Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SGM1

Protein Details
Accession A0A5C2SGM1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-50AERVKERDKEKTKKVVEDRSSKNBasic
107-129LFRGMKLTKREKRELERKKELLRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-124KREKRELERK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR002464  DNA/RNA_helicase_DEAH_CS  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00690  DEAH_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
CDD cd18791  SF2_C_RHA  
Amino Acid Sequences MNVELPEDEETRKERERLEDLRERDAFAERVKERDKEKTKKVVEDRSSKNSGAAAEAAERRRLADDTEARSRAMPNLREHSRQEYLTKREMQQIELLKREIADDEALFRGMKLTKREKRELERKKELLRLVEERLKINDKWEGYQLPEDYFTEQGKIDKKKKENVLYKRYEEAKPKDDQFTTDVDQWEAAQTKHSTFKTGAMDKPELVEDYEYVFDESQTIKFVMESTLGGEGNLSAADKLLQQQIDEAEQRGEHYHSLPIYQYREQLLEAIKEHQVLIVVAETGSGKTTQLPQYLHEAGYTANGLKVGCTQPRRVAAMSVAARVAEEMGTKVGYEVGYSIRFEDCTSDKTVLKYMTDGMLLREFLTEPDLAGYSALIIDEAHERTLSTDILFALVKDIARFRPELRLLISSATMDAEKFSEYFDDAPVFYVPGRRYPVDIHYTPQPEANYLHAAITTIFQIHTTQPKGDILVFFTGQDEIEAAQENLQETARALGNKIKELIGARKVVLATNIAETSITIDGVVFVIDPGFVKQNSYNPRTGMSSLVVVPVSLDITDHP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.41
3 0.48
4 0.51
5 0.57
6 0.6
7 0.58
8 0.63
9 0.59
10 0.53
11 0.46
12 0.45
13 0.38
14 0.33
15 0.39
16 0.31
17 0.38
18 0.41
19 0.45
20 0.45
21 0.53
22 0.6
23 0.61
24 0.69
25 0.72
26 0.73
27 0.78
28 0.82
29 0.82
30 0.81
31 0.81
32 0.79
33 0.76
34 0.75
35 0.65
36 0.57
37 0.49
38 0.4
39 0.33
40 0.26
41 0.19
42 0.2
43 0.25
44 0.26
45 0.26
46 0.26
47 0.25
48 0.26
49 0.26
50 0.23
51 0.27
52 0.32
53 0.36
54 0.44
55 0.44
56 0.42
57 0.42
58 0.41
59 0.39
60 0.4
61 0.39
62 0.38
63 0.46
64 0.5
65 0.54
66 0.57
67 0.57
68 0.54
69 0.51
70 0.5
71 0.5
72 0.51
73 0.53
74 0.55
75 0.51
76 0.55
77 0.53
78 0.49
79 0.47
80 0.49
81 0.46
82 0.44
83 0.42
84 0.34
85 0.33
86 0.31
87 0.25
88 0.18
89 0.15
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.13
95 0.12
96 0.14
97 0.15
98 0.2
99 0.26
100 0.36
101 0.42
102 0.51
103 0.59
104 0.64
105 0.72
106 0.78
107 0.81
108 0.8
109 0.83
110 0.81
111 0.79
112 0.77
113 0.7
114 0.65
115 0.6
116 0.54
117 0.51
118 0.5
119 0.46
120 0.41
121 0.42
122 0.41
123 0.35
124 0.34
125 0.33
126 0.28
127 0.28
128 0.3
129 0.27
130 0.25
131 0.3
132 0.28
133 0.23
134 0.23
135 0.22
136 0.2
137 0.2
138 0.18
139 0.15
140 0.15
141 0.18
142 0.23
143 0.32
144 0.38
145 0.44
146 0.5
147 0.56
148 0.65
149 0.71
150 0.73
151 0.75
152 0.77
153 0.75
154 0.73
155 0.71
156 0.67
157 0.62
158 0.61
159 0.57
160 0.52
161 0.5
162 0.5
163 0.49
164 0.45
165 0.42
166 0.35
167 0.33
168 0.31
169 0.29
170 0.26
171 0.21
172 0.21
173 0.19
174 0.19
175 0.16
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.16
180 0.22
181 0.22
182 0.23
183 0.22
184 0.27
185 0.3
186 0.33
187 0.34
188 0.32
189 0.33
190 0.31
191 0.31
192 0.26
193 0.2
194 0.16
195 0.14
196 0.09
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.06
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.1
232 0.1
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.09
242 0.09
243 0.11
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.13
248 0.16
249 0.17
250 0.18
251 0.17
252 0.17
253 0.17
254 0.18
255 0.16
256 0.13
257 0.13
258 0.13
259 0.13
260 0.12
261 0.12
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.05
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.09
277 0.12
278 0.16
279 0.16
280 0.17
281 0.22
282 0.24
283 0.23
284 0.19
285 0.16
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.07
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.09
295 0.11
296 0.15
297 0.18
298 0.19
299 0.23
300 0.26
301 0.28
302 0.25
303 0.24
304 0.2
305 0.24
306 0.23
307 0.19
308 0.16
309 0.14
310 0.13
311 0.12
312 0.12
313 0.05
314 0.05
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.12
332 0.12
333 0.13
334 0.16
335 0.17
336 0.18
337 0.19
338 0.23
339 0.2
340 0.19
341 0.17
342 0.16
343 0.14
344 0.14
345 0.13
346 0.11
347 0.12
348 0.11
349 0.11
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.1
354 0.09
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.04
365 0.03
366 0.04
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.11
374 0.1
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.11
386 0.11
387 0.13
388 0.15
389 0.15
390 0.22
391 0.24
392 0.26
393 0.26
394 0.27
395 0.25
396 0.25
397 0.24
398 0.16
399 0.14
400 0.13
401 0.1
402 0.08
403 0.08
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.09
410 0.09
411 0.1
412 0.11
413 0.1
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.15
419 0.15
420 0.19
421 0.24
422 0.23
423 0.25
424 0.27
425 0.33
426 0.35
427 0.35
428 0.33
429 0.36
430 0.38
431 0.37
432 0.37
433 0.32
434 0.26
435 0.27
436 0.27
437 0.22
438 0.19
439 0.19
440 0.15
441 0.15
442 0.13
443 0.13
444 0.1
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.1
449 0.13
450 0.2
451 0.21
452 0.22
453 0.23
454 0.24
455 0.25
456 0.26
457 0.23
458 0.19
459 0.2
460 0.19
461 0.17
462 0.17
463 0.16
464 0.13
465 0.12
466 0.1
467 0.07
468 0.07
469 0.09
470 0.08
471 0.09
472 0.11
473 0.11
474 0.12
475 0.12
476 0.11
477 0.1
478 0.12
479 0.14
480 0.14
481 0.15
482 0.19
483 0.22
484 0.24
485 0.26
486 0.23
487 0.23
488 0.27
489 0.32
490 0.33
491 0.32
492 0.29
493 0.31
494 0.31
495 0.29
496 0.27
497 0.22
498 0.17
499 0.18
500 0.18
501 0.15
502 0.15
503 0.13
504 0.15
505 0.13
506 0.11
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.05
513 0.04
514 0.05
515 0.05
516 0.06
517 0.07
518 0.12
519 0.12
520 0.15
521 0.18
522 0.27
523 0.36
524 0.4
525 0.42
526 0.4
527 0.43
528 0.43
529 0.41
530 0.36
531 0.29
532 0.27
533 0.23
534 0.25
535 0.21
536 0.17
537 0.16
538 0.14
539 0.12
540 0.09