Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A559MF46

Protein Details
Accession A0A559MF46    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-96TGVWVIRKQTRRKKQGEEDEIAHydrophilic
281-307EKTPTKSPGVKGPKRRKSKGVNSTGGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-299KKDGLKGEKTPTKSPGVKGPKRRKSK
Subcellular Location(s) mito_nucl 11.332, nucl 11, cyto_nucl 10.166, mito 10, cyto_mito 8.832, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MSMQGIHSNSVLFYFAESPFFDKTSNNAVLFSQALYNQAMLPVIQTREAFEGRLKTMSGLEFMVAQEPADPVNGTGVWVIRKQTRRKKQGEEDEIALHSTYFVVGENIYMAPAVADVLGSRTLSILTSLNKFFSTATTLPSFSPALGTTYLPPPSTSRLKPTESQSVLSQTSKENTPLPDSLTSKKALLPSTNNSTFLSSRLLEESLNITLKYGEEYMDENPITGEPGAFHLTTTGRVEKDKLAVPVVSKGGGLGSKTGTPAPPLLKTTGIEAKKDGLKGEKTPTKSPGVKGPKRRKSKGVNSTGGVTPTT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.14
4 0.15
5 0.18
6 0.18
7 0.2
8 0.19
9 0.17
10 0.2
11 0.26
12 0.3
13 0.28
14 0.27
15 0.26
16 0.27
17 0.27
18 0.23
19 0.17
20 0.12
21 0.14
22 0.13
23 0.14
24 0.12
25 0.11
26 0.11
27 0.09
28 0.1
29 0.12
30 0.12
31 0.14
32 0.14
33 0.15
34 0.19
35 0.2
36 0.2
37 0.2
38 0.23
39 0.22
40 0.24
41 0.22
42 0.19
43 0.2
44 0.2
45 0.17
46 0.14
47 0.12
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.1
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.06
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.1
65 0.12
66 0.15
67 0.2
68 0.28
69 0.38
70 0.48
71 0.57
72 0.66
73 0.72
74 0.79
75 0.82
76 0.85
77 0.83
78 0.76
79 0.68
80 0.59
81 0.52
82 0.43
83 0.32
84 0.21
85 0.13
86 0.09
87 0.07
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.03
102 0.02
103 0.02
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.11
115 0.12
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.12
120 0.11
121 0.15
122 0.12
123 0.15
124 0.15
125 0.16
126 0.16
127 0.18
128 0.17
129 0.11
130 0.12
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.09
136 0.11
137 0.13
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.16
142 0.21
143 0.2
144 0.24
145 0.27
146 0.3
147 0.33
148 0.36
149 0.4
150 0.36
151 0.37
152 0.32
153 0.31
154 0.3
155 0.26
156 0.23
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.15
163 0.18
164 0.17
165 0.19
166 0.21
167 0.22
168 0.23
169 0.23
170 0.23
171 0.2
172 0.22
173 0.23
174 0.21
175 0.21
176 0.23
177 0.26
178 0.33
179 0.33
180 0.33
181 0.3
182 0.31
183 0.28
184 0.25
185 0.23
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.1
204 0.1
205 0.14
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.09
213 0.06
214 0.08
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.11
219 0.12
220 0.14
221 0.17
222 0.18
223 0.17
224 0.18
225 0.2
226 0.21
227 0.24
228 0.25
229 0.24
230 0.23
231 0.23
232 0.23
233 0.25
234 0.23
235 0.2
236 0.16
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.13
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.13
245 0.15
246 0.14
247 0.15
248 0.18
249 0.2
250 0.22
251 0.23
252 0.24
253 0.25
254 0.25
255 0.28
256 0.32
257 0.31
258 0.29
259 0.28
260 0.31
261 0.33
262 0.34
263 0.31
264 0.3
265 0.32
266 0.35
267 0.44
268 0.46
269 0.47
270 0.51
271 0.53
272 0.55
273 0.56
274 0.55
275 0.55
276 0.59
277 0.63
278 0.69
279 0.75
280 0.77
281 0.82
282 0.86
283 0.86
284 0.85
285 0.88
286 0.87
287 0.86
288 0.83
289 0.75
290 0.73
291 0.65