Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A559M1A3

Protein Details
Accession A0A559M1A3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
211-233DWEINQTYKKPKKGQPRTPLILCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
545-548AKKK
968-981KRPGPGGRGGLGIK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 6.5, pero 6, cyto_mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12299  RRM4_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MPDPVGEDAWLALVDEASRTAGDLVQRVEVVELYKRAIFAEPWSNKLWLAYCEWVWSLHTDCQNGDAGWPEEEQLFGQEAFSLETALDIWQQGAQATQYRLNDSHELWNRWISIEQEQLALSKTPERIERIKKLFLDRLQIPHTTWEETSSAFSMFITKYDEPAWESTMVQVVKLAQNAKDLYSKREDHESKLRQVGDNESLIAAMKTYLDWEINQTYKKPKKGQPRTPLILCVALFERALCSTPLGLDATTWEDYLTFLSGADAAQAASLPSALSVVQRAVVHCSWSGNLWAQYILTAELANLSFEDMERIKHAATNTRELDRDGMEGVIEFYVAWAGYLKRRTMGSNVAEEDIDVAEMGLPTALESIQEWGQRRYGVAEWKGDPLFRIERIFIQYHTQRGSLDEARGYWRRLIPTHGDNYEFWQSYYMWEMTTQDPTSAAPEQATDVLVQAIHRHNLNWPEKIMEMYIRHCNLHEDVDTLVKARAIVYRLSKGITKRRAREAQEAAALYAQPQALEQATVEQSPSGASKRKREETPGDGEGNAKKKAKSAEESEALREQNLKRDRENTTVIVTGLPAELTQTKLRQYFKEYGHINQITLRTEVDKLSSTAMIEFRSPEDVQSALLRDGKYFVDKQIHVEAGAGLTLYVTNFPPTADDNYLRKLFKDCGEVFSIRWPSLKYNTTRRFCYISFRTRQAAAAATQMDGHSLGGVYKLLAKYSDPLNKKDREGAMAEGREVHVTGLDFGLSEDDVKEVFSKYGKVERARILRKMNGESKGAGFVSFENKEEAAAALELDKTKVKSRIITVEMSTGSNFKTTATTKGLSASPAPEGDGHSIASASPGPDGHPNTYGPPKADISNRTVALMNIPDTVNDARIRAIAEQHGEIVKLVLRPEHQGATIEYIDVPAAGRALLALENYEIAPGRKLRTGSVRDLFAQKDEIRTDKILIGKERKAPASFMQPSAPVKRPGPGGRGGLGIKKGVGYGVPKAAAQEGANGNGGKAKSNADFKAMFISGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.07
4 0.08
5 0.07
6 0.08
7 0.08
8 0.1
9 0.13
10 0.16
11 0.17
12 0.18
13 0.18
14 0.18
15 0.18
16 0.17
17 0.16
18 0.17
19 0.17
20 0.18
21 0.19
22 0.19
23 0.2
24 0.21
25 0.2
26 0.21
27 0.3
28 0.3
29 0.33
30 0.36
31 0.36
32 0.34
33 0.35
34 0.32
35 0.24
36 0.26
37 0.26
38 0.24
39 0.26
40 0.26
41 0.24
42 0.23
43 0.23
44 0.22
45 0.24
46 0.28
47 0.27
48 0.27
49 0.28
50 0.3
51 0.26
52 0.23
53 0.22
54 0.2
55 0.19
56 0.19
57 0.18
58 0.16
59 0.16
60 0.15
61 0.12
62 0.13
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.1
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.11
82 0.15
83 0.17
84 0.22
85 0.23
86 0.27
87 0.28
88 0.32
89 0.33
90 0.31
91 0.38
92 0.41
93 0.44
94 0.42
95 0.44
96 0.4
97 0.38
98 0.37
99 0.3
100 0.27
101 0.29
102 0.27
103 0.25
104 0.24
105 0.24
106 0.23
107 0.22
108 0.17
109 0.17
110 0.19
111 0.21
112 0.25
113 0.3
114 0.37
115 0.45
116 0.54
117 0.55
118 0.6
119 0.61
120 0.64
121 0.66
122 0.61
123 0.6
124 0.54
125 0.54
126 0.51
127 0.48
128 0.42
129 0.4
130 0.39
131 0.34
132 0.29
133 0.26
134 0.23
135 0.22
136 0.24
137 0.18
138 0.16
139 0.13
140 0.13
141 0.14
142 0.13
143 0.14
144 0.18
145 0.17
146 0.18
147 0.2
148 0.21
149 0.2
150 0.22
151 0.23
152 0.18
153 0.18
154 0.17
155 0.21
156 0.2
157 0.17
158 0.16
159 0.16
160 0.17
161 0.2
162 0.22
163 0.17
164 0.22
165 0.23
166 0.24
167 0.29
168 0.28
169 0.3
170 0.35
171 0.37
172 0.34
173 0.44
174 0.44
175 0.44
176 0.53
177 0.55
178 0.53
179 0.57
180 0.57
181 0.49
182 0.49
183 0.48
184 0.41
185 0.35
186 0.3
187 0.23
188 0.21
189 0.18
190 0.16
191 0.1
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.12
200 0.17
201 0.2
202 0.22
203 0.25
204 0.34
205 0.4
206 0.48
207 0.53
208 0.57
209 0.65
210 0.74
211 0.81
212 0.81
213 0.84
214 0.83
215 0.76
216 0.71
217 0.62
218 0.55
219 0.44
220 0.36
221 0.27
222 0.2
223 0.18
224 0.15
225 0.14
226 0.11
227 0.12
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.12
238 0.12
239 0.12
240 0.1
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.1
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.03
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.15
269 0.15
270 0.16
271 0.16
272 0.17
273 0.14
274 0.14
275 0.16
276 0.14
277 0.15
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.1
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.1
298 0.11
299 0.11
300 0.13
301 0.15
302 0.2
303 0.23
304 0.3
305 0.31
306 0.32
307 0.33
308 0.31
309 0.32
310 0.24
311 0.22
312 0.15
313 0.12
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.06
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.06
326 0.1
327 0.14
328 0.14
329 0.16
330 0.17
331 0.19
332 0.21
333 0.27
334 0.26
335 0.27
336 0.28
337 0.27
338 0.25
339 0.23
340 0.21
341 0.13
342 0.1
343 0.06
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.04
355 0.06
356 0.08
357 0.12
358 0.14
359 0.15
360 0.16
361 0.17
362 0.17
363 0.17
364 0.18
365 0.21
366 0.22
367 0.25
368 0.24
369 0.28
370 0.28
371 0.25
372 0.23
373 0.2
374 0.2
375 0.18
376 0.18
377 0.15
378 0.17
379 0.21
380 0.22
381 0.18
382 0.22
383 0.23
384 0.25
385 0.26
386 0.24
387 0.2
388 0.21
389 0.25
390 0.21
391 0.2
392 0.17
393 0.16
394 0.21
395 0.23
396 0.23
397 0.21
398 0.21
399 0.22
400 0.23
401 0.26
402 0.26
403 0.28
404 0.31
405 0.29
406 0.29
407 0.26
408 0.29
409 0.31
410 0.26
411 0.21
412 0.18
413 0.17
414 0.16
415 0.19
416 0.15
417 0.1
418 0.1
419 0.12
420 0.12
421 0.15
422 0.14
423 0.11
424 0.11
425 0.11
426 0.14
427 0.12
428 0.11
429 0.08
430 0.08
431 0.09
432 0.09
433 0.09
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.05
439 0.08
440 0.09
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.13
445 0.22
446 0.25
447 0.24
448 0.23
449 0.23
450 0.23
451 0.23
452 0.2
453 0.15
454 0.13
455 0.15
456 0.2
457 0.19
458 0.19
459 0.19
460 0.21
461 0.18
462 0.19
463 0.16
464 0.12
465 0.11
466 0.12
467 0.12
468 0.11
469 0.1
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.09
474 0.09
475 0.12
476 0.13
477 0.15
478 0.15
479 0.16
480 0.18
481 0.21
482 0.29
483 0.36
484 0.4
485 0.42
486 0.5
487 0.56
488 0.58
489 0.62
490 0.57
491 0.49
492 0.46
493 0.41
494 0.33
495 0.26
496 0.22
497 0.14
498 0.12
499 0.09
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.06
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.07
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.07
514 0.08
515 0.13
516 0.16
517 0.24
518 0.31
519 0.37
520 0.38
521 0.43
522 0.47
523 0.46
524 0.49
525 0.45
526 0.39
527 0.33
528 0.33
529 0.31
530 0.29
531 0.27
532 0.23
533 0.2
534 0.22
535 0.26
536 0.28
537 0.29
538 0.3
539 0.32
540 0.35
541 0.36
542 0.35
543 0.34
544 0.3
545 0.26
546 0.25
547 0.2
548 0.24
549 0.29
550 0.29
551 0.28
552 0.34
553 0.37
554 0.37
555 0.4
556 0.33
557 0.28
558 0.27
559 0.25
560 0.2
561 0.16
562 0.11
563 0.08
564 0.07
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.08
569 0.09
570 0.1
571 0.14
572 0.18
573 0.21
574 0.22
575 0.27
576 0.32
577 0.32
578 0.39
579 0.37
580 0.35
581 0.41
582 0.39
583 0.34
584 0.3
585 0.29
586 0.23
587 0.22
588 0.2
589 0.13
590 0.14
591 0.14
592 0.13
593 0.12
594 0.11
595 0.11
596 0.11
597 0.1
598 0.11
599 0.11
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.09
604 0.13
605 0.13
606 0.11
607 0.11
608 0.11
609 0.11
610 0.12
611 0.12
612 0.1
613 0.13
614 0.13
615 0.12
616 0.14
617 0.14
618 0.16
619 0.15
620 0.17
621 0.2
622 0.2
623 0.23
624 0.25
625 0.25
626 0.22
627 0.21
628 0.18
629 0.12
630 0.11
631 0.08
632 0.04
633 0.04
634 0.04
635 0.03
636 0.04
637 0.04
638 0.05
639 0.06
640 0.06
641 0.07
642 0.09
643 0.13
644 0.15
645 0.18
646 0.2
647 0.24
648 0.29
649 0.27
650 0.26
651 0.26
652 0.26
653 0.25
654 0.31
655 0.27
656 0.26
657 0.3
658 0.3
659 0.27
660 0.31
661 0.3
662 0.23
663 0.23
664 0.22
665 0.21
666 0.27
667 0.32
668 0.31
669 0.39
670 0.49
671 0.52
672 0.54
673 0.54
674 0.52
675 0.47
676 0.51
677 0.48
678 0.48
679 0.48
680 0.49
681 0.48
682 0.44
683 0.45
684 0.37
685 0.31
686 0.22
687 0.2
688 0.17
689 0.14
690 0.14
691 0.13
692 0.12
693 0.1
694 0.09
695 0.06
696 0.05
697 0.05
698 0.05
699 0.05
700 0.05
701 0.08
702 0.08
703 0.09
704 0.09
705 0.1
706 0.12
707 0.19
708 0.26
709 0.26
710 0.31
711 0.38
712 0.41
713 0.43
714 0.47
715 0.42
716 0.37
717 0.36
718 0.35
719 0.34
720 0.31
721 0.3
722 0.24
723 0.23
724 0.2
725 0.18
726 0.13
727 0.08
728 0.08
729 0.08
730 0.07
731 0.06
732 0.06
733 0.06
734 0.07
735 0.06
736 0.06
737 0.05
738 0.05
739 0.06
740 0.06
741 0.07
742 0.07
743 0.09
744 0.09
745 0.11
746 0.14
747 0.21
748 0.26
749 0.29
750 0.33
751 0.4
752 0.49
753 0.52
754 0.56
755 0.55
756 0.54
757 0.56
758 0.57
759 0.56
760 0.5
761 0.47
762 0.41
763 0.37
764 0.35
765 0.29
766 0.22
767 0.16
768 0.14
769 0.18
770 0.18
771 0.18
772 0.16
773 0.16
774 0.16
775 0.16
776 0.15
777 0.1
778 0.09
779 0.08
780 0.07
781 0.08
782 0.09
783 0.1
784 0.12
785 0.13
786 0.18
787 0.23
788 0.25
789 0.28
790 0.32
791 0.39
792 0.4
793 0.41
794 0.36
795 0.35
796 0.33
797 0.3
798 0.26
799 0.19
800 0.16
801 0.14
802 0.13
803 0.1
804 0.14
805 0.15
806 0.19
807 0.23
808 0.24
809 0.23
810 0.26
811 0.27
812 0.23
813 0.23
814 0.2
815 0.17
816 0.16
817 0.17
818 0.14
819 0.16
820 0.17
821 0.16
822 0.14
823 0.13
824 0.12
825 0.11
826 0.12
827 0.11
828 0.08
829 0.08
830 0.08
831 0.1
832 0.16
833 0.19
834 0.2
835 0.22
836 0.22
837 0.26
838 0.33
839 0.34
840 0.29
841 0.3
842 0.3
843 0.31
844 0.36
845 0.36
846 0.35
847 0.39
848 0.38
849 0.35
850 0.34
851 0.3
852 0.28
853 0.26
854 0.21
855 0.17
856 0.16
857 0.15
858 0.18
859 0.18
860 0.18
861 0.17
862 0.16
863 0.14
864 0.15
865 0.17
866 0.15
867 0.18
868 0.18
869 0.2
870 0.2
871 0.21
872 0.21
873 0.2
874 0.18
875 0.16
876 0.15
877 0.14
878 0.14
879 0.15
880 0.16
881 0.2
882 0.23
883 0.24
884 0.22
885 0.23
886 0.23
887 0.25
888 0.24
889 0.2
890 0.17
891 0.15
892 0.14
893 0.12
894 0.11
895 0.06
896 0.06
897 0.05
898 0.05
899 0.05
900 0.06
901 0.06
902 0.06
903 0.07
904 0.07
905 0.08
906 0.08
907 0.09
908 0.09
909 0.09
910 0.14
911 0.16
912 0.19
913 0.22
914 0.24
915 0.28
916 0.36
917 0.41
918 0.46
919 0.48
920 0.47
921 0.47
922 0.5
923 0.47
924 0.39
925 0.39
926 0.32
927 0.33
928 0.33
929 0.33
930 0.33
931 0.34
932 0.34
933 0.31
934 0.34
935 0.35
936 0.4
937 0.44
938 0.46
939 0.51
940 0.55
941 0.56
942 0.53
943 0.51
944 0.47
945 0.5
946 0.49
947 0.44
948 0.41
949 0.4
950 0.44
951 0.48
952 0.48
953 0.43
954 0.41
955 0.43
956 0.48
957 0.49
958 0.48
959 0.48
960 0.46
961 0.42
962 0.45
963 0.42
964 0.39
965 0.35
966 0.31
967 0.25
968 0.22
969 0.21
970 0.17
971 0.18
972 0.16
973 0.18
974 0.22
975 0.22
976 0.22
977 0.23
978 0.24
979 0.24
980 0.21
981 0.23
982 0.21
983 0.22
984 0.25
985 0.24
986 0.23
987 0.25
988 0.25
989 0.2
990 0.2
991 0.22
992 0.24
993 0.32
994 0.33
995 0.34
996 0.34
997 0.32
998 0.37