Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SWL8

Protein Details
Accession A0A5C2SWL8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
340-365HDTSDEQRPPKRRKLNVKQAKKAMSGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-146RGRGYSRGRARGQGRGRGVSGGAAGKAASK
348-360PPKRRKLNVKQAK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.5, cyto 7.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007529  Znf_HIT  
Pfam View protein in Pfam  
PF04438  zf-HIT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51083  ZF_HIT  
Amino Acid Sequences MNGADTLDVPHAESSKAAAQRQSPICVICQTNAAIYTCPRCNLRTCSLPCSTKHKTLGNGCSGIRNKAAYVPMNQYGYTTLMNDYTFLEEVGRKVGDWGREIVQGGYTAGQGPTAGRGRGYSRGRARGQGRGRGVSGGAAGKAASKREVLKMQLDFRDIEIELLPNGMERRMLNQSTWDFKNRTALLTIEFKFHPPRNLLAPTEPPDPPFTLLAHRVTLETPLLSAIQAHVTERSKSKKDKTLPEWVQTLALPDKDVPDSFTPPLCVMSTPLDPLAALNSNPHVFQPGRLIRNGYYKLDSSQPLGEVLKHKHFVEFPSIEIWEEDAFQGTIVDDQGTVVHDTSDEQRPPKRRKLNVKQAKKAMSGLLGGYGSDEDESPTEERNVLGLLGEYAASEDEEEADGQEANADGAQDEDAWGDEDAEGETDDEYEGSPEELATMLQKLREAGALRDPRMDSALGGYNVADEEQVDWGDSGDEDGGGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.2
3 0.25
4 0.27
5 0.29
6 0.32
7 0.41
8 0.45
9 0.46
10 0.41
11 0.38
12 0.37
13 0.38
14 0.36
15 0.28
16 0.27
17 0.24
18 0.23
19 0.25
20 0.23
21 0.2
22 0.22
23 0.27
24 0.27
25 0.3
26 0.3
27 0.31
28 0.36
29 0.42
30 0.45
31 0.48
32 0.5
33 0.53
34 0.58
35 0.6
36 0.57
37 0.59
38 0.59
39 0.58
40 0.6
41 0.58
42 0.59
43 0.63
44 0.67
45 0.64
46 0.61
47 0.53
48 0.55
49 0.52
50 0.47
51 0.41
52 0.34
53 0.28
54 0.29
55 0.33
56 0.28
57 0.3
58 0.32
59 0.34
60 0.35
61 0.34
62 0.3
63 0.26
64 0.25
65 0.22
66 0.17
67 0.13
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.12
75 0.13
76 0.12
77 0.13
78 0.15
79 0.14
80 0.12
81 0.15
82 0.18
83 0.19
84 0.2
85 0.22
86 0.21
87 0.23
88 0.24
89 0.21
90 0.18
91 0.16
92 0.14
93 0.12
94 0.1
95 0.09
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.12
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.15
105 0.18
106 0.27
107 0.3
108 0.34
109 0.38
110 0.46
111 0.48
112 0.54
113 0.54
114 0.55
115 0.58
116 0.57
117 0.54
118 0.48
119 0.47
120 0.4
121 0.37
122 0.28
123 0.23
124 0.16
125 0.12
126 0.09
127 0.08
128 0.1
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.16
134 0.2
135 0.24
136 0.24
137 0.28
138 0.31
139 0.35
140 0.35
141 0.34
142 0.3
143 0.27
144 0.27
145 0.21
146 0.18
147 0.13
148 0.11
149 0.09
150 0.09
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.11
158 0.16
159 0.17
160 0.17
161 0.22
162 0.24
163 0.28
164 0.3
165 0.32
166 0.28
167 0.28
168 0.35
169 0.31
170 0.29
171 0.25
172 0.23
173 0.21
174 0.26
175 0.26
176 0.21
177 0.2
178 0.21
179 0.26
180 0.27
181 0.28
182 0.24
183 0.25
184 0.27
185 0.3
186 0.3
187 0.27
188 0.29
189 0.29
190 0.3
191 0.28
192 0.24
193 0.24
194 0.23
195 0.22
196 0.18
197 0.15
198 0.15
199 0.17
200 0.18
201 0.16
202 0.15
203 0.15
204 0.14
205 0.14
206 0.11
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.09
218 0.1
219 0.12
220 0.16
221 0.21
222 0.25
223 0.31
224 0.36
225 0.41
226 0.47
227 0.55
228 0.56
229 0.61
230 0.6
231 0.57
232 0.53
233 0.45
234 0.39
235 0.29
236 0.26
237 0.17
238 0.13
239 0.11
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.14
247 0.14
248 0.15
249 0.14
250 0.13
251 0.15
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.12
273 0.2
274 0.24
275 0.26
276 0.27
277 0.29
278 0.27
279 0.35
280 0.37
281 0.3
282 0.26
283 0.25
284 0.25
285 0.27
286 0.26
287 0.21
288 0.19
289 0.17
290 0.17
291 0.16
292 0.17
293 0.18
294 0.22
295 0.24
296 0.26
297 0.25
298 0.26
299 0.27
300 0.27
301 0.3
302 0.26
303 0.22
304 0.22
305 0.22
306 0.2
307 0.18
308 0.17
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.05
319 0.06
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.08
329 0.12
330 0.18
331 0.19
332 0.23
333 0.29
334 0.39
335 0.47
336 0.56
337 0.62
338 0.64
339 0.73
340 0.81
341 0.85
342 0.87
343 0.89
344 0.88
345 0.87
346 0.83
347 0.73
348 0.64
349 0.55
350 0.45
351 0.36
352 0.27
353 0.21
354 0.15
355 0.13
356 0.11
357 0.09
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.09
364 0.1
365 0.11
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.09
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.06
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.07
404 0.07
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.07
410 0.06
411 0.07
412 0.06
413 0.07
414 0.06
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.1
426 0.11
427 0.12
428 0.13
429 0.13
430 0.14
431 0.18
432 0.19
433 0.19
434 0.28
435 0.34
436 0.34
437 0.39
438 0.39
439 0.36
440 0.36
441 0.34
442 0.24
443 0.21
444 0.26
445 0.21
446 0.21
447 0.19
448 0.17
449 0.17
450 0.17
451 0.13
452 0.06
453 0.07
454 0.08
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.09
461 0.09
462 0.08