FuNGI

A0A559M039

Protein Details

Accession

A0A559M039

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
132-155	PDEYSAARKRRDQKKKADKELDDF	Basic
401-422	QGYTIWTRKNRNFKNRKFTESV	Hydrophilic
429-448	EAPTATQRRKKKEHEYVDEN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
139-147	RKRRDQKKK
195-270	KPMKAKSSKIKSPKGKSSSVVALAKYNRERAAEKKANEKAQAARARELAKKDKGVAKEAEKERKALEKEQKKWEKE

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 14, cyto 12.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR042530 EME1/EME2_C IPR006166 ERCC4_domain IPR033310 Mms4/EME1/EME2 IPR047521 XPF_nuclease_EME1_ascomycetes
Gene Ontology	GO:0048476 C:Holliday junction resolvase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0004519 F:endonuclease activity GO:0006310 P:DNA recombination GO:0006281 P:DNA repair GO:0051321 P:meiotic cell cycle
Pfam	View protein in Pfam PF02732 ERCC4
CDD	cd20085 XPF_nuclease_Mms4

Amino Acid Sequences

MTIISSDDSVFNVPGISIPHVSRPSAFATTKPNTSKPPSKPTAAHDVDVFFQEDDFDSTVNLDDSVLGLPPAKRQRLSPPPKAAPSKSTGYKRSVSNIETSSKGATTRTLSAPLLKRAKTALEDEILFTSSPDEYSAARKRRDQKKKADKELDDFDDVFGLDPPRASTSYFAEISDSSEEEFPDVVDIPMTAPAKPMKAKSSKIKSPKGKSSSVVALAKYNRERAAEKKANEKAQAARARELAKKDKGVAKEAEKERKALEKEQKKWEKERNQELAKVNVSRNDKKISTSEMIVEMSSGLDSIIADVVQKQLHPLQVEHSTWDETAPIVKWKRKVQSKYDIEKGHWVPTPAHIKAEEHIIYIMTAEELVERVTADERADIDIHVLQLKAKFNSCKIIYLIQGYTIWTRKNRNFKNRKFTESVNGQIPQEAPTATQRRKKKEHEYVDENVLEDALLRLQVIHGAMIHHVMLKHETAEWIVTFTQHISTIPYRTQKDLLDTAFCMESGQVKSGEDANDTCSKMLQEIIRITAPVAYGIMAEYPTAQKLVKGLKDNGPLALEECRKMANKNGAFTDRRVGQAISRRVHSVFTERDPGSFDV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.13
3	0.14
4	0.16
5	0.17
6	0.24
7	0.27
8	0.28
9	0.27
10	0.27
11	0.29
12	0.33
13	0.32
14	0.29
15	0.35
16	0.39
17	0.46
18	0.49
19	0.49
20	0.5
21	0.58
22	0.64
23	0.63
24	0.69
25	0.66
26	0.68
27	0.67
28	0.65
29	0.67
30	0.61
31	0.54
32	0.46
33	0.42
34	0.36
35	0.34
36	0.29
37	0.18
38	0.15
39	0.14
40	0.13
41	0.14
42	0.13
43	0.11
44	0.1
45	0.1
46	0.11
47	0.11
48	0.1
49	0.07
50	0.07
51	0.07
52	0.08
53	0.07
54	0.07
55	0.09
56	0.1
57	0.18
58	0.27
59	0.31
60	0.32
61	0.35
62	0.45
63	0.54
64	0.62
65	0.64
66	0.66
67	0.68
68	0.76
69	0.8
70	0.73
71	0.67
72	0.63
73	0.6
74	0.58
75	0.59
76	0.56
77	0.54
78	0.55
79	0.53
80	0.55
81	0.53
82	0.47
83	0.45
84	0.43
85	0.41
86	0.37
87	0.36
88	0.3
89	0.25
90	0.24
91	0.19
92	0.18
93	0.19
94	0.21
95	0.22
96	0.24
97	0.24
98	0.31
99	0.35
100	0.41
101	0.44
102	0.4
103	0.4
104	0.38
105	0.4
106	0.36
107	0.34
108	0.29
109	0.24
110	0.25
111	0.24
112	0.24
113	0.21
114	0.18
115	0.15
116	0.12
117	0.09
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.09
122	0.17
123	0.26
124	0.32
125	0.36
126	0.43
127	0.53
128	0.62
129	0.73
130	0.74
131	0.77
132	0.81
133	0.88
134	0.91
135	0.91
136	0.84
137	0.79
138	0.77
139	0.7
140	0.61
141	0.51
142	0.4
143	0.3
144	0.26
145	0.2
146	0.15
147	0.11
148	0.08
149	0.08
150	0.09
151	0.11
152	0.12
153	0.12
154	0.12
155	0.15
156	0.2
157	0.2
158	0.19
159	0.18
160	0.18
161	0.19
162	0.18
163	0.15
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.11
168	0.1
169	0.08
170	0.08
171	0.08
172	0.07
173	0.06
174	0.06
175	0.06
176	0.1
177	0.11
178	0.1
179	0.12
180	0.13
181	0.16
182	0.19
183	0.21
184	0.24
185	0.3
186	0.36
187	0.44
188	0.51
189	0.57
190	0.63
191	0.71
192	0.73
193	0.75
194	0.78
195	0.74
196	0.68
197	0.62
198	0.57
199	0.51
200	0.48
201	0.42
202	0.32
203	0.32
204	0.29
205	0.33
206	0.31
207	0.3
208	0.26
209	0.26
210	0.28
211	0.27
212	0.37
213	0.38
214	0.37
215	0.44
216	0.48
217	0.5
218	0.49
219	0.48
220	0.41
221	0.43
222	0.47
223	0.4
224	0.36
225	0.36
226	0.37
227	0.38
228	0.39
229	0.38
230	0.36
231	0.35
232	0.37
233	0.38
234	0.36
235	0.38
236	0.36
237	0.33
238	0.38
239	0.43
240	0.48
241	0.43
242	0.43
243	0.4
244	0.43
245	0.41
246	0.4
247	0.44
248	0.45
249	0.51
250	0.6
251	0.67
252	0.64
253	0.7
254	0.71
255	0.71
256	0.7
257	0.73
258	0.71
259	0.65
260	0.67
261	0.62
262	0.56
263	0.49
264	0.43
265	0.35
266	0.32
267	0.35
268	0.33
269	0.33
270	0.34
271	0.31
272	0.3
273	0.31
274	0.3
275	0.26
276	0.23
277	0.2
278	0.17
279	0.17
280	0.15
281	0.13
282	0.08
283	0.06
284	0.05
285	0.04
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.03
294	0.05
295	0.05
296	0.05
297	0.06
298	0.08
299	0.1
300	0.11
301	0.11
302	0.13
303	0.17
304	0.17
305	0.17
306	0.17
307	0.16
308	0.15
309	0.14
310	0.11
311	0.07
312	0.09
313	0.08
314	0.13
315	0.16
316	0.2
317	0.25
318	0.31
319	0.39
320	0.47
321	0.53
322	0.55
323	0.61
324	0.67
325	0.68
326	0.69
327	0.63
328	0.55
329	0.57
330	0.5
331	0.43
332	0.36
333	0.31
334	0.24
335	0.29
336	0.34
337	0.27
338	0.27
339	0.23
340	0.22
341	0.21
342	0.27
343	0.21
344	0.14
345	0.14
346	0.13
347	0.12
348	0.11
349	0.11
350	0.04
351	0.04
352	0.03
353	0.03
354	0.03
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.05
360	0.06
361	0.06
362	0.07
363	0.08
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.12
374	0.15
375	0.16
376	0.19
377	0.2
378	0.21
379	0.28
380	0.28
381	0.27
382	0.26
383	0.27
384	0.25
385	0.26
386	0.24
387	0.18
388	0.18
389	0.16
390	0.18
391	0.18
392	0.2
393	0.21
394	0.29
395	0.34
396	0.45
397	0.53
398	0.62
399	0.7
400	0.76
401	0.83
402	0.81
403	0.81
404	0.74
405	0.67
406	0.65
407	0.59
408	0.54
409	0.48
410	0.44
411	0.36
412	0.34
413	0.32
414	0.24
415	0.2
416	0.16
417	0.12
418	0.19
419	0.27
420	0.32
421	0.39
422	0.45
423	0.53
424	0.62
425	0.7
426	0.73
427	0.75
428	0.79
429	0.81
430	0.79
431	0.74
432	0.71
433	0.63
434	0.52
435	0.41
436	0.31
437	0.21
438	0.15
439	0.11
440	0.05
441	0.05
442	0.04
443	0.04
444	0.04
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.08
451	0.09
452	0.09
453	0.09
454	0.09
455	0.1
456	0.11
457	0.11
458	0.12
459	0.11
460	0.12
461	0.11
462	0.12
463	0.11
464	0.11
465	0.11
466	0.1
467	0.1
468	0.11
469	0.11
470	0.1
471	0.1
472	0.13
473	0.16
474	0.19
475	0.24
476	0.31
477	0.32
478	0.35
479	0.38
480	0.35
481	0.38
482	0.39
483	0.36
484	0.32
485	0.3
486	0.28
487	0.25
488	0.23
489	0.18
490	0.13
491	0.16
492	0.15
493	0.17
494	0.15
495	0.15
496	0.17
497	0.2
498	0.21
499	0.18
500	0.17
501	0.19
502	0.24
503	0.24
504	0.23
505	0.21
506	0.2
507	0.19
508	0.22
509	0.2
510	0.2
511	0.21
512	0.24
513	0.24
514	0.24
515	0.23
516	0.2
517	0.19
518	0.13
519	0.11
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.08
524	0.07
525	0.07
526	0.08
527	0.09
528	0.1
529	0.11
530	0.11
531	0.11
532	0.16
533	0.24
534	0.29
535	0.34
536	0.39
537	0.45
538	0.52
539	0.52
540	0.49
541	0.42
542	0.37
543	0.32
544	0.34
545	0.29
546	0.23
547	0.23
548	0.26
549	0.26
550	0.28
551	0.35
552	0.38
553	0.39
554	0.43
555	0.49
556	0.52
557	0.53
558	0.53
559	0.52
560	0.45
561	0.43
562	0.41
563	0.35
564	0.35
565	0.41
566	0.48
567	0.44
568	0.44
569	0.45
570	0.42
571	0.44
572	0.41
573	0.4
574	0.37
575	0.38
576	0.44
577	0.41
578	0.41

A0A559M039

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer