Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A559LYJ2

Protein Details
Accession A0A559LYJ2    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-127WYELYCKYKKWQRKQIEKSEEILHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 16.5, mito_nucl 13.333, nucl 9, cyto_nucl 5.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPAPSLFDSSQKACIKNIRSTPLHPSLPRALANTHSLGLTDVGDFEYWKIRSVLARIDSPEQLHQIELRSPQIMGEDADLWRTFIARDIPNWASKSWEPKGPLEWYELYCKYKKWQRKQIEKSEEILRNTMMGIKKEQATKVSRIVDLRTLPKVPRDPRMLANNGGVPLGKKVSGAAKLAPTSLMFNGGSKTKMKDGKSVLTRARREAREISARSKLAKPTNMLVGDKKQIAKAPAGMLNEYRKAANPGLRILSRKKTPVGQFNGGISGPSLQEREKRLRAAMGGDSKGAGTGSSEEDTSDEDDDEVDDLFDDKPKQSPQAARPVQSHVSRPPSRPIPGPSAPRPPPKDMSGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.47
3 0.51
4 0.56
5 0.55
6 0.54
7 0.57
8 0.61
9 0.61
10 0.62
11 0.54
12 0.53
13 0.52
14 0.52
15 0.51
16 0.44
17 0.38
18 0.34
19 0.37
20 0.33
21 0.27
22 0.22
23 0.2
24 0.18
25 0.17
26 0.14
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.09
33 0.15
34 0.15
35 0.17
36 0.17
37 0.18
38 0.2
39 0.23
40 0.29
41 0.26
42 0.29
43 0.3
44 0.33
45 0.33
46 0.33
47 0.33
48 0.28
49 0.25
50 0.23
51 0.21
52 0.2
53 0.21
54 0.21
55 0.21
56 0.19
57 0.18
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.13
62 0.12
63 0.12
64 0.11
65 0.13
66 0.13
67 0.12
68 0.11
69 0.11
70 0.09
71 0.1
72 0.16
73 0.15
74 0.16
75 0.22
76 0.25
77 0.29
78 0.31
79 0.28
80 0.27
81 0.28
82 0.35
83 0.32
84 0.34
85 0.33
86 0.33
87 0.38
88 0.36
89 0.35
90 0.31
91 0.31
92 0.28
93 0.31
94 0.32
95 0.32
96 0.3
97 0.3
98 0.33
99 0.39
100 0.48
101 0.52
102 0.59
103 0.66
104 0.76
105 0.84
106 0.87
107 0.88
108 0.81
109 0.74
110 0.72
111 0.66
112 0.57
113 0.48
114 0.37
115 0.27
116 0.25
117 0.25
118 0.19
119 0.15
120 0.16
121 0.17
122 0.2
123 0.23
124 0.24
125 0.25
126 0.27
127 0.28
128 0.32
129 0.32
130 0.31
131 0.29
132 0.3
133 0.28
134 0.27
135 0.27
136 0.24
137 0.24
138 0.22
139 0.26
140 0.32
141 0.31
142 0.35
143 0.37
144 0.38
145 0.4
146 0.46
147 0.44
148 0.38
149 0.36
150 0.3
151 0.25
152 0.23
153 0.18
154 0.12
155 0.1
156 0.09
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.09
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.09
171 0.1
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.13
179 0.16
180 0.22
181 0.23
182 0.28
183 0.3
184 0.36
185 0.39
186 0.44
187 0.44
188 0.47
189 0.47
190 0.47
191 0.52
192 0.45
193 0.46
194 0.43
195 0.43
196 0.43
197 0.44
198 0.42
199 0.4
200 0.4
201 0.39
202 0.39
203 0.39
204 0.36
205 0.37
206 0.35
207 0.31
208 0.36
209 0.35
210 0.33
211 0.3
212 0.28
213 0.27
214 0.28
215 0.27
216 0.22
217 0.23
218 0.23
219 0.22
220 0.21
221 0.21
222 0.22
223 0.22
224 0.21
225 0.21
226 0.23
227 0.23
228 0.22
229 0.19
230 0.17
231 0.2
232 0.22
233 0.24
234 0.22
235 0.23
236 0.27
237 0.29
238 0.32
239 0.34
240 0.38
241 0.37
242 0.39
243 0.39
244 0.42
245 0.47
246 0.52
247 0.54
248 0.51
249 0.48
250 0.46
251 0.45
252 0.37
253 0.31
254 0.21
255 0.15
256 0.11
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.17
261 0.23
262 0.31
263 0.34
264 0.36
265 0.37
266 0.38
267 0.37
268 0.36
269 0.36
270 0.34
271 0.3
272 0.28
273 0.26
274 0.23
275 0.22
276 0.19
277 0.12
278 0.07
279 0.08
280 0.1
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.13
286 0.14
287 0.13
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.1
293 0.08
294 0.07
295 0.06
296 0.07
297 0.07
298 0.11
299 0.12
300 0.13
301 0.18
302 0.21
303 0.26
304 0.32
305 0.4
306 0.43
307 0.52
308 0.57
309 0.57
310 0.56
311 0.58
312 0.58
313 0.54
314 0.53
315 0.49
316 0.54
317 0.55
318 0.56
319 0.59
320 0.59
321 0.59
322 0.6
323 0.58
324 0.57
325 0.58
326 0.64
327 0.61
328 0.65
329 0.68
330 0.72
331 0.72
332 0.7
333 0.68