Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SFP0

Protein Details
Accession A0A5C2SFP0    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MSYHGGHRKRQPRENYDRHEYYEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 9, cyto 7.5, mito 6, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MSYHGGHRKRQPRENYDRHEYYETPDQKLRKNIIHYGEVDPVQELPRLATQIGEHSPANVPIVTEGFRIGVTEQPFKIPYYAALLRLLHDRPAAEGANMSFGRQVLEDFWKGFQAFLDKQAWREIRLCVQFFAHLTVARVVSASSMYELLKSFTAVYSEIVLVSHTRASKAGLCAAEGLVIAGVVIKDDSNLDISEIVNGLRTYVESTHAAKTLVQPITQLHCDKPSLEHAEEWLDCALAALQTLCASDFATTADSVPQPYLELPPVPDAPFDLPNVLVPPDVVELDTLTTESGEDVQVKKEEWPQCYVRLFDDDATPDPTTPAGFILRSNILDIIDIFEVNRKECARLLLEYPKWTLPGTFKARPGAPPSPPAEGKNWDLDNTLIETILGACFVLPESTHKVIYYITLITELAKSSPITIGPAVGKSIRKLYGLLADGLDVEVAHRFAEWFAVHMSNFLFSWPWKEWIPDLALVPQHPKRAFMRRAVEFEIRLSYYDRILRIVPDAMAEPEAQVMPDQAPGPEFEYEEPGNPYHEAAQSVLNLLRGRAKPEDVMTHLETVRNQLSETAEGNVNVDSLLRSITVQSLLSIGSRSFSHFLNAIERYLPLLRNLAAGHISDGGVPHAEARTDIMSAVATVWRRSRHMVLIVFDKLMQYQIVDPTDVVAWTFDHCPAVTSRQPKTTFNAFQWDLLKLALDKANGRVMVQRKKVAVLRREADDTAAVAIAGENMEVDADADLAPAGESPQLTSAIKAFTVLTREQKSALARAMDGFIDYLAAKSSSTKVAEVITEHAWHNRANWEDDAWETWETWGWYRHWGRTYSSYLRNYKTTLEAVASDKVRISNSSDPDPVVELFRRTWNIAVGQDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.87
3 0.87
4 0.82
5 0.78
6 0.72
7 0.63
8 0.57
9 0.57
10 0.53
11 0.48
12 0.5
13 0.49
14 0.51
15 0.58
16 0.59
17 0.56
18 0.59
19 0.61
20 0.61
21 0.62
22 0.58
23 0.53
24 0.52
25 0.45
26 0.39
27 0.32
28 0.27
29 0.23
30 0.22
31 0.18
32 0.15
33 0.17
34 0.18
35 0.18
36 0.17
37 0.17
38 0.21
39 0.23
40 0.24
41 0.21
42 0.22
43 0.24
44 0.23
45 0.24
46 0.18
47 0.16
48 0.14
49 0.17
50 0.16
51 0.14
52 0.13
53 0.12
54 0.11
55 0.12
56 0.12
57 0.15
58 0.17
59 0.23
60 0.23
61 0.26
62 0.27
63 0.27
64 0.28
65 0.23
66 0.2
67 0.23
68 0.25
69 0.23
70 0.26
71 0.25
72 0.26
73 0.31
74 0.3
75 0.25
76 0.24
77 0.22
78 0.2
79 0.24
80 0.23
81 0.18
82 0.19
83 0.16
84 0.22
85 0.22
86 0.2
87 0.17
88 0.16
89 0.17
90 0.15
91 0.16
92 0.12
93 0.18
94 0.2
95 0.2
96 0.2
97 0.23
98 0.22
99 0.22
100 0.19
101 0.21
102 0.2
103 0.24
104 0.31
105 0.28
106 0.29
107 0.38
108 0.38
109 0.34
110 0.36
111 0.34
112 0.36
113 0.42
114 0.41
115 0.34
116 0.34
117 0.33
118 0.31
119 0.31
120 0.25
121 0.19
122 0.19
123 0.2
124 0.2
125 0.17
126 0.16
127 0.12
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.09
150 0.1
151 0.12
152 0.11
153 0.12
154 0.12
155 0.15
156 0.19
157 0.2
158 0.24
159 0.21
160 0.2
161 0.2
162 0.2
163 0.18
164 0.13
165 0.11
166 0.06
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.03
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.13
193 0.13
194 0.16
195 0.18
196 0.19
197 0.19
198 0.18
199 0.21
200 0.27
201 0.25
202 0.23
203 0.22
204 0.23
205 0.27
206 0.3
207 0.29
208 0.22
209 0.23
210 0.24
211 0.24
212 0.24
213 0.27
214 0.29
215 0.28
216 0.27
217 0.25
218 0.29
219 0.28
220 0.26
221 0.19
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.1
226 0.05
227 0.06
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.14
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.14
257 0.15
258 0.16
259 0.15
260 0.13
261 0.11
262 0.12
263 0.13
264 0.11
265 0.09
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.12
286 0.12
287 0.14
288 0.21
289 0.26
290 0.26
291 0.3
292 0.3
293 0.35
294 0.36
295 0.35
296 0.28
297 0.27
298 0.25
299 0.21
300 0.21
301 0.17
302 0.17
303 0.19
304 0.18
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.12
309 0.1
310 0.1
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.12
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.07
324 0.07
325 0.06
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.14
330 0.13
331 0.14
332 0.15
333 0.18
334 0.16
335 0.17
336 0.2
337 0.24
338 0.26
339 0.26
340 0.27
341 0.25
342 0.24
343 0.22
344 0.2
345 0.15
346 0.22
347 0.27
348 0.29
349 0.31
350 0.33
351 0.34
352 0.35
353 0.39
354 0.35
355 0.3
356 0.31
357 0.31
358 0.32
359 0.33
360 0.32
361 0.28
362 0.27
363 0.27
364 0.27
365 0.25
366 0.21
367 0.21
368 0.19
369 0.17
370 0.15
371 0.13
372 0.08
373 0.07
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.05
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.06
385 0.11
386 0.13
387 0.13
388 0.13
389 0.14
390 0.14
391 0.14
392 0.13
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.1
413 0.1
414 0.1
415 0.13
416 0.13
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.16
421 0.16
422 0.15
423 0.12
424 0.11
425 0.11
426 0.1
427 0.09
428 0.04
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.04
435 0.04
436 0.06
437 0.05
438 0.06
439 0.07
440 0.08
441 0.08
442 0.09
443 0.09
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.05
449 0.1
450 0.1
451 0.13
452 0.13
453 0.14
454 0.14
455 0.16
456 0.18
457 0.15
458 0.14
459 0.13
460 0.14
461 0.13
462 0.18
463 0.18
464 0.22
465 0.2
466 0.23
467 0.25
468 0.34
469 0.38
470 0.4
471 0.45
472 0.42
473 0.46
474 0.47
475 0.45
476 0.36
477 0.32
478 0.27
479 0.2
480 0.18
481 0.17
482 0.13
483 0.13
484 0.15
485 0.15
486 0.14
487 0.14
488 0.14
489 0.13
490 0.13
491 0.11
492 0.09
493 0.1
494 0.09
495 0.09
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.06
501 0.05
502 0.06
503 0.05
504 0.07
505 0.07
506 0.06
507 0.07
508 0.07
509 0.09
510 0.09
511 0.1
512 0.09
513 0.13
514 0.13
515 0.14
516 0.15
517 0.13
518 0.14
519 0.14
520 0.14
521 0.12
522 0.12
523 0.12
524 0.11
525 0.12
526 0.11
527 0.12
528 0.12
529 0.13
530 0.12
531 0.11
532 0.17
533 0.16
534 0.2
535 0.21
536 0.21
537 0.2
538 0.22
539 0.25
540 0.2
541 0.25
542 0.22
543 0.23
544 0.22
545 0.22
546 0.2
547 0.21
548 0.2
549 0.15
550 0.14
551 0.13
552 0.14
553 0.15
554 0.15
555 0.14
556 0.13
557 0.13
558 0.13
559 0.11
560 0.1
561 0.08
562 0.07
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.05
569 0.07
570 0.07
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.07
575 0.08
576 0.08
577 0.07
578 0.07
579 0.07
580 0.1
581 0.11
582 0.11
583 0.12
584 0.13
585 0.14
586 0.18
587 0.19
588 0.17
589 0.16
590 0.16
591 0.17
592 0.18
593 0.17
594 0.13
595 0.14
596 0.13
597 0.15
598 0.15
599 0.13
600 0.12
601 0.12
602 0.11
603 0.1
604 0.1
605 0.08
606 0.09
607 0.08
608 0.07
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.07
613 0.06
614 0.08
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.07
619 0.07
620 0.07
621 0.08
622 0.08
623 0.09
624 0.11
625 0.15
626 0.17
627 0.19
628 0.23
629 0.25
630 0.27
631 0.32
632 0.34
633 0.32
634 0.35
635 0.34
636 0.31
637 0.28
638 0.24
639 0.17
640 0.15
641 0.12
642 0.08
643 0.09
644 0.12
645 0.13
646 0.13
647 0.13
648 0.13
649 0.13
650 0.12
651 0.11
652 0.07
653 0.07
654 0.08
655 0.1
656 0.1
657 0.1
658 0.1
659 0.12
660 0.13
661 0.19
662 0.23
663 0.29
664 0.32
665 0.39
666 0.42
667 0.43
668 0.47
669 0.5
670 0.49
671 0.45
672 0.5
673 0.42
674 0.43
675 0.43
676 0.37
677 0.29
678 0.24
679 0.22
680 0.14
681 0.16
682 0.15
683 0.15
684 0.15
685 0.17
686 0.22
687 0.21
688 0.21
689 0.24
690 0.3
691 0.38
692 0.42
693 0.44
694 0.41
695 0.46
696 0.5
697 0.53
698 0.51
699 0.51
700 0.49
701 0.48
702 0.5
703 0.45
704 0.41
705 0.33
706 0.27
707 0.19
708 0.15
709 0.11
710 0.07
711 0.07
712 0.06
713 0.05
714 0.04
715 0.04
716 0.03
717 0.04
718 0.04
719 0.04
720 0.04
721 0.04
722 0.04
723 0.04
724 0.04
725 0.04
726 0.05
727 0.04
728 0.05
729 0.06
730 0.06
731 0.07
732 0.09
733 0.11
734 0.11
735 0.12
736 0.13
737 0.13
738 0.13
739 0.13
740 0.13
741 0.12
742 0.17
743 0.2
744 0.26
745 0.28
746 0.3
747 0.3
748 0.33
749 0.34
750 0.34
751 0.35
752 0.28
753 0.25
754 0.25
755 0.25
756 0.21
757 0.19
758 0.14
759 0.1
760 0.09
761 0.09
762 0.08
763 0.08
764 0.08
765 0.08
766 0.1
767 0.12
768 0.16
769 0.18
770 0.18
771 0.18
772 0.19
773 0.21
774 0.2
775 0.21
776 0.19
777 0.2
778 0.2
779 0.23
780 0.23
781 0.22
782 0.23
783 0.26
784 0.27
785 0.29
786 0.29
787 0.27
788 0.27
789 0.28
790 0.28
791 0.24
792 0.21
793 0.18
794 0.16
795 0.18
796 0.18
797 0.2
798 0.22
799 0.21
800 0.3
801 0.34
802 0.4
803 0.43
804 0.44
805 0.46
806 0.49
807 0.56
808 0.54
809 0.58
810 0.6
811 0.62
812 0.63
813 0.62
814 0.57
815 0.52
816 0.48
817 0.41
818 0.35
819 0.3
820 0.28
821 0.28
822 0.32
823 0.29
824 0.26
825 0.25
826 0.25
827 0.25
828 0.24
829 0.27
830 0.29
831 0.33
832 0.37
833 0.38
834 0.36
835 0.36
836 0.37
837 0.31
838 0.28
839 0.26
840 0.24
841 0.25
842 0.31
843 0.33
844 0.32
845 0.33
846 0.32
847 0.33