FuNGI

A0A559M6Q3

Protein Details

Accession

A0A559M6Q3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
87-106	GVAPRAKMNQQRARRFRTAL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 17, nucl 6, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR016494 5_3_exoribonuclease_1 IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR041385 SH3_12 IPR040992 XRN1_D1 IPR047007 XRN1_D1_sf IPR041106 XRN1_D2_D3 IPR040486 Xrn1_D3 IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR047008 XRN1_SH3_sf
Gene Ontology	GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000956 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF18129 SH3_12 PF18332 XRN1_D1 PF18334 XRN1_D2_D3 PF18194 Xrn1_D3 PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPKFFRWMSERYPAISQLIAENRIPEFDCLYLDMNGIIHNCTHKDSDDATFRMSEEQMFLAIFNYIEHLYGKIKPKQLFFMAIDGVAPRAKMNQQRARRFRTALDVENAREKAIREGKEMPKEEAFDSNSITPGTEFMHKLTQQLKYFINKKVSEDVEWQGVEIVLSGHEVPGEGEHKVMEYIRLAKAQPDYDPNVRHCLYGLDADLIMLGLLSHDPHFCLLREEVTFGRQSKTKSKELEHQNFYLMHLCIVREYLELEFQELKEDGALGFAFDLERVIDDFILMAFFVGNDFLPNLPNLHINEGALALMFKIYKTVLPKGTGYINEGGVINMERLAVLLEELSHVEYRFFETESSDQKWFKSKQMAKEDVMVKGKTKGKITMTTPQREVWKQIKKYVTRRSDEPLNLPATLPAADRKFVQDLAESLHLEWKTIEDDQGDRHMQLSFPPKLVGDDEEDDEEDEESQLAVRRVVKQFDSAQTIDLSRAEAQAEMDRQYEEKFQEWKDKYYEGKFEWTRKNDTELTKLCENYVQGLQWVLFYYYRGVASWPWFYQYHYSPMISDVIKGLKADVNFKLGQPFHPYEQLMGVLPDRSKKIVPEVYHDLMTNPNSPIIDFYPRDFELDMNGKKMEWEAVVKIPFIEEDRLLAAMAPKNALLSADEKFRNEFGVTLKFTHDPDISFTYPSSLVGIFPDIPNCHCVENIFDLPTIEGLEYHVGLMEGVKLGHDALAGFPSLATLPYNATLGFHSVNVFQSDSKNESMVVTIEDSENRTNVKTATMKLGQRVFVGYPFLQEGKVVKVSDELFDYFPSSDGSNQPLQQPHGPREIEDFRKKADRIENNYSKRLGIIIGPVESITHVEILKGLRKTDEGASIKEYAVIPGIETDYATQICVDEVASEDQRFLEKAAVPIEEEFPPGSRAFFLGEFNYGRPLEIISHKDNRAEIWLSTIKAKEVEFGRNIVNGHGSKTHYTPSFAVAKMLGLHPLVLSKITSSFAISALGLDRLNLGLNLKFEAKKLKVLGYSQRTDKGWEFSNKAIGLLSTYMTKFPELFAGIQRKPQGNQYDAEDFYPAEIAGEKIKEIAAWLKSIESKNFEKVPLAAEQLDSDAVMAIERAADAALAATGAAEPSDFKKLKGVPRNALMKPSDAEHRLGNQTFALGDRVVYVQDSGRVPIATRGTVVGISRTQRAILLDVVFDVTFMSGTDLGQRCTHFRGSTITTTSVLNLTNKQMIAGSKAGAEKRPAPFSTPLSVNGGYGMPTGPGGRGQLREPNAPAPLRGSFRGAVAGQNGFRGNGFSRGRGRGGLGYSDQNASSGMHSSNMAIRGNLQNGMNG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.43
3	0.4
4	0.35
5	0.29
6	0.27
7	0.3
8	0.3
9	0.27
10	0.28
11	0.26
12	0.27
13	0.28
14	0.22
15	0.19
16	0.17
17	0.17
18	0.17
19	0.19
20	0.17
21	0.16
22	0.15
23	0.13
24	0.15
25	0.14
26	0.13
27	0.12
28	0.15
29	0.16
30	0.19
31	0.21
32	0.2
33	0.23
34	0.25
35	0.31
36	0.35
37	0.35
38	0.34
39	0.33
40	0.32
41	0.32
42	0.29
43	0.23
44	0.18
45	0.17
46	0.15
47	0.14
48	0.14
49	0.11
50	0.1
51	0.09
52	0.07
53	0.09
54	0.09
55	0.1
56	0.1
57	0.12
58	0.14
59	0.21
60	0.29
61	0.33
62	0.41
63	0.45
64	0.48
65	0.52
66	0.53
67	0.53
68	0.46
69	0.44
70	0.38
71	0.33
72	0.3
73	0.23
74	0.21
75	0.16
76	0.14
77	0.1
78	0.13
79	0.2
80	0.28
81	0.38
82	0.46
83	0.55
84	0.66
85	0.75
86	0.8
87	0.8
88	0.75
89	0.68
90	0.68
91	0.65
92	0.59
93	0.57
94	0.53
95	0.48
96	0.53
97	0.5
98	0.4
99	0.36
100	0.31
101	0.34
102	0.37
103	0.37
104	0.35
105	0.43
106	0.51
107	0.58
108	0.6
109	0.55
110	0.51
111	0.51
112	0.47
113	0.44
114	0.39
115	0.31
116	0.31
117	0.28
118	0.26
119	0.23
120	0.22
121	0.16
122	0.14
123	0.15
124	0.17
125	0.16
126	0.17
127	0.25
128	0.25
129	0.3
130	0.34
131	0.4
132	0.38
133	0.42
134	0.44
135	0.45
136	0.51
137	0.53
138	0.57
139	0.51
140	0.51
141	0.55
142	0.53
143	0.48
144	0.47
145	0.42
146	0.38
147	0.36
148	0.32
149	0.25
150	0.22
151	0.18
152	0.13
153	0.1
154	0.05
155	0.06
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.06
160	0.06
161	0.09
162	0.11
163	0.1
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.12
168	0.12
169	0.11
170	0.12
171	0.16
172	0.18
173	0.21
174	0.21
175	0.24
176	0.28
177	0.28
178	0.28
179	0.29
180	0.33
181	0.37
182	0.42
183	0.4
184	0.44
185	0.42
186	0.39
187	0.34
188	0.3
189	0.25
190	0.23
191	0.21
192	0.15
193	0.14
194	0.14
195	0.13
196	0.11
197	0.08
198	0.05
199	0.04
200	0.03
201	0.03
202	0.05
203	0.06
204	0.06
205	0.07
206	0.09
207	0.11
208	0.11
209	0.15
210	0.15
211	0.17
212	0.18
213	0.2
214	0.19
215	0.21
216	0.25
217	0.22
218	0.25
219	0.25
220	0.29
221	0.35
222	0.41
223	0.45
224	0.47
225	0.5
226	0.56
227	0.64
228	0.69
229	0.65
230	0.6
231	0.56
232	0.51
233	0.47
234	0.43
235	0.32
236	0.23
237	0.19
238	0.18
239	0.15
240	0.15
241	0.15
242	0.1
243	0.11
244	0.1
245	0.13
246	0.12
247	0.15
248	0.16
249	0.15
250	0.17
251	0.16
252	0.15
253	0.12
254	0.12
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.04
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.06
270	0.06
271	0.06
272	0.06
273	0.05
274	0.04
275	0.03
276	0.03
277	0.04
278	0.04
279	0.04
280	0.04
281	0.05
282	0.06
283	0.07
284	0.07
285	0.09
286	0.09
287	0.13
288	0.14
289	0.16
290	0.17
291	0.16
292	0.16
293	0.15
294	0.13
295	0.09
296	0.08
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.09
304	0.13
305	0.19
306	0.22
307	0.24
308	0.25
309	0.26
310	0.3
311	0.28
312	0.27
313	0.23
314	0.2
315	0.18
316	0.18
317	0.15
318	0.13
319	0.12
320	0.09
321	0.07
322	0.07
323	0.05
324	0.05
325	0.06
326	0.05
327	0.04
328	0.04
329	0.04
330	0.05
331	0.05
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.08
336	0.08
337	0.12
338	0.12
339	0.13
340	0.12
341	0.14
342	0.18
343	0.23
344	0.26
345	0.26
346	0.26
347	0.27
348	0.35
349	0.34
350	0.36
351	0.41
352	0.43
353	0.49
354	0.58
355	0.62
356	0.55
357	0.6
358	0.57
359	0.52
360	0.51
361	0.42
362	0.34
363	0.36
364	0.4
365	0.36
366	0.36
367	0.36
368	0.35
369	0.41
370	0.43
371	0.45
372	0.48
373	0.49
374	0.49
375	0.46
376	0.48
377	0.44
378	0.46
379	0.46
380	0.48
381	0.46
382	0.51
383	0.56
384	0.59
385	0.67
386	0.7
387	0.7
388	0.64
389	0.64
390	0.63
391	0.63
392	0.58
393	0.52
394	0.47
395	0.4
396	0.36
397	0.33
398	0.27
399	0.2
400	0.18
401	0.14
402	0.14
403	0.13
404	0.14
405	0.14
406	0.17
407	0.17
408	0.17
409	0.17
410	0.14
411	0.13
412	0.16
413	0.18
414	0.16
415	0.14
416	0.18
417	0.17
418	0.16
419	0.16
420	0.13
421	0.13
422	0.13
423	0.14
424	0.1
425	0.11
426	0.13
427	0.17
428	0.17
429	0.15
430	0.15
431	0.15
432	0.14
433	0.17
434	0.23
435	0.2
436	0.2
437	0.21
438	0.2
439	0.21
440	0.22
441	0.19
442	0.15
443	0.15
444	0.15
445	0.15
446	0.15
447	0.14
448	0.14
449	0.12
450	0.09
451	0.07
452	0.06
453	0.05
454	0.06
455	0.08
456	0.08
457	0.1
458	0.12
459	0.18
460	0.2
461	0.23
462	0.23
463	0.24
464	0.27
465	0.29
466	0.32
467	0.26
468	0.24
469	0.23
470	0.22
471	0.19
472	0.16
473	0.14
474	0.09
475	0.1
476	0.09
477	0.08
478	0.09
479	0.11
480	0.12
481	0.12
482	0.12
483	0.11
484	0.12
485	0.13
486	0.15
487	0.14
488	0.16
489	0.19
490	0.2
491	0.29
492	0.31
493	0.33
494	0.32
495	0.35
496	0.36
497	0.35
498	0.39
499	0.3
500	0.37
501	0.37
502	0.42
503	0.47
504	0.47
505	0.48
506	0.45
507	0.48
508	0.45
509	0.44
510	0.44
511	0.39
512	0.4
513	0.37
514	0.36
515	0.31
516	0.28
517	0.25
518	0.2
519	0.19
520	0.13
521	0.11
522	0.11
523	0.11
524	0.09
525	0.09
526	0.08
527	0.06
528	0.07
529	0.08
530	0.08
531	0.08
532	0.08
533	0.09
534	0.09
535	0.12
536	0.14
537	0.13
538	0.15
539	0.16
540	0.17
541	0.2
542	0.2
543	0.22
544	0.21
545	0.21
546	0.18
547	0.19
548	0.21
549	0.17
550	0.15
551	0.12
552	0.11
553	0.11
554	0.11
555	0.1
556	0.1
557	0.1
558	0.13
559	0.13
560	0.16
561	0.16
562	0.16
563	0.2
564	0.19
565	0.2
566	0.22
567	0.24
568	0.21
569	0.24
570	0.24
571	0.19
572	0.19
573	0.18
574	0.12
575	0.11
576	0.1
577	0.08
578	0.09
579	0.1
580	0.11
581	0.12
582	0.12
583	0.12
584	0.18
585	0.21
586	0.22
587	0.26
588	0.31
589	0.31
590	0.31
591	0.31
592	0.25
593	0.23
594	0.23
595	0.19
596	0.13
597	0.12
598	0.11
599	0.11
600	0.12
601	0.12
602	0.15
603	0.14
604	0.14
605	0.18
606	0.18
607	0.19
608	0.18
609	0.16
610	0.15
611	0.21
612	0.21
613	0.18
614	0.18
615	0.17
616	0.16
617	0.17
618	0.14
619	0.08
620	0.08
621	0.08
622	0.11
623	0.12
624	0.12
625	0.12
626	0.11
627	0.1
628	0.1
629	0.1
630	0.07
631	0.07
632	0.07
633	0.07
634	0.07
635	0.07
636	0.08
637	0.08
638	0.09
639	0.08
640	0.08
641	0.08
642	0.08
643	0.08
644	0.06
645	0.07
646	0.07
647	0.12
648	0.13
649	0.13
650	0.14
651	0.14
652	0.14
653	0.13
654	0.13
655	0.1
656	0.14
657	0.15
658	0.15
659	0.17
660	0.17
661	0.17
662	0.19
663	0.17
664	0.13
665	0.15
666	0.18
667	0.17
668	0.17
669	0.16
670	0.15
671	0.14
672	0.14
673	0.12
674	0.07
675	0.07
676	0.06
677	0.08
678	0.07
679	0.07
680	0.08
681	0.08
682	0.08
683	0.1
684	0.1
685	0.1
686	0.09
687	0.09
688	0.1
689	0.13
690	0.14
691	0.13
692	0.12
693	0.12
694	0.12
695	0.12
696	0.1
697	0.06
698	0.05
699	0.04
700	0.05
701	0.05
702	0.05
703	0.04
704	0.04
705	0.04
706	0.04
707	0.04
708	0.03
709	0.03
710	0.03
711	0.03
712	0.03
713	0.04
714	0.04
715	0.03
716	0.03
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.04
721	0.04
722	0.04
723	0.04
724	0.04
725	0.04
726	0.05
727	0.06
728	0.06
729	0.06
730	0.06
731	0.06
732	0.08
733	0.08
734	0.07
735	0.08
736	0.08
737	0.09
738	0.1
739	0.1
740	0.09
741	0.1
742	0.12
743	0.14
744	0.13
745	0.13
746	0.12
747	0.12
748	0.12
749	0.11
750	0.09
751	0.07
752	0.07
753	0.07
754	0.07
755	0.09
756	0.09
757	0.09
758	0.1
759	0.09
760	0.1
761	0.1
762	0.13
763	0.14
764	0.14
765	0.19
766	0.24
767	0.25
768	0.28
769	0.3
770	0.27
771	0.25
772	0.25
773	0.2
774	0.16
775	0.17
776	0.13
777	0.11
778	0.12
779	0.12
780	0.1
781	0.1
782	0.11
783	0.11
784	0.14
785	0.13
786	0.12
787	0.14
788	0.15
789	0.15
790	0.16
791	0.14
792	0.12
793	0.12
794	0.13
795	0.1
796	0.1
797	0.1
798	0.09
799	0.09
800	0.1
801	0.14
802	0.15
803	0.16
804	0.19
805	0.2
806	0.22
807	0.25
808	0.28
809	0.28
810	0.32
811	0.31
812	0.28
813	0.33
814	0.37
815	0.4
816	0.42
817	0.4
818	0.36
819	0.42
820	0.42
821	0.41
822	0.44
823	0.44
824	0.46
825	0.56
826	0.62
827	0.6
828	0.63
829	0.58
830	0.49
831	0.41
832	0.33
833	0.23
834	0.15
835	0.13
836	0.11
837	0.11
838	0.11
839	0.1
840	0.1
841	0.09
842	0.09
843	0.06
844	0.06
845	0.06
846	0.06
847	0.08
848	0.09
849	0.15
850	0.15
851	0.15
852	0.15
853	0.15
854	0.18
855	0.18
856	0.25
857	0.22
858	0.22
859	0.24
860	0.25
861	0.24
862	0.24
863	0.22
864	0.14
865	0.13
866	0.12
867	0.09
868	0.08
869	0.09
870	0.07
871	0.07
872	0.07
873	0.07
874	0.07
875	0.07
876	0.07
877	0.06
878	0.06
879	0.06
880	0.06
881	0.04
882	0.06
883	0.08
884	0.1
885	0.1
886	0.1
887	0.1
888	0.11
889	0.11
890	0.1
891	0.11
892	0.11
893	0.13
894	0.14
895	0.14
896	0.14
897	0.15
898	0.17
899	0.14
900	0.13
901	0.12
902	0.11
903	0.12
904	0.12
905	0.11
906	0.09
907	0.09
908	0.1
909	0.11
910	0.12
911	0.11
912	0.14
913	0.14
914	0.14
915	0.18
916	0.16
917	0.15
918	0.13
919	0.13
920	0.13
921	0.17
922	0.22
923	0.23
924	0.29
925	0.3
926	0.32
927	0.31
928	0.29
929	0.29
930	0.26
931	0.2
932	0.2
933	0.21
934	0.2
935	0.23
936	0.23
937	0.19
938	0.2
939	0.2
940	0.19
941	0.19
942	0.23
943	0.22
944	0.23
945	0.23
946	0.24
947	0.24
948	0.2
949	0.22
950	0.17
951	0.18
952	0.2
953	0.21
954	0.21
955	0.22
956	0.26
957	0.22
958	0.24
959	0.23
960	0.24
961	0.26
962	0.24
963	0.24
964	0.19
965	0.18
966	0.17
967	0.17
968	0.14
969	0.09
970	0.1
971	0.09
972	0.09
973	0.09
974	0.08
975	0.08
976	0.07
977	0.08
978	0.09
979	0.09
980	0.09
981	0.1
982	0.09
983	0.1
984	0.09
985	0.09
986	0.08
987	0.1
988	0.08
989	0.08
990	0.08
991	0.07
992	0.08
993	0.07
994	0.08
995	0.08
996	0.09
997	0.11
998	0.14
999	0.14
1000	0.15
1001	0.23
1002	0.23
1003	0.27
1004	0.28
1005	0.31
1006	0.31
1007	0.35
1008	0.43
1009	0.42
1010	0.45
1011	0.43
1012	0.46
1013	0.43
1014	0.44
1015	0.42
1016	0.36
1017	0.36
1018	0.37
1019	0.37
1020	0.34
1021	0.4
1022	0.35
1023	0.33
1024	0.29
1025	0.22
1026	0.18
1027	0.15
1028	0.14
1029	0.11
1030	0.11
1031	0.12
1032	0.13
1033	0.13
1034	0.12
1035	0.12
1036	0.14
1037	0.13
1038	0.14
1039	0.2
1040	0.28
1041	0.28
1042	0.32
1043	0.37
1044	0.36
1045	0.36
1046	0.42
1047	0.42
1048	0.36
1049	0.37
1050	0.37
1051	0.38
1052	0.36
1053	0.35
1054	0.28
1055	0.22
1056	0.19
1057	0.18
1058	0.12
1059	0.07
1060	0.07
1061	0.07
1062	0.09
1063	0.1
1064	0.09
1065	0.09
1066	0.1
1067	0.09
1068	0.1
1069	0.15
1070	0.13
1071	0.14
1072	0.14
1073	0.16
1074	0.21
1075	0.24
1076	0.26
1077	0.26
1078	0.28
1079	0.33
1080	0.35
1081	0.34
1082	0.31
1083	0.29
1084	0.28
1085	0.25
1086	0.25
1087	0.2
1088	0.17
1089	0.17
1090	0.16
1091	0.15
1092	0.12
1093	0.09
1094	0.07
1095	0.06
1096	0.05
1097	0.05
1098	0.04
1099	0.04
1100	0.04
1101	0.04
1102	0.03
1103	0.03
1104	0.03
1105	0.03
1106	0.03
1107	0.03
1108	0.03
1109	0.03
1110	0.03
1111	0.03
1112	0.03
1113	0.03
1114	0.05
1115	0.07
1116	0.16
1117	0.17
1118	0.17
1119	0.24
1120	0.31
1121	0.4
1122	0.49
1123	0.55
1124	0.53
1125	0.6
1126	0.68
1127	0.63
1128	0.63
1129	0.55
1130	0.48
1131	0.41
1132	0.37
1133	0.36
1134	0.3
1135	0.31
1136	0.27
1137	0.3
1138	0.34
1139	0.33
1140	0.32
1141	0.25
1142	0.23
1143	0.22
1144	0.2
1145	0.17
1146	0.11
1147	0.1
1148	0.1
1149	0.11
1150	0.1
1151	0.1
1152	0.1
1153	0.09
1154	0.14
1155	0.15
1156	0.15
1157	0.16
1158	0.16
1159	0.16
1160	0.21
1161	0.23
1162	0.19
1163	0.19
1164	0.18
1165	0.17
1166	0.19
1167	0.18
1168	0.16
1169	0.17
1170	0.19
1171	0.22
1172	0.21
1173	0.21
1174	0.21
1175	0.22
1176	0.21
1177	0.2
1178	0.18
1179	0.16
1180	0.15
1181	0.16
1182	0.14
1183	0.12
1184	0.1
1185	0.07
1186	0.06
1187	0.06
1188	0.08
1189	0.07
1190	0.07
1191	0.16
1192	0.17
1193	0.19
1194	0.22
1195	0.24
1196	0.24
1197	0.29
1198	0.33
1199	0.26
1200	0.26
1201	0.3
1202	0.33
1203	0.37
1204	0.38
1205	0.35
1206	0.32
1207	0.31
1208	0.31
1209	0.26
1210	0.23
1211	0.21
1212	0.2
1213	0.22
1214	0.25
1215	0.24
1216	0.23
1217	0.24
1218	0.22
1219	0.24
1220	0.22
1221	0.19
1222	0.19
1223	0.23
1224	0.26
1225	0.27
1226	0.3
1227	0.32
1228	0.36
1229	0.43
1230	0.4
1231	0.41
1232	0.44
1233	0.45
1234	0.47
1235	0.42
1236	0.39
1237	0.38
1238	0.37
1239	0.32
1240	0.28
1241	0.24
1242	0.18
1243	0.17
1244	0.14
1245	0.09
1246	0.09
1247	0.1
1248	0.09
1249	0.11
1250	0.14
1251	0.17
1252	0.19
1253	0.22
1254	0.29
1255	0.33
1256	0.37
1257	0.39
1258	0.4
1259	0.42
1260	0.41
1261	0.39
1262	0.35
1263	0.36
1264	0.35
1265	0.34
1266	0.34
1267	0.28
1268	0.28
1269	0.31
1270	0.28
1271	0.25
1272	0.25
1273	0.27
1274	0.23
1275	0.26
1276	0.25
1277	0.21
1278	0.21
1279	0.21
1280	0.2
1281	0.25
1282	0.27
1283	0.29
1284	0.35
1285	0.39
1286	0.41
1287	0.4
1288	0.4
1289	0.36
1290	0.37
1291	0.35
1292	0.31
1293	0.31
1294	0.31
1295	0.32
1296	0.29
1297	0.24
1298	0.22
1299	0.19
1300	0.17
1301	0.15
1302	0.14
1303	0.13
1304	0.14
1305	0.15
1306	0.19
1307	0.22
1308	0.21
1309	0.19
1310	0.22
1311	0.27
1312	0.29
1313	0.31

A0A559M6Q3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer