.62
78 0.59
79 0.59
80 0.53
81 0.45
82 0.35
83 0.31
84 0.25
85 0.23
86 0.19
87 0.14
88 0.14
89 0.16
90 0.18
91 0.22
92 0.22
93 0.26
94 0.29
95 0.32
96 0.31
97 0.32
98 0.32
99 0.3
100 0.27
101 0.24
102 0.24
103 0.2
104 0.19
105 0.17
106 0.15
107 0.12
108 0.16
109 0.15
110 0.14
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.18
115 0.19
116 0.23
117 0.28
118 0.32
119 0.35
120 0.37
121 0.39
122 0.37
123 0.4
124 0.36
125 0.32
126 0.29
127 0.25
128 0.24
129 0.21
130 0.21
131 0.18
132 0.16
133 0.18
134 0.15
135 0.22
136 0.24
137 0.3
138 0.36
139 0.38
140 0.41
141 0.43
142 0.5
143 0.43
144 0.49
145 0.53
146 0.47
147 0.48
148 0.49
149 0.46
150 0.45
151 0.46
152 0.42
153 0.38
154 0.41
155 0.44
156 0.44
157 0.46
158 0.49
159 0.55
160 0.58
161 0.55
162 0.54
163 0.5
164 0.45
165 0.46
166 0.37
167 0.29
168 0.21
169 0.18
170 0.16
171 0.13
172 0.12
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.07
193 0.09
194 0.11
195 0.14
196 0.18
197 0.26
198 0.29
199 0.34
200 0.34
201 0.34
202 0.38
203 0.35
204 0.35
205 0.28
206 0.28
207 0.23
208 0.22
209 0.2
210 0.14
211 0.14
212 0.11
213 0.1
214 0.08
215 0.08
216 0.1
217 0.12
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.16
222 0.15
223 0.16
224 0.15
225 0.13
226 0.19
227 0.23
228 0.25
229 0.31
230 0.37
231 0.45
232 0.54
233 0.63
234 0.68
235 0.75
236 0.8
237 0.83
238 0.87
239 0.87
240 0.85
241 0.8
242 0.75
243 0.69
244 0.62
245 0.54
246 0.46
247 0.38
248 0.31
249 0.27
250 0.21
251 0.15
252 0.13
253 0.11
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.13
267 0.13
268 0.14
269 0.14
270 0.15
271 0.15
272 0.15
273 0.17
274 0.15
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.12
279 0.11
280 0.11
281 0.09
282 0.08
283 0.07
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.05
289 0.04
290 0.05
291 0.06
292 0.1
293 0.1
294 0.17
295 0.2
296 0.22
297 0.28
298 0.33
299 0.42
300 0.49
301 0.58
302 0.62
303 0.71
304 0.79
305 0.84
306 0.88
307 0.89
308 0.9
309 0.91
310 0.92
311 0.92
312 0.91
313 0.87
314 0.85
315 0.77
316 0.71
317 0.66
318 0.58
319 0.46
320 0.37
321 0.3
322 0.21
323 0.18
324 0.13
325 0.07
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.06
336 0.08
337 0.08
338 0.1
339 0.12
340 0.16
341 0.26
342 0.33
343 0.41
344 0.46
345 0.54
346 0.62
347 0.71
348 0.79
349 0.78
350 0.8
351 0.82
352 0.84
353 0.83
354 0.83
355 0.81
356 0.75
357 0.67
358 0.62
359 0.56
360 0.48
361 0.41
362 0.34
363 0.24
364 0.18
365 0.16
366 0.12
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.09
376 0.1
377 0.1
378 0.11
379 0.14
380 0.16
381 0.19
382 0.18
383 0.19
384 0.19
385 0.17
386 0.16
387 0.13
388 0.1
389 0.06
390 0.07
391 0.05
392 0.05
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.09
397 0.13
398 0.14
399 0.15
400 0.15
401 0.13
402 0.15
403 0.18
404 0.18
405 0.17
406 0.18
407 0.18
408 0.18
409 0.19
410 0.18
411 0.18
412 0.18
413 0.17
414 0.15
415 0.14
416 0.14
417 0.13
418 0.11
419 0.09
420 0.08
421 0.06
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.03
426 0.03
427 0.04
428 0.03
429 0.03
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.05
443 0.05
444 0.06
445 0.07
446 0.09
447 0.09
448 0.1
449 0.13
450 0.15
451 0.16
452 0.15
453 0.14
454 0.12
455 0.15
456 0.14
457 0.12
458 0.11
459 0.12
460 0.12
461 0.15
462 0.16
463 0.2
464 0.24
465 0.26
466 0.27
467 0.3
468 0.35
469 0.33
470 0.34
471 0.33
472 0.31
473 0.32
474 0.32
475 0.28
476 0.25
477 0.29
478 0.3
479 0.26
480 0.23
481 0.2
482 0.2
483 0.18
484 0.15
485 0.09
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.08
490 0.06
491 0.05
492 0.06
493 0.06
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.09
505 0.11
506 0.14
507 0.18
508 0.24
509 0.28
510 0.39
511 0.49
512 0.56
513 0.63
514 0.69
515 0.75
516 0.73
517 0.75
518 0.72
519 0.66
520 0.62
521 0.58
522 0.55
523 0.47
524 0.47
525 0.43
526 0.36
527 0.32
528 0.27
529 0.23
530 0.19
531 0.19
532 0.16
533 0.15
534 0.15
535 0.12
536 0.11
537 0.09
538 0.06
539 0.05
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.06
548 0.06
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.05
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.07
558 0.08
559 0.1
560 0.11
561 0.12
562 0.13
563 0.18
564 0.2
565 0.2
566 0.23
567 0.23
568 0.23
569 0.27
570 0.27
571 0.23
572 0.22
573 0.21
574 0.18
575 0.19
576 0.2
577 0.2
578 0.2
579 0.18
580 0.17
581 0.17
582 0.16
583 0.14
584 0.15
585 0.13
586 0.13
587 0.12
588 0.12
589 0.13
590 0.13
591 0.14
592 0.12
593 0.09
594 0.08
595 0.07
596 0.08
597 0.07
598 0.08
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.05
607 0.05
608 0.05
609 0.06
610 0.08
611 0.08
612 0.1
613 0.12
614 0.12
615 0.14
616 0.14
617 0.15
618 0.17
619 0.18
620 0.16
621 0.15
622 0.15
623 0.14
624 0.14
625 0.14
626 0.11
627 0.1
628 0.1
629 0.12
630 0.12
631 0.11
632 0.11
633 0.1
634 0.09
635 0.09
636 0.09
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.09
641 0.1
642 0.09
643 0.11
644 0.11
645 0.11
646 0.13
647 0.14
648 0.13
649 0.13
650 0.13
651 0.11
652 0.17
653 0.17
654 0.15
655 0.16
656 0.18
657 0.19
658 0.19
659 0.18
660 0.12
661 0.14
662 0.21
663 0.22
664 0.2
665 0.2
666 0.2
667 0.21
668 0.2
669 0.22
670 0.17
671 0.22
672 0.28
673 0.28
674 0.28
675 0.31
676 0.32
677 0.35
678 0.4
679 0.36
680 0.36
681 0.39
682 0.42
683 0.42
684 0.46
685 0.42
686 0.38
687 0.39
688 0.38
689 0.38
690 0.35
691 0.33
692 0.28
693 0.25
694 0.21
695 0.17
696 0.16
697 0.1
698 0.11
699 0.11
700 0.11
701 0.11
702 0.11
703 0.11
704 0.09
705 0.11
706 0.11
707 0.15
708 0.15
709 0.15
710 0.16
711 0.16
712 0.16
713 0.16
714 0.17
715 0.16
716 0.17
717 0.18
718 0.26
719 0.32
720 0.38
721 0.42
722 0.42
723 0.47
724 0.5
725 0.52
726 0.48
727 0.44
728 0.46
729 0.42
730 0.4
731 0.36
732 0.36
733 0.34
734 0.33
735 0.3
736 0.22
737 0.21
738 0.2
739 0.18
740 0.16
741 0.15
742 0.14
743 0.16
744 0.15
745 0.15
746 0.17
747 0.18
748 0.16
749 0.16
750 0.15
751 0.17
752 0.17
753 0.19
754 0.22
755 0.23
756 0.22
757 0.24
758 0.29
759 0.35
760 0.35
761 0.35
762 0.31
763 0.32
764 0.31
765 0.29
766 0.23
767 0.15
768 0.17
769 0.17
770 0.16
771 0.12
772 0.12
773 0.11
774 0.11
775 0.11
776 0.07
777 0.06
778 0.07
779 0.14
780 0.15
781 0.17
782 0.18
783 0.17
784 0.18
785 0.19
786 0.22
787 0.21
788 0.26
789 0.27
790 0.32
791 0.36
792 0.37
793 0.38
794 0.35
795 0.31
796 0.31
797 0.29
798 0.28
799 0.29
800 0.3
801 0.29
802 0.3
803 0.29
804 0.23
805 0.23
806 0.21
807 0.2
808 0.17
809 0.16
810 0.13
811 0.13
812 0.16
813 0.15
814 0.13
815 0.08
816 0.09
817 0.08
818 0.08
819 0.07
820 0.05
821 0.05
822 0.05
823 0.06
824 0.05
825 0.06
826 0.06
827 0.06
828 0.05
829 0.05
830 0.05
831 0.06
832 0.08
833 0.14
834 0.15
835 0.19
836 0.2
837 0.2
838 0.21
839 0.21
840 0.24
841 0.21
842 0.23
843 0.22
844 0.28
845 0.29
846 0.33
847 0.36
848 0.33
849 0.3
850 0.34
851 0.34
852 0.33
853 0.37
854 0.34
855 0.34
856 0.35
857 0.34
858 0.28
859 0.26
860 0.22
861 0.17
862 0.14
863 0.12
864 0.08
865 0.08
866 0.08
867 0.08
868 0.07
869 0.07
870 0.1
871 0.12
872 0.16
873 0.2
874 0.23
875 0.23
876 0.26
877 0.34
878 0.38
879 0.38
880 0.43
881 0.43
882 0.46
883 0.49
884 0.48
885 0.42
886 0.43
887 0.48
888 0.44
889 0.5
890 0.51
891 0.56
892 0.64
893 0.65
894 0.64
895 0.68
896 0.68
897 0.64
898 0.64
899 0.56
900 0.52
901 0.52
902 0.46
903 0.36
904 0.31
905 0.25
906 0.18
907 0.17
908 0.11
909 0.08
910 0.06
911 0.07
912 0.08
913 0.08
914 0.07
915 0.07
916 0.07
917 0.08
918 0.08
919 0.09
920 0.07
921 0.08
922 0.13
923 0.13
924 0.19
925 0.22
926 0.27
927 0.3
928 0.32
929 0.41
930 0.43
931 0.46
932 0.47
933 0.46
934 0.42
935 0.46
936 0.49
937 0.46
938 0.41
939 0.42
940 0.4
941 0.4
942 0.39
943 0.34
944 0.31
945 0.29
946 0.31
947 0.32
948 0.31
949 0.34
950 0.36
951 0.35
952 0.37
953 0.35
954 0.3
955 0.25
956 0.23
957 0.17
958 0.15
959 0.17
960 0.14
961 0.13
962 0.13
963 0.15
964 0.17
965 0.18
966 0.18
967 0.16
968 0.16
969 0.18
970 0.16
971 0.19
972 0.16
973 0.14
974 0.14
975 0.16
976 0.17
977 0.15
978 0.16
979 0.13
980 0.16
981 0.17
982 0.16
983 0.14
984 0.12
985 0.11
986 0.11
987 0.1
988 0.06
989 0.07
990 0.08
991 0.08
992 0.08
993 0.09
994 0.1
995 0.14
996 0.15
997 0.16
998 0.18
999 0.22
1000 0.26
1001 0.26
1002 0.25
1003 0.2
1004 0.2
1005 0.18
1006 0.16
1007 0.12
1008 0.08
1009 0.11
1010 0.15
1011 0.17
1012 0.17
1013 0.17
1014 0.2
1015 0.27
1016 0.31
1017 0.33
1018 0.35
1019 0.37
1020 0.44
1021 0.47
1022 0.45
1023 0.41
1024 0.37
1025 0.36
1026 0.33
1027 0.3
1028 0.23
1029 0.2
1030 0.22
1031 0.23
1032 0.23
1033 0.21
1034 0.24
1035 0.25
1036 0.25
1037 0.25
1038 0.22
1039 0.19
1040 0.19
1041 0.18
1042 0.17
1043 0.16
1044 0.17
1045 0.18
1046 0.19
1047 0.2
1048 0.2
1049 0.2
1050 0.16
1051 0.19
1052 0.19
1053 0.19
1054 0.19
1055 0.21
1056 0.2
1057 0.19
1058 0.2
1059 0.17
1060 0.21
1061 0.24
1062 0.26
1063 0.25
1064 0.27
1065 0.29
1066 0.32
1067 0.33
1068 0.3
1069 0.3
1070 0.3
1071 0.29
1072 0.3
1073 0.29
1074 0.29
1075 0.28
1076 0.26
1077 0.25
1078 0.23
1079 0.24
1080 0.22
1081 0.22
1082 0.18
1083 0.19
1084 0.19
1085 0.18
1086 0.16
1087 0.15
1088 0.15
1089 0.15
1090 0.15
1091 0.14
1092 0.12
1093 0.12
1094 0.11
1095 0.13
1096 0.12
1097 0.15
1098 0.14
1099 0.14
1100 0.16
1101 0.17
1102 0.17
1103 0.18
1104 0.22
1105 0.22
1106 0.24
1107 0.29
1108 0.32
1109 0.33
1110 0.35
1111 0.37
1112 0.37
1113 0.42
1114 0.48
1115 0.52
1116 0.51
1117 0.51
1118 0.51
1119 0.57
1120 0.52
1121 0.45
1122 0.39
1123 0.38
1124 0.39
1125 0.38
1126 0.37
1127 0.3
1128 0.3
1129 0.29
1130 0.27
1131 0.24
1132 0.19
1133 0.18
1134 0.22
1135 0.23
1136 0.22
1137 0.22
1138 0.22
1139 0.17
1140 0.17
1141 0.17
1142 0.15
1143 0.19
1144 0.19
1145 0.24
1146 0.23
1147 0.26
1148 0.26
1149 0.28
1150 0.28
1151 0.28
1152 0.34
1153 0.37
1154 0.42
1155 0.48
1156 0.52
1157 0.51
1158 0.52
1159 0.48
1160 0.43
1161 0.41
1162 0.38
1163 0.31
1164 0.27
1165 0.27
1166 0.23
1167 0.21
1168 0.19
1169 0.13
1170 0.11
1171 0.11
1172 0.1
1173 0.08
1174 0.07
1175 0.08
1176 0.08
1177 0.11
1178 0.11
1179 0.14
1180 0.2
1181 0.29
1182 0.37
1183 0.43
1184 0.44
1185 0.47
1186 0.5
1187 0.54
1188 0.57
1189 0.56
1190 0.56
1191 0.55
1192 0.58
1193 0.59
1194 0.57
1195 0.58
1196 0.58
1197 0.57
1198 0.55
1199 0.6
1200 0.64