Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A559M7Y7

Protein Details
Accession A0A559M7Y7    Localization Confidence High Confidence Score 25.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-23NPNMEKIGKRKNAPAKKQADHydrophilic
34-59STSVTKSQNQDRSKNKQEKQLAKDLLHydrophilic
143-165GKVIKKRNVKQAKMEKKKAKVQEBasic
471-498LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGYIDVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-162VIKKRNVKQAKMEKKKAK
218-231APSPKPKSRGLKRK
477-489KGFTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSGNPNMEKIGKRKNAPAKKQADWLFPSSDKPASTSVTKSQNQDRSKNKQEKQLAKDLLKQQADGASSKPAPPSQLVGLIGAFLSENEFASTTRAFRTESGTRGLAVEDVQNIPSLNTIYNEWLLLKVQDTVPDSKANVGENGKVIKKRNVKQAKMEKKKAKVQESSGASDVEMTDAPPTKVSGKRSPSLSSSGLSSASSSSSDSDADDEKEAPTTKAPSPKPKSRGLKRKAVSSSSESSTSGSDSSSDDEAPQVKKVKTKASSPSSSESSESSSGSDSSSDEAKVVNSSPSRSVSSSSDTGSSSDDEDPDTKKVVQTSSSSESDSSEGESDSSCNSVAQKTPLPASDSESSSGSDSDSTSSKKAAVNSESSATLSDGAKKSTTSSSDSSSESSSSDSDEEPKSKKVTKTVVTVTERKLSPPLPPNPVIKKPSRKTNVPFSRIPSDVKVDERLASNAYVPYDYAQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGYIDVEGKKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.74
3 0.78
4 0.81
5 0.78
6 0.74
7 0.79
8 0.75
9 0.73
10 0.67
11 0.61
12 0.56
13 0.5
14 0.49
15 0.44
16 0.41
17 0.33
18 0.31
19 0.3
20 0.28
21 0.3
22 0.31
23 0.34
24 0.4
25 0.44
26 0.48
27 0.54
28 0.59
29 0.63
30 0.68
31 0.7
32 0.7
33 0.77
34 0.82
35 0.78
36 0.78
37 0.81
38 0.82
39 0.8
40 0.8
41 0.77
42 0.71
43 0.73
44 0.71
45 0.7
46 0.61
47 0.54
48 0.45
49 0.41
50 0.39
51 0.32
52 0.26
53 0.24
54 0.24
55 0.25
56 0.27
57 0.24
58 0.25
59 0.25
60 0.27
61 0.22
62 0.25
63 0.24
64 0.22
65 0.2
66 0.17
67 0.15
68 0.12
69 0.1
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.08
76 0.08
77 0.11
78 0.12
79 0.12
80 0.13
81 0.15
82 0.15
83 0.16
84 0.23
85 0.25
86 0.26
87 0.29
88 0.28
89 0.27
90 0.26
91 0.25
92 0.19
93 0.15
94 0.14
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.12
107 0.12
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.14
117 0.17
118 0.19
119 0.2
120 0.22
121 0.21
122 0.22
123 0.23
124 0.2
125 0.21
126 0.19
127 0.19
128 0.19
129 0.23
130 0.24
131 0.27
132 0.3
133 0.35
134 0.43
135 0.48
136 0.56
137 0.62
138 0.63
139 0.69
140 0.76
141 0.79
142 0.8
143 0.84
144 0.81
145 0.78
146 0.82
147 0.8
148 0.77
149 0.72
150 0.66
151 0.64
152 0.6
153 0.56
154 0.49
155 0.4
156 0.32
157 0.26
158 0.21
159 0.14
160 0.1
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.09
166 0.11
167 0.14
168 0.18
169 0.24
170 0.3
171 0.34
172 0.38
173 0.4
174 0.42
175 0.39
176 0.4
177 0.36
178 0.28
179 0.24
180 0.21
181 0.19
182 0.16
183 0.14
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.11
202 0.14
203 0.16
204 0.24
205 0.28
206 0.36
207 0.43
208 0.51
209 0.54
210 0.6
211 0.67
212 0.69
213 0.76
214 0.72
215 0.74
216 0.67
217 0.71
218 0.65
219 0.58
220 0.51
221 0.46
222 0.43
223 0.35
224 0.34
225 0.26
226 0.23
227 0.2
228 0.17
229 0.12
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.12
239 0.12
240 0.14
241 0.17
242 0.18
243 0.21
244 0.24
245 0.31
246 0.31
247 0.36
248 0.41
249 0.43
250 0.46
251 0.45
252 0.46
253 0.41
254 0.39
255 0.34
256 0.26
257 0.22
258 0.2
259 0.17
260 0.14
261 0.12
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.11
275 0.1
276 0.12
277 0.14
278 0.16
279 0.17
280 0.17
281 0.19
282 0.17
283 0.21
284 0.21
285 0.2
286 0.19
287 0.17
288 0.17
289 0.16
290 0.14
291 0.13
292 0.12
293 0.11
294 0.11
295 0.13
296 0.14
297 0.14
298 0.15
299 0.13
300 0.14
301 0.15
302 0.15
303 0.16
304 0.17
305 0.21
306 0.24
307 0.25
308 0.24
309 0.23
310 0.23
311 0.21
312 0.19
313 0.14
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.07
322 0.07
323 0.08
324 0.09
325 0.11
326 0.14
327 0.16
328 0.17
329 0.19
330 0.2
331 0.22
332 0.21
333 0.24
334 0.24
335 0.23
336 0.22
337 0.22
338 0.21
339 0.19
340 0.18
341 0.13
342 0.1
343 0.09
344 0.1
345 0.11
346 0.13
347 0.13
348 0.14
349 0.16
350 0.18
351 0.21
352 0.25
353 0.25
354 0.27
355 0.28
356 0.29
357 0.26
358 0.24
359 0.22
360 0.16
361 0.15
362 0.12
363 0.17
364 0.17
365 0.18
366 0.18
367 0.17
368 0.2
369 0.21
370 0.24
371 0.22
372 0.23
373 0.25
374 0.27
375 0.29
376 0.28
377 0.25
378 0.23
379 0.19
380 0.18
381 0.14
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.16
386 0.19
387 0.22
388 0.24
389 0.28
390 0.31
391 0.36
392 0.39
393 0.42
394 0.47
395 0.48
396 0.52
397 0.54
398 0.58
399 0.58
400 0.6
401 0.56
402 0.55
403 0.5
404 0.45
405 0.43
406 0.35
407 0.37
408 0.41
409 0.45
410 0.44
411 0.48
412 0.54
413 0.58
414 0.65
415 0.63
416 0.63
417 0.67
418 0.67
419 0.74
420 0.73
421 0.74
422 0.73
423 0.78
424 0.79
425 0.74
426 0.72
427 0.67
428 0.66
429 0.59
430 0.56
431 0.48
432 0.44
433 0.41
434 0.4
435 0.38
436 0.33
437 0.33
438 0.32
439 0.3
440 0.25
441 0.23
442 0.22
443 0.2
444 0.19
445 0.17
446 0.15
447 0.15
448 0.19
449 0.19
450 0.18
451 0.17
452 0.19
453 0.2
454 0.21
455 0.22
456 0.18
457 0.19
458 0.25
459 0.29
460 0.27
461 0.27
462 0.3
463 0.31
464 0.36
465 0.4
466 0.43
467 0.49
468 0.59
469 0.68
470 0.75
471 0.82
472 0.84
473 0.9
474 0.91
475 0.9
476 0.9
477 0.88
478 0.87
479 0.85
480 0.8
481 0.7
482 0.61
483 0.59
484 0.49
485 0.43
486 0.34
487 0.28
488 0.25