Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A559MHH4

Protein Details
Accession A0A559MHH4    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
48-97LCPIMPPSNNRPKRARREVAPAADIPDSSPSRPAKKRRRTTEAPRPTPAPHydrophilic
484-509LSYRAKDSAKKRSPKRSPTSKSPPSGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-65PKRARRE
76-92SPSRPAKKRRRTTEAPR
489-501KDSAKKRSPKRSP
Subcellular Location(s) mito 14, nucl 9, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000253  FHA_dom  
IPR001766  Fork_head_dom  
IPR008984  SMAD_FHA_dom_sf  
IPR030456  TF_fork_head_CS_2  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00498  FHA  
PF00250  Forkhead  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50006  FHA_DOMAIN  
PS00658  FORK_HEAD_2  
PS50039  FORK_HEAD_3  
CDD cd22701  FHA_FKH1-like  
Amino Acid Sequences VSRASVRASSNFLSICREGKKTGIRLFDVAVHTSNCADLLRRYSRIYLCPIMPPSNNRPKRARREVAPAADIPDSSPSRPAKKRRRTTEAPRPTPAPEPEPLPKDREGIRMGDDELIASIVPYLSMPNHEVQASTDHANALYEKLDNGVTAYAKLAGRDWTYYVKNLTNYIGRPPEGTPSENVAQDAVHNDLVWSTIHVDLGPIKMVSRQHVEIFFDTEEEEKWQILVHGRNGIRIDGVLFKKGEIHALVSGEVIDVAGVEMMFVLPQEGSLQVKKEYLLRAGLIDPSAANDSEEHGGNTTSSASSSSAQTVRGQNGVGPLPIAPAPPDYRRPGTPVSGRSNVKYTAGKSPYAGGTMMMNAEDVNLSLDSNQHIKPSYSYAQMITQAILDTDEEKLNLAGIYAYIQDKYAYYRYQLAGGWQNSIRHNLSLNKSFHKVARETDEPGKGMKWCIKPECRDDMARLCWKGGRGGHRGSSAPTSPANLSYRAKDSAKKRSPKRSPTSKSPPSGSFPDNAPQFTPDRSGQSMHDLPGDGSPLPRHRKMNHSKFGLSDDTPGSSPVLTSSYLQEEGHALVTPAPARVHPRLAPPSTAQRPSLGMPTSSPAPFWKYAEIGNTPMRGVGLDSSPIKRGAAPVPRSSSPAPARSPIRNGSTAKQPSAPEPEEIDEEDEGFDLTKGFQSIGSFHAPVSNGLPVAPARPAINSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.32
4 0.34
5 0.31
6 0.38
7 0.45
8 0.48
9 0.52
10 0.53
11 0.51
12 0.5
13 0.49
14 0.48
15 0.42
16 0.36
17 0.32
18 0.26
19 0.24
20 0.23
21 0.21
22 0.16
23 0.14
24 0.14
25 0.15
26 0.22
27 0.28
28 0.31
29 0.33
30 0.39
31 0.43
32 0.45
33 0.49
34 0.46
35 0.42
36 0.45
37 0.48
38 0.47
39 0.46
40 0.48
41 0.51
42 0.57
43 0.62
44 0.62
45 0.68
46 0.72
47 0.79
48 0.83
49 0.81
50 0.77
51 0.8
52 0.82
53 0.78
54 0.72
55 0.62
56 0.54
57 0.47
58 0.4
59 0.31
60 0.29
61 0.24
62 0.21
63 0.27
64 0.29
65 0.37
66 0.46
67 0.56
68 0.61
69 0.7
70 0.79
71 0.82
72 0.87
73 0.88
74 0.9
75 0.9
76 0.9
77 0.86
78 0.81
79 0.73
80 0.67
81 0.65
82 0.58
83 0.51
84 0.42
85 0.41
86 0.43
87 0.46
88 0.45
89 0.42
90 0.39
91 0.39
92 0.4
93 0.41
94 0.36
95 0.33
96 0.33
97 0.31
98 0.3
99 0.27
100 0.24
101 0.17
102 0.15
103 0.13
104 0.09
105 0.07
106 0.06
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.06
112 0.08
113 0.11
114 0.12
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.14
119 0.17
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.15
124 0.15
125 0.16
126 0.15
127 0.13
128 0.11
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.15
144 0.16
145 0.17
146 0.19
147 0.2
148 0.22
149 0.24
150 0.26
151 0.26
152 0.26
153 0.27
154 0.27
155 0.26
156 0.26
157 0.3
158 0.3
159 0.27
160 0.27
161 0.26
162 0.3
163 0.28
164 0.29
165 0.25
166 0.26
167 0.28
168 0.27
169 0.26
170 0.2
171 0.17
172 0.16
173 0.16
174 0.12
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.08
191 0.08
192 0.11
193 0.13
194 0.16
195 0.19
196 0.2
197 0.22
198 0.24
199 0.26
200 0.24
201 0.25
202 0.21
203 0.17
204 0.16
205 0.14
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.14
214 0.17
215 0.16
216 0.23
217 0.23
218 0.26
219 0.27
220 0.26
221 0.21
222 0.18
223 0.17
224 0.16
225 0.17
226 0.17
227 0.16
228 0.16
229 0.18
230 0.18
231 0.19
232 0.13
233 0.14
234 0.12
235 0.13
236 0.13
237 0.1
238 0.1
239 0.08
240 0.07
241 0.05
242 0.03
243 0.03
244 0.02
245 0.03
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.03
253 0.02
254 0.03
255 0.03
256 0.04
257 0.06
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.14
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.14
269 0.15
270 0.15
271 0.11
272 0.1
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.07
277 0.07
278 0.06
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.15
298 0.17
299 0.17
300 0.17
301 0.16
302 0.14
303 0.16
304 0.15
305 0.12
306 0.09
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.06
312 0.07
313 0.1
314 0.12
315 0.17
316 0.19
317 0.21
318 0.22
319 0.26
320 0.26
321 0.28
322 0.3
323 0.32
324 0.35
325 0.39
326 0.39
327 0.36
328 0.37
329 0.33
330 0.31
331 0.26
332 0.23
333 0.25
334 0.26
335 0.25
336 0.23
337 0.23
338 0.21
339 0.2
340 0.18
341 0.1
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.05
346 0.05
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.03
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.05
356 0.06
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.11
362 0.12
363 0.16
364 0.17
365 0.16
366 0.17
367 0.17
368 0.17
369 0.19
370 0.18
371 0.13
372 0.11
373 0.09
374 0.08
375 0.08
376 0.06
377 0.05
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.04
387 0.03
388 0.04
389 0.05
390 0.06
391 0.05
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.09
396 0.12
397 0.11
398 0.12
399 0.16
400 0.16
401 0.18
402 0.18
403 0.18
404 0.22
405 0.22
406 0.24
407 0.21
408 0.24
409 0.23
410 0.27
411 0.25
412 0.18
413 0.21
414 0.24
415 0.27
416 0.32
417 0.34
418 0.33
419 0.35
420 0.36
421 0.35
422 0.34
423 0.32
424 0.27
425 0.31
426 0.3
427 0.32
428 0.35
429 0.35
430 0.31
431 0.29
432 0.27
433 0.22
434 0.22
435 0.25
436 0.25
437 0.29
438 0.36
439 0.42
440 0.45
441 0.5
442 0.54
443 0.5
444 0.47
445 0.45
446 0.43
447 0.43
448 0.44
449 0.39
450 0.33
451 0.31
452 0.3
453 0.31
454 0.3
455 0.3
456 0.3
457 0.32
458 0.35
459 0.35
460 0.35
461 0.32
462 0.32
463 0.26
464 0.23
465 0.2
466 0.19
467 0.17
468 0.21
469 0.21
470 0.22
471 0.22
472 0.23
473 0.26
474 0.28
475 0.29
476 0.32
477 0.37
478 0.44
479 0.51
480 0.58
481 0.64
482 0.71
483 0.79
484 0.83
485 0.86
486 0.86
487 0.84
488 0.85
489 0.87
490 0.84
491 0.79
492 0.74
493 0.67
494 0.61
495 0.59
496 0.5
497 0.41
498 0.35
499 0.37
500 0.34
501 0.31
502 0.26
503 0.24
504 0.24
505 0.22
506 0.25
507 0.2
508 0.22
509 0.23
510 0.24
511 0.23
512 0.29
513 0.29
514 0.26
515 0.25
516 0.22
517 0.21
518 0.2
519 0.2
520 0.13
521 0.12
522 0.15
523 0.22
524 0.28
525 0.33
526 0.38
527 0.41
528 0.52
529 0.61
530 0.68
531 0.69
532 0.68
533 0.64
534 0.6
535 0.6
536 0.54
537 0.43
538 0.36
539 0.28
540 0.24
541 0.23
542 0.22
543 0.18
544 0.13
545 0.12
546 0.1
547 0.11
548 0.1
549 0.1
550 0.12
551 0.15
552 0.16
553 0.16
554 0.16
555 0.15
556 0.15
557 0.15
558 0.13
559 0.1
560 0.09
561 0.11
562 0.11
563 0.12
564 0.12
565 0.13
566 0.19
567 0.22
568 0.27
569 0.28
570 0.35
571 0.41
572 0.43
573 0.44
574 0.42
575 0.49
576 0.51
577 0.52
578 0.45
579 0.39
580 0.39
581 0.38
582 0.4
583 0.31
584 0.24
585 0.22
586 0.24
587 0.26
588 0.24
589 0.23
590 0.2
591 0.23
592 0.25
593 0.26
594 0.26
595 0.23
596 0.25
597 0.29
598 0.29
599 0.29
600 0.3
601 0.29
602 0.26
603 0.25
604 0.23
605 0.18
606 0.16
607 0.14
608 0.11
609 0.15
610 0.18
611 0.19
612 0.22
613 0.22
614 0.22
615 0.2
616 0.23
617 0.26
618 0.33
619 0.37
620 0.41
621 0.47
622 0.48
623 0.52
624 0.49
625 0.51
626 0.48
627 0.49
628 0.45
629 0.46
630 0.51
631 0.52
632 0.57
633 0.54
634 0.53
635 0.53
636 0.53
637 0.5
638 0.55
639 0.55
640 0.51
641 0.5
642 0.46
643 0.45
644 0.5
645 0.48
646 0.4
647 0.38
648 0.38
649 0.35
650 0.35
651 0.32
652 0.23
653 0.22
654 0.19
655 0.16
656 0.13
657 0.11
658 0.09
659 0.07
660 0.08
661 0.09
662 0.1
663 0.1
664 0.11
665 0.12
666 0.14
667 0.17
668 0.21
669 0.19
670 0.19
671 0.22
672 0.22
673 0.22
674 0.23
675 0.22
676 0.17
677 0.16
678 0.19
679 0.15
680 0.16
681 0.16
682 0.16
683 0.14