Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A559LZL1

Protein Details
Accession A0A559LZL1    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-65MAEPPHKRARRPDSKQMWDEADRRAPLPSRERDEPRRDRRDDRDRDRNRRYRSRSPRDSRGGDRDBasic
138-159DSGRRVTRSRSPRRERDRDERIBasic
215-238VDPGQKSKGKGKKGKGKNKAAAEDBasic
274-294ISAVRKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-12KRARRP
22-92DRRAPLPSRERDEPRRDRRDDRDRDRNRRYRSRSPRDSRGGDRDRDRRRDDRDARGSGRGRDDRDRNGRRE
122-159GREKPRLRSRERERERDSGRRVTRSRSPRRERDRDERI
220-233KSKGKGKKGKGKNK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MAEPPHKRARRPDSKQMWDEADRRAPLPSRERDEPRRDRRDDRDRDRNRRYRSRSPRDSRGGDRDRDRRRDDRDARGSGRGRDDRDRNGRREDDRDRARDRDVFSGDLAFRQRSNGVSQDGGREKPRLRSRERERERDSGRRVTRSRSPRRERDRDERIDGAKEKHAEHEVEKEKEDTAALIGDDEPLKSRAATPPVSFKVGTVPAAQDHDRMDVDPGQKSKGKGKKGKGKNKAAAEDDDDLVVEDAGMAAMQAMMGFGGFGTTQNKKVAGNDISAVRKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPSRET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.83
3 0.78
4 0.74
5 0.69
6 0.64
7 0.6
8 0.56
9 0.48
10 0.45
11 0.44
12 0.41
13 0.42
14 0.48
15 0.49
16 0.49
17 0.56
18 0.64
19 0.7
20 0.76
21 0.79
22 0.81
23 0.82
24 0.81
25 0.81
26 0.83
27 0.84
28 0.84
29 0.83
30 0.84
31 0.84
32 0.89
33 0.91
34 0.9
35 0.89
36 0.89
37 0.88
38 0.88
39 0.88
40 0.89
41 0.89
42 0.88
43 0.88
44 0.86
45 0.84
46 0.8
47 0.8
48 0.76
49 0.72
50 0.72
51 0.72
52 0.72
53 0.74
54 0.74
55 0.71
56 0.71
57 0.75
58 0.74
59 0.75
60 0.74
61 0.72
62 0.68
63 0.68
64 0.64
65 0.57
66 0.58
67 0.52
68 0.49
69 0.5
70 0.52
71 0.54
72 0.61
73 0.64
74 0.6
75 0.62
76 0.64
77 0.6
78 0.63
79 0.59
80 0.59
81 0.59
82 0.61
83 0.59
84 0.55
85 0.55
86 0.51
87 0.47
88 0.43
89 0.38
90 0.32
91 0.27
92 0.27
93 0.24
94 0.22
95 0.21
96 0.16
97 0.14
98 0.14
99 0.15
100 0.14
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.17
105 0.17
106 0.22
107 0.23
108 0.24
109 0.24
110 0.25
111 0.25
112 0.32
113 0.4
114 0.41
115 0.44
116 0.52
117 0.6
118 0.68
119 0.73
120 0.74
121 0.72
122 0.73
123 0.73
124 0.71
125 0.66
126 0.64
127 0.61
128 0.59
129 0.55
130 0.51
131 0.54
132 0.56
133 0.62
134 0.63
135 0.68
136 0.7
137 0.78
138 0.83
139 0.82
140 0.81
141 0.79
142 0.74
143 0.69
144 0.63
145 0.55
146 0.49
147 0.44
148 0.37
149 0.31
150 0.28
151 0.24
152 0.23
153 0.24
154 0.21
155 0.19
156 0.26
157 0.28
158 0.28
159 0.28
160 0.26
161 0.24
162 0.23
163 0.22
164 0.13
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.1
178 0.13
179 0.17
180 0.2
181 0.2
182 0.26
183 0.28
184 0.31
185 0.29
186 0.25
187 0.25
188 0.24
189 0.24
190 0.17
191 0.16
192 0.15
193 0.18
194 0.19
195 0.16
196 0.15
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.15
201 0.17
202 0.18
203 0.21
204 0.21
205 0.23
206 0.26
207 0.27
208 0.34
209 0.37
210 0.45
211 0.5
212 0.59
213 0.66
214 0.73
215 0.82
216 0.83
217 0.86
218 0.84
219 0.83
220 0.79
221 0.72
222 0.64
223 0.58
224 0.5
225 0.4
226 0.32
227 0.24
228 0.19
229 0.15
230 0.12
231 0.07
232 0.04
233 0.04
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.03
247 0.03
248 0.05
249 0.1
250 0.13
251 0.16
252 0.19
253 0.2
254 0.21
255 0.23
256 0.3
257 0.28
258 0.27
259 0.27
260 0.31
261 0.33
262 0.35
263 0.38
264 0.36
265 0.37
266 0.39
267 0.45
268 0.5
269 0.57
270 0.65
271 0.69
272 0.74
273 0.79
274 0.83
275 0.82
276 0.78
277 0.72
278 0.65
279 0.57
280 0.54
281 0.51
282 0.45
283 0.41
284 0.39
285 0.38