FuNGI

A0A559M3V9

Protein Details

Accession

A0A559M3V9

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-29	MNKVAKNKKTAVPKKPEKIPTTT	Hydrophilic
400-421	IDDRQLKRQKTKQNGSQEDRVS	Hydrophilic
479-505	VSNGSEVKVKKSKHKHRDRDEQAFYDA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
284-284	K
364-395	KPKVSKAPSSSTPLKRKHSEGGEKKTKHSSSK
488-493	KKSKHK

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, mito_nucl 12.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013240 DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34
Gene Ontology	GO:0006360 P:transcription by RNA polymerase I
Pfam	View protein in Pfam PF08208 RNA_polI_A34

Amino Acid Sequences

MPSLNAMNKVAKNKKTAVPKKPEKIPTTTSAALSSEFVEESDEESDGKQSESENDSLPENPIDSLPKSNGKLPAPDGSESSSENESESEGSQEESGDDDEEEPSKHKAQPVEAVNSSLNYREPSKEPASKTPTIQPPPPYKAPAGFESSSIDGTSQAATTFKKSSLEGKQIWYFTAPASVPISSVKKMSLSAVEDGKKVCSHNNCDYGFVKDIAEDKTYTKIMVPNSSDDGYQTGALPILVHAVDFVIVRKPIDQILHLQQIIKIPGMDGSTAKSSKATVPAKKPVRPQPKGLKMRFLPIGFGTGNPGKIGSDSNSVDGSSTESVSGSDNEEGASKGFKKPASIASSSDEESDQEMTEAPPLPKPKVSKAPSSSTPLKRKHSEGGEKKTKHSSSKPAPDIDDRQLKRQKTKQNGSQEDRVSASTKTATPIPPPKSLLKTSDTPKSILKKPTHGPASSPPKLSESTHSDLPPPPASAPPVSNGSEVKVKKSKHKHRDRDEQAFYDAGKRAVYQGAHEGYRS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.61
2	0.66
3	0.71
4	0.72
5	0.74
6	0.79
7	0.81
8	0.85
9	0.87
10	0.81
11	0.79
12	0.74
13	0.68
14	0.65
15	0.59
16	0.5
17	0.43
18	0.38
19	0.32
20	0.27
21	0.23
22	0.16
23	0.13
24	0.12
25	0.12
26	0.11
27	0.12
28	0.13
29	0.12
30	0.11
31	0.12
32	0.14
33	0.13
34	0.13
35	0.12
36	0.11
37	0.16
38	0.2
39	0.21
40	0.21
41	0.22
42	0.23
43	0.23
44	0.24
45	0.2
46	0.16
47	0.15
48	0.15
49	0.17
50	0.18
51	0.21
52	0.23
53	0.29
54	0.3
55	0.34
56	0.4
57	0.38
58	0.41
59	0.4
60	0.43
61	0.4
62	0.39
63	0.35
64	0.31
65	0.31
66	0.27
67	0.27
68	0.21
69	0.18
70	0.17
71	0.16
72	0.14
73	0.14
74	0.13
75	0.11
76	0.1
77	0.11
78	0.1
79	0.1
80	0.09
81	0.09
82	0.1
83	0.09
84	0.09
85	0.09
86	0.1
87	0.11
88	0.12
89	0.12
90	0.15
91	0.18
92	0.2
93	0.23
94	0.25
95	0.28
96	0.35
97	0.38
98	0.41
99	0.38
100	0.38
101	0.35
102	0.33
103	0.3
104	0.23
105	0.19
106	0.15
107	0.17
108	0.18
109	0.2
110	0.26
111	0.32
112	0.38
113	0.4
114	0.47
115	0.52
116	0.51
117	0.51
118	0.53
119	0.55
120	0.54
121	0.55
122	0.53
123	0.54
124	0.58
125	0.59
126	0.54
127	0.46
128	0.46
129	0.44
130	0.4
131	0.38
132	0.31
133	0.28
134	0.27
135	0.26
136	0.23
137	0.19
138	0.16
139	0.1
140	0.1
141	0.1
142	0.07
143	0.07
144	0.08
145	0.09
146	0.12
147	0.13
148	0.13
149	0.15
150	0.16
151	0.22
152	0.27
153	0.34
154	0.33
155	0.36
156	0.39
157	0.38
158	0.38
159	0.31
160	0.25
161	0.18
162	0.19
163	0.14
164	0.12
165	0.13
166	0.13
167	0.12
168	0.15
169	0.18
170	0.15
171	0.16
172	0.14
173	0.13
174	0.14
175	0.15
176	0.14
177	0.14
178	0.16
179	0.2
180	0.21
181	0.21
182	0.21
183	0.21
184	0.19
185	0.18
186	0.2
187	0.21
188	0.27
189	0.32
190	0.39
191	0.38
192	0.4
193	0.4
194	0.38
195	0.34
196	0.28
197	0.21
198	0.15
199	0.17
200	0.16
201	0.16
202	0.14
203	0.13
204	0.15
205	0.15
206	0.14
207	0.13
208	0.15
209	0.15
210	0.19
211	0.2
212	0.19
213	0.21
214	0.22
215	0.2
216	0.17
217	0.16
218	0.12
219	0.11
220	0.09
221	0.07
222	0.06
223	0.06
224	0.06
225	0.05
226	0.05
227	0.04
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.04
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.07
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.1
241	0.1
242	0.12
243	0.16
244	0.19
245	0.19
246	0.19
247	0.18
248	0.19
249	0.19
250	0.16
251	0.11
252	0.08
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.07
257	0.08
258	0.1
259	0.11
260	0.11
261	0.1
262	0.1
263	0.11
264	0.2
265	0.24
266	0.27
267	0.33
268	0.42
269	0.48
270	0.51
271	0.57
272	0.59
273	0.64
274	0.61
275	0.64
276	0.65
277	0.7
278	0.75
279	0.69
280	0.67
281	0.57
282	0.58
283	0.54
284	0.44
285	0.35
286	0.25
287	0.27
288	0.19
289	0.18
290	0.17
291	0.14
292	0.14
293	0.13
294	0.13
295	0.09
296	0.1
297	0.11
298	0.09
299	0.13
300	0.13
301	0.15
302	0.15
303	0.15
304	0.14
305	0.13
306	0.14
307	0.09
308	0.09
309	0.08
310	0.07
311	0.08
312	0.09
313	0.1
314	0.09
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.09
319	0.09
320	0.08
321	0.1
322	0.1
323	0.12
324	0.15
325	0.16
326	0.17
327	0.19
328	0.26
329	0.29
330	0.29
331	0.29
332	0.28
333	0.3
334	0.29
335	0.27
336	0.2
337	0.16
338	0.15
339	0.14
340	0.1
341	0.08
342	0.08
343	0.08
344	0.1
345	0.12
346	0.12
347	0.15
348	0.18
349	0.2
350	0.23
351	0.27
352	0.31
353	0.39
354	0.42
355	0.47
356	0.5
357	0.54
358	0.54
359	0.59
360	0.61
361	0.6
362	0.65
363	0.63
364	0.66
365	0.64
366	0.64
367	0.64
368	0.64
369	0.66
370	0.66
371	0.69
372	0.72
373	0.7
374	0.69
375	0.71
376	0.65
377	0.62
378	0.59
379	0.59
380	0.59
381	0.67
382	0.68
383	0.63
384	0.62
385	0.61
386	0.6
387	0.57
388	0.57
389	0.48
390	0.53
391	0.56
392	0.57
393	0.61
394	0.64
395	0.66
396	0.67
397	0.75
398	0.74
399	0.78
400	0.83
401	0.8
402	0.8
403	0.72
404	0.64
405	0.56
406	0.49
407	0.39
408	0.3
409	0.26
410	0.2
411	0.19
412	0.19
413	0.21
414	0.22
415	0.28
416	0.36
417	0.39
418	0.41
419	0.44
420	0.48
421	0.5
422	0.52
423	0.49
424	0.45
425	0.47
426	0.47
427	0.52
428	0.48
429	0.44
430	0.47
431	0.5
432	0.52
433	0.54
434	0.54
435	0.53
436	0.56
437	0.64
438	0.64
439	0.58
440	0.55
441	0.56
442	0.61
443	0.59
444	0.56
445	0.48
446	0.44
447	0.46
448	0.44
449	0.41
450	0.38
451	0.38
452	0.41
453	0.4
454	0.4
455	0.41
456	0.44
457	0.4
458	0.34
459	0.31
460	0.29
461	0.32
462	0.31
463	0.29
464	0.27
465	0.29
466	0.29
467	0.3
468	0.27
469	0.27
470	0.32
471	0.31
472	0.36
473	0.38
474	0.4
475	0.48
476	0.59
477	0.67
478	0.7
479	0.8
480	0.83
481	0.86
482	0.94
483	0.93
484	0.93
485	0.89
486	0.81
487	0.73
488	0.64
489	0.55
490	0.5
491	0.42
492	0.33
493	0.26
494	0.23
495	0.22
496	0.25
497	0.25
498	0.22
499	0.27
500	0.31

A0A559M3V9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer