Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A559MCH0

Protein Details
Accession A0A559MCH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
456-475FTPLIKKKAVKDRRISSRGPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-109RASKSKAPKN
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 5.5, cyto_mito 5, cyto 3.5, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MPLKTDNSLILTPSLPGRRVGLSKRGYKRCLGTVNGTRDQVEMPISTAKAAGKKSKVVKLEGDEDINRMPDSAESSSNGEDRGRIRPTAFQRAWQGPGARASKSKAPKNGMKPATVNGVRKNTRGSAKDIIASTQDSGSSSPKRKSQDDPPVHGSSMLDQFGRVQGKKAKTTFGSSQPSSSSYGRNSKKEKGIKIPEGPPDSPQTPDKGFKVLNIPEDSPGSTPGSNRGFVETTALRDDHSPILDFKHLPKLDDSMDEVSTGHHDSSPAGTRKTRGRKTFQSDDPSTQIAPFKMIEGLDELSGTAEAIIDEDIFKIPSKPQDELDDDIFATMTQRARCPMCNKPVDPEDLRAFGNMNTRKQEKFCQSHQKKTAQEEWELKEYPEIDWEKLGSRISKHYSFIRNVINGGESHYRDLLEDKVNAGKDRSLMKMTSNLTPGYYGARGLRAISENIMLEFTPLIKKKAVKDRRISSRGPTAFVQSVLVPEVTVLLIMEDMHVKVDKAREILDDSAGIGELIHEEIRDVVRKRVEDSEEESDFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.23
3 0.24
4 0.25
5 0.28
6 0.34
7 0.39
8 0.42
9 0.45
10 0.54
11 0.63
12 0.69
13 0.68
14 0.68
15 0.68
16 0.67
17 0.65
18 0.6
19 0.6
20 0.6
21 0.64
22 0.63
23 0.58
24 0.51
25 0.45
26 0.41
27 0.33
28 0.26
29 0.18
30 0.15
31 0.18
32 0.17
33 0.16
34 0.18
35 0.19
36 0.22
37 0.26
38 0.32
39 0.32
40 0.4
41 0.47
42 0.52
43 0.54
44 0.53
45 0.55
46 0.52
47 0.54
48 0.49
49 0.46
50 0.4
51 0.37
52 0.34
53 0.3
54 0.24
55 0.18
56 0.16
57 0.12
58 0.16
59 0.16
60 0.17
61 0.17
62 0.2
63 0.21
64 0.22
65 0.22
66 0.18
67 0.19
68 0.2
69 0.25
70 0.26
71 0.26
72 0.26
73 0.34
74 0.4
75 0.48
76 0.46
77 0.44
78 0.48
79 0.51
80 0.52
81 0.49
82 0.44
83 0.36
84 0.43
85 0.4
86 0.35
87 0.33
88 0.34
89 0.37
90 0.44
91 0.48
92 0.48
93 0.53
94 0.6
95 0.66
96 0.72
97 0.67
98 0.63
99 0.58
100 0.52
101 0.54
102 0.5
103 0.46
104 0.43
105 0.49
106 0.47
107 0.47
108 0.49
109 0.45
110 0.47
111 0.45
112 0.44
113 0.41
114 0.4
115 0.43
116 0.39
117 0.34
118 0.29
119 0.27
120 0.22
121 0.16
122 0.15
123 0.11
124 0.12
125 0.16
126 0.22
127 0.26
128 0.3
129 0.35
130 0.4
131 0.43
132 0.48
133 0.53
134 0.57
135 0.59
136 0.62
137 0.63
138 0.61
139 0.56
140 0.51
141 0.41
142 0.33
143 0.28
144 0.23
145 0.16
146 0.13
147 0.13
148 0.18
149 0.22
150 0.19
151 0.21
152 0.27
153 0.32
154 0.38
155 0.39
156 0.39
157 0.36
158 0.42
159 0.42
160 0.44
161 0.46
162 0.4
163 0.4
164 0.36
165 0.36
166 0.34
167 0.31
168 0.26
169 0.24
170 0.33
171 0.36
172 0.43
173 0.46
174 0.49
175 0.57
176 0.6
177 0.61
178 0.61
179 0.65
180 0.64
181 0.65
182 0.63
183 0.61
184 0.59
185 0.54
186 0.46
187 0.42
188 0.36
189 0.33
190 0.29
191 0.26
192 0.24
193 0.26
194 0.25
195 0.25
196 0.24
197 0.23
198 0.29
199 0.27
200 0.29
201 0.28
202 0.27
203 0.25
204 0.25
205 0.24
206 0.18
207 0.17
208 0.14
209 0.12
210 0.12
211 0.17
212 0.18
213 0.19
214 0.18
215 0.19
216 0.18
217 0.17
218 0.21
219 0.15
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.13
224 0.13
225 0.15
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.12
231 0.14
232 0.14
233 0.14
234 0.21
235 0.21
236 0.21
237 0.21
238 0.22
239 0.21
240 0.21
241 0.21
242 0.14
243 0.14
244 0.13
245 0.12
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.08
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.09
254 0.15
255 0.16
256 0.17
257 0.18
258 0.2
259 0.29
260 0.38
261 0.44
262 0.44
263 0.49
264 0.56
265 0.63
266 0.68
267 0.66
268 0.64
269 0.59
270 0.55
271 0.5
272 0.43
273 0.35
274 0.28
275 0.24
276 0.16
277 0.15
278 0.12
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.03
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.08
304 0.14
305 0.17
306 0.18
307 0.19
308 0.23
309 0.26
310 0.28
311 0.27
312 0.22
313 0.19
314 0.18
315 0.16
316 0.11
317 0.09
318 0.09
319 0.1
320 0.11
321 0.12
322 0.15
323 0.17
324 0.22
325 0.26
326 0.32
327 0.38
328 0.43
329 0.43
330 0.46
331 0.47
332 0.48
333 0.45
334 0.41
335 0.35
336 0.3
337 0.3
338 0.24
339 0.22
340 0.18
341 0.25
342 0.25
343 0.26
344 0.29
345 0.32
346 0.33
347 0.36
348 0.42
349 0.42
350 0.44
351 0.49
352 0.56
353 0.59
354 0.67
355 0.72
356 0.72
357 0.67
358 0.68
359 0.67
360 0.59
361 0.59
362 0.56
363 0.52
364 0.49
365 0.45
366 0.39
367 0.33
368 0.3
369 0.24
370 0.24
371 0.23
372 0.18
373 0.18
374 0.19
375 0.18
376 0.19
377 0.21
378 0.17
379 0.17
380 0.23
381 0.28
382 0.3
383 0.32
384 0.37
385 0.41
386 0.41
387 0.44
388 0.43
389 0.39
390 0.36
391 0.34
392 0.29
393 0.22
394 0.23
395 0.24
396 0.19
397 0.2
398 0.2
399 0.19
400 0.18
401 0.2
402 0.2
403 0.18
404 0.18
405 0.17
406 0.21
407 0.23
408 0.24
409 0.23
410 0.21
411 0.2
412 0.23
413 0.25
414 0.23
415 0.22
416 0.23
417 0.29
418 0.3
419 0.3
420 0.29
421 0.26
422 0.24
423 0.24
424 0.22
425 0.19
426 0.17
427 0.15
428 0.14
429 0.15
430 0.15
431 0.15
432 0.18
433 0.17
434 0.17
435 0.17
436 0.17
437 0.16
438 0.16
439 0.16
440 0.12
441 0.11
442 0.1
443 0.1
444 0.15
445 0.17
446 0.19
447 0.22
448 0.27
449 0.35
450 0.46
451 0.55
452 0.57
453 0.65
454 0.73
455 0.8
456 0.81
457 0.76
458 0.71
459 0.72
460 0.64
461 0.58
462 0.49
463 0.44
464 0.4
465 0.37
466 0.32
467 0.22
468 0.21
469 0.19
470 0.17
471 0.11
472 0.09
473 0.09
474 0.08
475 0.07
476 0.06
477 0.04
478 0.05
479 0.05
480 0.06
481 0.07
482 0.07
483 0.09
484 0.09
485 0.1
486 0.13
487 0.18
488 0.2
489 0.21
490 0.22
491 0.23
492 0.27
493 0.28
494 0.26
495 0.22
496 0.19
497 0.18
498 0.16
499 0.13
500 0.09
501 0.07
502 0.06
503 0.08
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.1
508 0.13
509 0.2
510 0.21
511 0.27
512 0.33
513 0.34
514 0.38
515 0.44
516 0.45
517 0.43
518 0.48
519 0.49
520 0.44