FuNGI

A0A559MED6

Protein Details

Accession

A0A559MED6

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
11-30	VDLSKNPKRKAPPQSSSNSQ	Hydrophilic
99-130	PRDMRRRTASHNVKKVPKRLRNRAAREMREDN	Basic
189-213	LNDPPKPISKFRKRQIHKSWLPTHM	Hydrophilic
606-627	MDQRERRKAEWDRRPKGKRIEW	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
103-127	RRRTASHNVKKVPKRLRNRAAREMR
136-210	SNKKKPGSSRGRIRAETAKRLGILAAKKRAQKNIGQGKGLETRVPRPKIRRDLLNDPPKPISKFRKRQIHKSWLP
215-220	HAKRAR
611-624	RRKAEWDRRPKGKR

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 8, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039182 Pop1 IPR009723 Pop1_N IPR012590 POPLD_dom
Gene Ontology	GO:0005655 C:nucleolar ribonuclease P complex GO:0000172 C:ribonuclease MRP complex GO:0001682 P:tRNA 5'-leader removal
Pfam	View protein in Pfam PF06978 POP1 PF08170 POPLD

Amino Acid Sequences

MPPKKDFTGSVDLSKNPKRKAPPQSSSNSQGADRGRAVKRVKMIDSRLILTQKADAALKNGELDLQAFLKSREFEIKALEDGMQRSKASSTQRAFQQVPRDMRRRTASHNVKKVPKRLRNRAAREMREDNTPTVNSNKKKPGSSRGRIRAETAKRLGILAAKKRAQKNIGQGKGLETRVPRPKIRRDLLNDPPKPISKFRKRQIHKSWLPTHMWHAKRARMTEPKKPLWRFAIPITSTEKSYRPTHRAGGARGAVVWDMSYMSTIGLEGPVESLEQVLNGVGVLDLGLWNGKGEKWMAGKRSWTGWLSRETKGKRTQIGPSTVIWCSSEQDSTDEADHMSKKRPLRRVFLRVHPAAFLETWGELLRLSKVQRPTVHIEDLRFEIGSINITGPGSTEALLGILQPYCQPNGAQENHAQAFSSLAGVTNPGSLPANSVLAFSISDPRLHYPPRPAKAPKSDDEEANFALLEKLSTWPVDEFSPSSALFDRNARFKATRLPAQKSINRRKSQAKPGEYPSIIPTDPPIPIILFASRSASSAAAQGTWTLLAPWKCILPIWYGLVHYPLSSGGNPRFGGLDELRQIHFEQGVPWFPADYPGTNSGFLWEMDQRERRKAEWDRRPKGKRIEWDSLDLGAGRKGEIGRGWACDFERLLGLTPLLEGGNTASTAQDTENLSTAQPERSVIESPIEHLNSKTFTHLLSSSNYELPHPSTVATVRIMLTTRGVAAPCALIYRLPQASASSKSSTTGSSNPTTREEWTALLPAAFGSKSLPNPKSKSAKGLGRIPLDTPVPQRIRLLAQSLLQNPPLPYPADKDDGHPLVPGEEDLIGFVTTGEFNLAEGKGVAVGTVAVAKVLEGLRRDRKVFKEGRLCIVRNAGEKIGRLARWEAV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.58
3	0.53
4	0.58
5	0.6
6	0.65
7	0.72
8	0.75
9	0.76
10	0.76
11	0.8
12	0.8
13	0.77
14	0.72
15	0.64
16	0.53
17	0.5
18	0.44
19	0.41
20	0.37
21	0.4
22	0.38
23	0.44
24	0.47
25	0.46
26	0.51
27	0.52
28	0.55
29	0.55
30	0.57
31	0.57
32	0.58
33	0.54
34	0.52
35	0.48
36	0.42
37	0.35
38	0.32
39	0.26
40	0.24
41	0.24
42	0.19
43	0.2
44	0.22
45	0.21
46	0.2
47	0.18
48	0.16
49	0.15
50	0.15
51	0.13
52	0.12
53	0.13
54	0.13
55	0.14
56	0.17
57	0.17
58	0.19
59	0.25
60	0.26
61	0.26
62	0.3
63	0.32
64	0.29
65	0.29
66	0.29
67	0.24
68	0.25
69	0.28
70	0.26
71	0.24
72	0.24
73	0.24
74	0.27
75	0.31
76	0.38
77	0.37
78	0.4
79	0.46
80	0.52
81	0.54
82	0.53
83	0.56
84	0.55
85	0.61
86	0.63
87	0.65
88	0.6
89	0.65
90	0.68
91	0.63
92	0.62
93	0.64
94	0.66
95	0.69
96	0.76
97	0.77
98	0.79
99	0.82
100	0.84
101	0.84
102	0.83
103	0.83
104	0.84
105	0.86
106	0.87
107	0.88
108	0.89
109	0.89
110	0.85
111	0.82
112	0.78
113	0.69
114	0.66
115	0.6
116	0.52
117	0.46
118	0.4
119	0.34
120	0.35
121	0.42
122	0.39
123	0.45
124	0.52
125	0.52
126	0.58
127	0.62
128	0.66
129	0.68
130	0.73
131	0.75
132	0.76
133	0.79
134	0.74
135	0.72
136	0.71
137	0.68
138	0.66
139	0.59
140	0.52
141	0.44
142	0.43
143	0.39
144	0.35
145	0.35
146	0.34
147	0.39
148	0.42
149	0.49
150	0.53
151	0.59
152	0.58
153	0.56
154	0.59
155	0.61
156	0.61
157	0.56
158	0.51
159	0.49
160	0.51
161	0.46
162	0.39
163	0.31
164	0.35
165	0.42
166	0.47
167	0.49
168	0.51
169	0.6
170	0.67
171	0.7
172	0.71
173	0.69
174	0.72
175	0.76
176	0.78
177	0.71
178	0.64
179	0.63
180	0.58
181	0.54
182	0.54
183	0.54
184	0.55
185	0.62
186	0.68
187	0.75
188	0.76
189	0.84
190	0.86
191	0.86
192	0.83
193	0.83
194	0.81
195	0.76
196	0.73
197	0.64
198	0.62
199	0.6
200	0.54
201	0.52
202	0.49
203	0.49
204	0.5
205	0.51
206	0.52
207	0.53
208	0.57
209	0.58
210	0.63
211	0.66
212	0.7
213	0.69
214	0.67
215	0.63
216	0.62
217	0.55
218	0.51
219	0.5
220	0.42
221	0.42
222	0.42
223	0.37
224	0.34
225	0.33
226	0.31
227	0.27
228	0.33
229	0.38
230	0.37
231	0.4
232	0.42
233	0.47
234	0.49
235	0.47
236	0.47
237	0.41
238	0.36
239	0.32
240	0.28
241	0.21
242	0.16
243	0.13
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.03
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.03
276	0.03
277	0.04
278	0.04
279	0.06
280	0.06
281	0.1
282	0.15
283	0.19
284	0.22
285	0.24
286	0.26
287	0.27
288	0.29
289	0.29
290	0.25
291	0.24
292	0.24
293	0.3
294	0.32
295	0.34
296	0.4
297	0.39
298	0.45
299	0.5
300	0.52
301	0.49
302	0.48
303	0.52
304	0.5
305	0.52
306	0.47
307	0.4
308	0.38
309	0.34
310	0.31
311	0.25
312	0.19
313	0.15
314	0.14
315	0.14
316	0.11
317	0.13
318	0.13
319	0.13
320	0.13
321	0.12
322	0.11
323	0.13
324	0.15
325	0.15
326	0.18
327	0.22
328	0.28
329	0.35
330	0.43
331	0.46
332	0.53
333	0.6
334	0.64
335	0.65
336	0.68
337	0.68
338	0.61
339	0.56
340	0.48
341	0.39
342	0.31
343	0.25
344	0.17
345	0.1
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.07
350	0.06
351	0.06
352	0.07
353	0.09
354	0.11
355	0.15
356	0.18
357	0.23
358	0.26
359	0.3
360	0.35
361	0.36
362	0.4
363	0.37
364	0.33
365	0.3
366	0.29
367	0.25
368	0.19
369	0.15
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.07
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.04
390	0.05
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.07
395	0.09
396	0.15
397	0.17
398	0.17
399	0.19
400	0.23
401	0.23
402	0.23
403	0.2
404	0.14
405	0.13
406	0.11
407	0.09
408	0.05
409	0.04
410	0.04
411	0.05
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.06
417	0.05
418	0.07
419	0.07
420	0.08
421	0.07
422	0.08
423	0.07
424	0.07
425	0.07
426	0.06
427	0.1
428	0.1
429	0.1
430	0.11
431	0.13
432	0.16
433	0.17
434	0.19
435	0.24
436	0.31
437	0.34
438	0.39
439	0.41
440	0.44
441	0.52
442	0.55
443	0.48
444	0.48
445	0.47
446	0.42
447	0.4
448	0.36
449	0.27
450	0.22
451	0.18
452	0.11
453	0.1
454	0.08
455	0.06
456	0.04
457	0.05
458	0.06
459	0.06
460	0.06
461	0.06
462	0.08
463	0.08
464	0.08
465	0.08
466	0.08
467	0.1
468	0.09
469	0.1
470	0.1
471	0.11
472	0.11
473	0.15
474	0.16
475	0.18
476	0.19
477	0.21
478	0.21
479	0.21
480	0.28
481	0.29
482	0.34
483	0.36
484	0.4
485	0.44
486	0.5
487	0.54
488	0.56
489	0.62
490	0.64
491	0.61
492	0.61
493	0.63
494	0.65
495	0.71
496	0.7
497	0.65
498	0.6
499	0.62
500	0.64
501	0.55
502	0.48
503	0.39
504	0.33
505	0.27
506	0.22
507	0.18
508	0.13
509	0.13
510	0.12
511	0.11
512	0.08
513	0.09
514	0.1
515	0.09
516	0.08
517	0.08
518	0.11
519	0.1
520	0.11
521	0.11
522	0.11
523	0.1
524	0.11
525	0.11
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.07
530	0.07
531	0.06
532	0.05
533	0.08
534	0.09
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.11
540	0.12
541	0.1
542	0.12
543	0.13
544	0.13
545	0.13
546	0.13
547	0.15
548	0.14
549	0.11
550	0.09
551	0.08
552	0.09
553	0.09
554	0.13
555	0.13
556	0.17
557	0.17
558	0.17
559	0.17
560	0.16
561	0.19
562	0.16
563	0.18
564	0.17
565	0.19
566	0.18
567	0.19
568	0.19
569	0.16
570	0.16
571	0.13
572	0.11
573	0.12
574	0.14
575	0.13
576	0.13
577	0.12
578	0.11
579	0.15
580	0.15
581	0.13
582	0.14
583	0.18
584	0.19
585	0.19
586	0.19
587	0.16
588	0.16
589	0.15
590	0.14
591	0.12
592	0.14
593	0.19
594	0.26
595	0.27
596	0.32
597	0.34
598	0.33
599	0.4
600	0.47
601	0.53
602	0.57
603	0.65
604	0.68
605	0.77
606	0.82
607	0.81
608	0.81
609	0.77
610	0.76
611	0.73
612	0.73
613	0.65
614	0.64
615	0.57
616	0.48
617	0.41
618	0.32
619	0.24
620	0.16
621	0.14
622	0.09
623	0.1
624	0.09
625	0.11
626	0.11
627	0.15
628	0.14
629	0.17
630	0.18
631	0.18
632	0.19
633	0.19
634	0.19
635	0.15
636	0.15
637	0.12
638	0.13
639	0.11
640	0.11
641	0.09
642	0.08
643	0.08
644	0.07
645	0.06
646	0.05
647	0.05
648	0.06
649	0.06
650	0.06
651	0.06
652	0.06
653	0.07
654	0.07
655	0.1
656	0.11
657	0.12
658	0.13
659	0.14
660	0.14
661	0.15
662	0.17
663	0.15
664	0.14
665	0.14
666	0.14
667	0.15
668	0.17
669	0.16
670	0.18
671	0.16
672	0.18
673	0.23
674	0.22
675	0.21
676	0.2
677	0.21
678	0.2
679	0.21
680	0.21
681	0.16
682	0.15
683	0.18
684	0.19
685	0.18
686	0.18
687	0.22
688	0.22
689	0.24
690	0.24
691	0.22
692	0.22
693	0.23
694	0.22
695	0.18
696	0.16
697	0.15
698	0.16
699	0.18
700	0.17
701	0.15
702	0.14
703	0.15
704	0.15
705	0.14
706	0.14
707	0.12
708	0.12
709	0.13
710	0.12
711	0.11
712	0.11
713	0.11
714	0.1
715	0.1
716	0.09
717	0.08
718	0.09
719	0.15
720	0.15
721	0.15
722	0.16
723	0.17
724	0.21
725	0.25
726	0.28
727	0.24
728	0.24
729	0.25
730	0.26
731	0.25
732	0.24
733	0.25
734	0.26
735	0.29
736	0.32
737	0.34
738	0.36
739	0.36
740	0.35
741	0.35
742	0.31
743	0.27
744	0.25
745	0.25
746	0.22
747	0.2
748	0.17
749	0.13
750	0.13
751	0.11
752	0.1
753	0.09
754	0.13
755	0.19
756	0.28
757	0.33
758	0.39
759	0.44
760	0.53
761	0.59
762	0.58
763	0.6
764	0.59
765	0.62
766	0.6
767	0.64
768	0.62
769	0.58
770	0.57
771	0.49
772	0.45
773	0.4
774	0.37
775	0.33
776	0.35
777	0.33
778	0.34
779	0.34
780	0.33
781	0.36
782	0.35
783	0.35
784	0.28
785	0.29
786	0.33
787	0.35
788	0.36
789	0.33
790	0.33
791	0.3
792	0.29
793	0.28
794	0.24
795	0.23
796	0.25
797	0.28
798	0.3
799	0.3
800	0.31
801	0.38
802	0.37
803	0.36
804	0.32
805	0.28
806	0.23
807	0.23
808	0.2
809	0.12
810	0.1
811	0.1
812	0.09
813	0.09
814	0.08
815	0.08
816	0.08
817	0.07
818	0.07
819	0.07
820	0.08
821	0.06
822	0.07
823	0.1
824	0.1
825	0.1
826	0.1
827	0.1
828	0.1
829	0.1
830	0.09
831	0.06
832	0.06
833	0.05
834	0.07
835	0.06
836	0.06
837	0.06
838	0.06
839	0.09
840	0.11
841	0.14
842	0.16
843	0.24
844	0.33
845	0.39
846	0.44
847	0.48
848	0.52
849	0.59
850	0.63
851	0.65
852	0.66
853	0.65
854	0.71
855	0.72
856	0.68
857	0.62
858	0.62
859	0.57
860	0.51
861	0.5
862	0.45
863	0.4
864	0.4
865	0.42
866	0.41
867	0.37
868	0.36

A0A559MED6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer