FuNGI

A0A559M1X9

Protein Details

Accession

A0A559M1X9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
76-98	IASKVKGKTPKDKKIPSDQRTTT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 13, cyto_nucl 12, nucl 9, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR029058 AB_hydrolase IPR020708 DNA-dir_RNA_polK_14-18kDa_CS IPR000801 Esterase-like IPR006110 Pol_omega/Rpo6/RPB6 IPR036161 RPB6/omega-like_sf IPR006111 Rpo6/Rpb6 IPR014186 S-formylglutathione_hydrol
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0052689 F:carboxylic ester hydrolase activity GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0018738 F:S-formylglutathione hydrolase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription GO:0046294 P:formaldehyde catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00756 Esterase PF01192 RNA_pol_Rpb6
PROSITE	View protein in PROSITE PS01111 RNA_POL_K_14KD

Amino Acid Sequences

MSDDEGGWGDAGGGGGEDYYENDEPEYDPDEPAEPVDLDEESHQVDDIAVGQNPDQLLTTGERSGVIEAGDLDAAIASKVKGKTPKDKKIPSDQRTTTPYMTKYERARILGTRALQISMNAPVLVDLEGETDPLQIAIKELREKKIPLIVRRYMPDGFTLSCDMALNLYLPPSAESSTQKIPVLFYLAGLTCTGDNGAEKGFFQKRASEKGIAVVYPDTSPRGLTISGQDESYDFGTGAGFYINATRAPWSSNYKMESYITTELPTHLFSSFPTLDRTRQSITGHSMGGHGALTLYLKNPGLYKSVSAFAPIANPVNCPWGQKAFAGYLGEEKEEWKKHDASELLRGWKGKGFETLIDVGTGDNFYKQGQLLPENFVAAAKESGNEKGVVVRYQDGYDHSYFFISTFSADHVDHAAKYLFA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.04
2	0.04
3	0.05
4	0.05
5	0.05
6	0.1
7	0.11
8	0.12
9	0.12
10	0.13
11	0.14
12	0.17
13	0.2
14	0.16
15	0.16
16	0.17
17	0.18
18	0.18
19	0.17
20	0.17
21	0.12
22	0.12
23	0.13
24	0.11
25	0.11
26	0.12
27	0.12
28	0.11
29	0.11
30	0.11
31	0.09
32	0.09
33	0.08
34	0.09
35	0.1
36	0.1
37	0.11
38	0.11
39	0.13
40	0.13
41	0.13
42	0.11
43	0.09
44	0.11
45	0.13
46	0.15
47	0.13
48	0.14
49	0.14
50	0.14
51	0.14
52	0.13
53	0.1
54	0.08
55	0.08
56	0.09
57	0.08
58	0.07
59	0.06
60	0.05
61	0.05
62	0.05
63	0.05
64	0.05
65	0.11
66	0.12
67	0.17
68	0.25
69	0.31
70	0.42
71	0.52
72	0.63
73	0.67
74	0.75
75	0.76
76	0.8
77	0.85
78	0.8
79	0.8
80	0.73
81	0.69
82	0.66
83	0.64
84	0.56
85	0.51
86	0.47
87	0.42
88	0.43
89	0.43
90	0.42
91	0.45
92	0.46
93	0.43
94	0.43
95	0.41
96	0.41
97	0.39
98	0.36
99	0.32
100	0.28
101	0.26
102	0.23
103	0.21
104	0.18
105	0.16
106	0.15
107	0.11
108	0.1
109	0.09
110	0.1
111	0.09
112	0.08
113	0.05
114	0.06
115	0.06
116	0.07
117	0.07
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.05
123	0.06
124	0.07
125	0.1
126	0.17
127	0.2
128	0.23
129	0.27
130	0.28
131	0.29
132	0.34
133	0.38
134	0.37
135	0.42
136	0.44
137	0.43
138	0.44
139	0.46
140	0.39
141	0.34
142	0.3
143	0.24
144	0.19
145	0.17
146	0.17
147	0.13
148	0.12
149	0.12
150	0.1
151	0.08
152	0.08
153	0.07
154	0.05
155	0.05
156	0.05
157	0.05
158	0.06
159	0.07
160	0.08
161	0.09
162	0.11
163	0.15
164	0.17
165	0.19
166	0.19
167	0.18
168	0.18
169	0.16
170	0.17
171	0.14
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.1
188	0.12
189	0.14
190	0.15
191	0.19
192	0.22
193	0.27
194	0.31
195	0.28
196	0.26
197	0.27
198	0.27
199	0.22
200	0.2
201	0.14
202	0.12
203	0.1
204	0.1
205	0.08
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.08
210	0.07
211	0.07
212	0.1
213	0.13
214	0.13
215	0.13
216	0.13
217	0.11
218	0.12
219	0.12
220	0.09
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.05
225	0.05
226	0.04
227	0.04
228	0.03
229	0.05
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.07
234	0.07
235	0.09
236	0.12
237	0.17
238	0.2
239	0.23
240	0.25
241	0.25
242	0.26
243	0.26
244	0.23
245	0.22
246	0.22
247	0.18
248	0.17
249	0.16
250	0.16
251	0.16
252	0.15
253	0.12
254	0.1
255	0.09
256	0.08
257	0.15
258	0.15
259	0.15
260	0.19
261	0.2
262	0.23
263	0.26
264	0.29
265	0.25
266	0.27
267	0.28
268	0.27
269	0.3
270	0.29
271	0.27
272	0.23
273	0.22
274	0.18
275	0.17
276	0.13
277	0.08
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.08
284	0.08
285	0.09
286	0.1
287	0.12
288	0.14
289	0.14
290	0.15
291	0.15
292	0.17
293	0.17
294	0.17
295	0.16
296	0.13
297	0.15
298	0.15
299	0.16
300	0.14
301	0.15
302	0.14
303	0.19
304	0.19
305	0.19
306	0.21
307	0.21
308	0.22
309	0.22
310	0.24
311	0.2
312	0.22
313	0.21
314	0.18
315	0.18
316	0.17
317	0.17
318	0.15
319	0.16
320	0.21
321	0.24
322	0.27
323	0.28
324	0.29
325	0.29
326	0.36
327	0.38
328	0.34
329	0.4
330	0.42
331	0.41
332	0.42
333	0.42
334	0.36
335	0.36
336	0.34
337	0.26
338	0.26
339	0.24
340	0.22
341	0.26
342	0.26
343	0.23
344	0.22
345	0.2
346	0.15
347	0.13
348	0.13
349	0.09
350	0.08
351	0.08
352	0.08
353	0.1
354	0.11
355	0.13
356	0.16
357	0.22
358	0.23
359	0.27
360	0.28
361	0.26
362	0.26
363	0.23
364	0.19
365	0.16
366	0.15
367	0.11
368	0.12
369	0.13
370	0.16
371	0.17
372	0.17
373	0.15
374	0.19
375	0.22
376	0.23
377	0.23
378	0.25
379	0.25
380	0.25
381	0.27
382	0.24
383	0.27
384	0.26
385	0.25
386	0.22
387	0.21
388	0.2
389	0.19
390	0.16
391	0.11
392	0.1
393	0.09
394	0.11
395	0.13
396	0.13
397	0.15
398	0.18
399	0.19
400	0.19
401	0.21

A0A559M1X9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer