FuNGI

A0A559MK73

Protein Details

Accession

A0A559MK73

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-51	PPQFVRKHKATDPLRPRKKPVRRPNVPAGAAP	Hydrophilic
531-551	SGNESSRKKLKKKHHASPGAS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-47	RKHKATDPLRPRKKPVRRPNVPA
429-436	KLGKKTRK
474-525	KRKEEEAKNKAKSESKLPSGASSKGTNTPSGRPKHTDPLKKSKANLKRSGSP
533-545	NESSRKKLKKKHH
624-641	GKKKKLKLRVGSPSGSRA

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSGQSNNQTPTPNGGPPQFVRKHKATDPLRPRKKPVRRPNVPAGAAPLRPNGPAPAAPVNRYPVNGILPPRGAPSQAGPANGTADPSVTGGWTNAPTGQYTDFPLFTTKRAMREGLRYHIARFSTKKDVDPANQAEFTRPVVLHRRDPRQPPPGKGIKDEDIPTDDVPMDSKEREKLEILKAEKDARKAADLAQIAPTGNNASALAAKKNQAFRNEKTSQVFRLDKTAEQKKASDLRYEEALPWHLEDADNKNTWVGSYEAALSDTNVMFVIDGARFIMVPIEKWYKFTPKNQFKTYTIEEAEAQLNKKTRESRWVMKANEKKMGELKAPPMHKMYTVKSESNTYKNSSKNERQDMDDLDFEEDDLFQDDDAQVTVEPDNDEDTKDAQEKIKREQLGANIFDQADELEVEKELEKELMEQEAEKKLGKKTRKALTKREQNLIYESDSDHPYSDSSDDDTADEDKQKEIDKRKEEEAKNKAKSESKLPSGASSKGTNTPSGRPKHTDPLKKSKANLKRSGSPNLSESSGNESSRKKLKKKHHASPGASGTSTPVPGSRPMSPAPSGSQPASSQARKSSVVKLNVNPSKLSEIQKAPPNPSPVHGGSMSDGEATGGEMSDGGKKKKLKLRVGSPSGSRAGTPAPGRAGSIGAGGSRAGSPAAQGQSMQFIPPPPILYLMGGFVGDTLQYRFQEKWIMPRRPPQPLEPVFYSVNTPCHTAMKLAIRFHLSQWARAPQSMSFVEWLRVCAAEQTRAQSPGLGPISVQEVIAAIPASGISSGDLMRSFAGRVGDNPGQTDKKAFFSMVKEHSKYSADKLLRPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.43
3	0.43
4	0.42
5	0.39
6	0.4
7	0.4
8	0.48
9	0.5
10	0.51
11	0.55
12	0.56
13	0.6
14	0.6
15	0.67
16	0.64
17	0.67
18	0.72
19	0.75
20	0.81
21	0.8
22	0.84
23	0.84
24	0.88
25	0.88
26	0.88
27	0.89
28	0.87
29	0.89
30	0.91
31	0.9
32	0.81
33	0.71
34	0.67
35	0.61
36	0.54
37	0.47
38	0.41
39	0.32
40	0.31
41	0.31
42	0.26
43	0.24
44	0.22
45	0.25
46	0.31
47	0.32
48	0.34
49	0.36
50	0.39
51	0.37
52	0.37
53	0.34
54	0.28
55	0.29
56	0.31
57	0.31
58	0.3
59	0.3
60	0.3
61	0.32
62	0.29
63	0.26
64	0.23
65	0.23
66	0.27
67	0.28
68	0.28
69	0.26
70	0.26
71	0.28
72	0.26
73	0.24
74	0.15
75	0.13
76	0.12
77	0.12
78	0.11
79	0.08
80	0.09
81	0.08
82	0.1
83	0.11
84	0.11
85	0.13
86	0.13
87	0.14
88	0.16
89	0.17
90	0.16
91	0.19
92	0.21
93	0.19
94	0.19
95	0.24
96	0.23
97	0.22
98	0.3
99	0.3
100	0.32
101	0.35
102	0.38
103	0.36
104	0.45
105	0.49
106	0.46
107	0.5
108	0.47
109	0.45
110	0.46
111	0.44
112	0.41
113	0.39
114	0.38
115	0.41
116	0.42
117	0.43
118	0.45
119	0.49
120	0.47
121	0.52
122	0.51
123	0.46
124	0.46
125	0.44
126	0.4
127	0.35
128	0.33
129	0.27
130	0.23
131	0.22
132	0.29
133	0.34
134	0.4
135	0.47
136	0.54
137	0.58
138	0.66
139	0.7
140	0.71
141	0.73
142	0.69
143	0.7
144	0.7
145	0.65
146	0.63
147	0.6
148	0.53
149	0.52
150	0.48
151	0.41
152	0.36
153	0.35
154	0.3
155	0.25
156	0.21
157	0.16
158	0.16
159	0.16
160	0.15
161	0.14
162	0.17
163	0.2
164	0.22
165	0.24
166	0.25
167	0.29
168	0.33
169	0.39
170	0.39
171	0.38
172	0.39
173	0.45
174	0.45
175	0.43
176	0.4
177	0.34
178	0.34
179	0.31
180	0.31
181	0.29
182	0.27
183	0.25
184	0.23
185	0.23
186	0.2
187	0.19
188	0.17
189	0.12
190	0.11
191	0.1
192	0.08
193	0.07
194	0.11
195	0.12
196	0.14
197	0.15
198	0.19
199	0.23
200	0.3
201	0.33
202	0.38
203	0.43
204	0.45
205	0.52
206	0.51
207	0.52
208	0.51
209	0.5
210	0.45
211	0.46
212	0.45
213	0.36
214	0.4
215	0.37
216	0.35
217	0.41
218	0.46
219	0.43
220	0.42
221	0.42
222	0.42
223	0.48
224	0.46
225	0.43
226	0.37
227	0.34
228	0.35
229	0.35
230	0.29
231	0.24
232	0.24
233	0.19
234	0.17
235	0.16
236	0.13
237	0.12
238	0.14
239	0.17
240	0.2
241	0.2
242	0.2
243	0.19
244	0.19
245	0.18
246	0.17
247	0.13
248	0.08
249	0.08
250	0.09
251	0.09
252	0.1
253	0.1
254	0.08
255	0.09
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.07
260	0.06
261	0.06
262	0.07
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.08
270	0.06
271	0.07
272	0.12
273	0.18
274	0.18
275	0.21
276	0.24
277	0.3
278	0.34
279	0.42
280	0.48
281	0.52
282	0.6
283	0.62
284	0.65
285	0.58
286	0.61
287	0.56
288	0.51
289	0.41
290	0.35
291	0.3
292	0.27
293	0.27
294	0.22
295	0.2
296	0.17
297	0.2
298	0.19
299	0.23
300	0.26
301	0.25
302	0.32
303	0.38
304	0.43
305	0.48
306	0.56
307	0.54
308	0.59
309	0.64
310	0.59
311	0.6
312	0.52
313	0.45
314	0.41
315	0.41
316	0.34
317	0.3
318	0.32
319	0.3
320	0.31
321	0.31
322	0.29
323	0.27
324	0.28
325	0.29
326	0.25
327	0.28
328	0.3
329	0.3
330	0.29
331	0.34
332	0.34
333	0.35
334	0.35
335	0.31
336	0.32
337	0.35
338	0.39
339	0.42
340	0.46
341	0.5
342	0.54
343	0.52
344	0.5
345	0.49
346	0.46
347	0.4
348	0.33
349	0.26
350	0.19
351	0.17
352	0.14
353	0.11
354	0.08
355	0.06
356	0.07
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.04
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.06
370	0.07
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.09
375	0.1
376	0.11
377	0.12
378	0.14
379	0.18
380	0.2
381	0.24
382	0.28
383	0.28
384	0.27
385	0.29
386	0.3
387	0.31
388	0.3
389	0.26
390	0.22
391	0.21
392	0.2
393	0.17
394	0.12
395	0.07
396	0.06
397	0.06
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.06
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.08
412	0.1
413	0.11
414	0.12
415	0.14
416	0.17
417	0.24
418	0.29
419	0.34
420	0.4
421	0.48
422	0.56
423	0.6
424	0.66
425	0.7
426	0.75
427	0.72
428	0.71
429	0.64
430	0.56
431	0.53
432	0.44
433	0.35
434	0.25
435	0.22
436	0.18
437	0.17
438	0.16
439	0.13
440	0.11
441	0.1
442	0.1
443	0.1
444	0.08
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.09
449	0.1
450	0.1
451	0.1
452	0.12
453	0.11
454	0.11
455	0.12
456	0.15
457	0.2
458	0.27
459	0.35
460	0.39
461	0.42
462	0.48
463	0.56
464	0.57
465	0.61
466	0.62
467	0.63
468	0.61
469	0.6
470	0.58
471	0.54
472	0.51
473	0.5
474	0.47
475	0.4
476	0.39
477	0.37
478	0.38
479	0.35
480	0.35
481	0.29
482	0.25
483	0.23
484	0.25
485	0.26
486	0.26
487	0.25
488	0.3
489	0.35
490	0.38
491	0.4
492	0.39
493	0.42
494	0.48
495	0.55
496	0.57
497	0.57
498	0.63
499	0.68
500	0.67
501	0.67
502	0.66
503	0.67
504	0.67
505	0.69
506	0.63
507	0.63
508	0.64
509	0.69
510	0.62
511	0.54
512	0.47
513	0.39
514	0.36
515	0.27
516	0.23
517	0.23
518	0.23
519	0.22
520	0.24
521	0.24
522	0.27
523	0.35
524	0.42
525	0.42
526	0.48
527	0.58
528	0.66
529	0.75
530	0.79
531	0.81
532	0.83
533	0.8
534	0.78
535	0.73
536	0.64
537	0.54
538	0.44
539	0.36
540	0.27
541	0.24
542	0.16
543	0.11
544	0.11
545	0.14
546	0.17
547	0.17
548	0.19
549	0.2
550	0.24
551	0.24
552	0.24
553	0.24
554	0.24
555	0.24
556	0.22
557	0.22
558	0.19
559	0.23
560	0.28
561	0.27
562	0.25
563	0.26
564	0.29
565	0.31
566	0.33
567	0.37
568	0.38
569	0.44
570	0.46
571	0.46
572	0.53
573	0.54
574	0.53
575	0.44
576	0.38
577	0.36
578	0.36
579	0.36
580	0.32
581	0.32
582	0.36
583	0.43
584	0.45
585	0.44
586	0.45
587	0.46
588	0.41
589	0.39
590	0.39
591	0.33
592	0.33
593	0.29
594	0.24
595	0.2
596	0.21
597	0.19
598	0.12
599	0.11
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.06
604	0.04
605	0.04
606	0.04
607	0.05
608	0.11
609	0.15
610	0.16
611	0.22
612	0.25
613	0.34
614	0.41
615	0.5
616	0.54
617	0.59
618	0.67
619	0.72
620	0.75
621	0.72
622	0.67
623	0.61
624	0.54
625	0.46
626	0.35
627	0.26
628	0.21
629	0.22
630	0.21
631	0.19
632	0.19
633	0.19
634	0.2
635	0.19
636	0.18
637	0.13
638	0.13
639	0.1
640	0.08
641	0.08
642	0.07
643	0.07
644	0.07
645	0.07
646	0.06
647	0.06
648	0.06
649	0.11
650	0.13
651	0.12
652	0.13
653	0.13
654	0.17
655	0.17
656	0.17
657	0.13
658	0.13
659	0.16
660	0.17
661	0.18
662	0.15
663	0.17
664	0.17
665	0.16
666	0.16
667	0.13
668	0.12
669	0.1
670	0.09
671	0.07
672	0.06
673	0.06
674	0.06
675	0.07
676	0.11
677	0.12
678	0.15
679	0.15
680	0.17
681	0.24
682	0.25
683	0.34
684	0.4
685	0.48
686	0.5
687	0.58
688	0.64
689	0.66
690	0.68
691	0.63
692	0.63
693	0.6
694	0.62
695	0.57
696	0.54
697	0.45
698	0.42
699	0.4
700	0.32
701	0.32
702	0.27
703	0.26
704	0.23
705	0.25
706	0.25
707	0.23
708	0.26
709	0.3
710	0.34
711	0.33
712	0.36
713	0.37
714	0.37
715	0.37
716	0.41
717	0.33
718	0.33
719	0.37
720	0.41
721	0.39
722	0.4
723	0.41
724	0.32
725	0.37
726	0.33
727	0.29
728	0.24
729	0.23
730	0.25
731	0.24
732	0.24
733	0.19
734	0.19
735	0.17
736	0.21
737	0.22
738	0.24
739	0.26
740	0.29
741	0.32
742	0.33
743	0.33
744	0.29
745	0.27
746	0.3
747	0.3
748	0.25
749	0.21
750	0.2
751	0.24
752	0.21
753	0.21
754	0.12
755	0.1
756	0.1
757	0.11
758	0.1
759	0.06
760	0.05
761	0.05
762	0.06
763	0.06
764	0.06
765	0.05
766	0.07
767	0.07
768	0.09
769	0.09
770	0.1
771	0.1
772	0.11
773	0.11
774	0.13
775	0.15
776	0.14
777	0.16
778	0.23
779	0.26
780	0.26
781	0.29
782	0.32
783	0.33
784	0.33
785	0.36
786	0.31
787	0.31
788	0.33
789	0.31
790	0.29
791	0.31
792	0.39
793	0.43
794	0.5
795	0.47
796	0.47
797	0.5
798	0.5
799	0.47
800	0.45
801	0.45
802	0.4

A0A559MK73

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer