FuNGI

A0A559MED7

Protein Details

Accession

A0A559MED7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-36	VEPPRKRQKLSPTPTPTPNT	Hydrophilic
905-924	GSPVKKVKDAFKKLDKRSST	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto 12, mito_nucl 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR001656 PsdUridine_synth_TruD IPR020119 PsdUridine_synth_TruD_CS IPR011760 PsdUridine_synth_TruD_insert IPR042214 TruD_catalytic
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01142 TruD
PROSITE	View protein in PROSITE PS50984 TRUD PS01268 UPF0024
CDD	cd02576 PseudoU_synth_ScPUS7

Amino Acid Sequences

MASLESKVSVGEAAAGVEPPRKRQKLSPTPTPTPNTNTTTTTDDNKTNMDHRPSKLDVVGETSDGKEAEVGILHFVNASNPGFSGVLKQRYTDFLVHEIDLDGTVIHLTDDQAPRVSNDARKVPEVQPTKPVPEAANATAPAAEENEVKPAPEVSKENVAPQPSSDVKSEAGALTEPPSANAIPGELFTSTETQDRIKPEEFQLLISYFGHDLTEKIFKMYQSILAKPGAKASTFGTIQTEPITDKEIRGRIHGDIRRIFNSKLETEMINEGKILIAASRGAMSQNGRYQNPRNQPRGGQPQGKVGWEELGGQHLHFTLEKKNKDTMEVLGYLARMMKMKPKEFAFAGTKDRRAVTVQRVSVFRKHAKELARYNSSLREARIGNFEYKKNRLELGELGGNQFTITLRDCQFPNEADLDEEARLELGRTLVGDAVKYLQANGFINYFGLQRFGTFGIGTHQIGMKILKDDFEGAVWDILSYTDETLRMGLYPEEHPEPLNRTNRDDVDRALAINSFKKGGRAQDSLRRLPKKFHGEASLIQALTGHHKNDFAGALLQITRGLRTMYVHAYQSYIWNMAASIRWAKYGTKVIAGDLVLVDTPAQIASAAKDEVDENGEVVVRPAADDTAVTHDDLYQRARSLSVEEAESGKYTIFDIILPTPGFDIEYPANDIGDYYKEFMGSEQGGGLDPANMRRKHKDFSLSGSYRPLMAKVGQDLSFEVQAYHSETEQLVETDTEKLDNSRPKRVATGGWNNNRDNNANGRENKPWASRGQFNNSRGGPSSDQGNNWTTRQGRNTNAGKSEEANQDSSALKAWKALPDKLQAEEKAAAEVYEAQKLITKPDDPNTVPQPLIKDTFIETNPGDWTKKTGRKTTVIHAAQNQDSNKDEKHDAGIRSFDGASDSKPGSPVKKVKDAFKKLDKRSSTSDLTVPGANDDSHSSTTELTPQESGMIQHVVSTPSISDTSDGGVKLSGHSDEVGKKPASILRPDAKEFSVKQENGKVPTSMLDSAEPSSKRPAEEITQEAEQARIAVVVKFALGSSQYATMALRELMKAGGVKNYTPEFCSAR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.1
3	0.1
4	0.16
5	0.18
6	0.25
7	0.36
8	0.39
9	0.43
10	0.5
11	0.6
12	0.66
13	0.73
14	0.75
15	0.74
16	0.77
17	0.81
18	0.78
19	0.72
20	0.67
21	0.66
22	0.6
23	0.54
24	0.49
25	0.44
26	0.45
27	0.43
28	0.43
29	0.41
30	0.39
31	0.37
32	0.37
33	0.37
34	0.36
35	0.4
36	0.43
37	0.45
38	0.45
39	0.51
40	0.51
41	0.52
42	0.5
43	0.44
44	0.36
45	0.34
46	0.32
47	0.27
48	0.25
49	0.22
50	0.21
51	0.19
52	0.18
53	0.12
54	0.11
55	0.1
56	0.11
57	0.1
58	0.11
59	0.11
60	0.11
61	0.11
62	0.1
63	0.11
64	0.13
65	0.13
66	0.11
67	0.11
68	0.13
69	0.13
70	0.13
71	0.2
72	0.24
73	0.31
74	0.32
75	0.33
76	0.33
77	0.36
78	0.41
79	0.36
80	0.31
81	0.28
82	0.3
83	0.29
84	0.27
85	0.24
86	0.2
87	0.17
88	0.14
89	0.09
90	0.06
91	0.06
92	0.05
93	0.05
94	0.05
95	0.06
96	0.14
97	0.16
98	0.18
99	0.2
100	0.2
101	0.21
102	0.25
103	0.29
104	0.27
105	0.31
106	0.37
107	0.38
108	0.41
109	0.45
110	0.44
111	0.48
112	0.48
113	0.44
114	0.46
115	0.47
116	0.48
117	0.45
118	0.44
119	0.36
120	0.35
121	0.38
122	0.32
123	0.32
124	0.28
125	0.27
126	0.24
127	0.23
128	0.18
129	0.15
130	0.14
131	0.11
132	0.11
133	0.16
134	0.16
135	0.16
136	0.16
137	0.17
138	0.17
139	0.2
140	0.23
141	0.21
142	0.3
143	0.3
144	0.35
145	0.36
146	0.37
147	0.33
148	0.3
149	0.33
150	0.28
151	0.3
152	0.26
153	0.24
154	0.22
155	0.23
156	0.24
157	0.17
158	0.15
159	0.13
160	0.12
161	0.12
162	0.15
163	0.14
164	0.13
165	0.15
166	0.14
167	0.14
168	0.13
169	0.11
170	0.09
171	0.09
172	0.1
173	0.08
174	0.09
175	0.09
176	0.11
177	0.12
178	0.13
179	0.14
180	0.15
181	0.19
182	0.22
183	0.26
184	0.26
185	0.28
186	0.29
187	0.35
188	0.34
189	0.31
190	0.3
191	0.25
192	0.25
193	0.22
194	0.2
195	0.13
196	0.13
197	0.12
198	0.09
199	0.09
200	0.11
201	0.16
202	0.15
203	0.17
204	0.18
205	0.18
206	0.21
207	0.22
208	0.26
209	0.25
210	0.26
211	0.27
212	0.29
213	0.31
214	0.28
215	0.32
216	0.26
217	0.22
218	0.22
219	0.21
220	0.23
221	0.21
222	0.22
223	0.2
224	0.19
225	0.2
226	0.19
227	0.18
228	0.13
229	0.14
230	0.18
231	0.14
232	0.16
233	0.21
234	0.26
235	0.26
236	0.28
237	0.29
238	0.29
239	0.37
240	0.39
241	0.4
242	0.41
243	0.44
244	0.46
245	0.47
246	0.43
247	0.38
248	0.39
249	0.33
250	0.3
251	0.28
252	0.23
253	0.22
254	0.28
255	0.24
256	0.2
257	0.19
258	0.16
259	0.14
260	0.13
261	0.11
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.09
270	0.1
271	0.14
272	0.2
273	0.24
274	0.25
275	0.3
276	0.36
277	0.43
278	0.52
279	0.56
280	0.56
281	0.55
282	0.58
283	0.62
284	0.66
285	0.64
286	0.61
287	0.53
288	0.56
289	0.54
290	0.51
291	0.43
292	0.33
293	0.27
294	0.2
295	0.2
296	0.12
297	0.13
298	0.12
299	0.11
300	0.11
301	0.09
302	0.1
303	0.1
304	0.12
305	0.18
306	0.26
307	0.29
308	0.32
309	0.37
310	0.36
311	0.38
312	0.38
313	0.32
314	0.27
315	0.25
316	0.22
317	0.18
318	0.17
319	0.15
320	0.14
321	0.12
322	0.09
323	0.09
324	0.16
325	0.21
326	0.24
327	0.28
328	0.29
329	0.32
330	0.32
331	0.36
332	0.34
333	0.3
334	0.37
335	0.36
336	0.37
337	0.35
338	0.35
339	0.31
340	0.3
341	0.32
342	0.32
343	0.35
344	0.35
345	0.37
346	0.39
347	0.41
348	0.43
349	0.44
350	0.42
351	0.38
352	0.39
353	0.4
354	0.43
355	0.47
356	0.5
357	0.51
358	0.49
359	0.46
360	0.45
361	0.44
362	0.42
363	0.37
364	0.3
365	0.27
366	0.23
367	0.24
368	0.27
369	0.25
370	0.27
371	0.29
372	0.33
373	0.34
374	0.37
375	0.37
376	0.34
377	0.33
378	0.28
379	0.27
380	0.24
381	0.23
382	0.22
383	0.2
384	0.19
385	0.17
386	0.16
387	0.13
388	0.12
389	0.08
390	0.06
391	0.07
392	0.11
393	0.12
394	0.15
395	0.15
396	0.17
397	0.19
398	0.18
399	0.19
400	0.16
401	0.15
402	0.13
403	0.14
404	0.13
405	0.11
406	0.1
407	0.08
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.05
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.05
416	0.06
417	0.07
418	0.06
419	0.06
420	0.07
421	0.08
422	0.07
423	0.07
424	0.07
425	0.09
426	0.09
427	0.1
428	0.09
429	0.08
430	0.09
431	0.09
432	0.09
433	0.07
434	0.08
435	0.07
436	0.07
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.07
441	0.08
442	0.09
443	0.11
444	0.11
445	0.1
446	0.1
447	0.1
448	0.1
449	0.11
450	0.09
451	0.09
452	0.09
453	0.09
454	0.08
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.07
460	0.07
461	0.06
462	0.06
463	0.05
464	0.05
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.06
472	0.06
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.07
477	0.08
478	0.1
479	0.11
480	0.11
481	0.12
482	0.13
483	0.17
484	0.22
485	0.28
486	0.27
487	0.29
488	0.32
489	0.34
490	0.36
491	0.33
492	0.27
493	0.23
494	0.22
495	0.19
496	0.16
497	0.15
498	0.12
499	0.13
500	0.12
501	0.1
502	0.1
503	0.12
504	0.14
505	0.17
506	0.21
507	0.23
508	0.26
509	0.32
510	0.38
511	0.41
512	0.47
513	0.48
514	0.43
515	0.44
516	0.49
517	0.49
518	0.46
519	0.43
520	0.39
521	0.36
522	0.37
523	0.38
524	0.32
525	0.24
526	0.21
527	0.19
528	0.15
529	0.18
530	0.18
531	0.13
532	0.11
533	0.12
534	0.12
535	0.12
536	0.12
537	0.08
538	0.07
539	0.07
540	0.07
541	0.06
542	0.07
543	0.07
544	0.07
545	0.06
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.07
550	0.09
551	0.11
552	0.12
553	0.13
554	0.12
555	0.13
556	0.13
557	0.14
558	0.12
559	0.1
560	0.09
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.07
566	0.09
567	0.09
568	0.1
569	0.11
570	0.11
571	0.14
572	0.19
573	0.19
574	0.19
575	0.19
576	0.18
577	0.19
578	0.18
579	0.15
580	0.09
581	0.09
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.03
591	0.04
592	0.06
593	0.06
594	0.05
595	0.06
596	0.06
597	0.07
598	0.08
599	0.08
600	0.06
601	0.06
602	0.07
603	0.06
604	0.06
605	0.06
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.04
610	0.04
611	0.04
612	0.05
613	0.09
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.11
618	0.12
619	0.13
620	0.15
621	0.11
622	0.12
623	0.12
624	0.12
625	0.11
626	0.12
627	0.13
628	0.12
629	0.12
630	0.12
631	0.12
632	0.12
633	0.12
634	0.1
635	0.08
636	0.07
637	0.07
638	0.07
639	0.06
640	0.06
641	0.07
642	0.07
643	0.1
644	0.1
645	0.1
646	0.09
647	0.09
648	0.09
649	0.07
650	0.1
651	0.08
652	0.09
653	0.11
654	0.11
655	0.11
656	0.1
657	0.1
658	0.08
659	0.09
660	0.09
661	0.09
662	0.09
663	0.09
664	0.09
665	0.09
666	0.12
667	0.1
668	0.09
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.08
673	0.08
674	0.07
675	0.07
676	0.13
677	0.21
678	0.23
679	0.27
680	0.34
681	0.38
682	0.39
683	0.43
684	0.45
685	0.39
686	0.44
687	0.51
688	0.45
689	0.42
690	0.42
691	0.38
692	0.32
693	0.3
694	0.23
695	0.15
696	0.15
697	0.15
698	0.15
699	0.18
700	0.17
701	0.17
702	0.17
703	0.17
704	0.16
705	0.14
706	0.12
707	0.09
708	0.09
709	0.12
710	0.11
711	0.1
712	0.1
713	0.1
714	0.11
715	0.11
716	0.1
717	0.08
718	0.08
719	0.09
720	0.09
721	0.09
722	0.09
723	0.09
724	0.1
725	0.15
726	0.23
727	0.26
728	0.33
729	0.36
730	0.36
731	0.39
732	0.4
733	0.39
734	0.4
735	0.47
736	0.47
737	0.53
738	0.57
739	0.56
740	0.57
741	0.54
742	0.47
743	0.39
744	0.36
745	0.34
746	0.36
747	0.39
748	0.39
749	0.4
750	0.42
751	0.44
752	0.4
753	0.37
754	0.35
755	0.36
756	0.4
757	0.42
758	0.49
759	0.52
760	0.51
761	0.55
762	0.51
763	0.48
764	0.42
765	0.41
766	0.33
767	0.26
768	0.3
769	0.25
770	0.25
771	0.26
772	0.28
773	0.26
774	0.24
775	0.29
776	0.25
777	0.28
778	0.34
779	0.36
780	0.36
781	0.43
782	0.48
783	0.48
784	0.49
785	0.47
786	0.41
787	0.38
788	0.4
789	0.37
790	0.34
791	0.31
792	0.27
793	0.26
794	0.25
795	0.24
796	0.2
797	0.15
798	0.13
799	0.15
800	0.17
801	0.22
802	0.26
803	0.28
804	0.29
805	0.36
806	0.38
807	0.37
808	0.41
809	0.35
810	0.35
811	0.35
812	0.3
813	0.24
814	0.22
815	0.19
816	0.14
817	0.18
818	0.16
819	0.16
820	0.15
821	0.14
822	0.18
823	0.19
824	0.22
825	0.2
826	0.22
827	0.23
828	0.28
829	0.35
830	0.33
831	0.39
832	0.4
833	0.39
834	0.37
835	0.35
836	0.33
837	0.3
838	0.31
839	0.24
840	0.21
841	0.2
842	0.25
843	0.24
844	0.24
845	0.21
846	0.2
847	0.22
848	0.24
849	0.23
850	0.18
851	0.24
852	0.3
853	0.37
854	0.42
855	0.47
856	0.5
857	0.57
858	0.61
859	0.62
860	0.63
861	0.6
862	0.58
863	0.55
864	0.54
865	0.49
866	0.5
867	0.43
868	0.35
869	0.34
870	0.33
871	0.29
872	0.28
873	0.27
874	0.23
875	0.28
876	0.32
877	0.32
878	0.31
879	0.32
880	0.29
881	0.29
882	0.28
883	0.21
884	0.18
885	0.17
886	0.15
887	0.18
888	0.18
889	0.17
890	0.2
891	0.23
892	0.24
893	0.32
894	0.38
895	0.4
896	0.49
897	0.52
898	0.58
899	0.66
900	0.71
901	0.71
902	0.74
903	0.78
904	0.76
905	0.82
906	0.77
907	0.71
908	0.7
909	0.67
910	0.61
911	0.54
912	0.5
913	0.43
914	0.4
915	0.37
916	0.29
917	0.24
918	0.21
919	0.18
920	0.16
921	0.17
922	0.18
923	0.17
924	0.18
925	0.17
926	0.17
927	0.18
928	0.23
929	0.21
930	0.19
931	0.19
932	0.17
933	0.18
934	0.17
935	0.17
936	0.14
937	0.14
938	0.12
939	0.14
940	0.15
941	0.15
942	0.14
943	0.14
944	0.12
945	0.13
946	0.14
947	0.12
948	0.12
949	0.11
950	0.13
951	0.15
952	0.15
953	0.12
954	0.13
955	0.13
956	0.13
957	0.15
958	0.14
959	0.12
960	0.13
961	0.16
962	0.2
963	0.24
964	0.29
965	0.27
966	0.26
967	0.29
968	0.33
969	0.34
970	0.34
971	0.38
972	0.41
973	0.46
974	0.49
975	0.49
976	0.46
977	0.47
978	0.43
979	0.44
980	0.45
981	0.41
982	0.43
983	0.49
984	0.53
985	0.51
986	0.53
987	0.44
988	0.35
989	0.37
990	0.36
991	0.29
992	0.25
993	0.22
994	0.21
995	0.22
996	0.28
997	0.26
998	0.24
999	0.31
1000	0.32
1001	0.31
1002	0.31
1003	0.34
1004	0.33
1005	0.39
1006	0.4
1007	0.36
1008	0.35
1009	0.36
1010	0.34
1011	0.29
1012	0.23
1013	0.18
1014	0.14
1015	0.11
1016	0.11
1017	0.1
1018	0.1
1019	0.1
1020	0.1
1021	0.1
1022	0.09
1023	0.09
1024	0.09
1025	0.1
1026	0.11
1027	0.13
1028	0.13
1029	0.13
1030	0.14
1031	0.13
1032	0.14
1033	0.14
1034	0.14
1035	0.12
1036	0.13
1037	0.13
1038	0.15
1039	0.16
1040	0.15
1041	0.2
1042	0.2
1043	0.21
1044	0.26
1045	0.31
1046	0.3
1047	0.3

A0A559MED7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer