Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A559MC26

Protein Details
Accession A0A559MC26    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
614-642EDIDKVQKQMPRKTKRRRKMDDDTYEEYVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
624-632PRKTKRRRK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12, cyto 10.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MEDSTRGPPRVKNKAPSAIQISAEQLLREAVDRQEPGLQAPTQRFADLEELHEFQGRKRKEFEAYVQRNRINMNNWMRYAQWELEQKEYKRARSIFERALDVDATSVTLWIRYIEAEMKSRNINHARNLLDRAVTILPRVDKLWYKYCYMEEMLSNIPGTRQVFERWMSWEPDEAAWSSYIKMEKRYGEFQRAREIFQRFTMVHPEPRNWIKWARFEEEFGTSDLVREVFGTAVEALGDDFMDERLFIAYARYEAKLKEYERARAIYKYALDRLARSKSISLHKAYTTFEKQFGDREGVEDVILSKRRVQYEEQVKENPKNYDTWFDYARLEEVSGDVDRVRDVYERAIAQIPPTQEKRHWRRYIYLWIFYAIWEEIDTKDVERARQIYQECLKLIPHKKFTFAKIWLMKAQFEIRQQQLLTARKTLGQAIGMCPKDKLFKGYIDLELKLFEFVRCRTLYEKHIEWNSANCQAWIKFAELERGLDDLERTRAIFELAISQNVLDMPELLWKAYIDFEEEEGEYERTRKLYERLLDKTDHVKVWISYAHFEINVPDEDEDEDEEEDKPVSEMAKARARKVFERALTSMKDKELKEERVTLLNAWLSFERTHGSEEDIDKVQKQMPRKTKRRRKMDDDTYEEYVDYVFPADDQQTAKLSNFLAMAQSWKQAGGTITGNGTNGDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.73
3 0.74
4 0.71
5 0.65
6 0.58
7 0.5
8 0.44
9 0.38
10 0.35
11 0.28
12 0.21
13 0.17
14 0.16
15 0.15
16 0.15
17 0.14
18 0.19
19 0.2
20 0.21
21 0.25
22 0.25
23 0.26
24 0.28
25 0.28
26 0.27
27 0.3
28 0.34
29 0.31
30 0.31
31 0.28
32 0.26
33 0.3
34 0.26
35 0.27
36 0.25
37 0.25
38 0.26
39 0.3
40 0.28
41 0.26
42 0.34
43 0.34
44 0.35
45 0.38
46 0.42
47 0.44
48 0.5
49 0.55
50 0.57
51 0.63
52 0.68
53 0.71
54 0.69
55 0.64
56 0.61
57 0.57
58 0.5
59 0.5
60 0.5
61 0.49
62 0.48
63 0.47
64 0.45
65 0.43
66 0.43
67 0.35
68 0.32
69 0.33
70 0.34
71 0.41
72 0.48
73 0.47
74 0.52
75 0.56
76 0.53
77 0.54
78 0.54
79 0.51
80 0.52
81 0.58
82 0.55
83 0.53
84 0.52
85 0.45
86 0.45
87 0.39
88 0.3
89 0.23
90 0.16
91 0.13
92 0.09
93 0.09
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.09
101 0.13
102 0.16
103 0.2
104 0.22
105 0.24
106 0.27
107 0.28
108 0.35
109 0.38
110 0.4
111 0.41
112 0.46
113 0.47
114 0.47
115 0.5
116 0.43
117 0.35
118 0.31
119 0.28
120 0.24
121 0.21
122 0.18
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.18
127 0.19
128 0.22
129 0.27
130 0.34
131 0.33
132 0.35
133 0.36
134 0.37
135 0.37
136 0.33
137 0.29
138 0.22
139 0.23
140 0.21
141 0.19
142 0.18
143 0.14
144 0.13
145 0.15
146 0.15
147 0.13
148 0.14
149 0.16
150 0.19
151 0.21
152 0.23
153 0.23
154 0.26
155 0.27
156 0.26
157 0.26
158 0.24
159 0.23
160 0.22
161 0.18
162 0.16
163 0.14
164 0.13
165 0.11
166 0.13
167 0.16
168 0.16
169 0.2
170 0.23
171 0.27
172 0.31
173 0.39
174 0.4
175 0.47
176 0.51
177 0.49
178 0.55
179 0.51
180 0.5
181 0.48
182 0.47
183 0.38
184 0.35
185 0.37
186 0.27
187 0.28
188 0.33
189 0.29
190 0.32
191 0.33
192 0.33
193 0.35
194 0.38
195 0.39
196 0.35
197 0.39
198 0.36
199 0.41
200 0.44
201 0.43
202 0.4
203 0.39
204 0.38
205 0.34
206 0.31
207 0.24
208 0.21
209 0.16
210 0.15
211 0.14
212 0.12
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.07
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.14
243 0.19
244 0.2
245 0.25
246 0.26
247 0.31
248 0.32
249 0.35
250 0.33
251 0.29
252 0.3
253 0.26
254 0.26
255 0.23
256 0.22
257 0.24
258 0.22
259 0.23
260 0.27
261 0.27
262 0.26
263 0.24
264 0.24
265 0.25
266 0.31
267 0.33
268 0.31
269 0.3
270 0.3
271 0.31
272 0.3
273 0.31
274 0.29
275 0.26
276 0.27
277 0.25
278 0.25
279 0.25
280 0.25
281 0.22
282 0.17
283 0.16
284 0.14
285 0.13
286 0.13
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.12
291 0.12
292 0.14
293 0.18
294 0.19
295 0.22
296 0.23
297 0.29
298 0.37
299 0.41
300 0.41
301 0.43
302 0.44
303 0.46
304 0.47
305 0.4
306 0.3
307 0.28
308 0.26
309 0.27
310 0.26
311 0.25
312 0.23
313 0.22
314 0.22
315 0.19
316 0.19
317 0.13
318 0.1
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.09
333 0.09
334 0.11
335 0.12
336 0.11
337 0.12
338 0.14
339 0.14
340 0.16
341 0.18
342 0.19
343 0.22
344 0.32
345 0.39
346 0.47
347 0.52
348 0.5
349 0.52
350 0.56
351 0.62
352 0.56
353 0.51
354 0.41
355 0.36
356 0.34
357 0.29
358 0.25
359 0.14
360 0.1
361 0.07
362 0.08
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.13
371 0.15
372 0.15
373 0.2
374 0.21
375 0.23
376 0.26
377 0.28
378 0.26
379 0.25
380 0.25
381 0.28
382 0.34
383 0.34
384 0.39
385 0.37
386 0.42
387 0.44
388 0.47
389 0.46
390 0.42
391 0.44
392 0.4
393 0.41
394 0.4
395 0.38
396 0.35
397 0.3
398 0.3
399 0.25
400 0.24
401 0.27
402 0.24
403 0.26
404 0.25
405 0.26
406 0.3
407 0.32
408 0.31
409 0.28
410 0.27
411 0.26
412 0.27
413 0.25
414 0.19
415 0.16
416 0.15
417 0.16
418 0.22
419 0.21
420 0.21
421 0.2
422 0.2
423 0.22
424 0.21
425 0.22
426 0.18
427 0.19
428 0.23
429 0.25
430 0.29
431 0.27
432 0.27
433 0.24
434 0.22
435 0.2
436 0.17
437 0.15
438 0.1
439 0.11
440 0.12
441 0.16
442 0.16
443 0.18
444 0.2
445 0.24
446 0.29
447 0.32
448 0.33
449 0.33
450 0.35
451 0.36
452 0.33
453 0.33
454 0.32
455 0.31
456 0.29
457 0.24
458 0.24
459 0.23
460 0.24
461 0.21
462 0.19
463 0.16
464 0.16
465 0.22
466 0.2
467 0.2
468 0.18
469 0.18
470 0.16
471 0.14
472 0.14
473 0.1
474 0.12
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.1
481 0.09
482 0.14
483 0.15
484 0.15
485 0.15
486 0.14
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.06
491 0.06
492 0.05
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.11
500 0.11
501 0.1
502 0.1
503 0.11
504 0.12
505 0.12
506 0.13
507 0.14
508 0.14
509 0.12
510 0.13
511 0.14
512 0.13
513 0.14
514 0.17
515 0.18
516 0.25
517 0.32
518 0.38
519 0.42
520 0.45
521 0.45
522 0.45
523 0.47
524 0.44
525 0.38
526 0.31
527 0.29
528 0.25
529 0.26
530 0.26
531 0.22
532 0.19
533 0.2
534 0.2
535 0.18
536 0.18
537 0.16
538 0.16
539 0.15
540 0.15
541 0.13
542 0.12
543 0.13
544 0.14
545 0.14
546 0.12
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.11
552 0.1
553 0.09
554 0.08
555 0.09
556 0.11
557 0.14
558 0.2
559 0.28
560 0.3
561 0.35
562 0.39
563 0.43
564 0.45
565 0.48
566 0.5
567 0.46
568 0.5
569 0.48
570 0.48
571 0.47
572 0.47
573 0.43
574 0.4
575 0.42
576 0.36
577 0.42
578 0.45
579 0.47
580 0.48
581 0.5
582 0.48
583 0.46
584 0.47
585 0.39
586 0.35
587 0.32
588 0.28
589 0.25
590 0.23
591 0.2
592 0.19
593 0.19
594 0.17
595 0.16
596 0.18
597 0.16
598 0.19
599 0.21
600 0.23
601 0.26
602 0.28
603 0.28
604 0.26
605 0.28
606 0.29
607 0.28
608 0.35
609 0.41
610 0.48
611 0.57
612 0.67
613 0.76
614 0.83
615 0.89
616 0.93
617 0.92
618 0.92
619 0.92
620 0.92
621 0.91
622 0.88
623 0.83
624 0.76
625 0.66
626 0.56
627 0.45
628 0.34
629 0.24
630 0.16
631 0.11
632 0.07
633 0.07
634 0.09
635 0.1
636 0.13
637 0.14
638 0.16
639 0.18
640 0.2
641 0.2
642 0.21
643 0.2
644 0.19
645 0.18
646 0.17
647 0.16
648 0.15
649 0.19
650 0.18
651 0.21
652 0.19
653 0.18
654 0.18
655 0.19
656 0.19
657 0.18
658 0.18
659 0.17
660 0.19
661 0.2
662 0.2