Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A559MC26

Protein Details
Accession A0A559MC26   
Localization Confidence Medium
Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
614-642EDIDKVQKQMPRKTKRRRKMDDDTYEEYVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
624-632PRKTKRRRK
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 12, mito 2, nucl 12.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02184  HAT  
PF14559  TPR_19  
Amino Acid Sequences MEDSTRGPPRVKNKAPSAIQISAEQLLREAVDRQEPGLQAPTQRFADLEELHEFQGRKRKEFEAYVQRNRINMNNWMRYAQWELEQKEYKRARSIFERALDVDATSVTLWIRYIEAEMKSRNINHARNLLDRAVTILPRVDKLWYKYCYMEEMLSNIPGTRQVFERWMSWEPDEAAWSSYIKMEKRYGEFQRAREIFQRFTMVHPEPRNWIKWARFEEEFGTSDLVREVFGTAVEALGDDFMDERLFIAYARYEAKLKEYERARAIYKYALDRLARSKSISLHKAYTTFEKQFGDREGVEDVILSKRRVQYEEQVKENPKNYDTWFDYARLEEVSGDVDRVRDVYERAIAQIPPTQEKRHWRRYIYLWIFYAIWEEIDTKDVERARQIYQECLKLIPHKKFTFAKIWLMKAQFEIRQQQLLTARKTLGQAIGMCPKDKLFKGYIDLELKLFEFVRCRTLYEKHIEWNSANCQAWIKFAELERGLDDLERTRAIFELAISQNVLDMPELLWKAYIDFEEEEGEYERTRKLYERLLDKTDHVKVWISYAHFEINVPDEDEDEDEEEDKPVSEMAKARARKVFERALTSMKDKELKEERVTLLNAWLSFERTHGSEEDIDKVQKQMPRKTKRRRKMDDDTYEEYVDYVFPADDQQTAKLSNFLAMAQSWKQAGGTITGNGTNGDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.73
3 0.74
4 0.71
5 0.65
6 0.58
7 0.5
8 0.44
9 0.38
10 0.35
11 0.28
12 0.21
13 0.17
14 0.16
15 0.15
16 0.15
17 0.14
18 0.19
19 0.2
20 0.21
21 0.25
22 0.25
23 0.26
24 0.28
25 0.28
26 0.27
27 0.3
28 0.34
29 0.31
30 0.31
31 0.28
32 0.26
33 0.3
34 0.26
35 0.27
36 0.25
37 0.25
38 0.26
39 0.3
40 0.28
41 0.26
42 0.34
43 0.34
44 0.35
45 0.38
46 0.42
47 0.44
48 0.5
49 0.55
50 0.57
51 0.63
52 0.68
53 0.71
54 0.69
55 0.64
56 0.61
57 0.57
58 0.5
59 0.5
60 0.5
61 0.49
62 0.48
63 0.47
64 0.45
65 0.43
66 0.43
67 0.35
68 0.32
69 0.33
70 0.34
71 0.41
72 0.48
73 0.47
74 0.52
75 0.56
76 0.53
77 0.54
78 0.54
79 0.51
80 0.52
81 0.58
82 0.55
83 0.53
84 0.52
85 0.45
86 0.45
87 0.39
88 0.3
89 0.23
90 0.16
91 0.13
92 0.09
93 0.09
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.09
101 0.13
102 0.16
103 0.2
104 0.22
105 0.24
106 0.27
107 0.28
108 0.35
109 0.38
110 0.4
111 0.41
112 0.46
113 0.47
114 0.47
115 0.5
116 0.43
117 0.35
118 0.31
119 0.28
120 0.24
121 0.21
122 0.18
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.18
127 0.19
128 0.22
129 0.27
130 0.34
131 0.33
132 0.35
133 0.36
134 0.37
135 0.37
136 0.33
137 0.29
138 0.22
139 0.23
140 0.21
141 0.19
142 0.18
143 0.14
144 0.13
145 0.15
146 0.15
147 0.13
148 0.14
149 0.16
150 0.19
151 0.21
152 0.23
153 0.23
154 0.26
155 0.27
156 0.26
157 0.26
158 0.24
159 0.23
160 0.22
161 0.18
162 0.16
163 0.14
164 0.13
165 0.11
166 0.13
167 0.16
168 0.16
169 0.2
170 0.23
171 0.27
172 0.31
173 0.39
174 0.4
175 0.47
176 0.51
177 0.49
178 0.55
179 0.51
180 0.5
181 0.48
182 0.47
183 0.38
184 0.35
185 0.37
186 0.27
187 0.28
188 0.33
189 0.29
190 0.32
191 0.33
192 0.33
193 0.35
194 0.38
195 0.39
196 0.35
197 0.39
198 0.36
199 0.41
200 0.44
201 0.43
202 0.4
203 0.39
204 0.38
205 0.34
206 0.31
207 0.24
208 0.21
209 0.16
210 0.15
211 0.14
212 0.12
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.07
238 0.09
239 0.1
240 0.11
241 0.11
242 0.14
243 0.19
244 0.2
245 0.25
246 0.26
247 0.31
248 0.32
249 0.35
250 0.33
251 0.29
252 0.3
253 0.26
254 0.26
255 0.23
256 0.22
257 0.24
258 0.22
259 0.23
260 0.27
261 0.27
262 0.26
263 0.24
264 0.24
265 0.25
266 0.31
267 0.33
268 0.31
269 0.3
270 0.3
271 0.31
272 0.3
273 0.31
274 0.29
275 0.26
276 0.27
277 0.25
278 0.25
279 0.25
280 0.25
281 0.22
282 0.17
283 0.16
284 0.14
285 0.13
286 0.13
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.12
291 0.12
292 0.14
293 0.18
294 0.19
295 0.22
296 0.23
297 0.29
298 0.37
299 0.41
300 0.41
301 0.43
302 0.44
303 0.46
304 0.47
305 0.4
306 0.3
307 0.28
308 0.26
309 0.27
310 0.26
311 0.25
312 0.23
313 0.22
314 0.22
315 0.19
316 0.19
317 0.13
318 0.1
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.07
331 0.07
332 0.09
333 0.09
334 0.11
335 0.12
336 0.11
337 0.12
338 0.14
339 0.14
340 0.16
341 0.18
342 0.19
343 0.22
344 0.32
345 0.39
346 0.47
347 0.52
348 0.5
349 0.52
350 0.56
351 0.62
352 0.56
353 0.51
354 0.41
355 0.36
356 0.34
357 0.29
358 0.25
359 0.14
360 0.1
361 0.07
362 0.08
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.1
368 0.11
369 0.11
370 0.13
371 0.15
372 0.15
373 0.2
374 0.21
375 0.23
376 0.26
377 0.28
378 0.26
379 0.25
380 0.25
381 0.28
382 0.34
383 0.34
384 0.39
385 0.37
386 0.42
387 0.44
388 0.47
389 0.46
390 0.42
391 0.44
392 0.4
393 0.41
394 0.4
395 0.38
396 0.35
397 0.3
398 0.3
399 0.25
400 0.24
401 0.27
402 0.24
403 0.26
404 0.25
405 0.26
406 0.3
407 0.32
408 0.31
409 0.28
410 0.27
411 0.26
412 0.27
413 0.25
414 0.19
415 0.16
416 0.15
417 0.16
418 0.22
419 0.21
420 0.21
421 0.2
422 0.2
423 0.22
424 0.21
425 0.22
426 0.18
427 0.19
428 0.23
429 0.25
430 0.29
431 0.27
432 0.27
433 0.24
434 0.22
435 0.2
436 0.17
437 0.15
438 0.1
439 0.11
440 0.12
441 0.16
442 0.16
443 0.18
444 0.2
445 0.24
446 0.29
447 0.32
448 0.33
449 0.33
450 0.35
451 0.36
452 0.33
453 0.33
454 0.32
455 0.31
456 0.29
457 0.24
458 0.24
459 0.23
460 0.24
461 0.21
462 0.19
463 0.16
464 0.16
465 0.22
466 0.2
467 0.2
468 0.18
469 0.18
470 0.16
471 0.14
472 0.14
473 0.1
474 0.12
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.11
480 0.1
481 0.09
482 0.14
483 0.15
484 0.15
485 0.15
486 0.14
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.06
491 0.06
492 0.05
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.1
499 0.11
500 0.11
501 0.1
502 0.1
503 0.11
504 0.12
505 0.12
506 0.13
507 0.14
508 0.14
509 0.12
510 0.13
511 0.14
512 0.13
513 0.14
514 0.17
515 0.18
516 0.25
517 0.32
518 0.38
519 0.42
520 0.45
521 0.45
522 0.45
523 0.47
524 0.44
525 0.38
526 0.31
527 0.29
528 0.25
529 0.26
530 0.26
531 0.22
532 0.19
533 0.2
534 0.2
535 0.18
536 0.18
537 0.16
538 0.16
539 0.15
540 0.15
541 0.13
542 0.12
543 0.13
544 0.14
545 0.14
546 0.12
547 0.11
548 0.11
549 0.11
550 0.11
551 0.11
552 0.1
553 0.09
554 0.08
555 0.09
556 0.11
557 0.14
558 0.2
559 0.28
560 0.3
561 0.35
562 0.39
563 0.43
564 0.45
565 0.48
566 0.5
567 0.46
568 0.5
569 0.48
570 0.48
571 0.47
572 0.47
573 0.43
574 0.4
575 0.42
576 0.36
577 0.42
578 0.45
579 0.47
580 0.48
581 0.5
582 0.48
583 0.46
584 0.47
585 0.39
586 0.35
587 0.32
588 0.28
589 0.25
590 0.23
591 0.2
592 0.19
593 0.19
594 0.17
595 0.16
596 0.18
597 0.16
598 0.19
599 0.21
600 0.23
601 0.26
602 0.28
603 0.28
604 0.26
605 0.28
606 0.29
607 0.28
608 0.35
609 0.41
610 0.48
611 0.57
612 0.67
613 0.76
614 0.83
615 0.89
616 0.93
617 0.92
618 0.92
619 0.92
620 0.92
621 0.91
622 0.88
623 0.83
624 0.76
625 0.66
626 0.56
627 0.45
628 0.34
629 0.24
630 0.16
631 0.11
632 0.07
633 0.07
634 0.09
635 0.1
636 0.13
637 0.14
638 0.16
639 0.18
640 0.2
641 0.2
642 0.21
643 0.2
644 0.19
645 0.18
646 0.17
647 0.16
648 0.15
649 0.19
650 0.18
651 0.21
652 0.19
653 0.18
654 0.18
655 0.19
656 0.19
657 0.18
658 0.18
659 0.17
660 0.19
661 0.2
662 0.2