Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A559MF46

Protein Details
Accession A0A559MF46   
Localization Confidence Medium
Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-96TGVWVIRKQTRRKKQGEEDEIAHydrophilic
281-307EKTPTKSPGVKGPKRRKSKGVNSTGGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-299KKDGLKGEKTPTKSPGVKGPKRRKSK
Subcellular Location(s) cyto 6, cyto_mito 8.832, cyto_nucl 10.166, mito 10, mito_nucl 11.332, nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MSMQGIHSNSVLFYFAESPFFDKTSNNAVLFSQALYNQAMLPVIQTREAFEGRLKTMSGLEFMVAQEPADPVNGTGVWVIRKQTRRKKQGEEDEIALHSTYFVVGENIYMAPAVADVLGSRTLSILTSLNKFFSTATTLPSFSPALGTTYLPPPSTSRLKPTESQSVLSQTSKENTPLPDSLTSKKALLPSTNNSTFLSSRLLEESLNITLKYGEEYMDENPITGEPGAFHLTTTGRVEKDKLAVPVVSKGGGLGSKTGTPAPPLLKTTGIEAKKDGLKGEKTPTKSPGVKGPKRRKSKGVNSTGGVTPTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.14
4 0.15
5 0.18
6 0.18
7 0.2
8 0.19
9 0.17
10 0.2
11 0.26
12 0.3
13 0.28
14 0.27
15 0.26
16 0.27
17 0.27
18 0.23
19 0.17
20 0.12
21 0.14
22 0.13
23 0.14
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.09
28 0.1
29 0.12
30 0.12
31 0.14
32 0.14
33 0.15
34 0.19
35 0.2
36 0.2
37 0.2
38 0.23
39 0.22
40 0.24
41 0.22
42 0.19
43 0.2
44 0.2
45 0.17
46 0.14
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.1
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.06
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.1
65 0.12
66 0.15
67 0.2
68 0.28
69 0.38
70 0.48
71 0.57
72 0.66
73 0.72
74 0.79
75 0.82
76 0.85
77 0.83
78 0.76
79 0.68
80 0.59
81 0.52
82 0.43
83 0.32
84 0.21
85 0.13
86 0.09
87 0.07
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.03
102 0.02
103 0.02
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.11
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.15
122 0.12
123 0.15
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.18
128 0.17
129 0.11
130 0.12
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.09
136 0.11
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.16
142 0.21
143 0.2
144 0.24
145 0.27
146 0.3
147 0.33
148 0.36
149 0.4
150 0.36
151 0.37
152 0.32
153 0.31
154 0.3
155 0.26
156 0.23
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.15
163 0.18
164 0.17
165 0.19
166 0.21
167 0.22
168 0.23
169 0.23
170 0.23
171 0.2
172 0.22
173 0.23
174 0.21
175 0.21
176 0.23
177 0.26
178 0.33
179 0.33
180 0.33
181 0.3
182 0.31
183 0.28
184 0.25
185 0.23
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.1
204 0.1
205 0.14
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.09
213 0.06
214 0.08
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.12
220 0.14
221 0.17
222 0.18
223 0.17
224 0.18
225 0.2
226 0.21
227 0.24
228 0.25
229 0.24
230 0.23
231 0.23
232 0.23
233 0.25
234 0.23
235 0.2
236 0.16
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.13
245 0.15
246 0.14
247 0.15
248 0.18
249 0.2
250 0.22
251 0.23
252 0.24
253 0.25
254 0.25
255 0.28
256 0.32
257 0.31
258 0.29
259 0.28
260 0.31
261 0.33
262 0.34
263 0.31
264 0.3
265 0.32
266 0.35
267 0.44
268 0.46
269 0.47
270 0.51
271 0.53
272 0.55
273 0.56
274 0.55
275 0.55
276 0.59
277 0.63
278 0.69
279 0.75
280 0.77
281 0.82
282 0.86
283 0.86
284 0.85
285 0.88
286 0.87
287 0.86
288 0.83
289 0.75
290 0.73
291 0.65