Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SSC6

Protein Details
Accession A0A5C2SSC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1067-1087DSDRPKKASAKSKGKANGKASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1069-1094DRPKKASAKSKGKANGKASGKANGRR
Subcellular Location(s) cyto 14, nucl 10.5, mito_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029149  Creatin/AminoP/Spt16_NTD  
IPR036005  Creatinase/aminopeptidase-like  
IPR029148  FACT-Spt16_Nlobe  
IPR013953  FACT_Spt16  
IPR000994  Pept_M24  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR013719  RTT106/SPT16-like_middle_dom  
IPR040258  Spt16  
Gene Ontology GO:0035101  C:FACT complex  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF14826  FACT-Spt16_Nlob  
PF00557  Peptidase_M24  
PF08512  Rtt106  
PF08644  SPT16  
Amino Acid Sequences MSGIKLNAELFSKRLGSVYNAWNNTQQDHDYTSIADVDALILLAGDPAAEDEPIRKGTAFQTWLLGFEFPSTFLLFEKQRLSILCSASKAKILSQLKNAESPVPIELFVQAKAKEPPTDALPRFVQAYTAHDRAATLTKESPSGKLIDEWNRAVGEAEKKPTLVDMSAAVASFLAVKDEEELKCIRTAANLTSTLLAHYVAPKLETILDREAKISHEAFAGQIEARIGYGEGDKAKGPDMKVWSKGRGLNDVDWGSTEFCYQPIIQSQSTSSGYDISPSAESTPDDISHKGVLLVAVGMRYKSYCANLGRSFIVDPSKEQEAIYSLLVSLQSEMLSLLKDGAAAKDLYQHALSFVREKKPELESHFSKNIGHGMGMEFRDSSYILSSKNGRKLRSGMVFNLVLGFTGLEEGGKKYALQLIDTVLVGSDKATCLTFGVKSVKDTMFFLNQDEGEGQSSKAPKKLPTAKAGANGNASPAKNKTAGGKVLRNKTRSAAQEDLAQSMAAKIAEHQRELHGKLHQEGLARFSEGGGGTGGKEGKGWKRFQSYKGEAALPREVENLRIFVDKKSQTVVLPIHGYAVPFHINTIKNVSKSEEGDLTLLRVNFQTPGQLAGKKEDTPFEDPDATFIRSITYRSSDASRFEHIMKQITELKKEVNKREQQKKEMADVIEQDTLIEIKGRRPTKLPEVFVRPALDGKRLPGEVEIHQNGLRYQSPMGSQKIDILFSNVKHLFFQPCDHELLVIIHIHLKAPIMIGKKKAHDVQFYREASDVQFDETGNRKRKYRYGDEDELELEQQERKRRQMLNKEFKLFSEKIAEAATGSVRFYTALVSNELTYVTAQTGDPLEPDIPFRELSFEGVPFRTNVRLQPTTECLVHLSDPPFLVVTLADIEIASLERVQFGLKQFDMVLIFKDFSKTPLHINSIPSAQLDDVKNWLDSVDIPLSEGPVNLNWGPIMKTINEDPYDFFQQGGWSFLGGAAGGEESEGDDDSEEESEFEAESDASEPSESSEGGSDYYDGSDASEDEGSGSDFGSDDSEGADWDELERKAAKDDKKRTETGRGHDSGDDSDRPKKASAKSKGKANGKASGKANGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.22
4 0.28
5 0.36
6 0.41
7 0.42
8 0.43
9 0.48
10 0.48
11 0.45
12 0.42
13 0.35
14 0.29
15 0.3
16 0.3
17 0.25
18 0.24
19 0.23
20 0.2
21 0.18
22 0.15
23 0.11
24 0.09
25 0.08
26 0.07
27 0.05
28 0.04
29 0.04
30 0.04
31 0.04
32 0.03
33 0.03
34 0.05
35 0.05
36 0.06
37 0.06
38 0.08
39 0.12
40 0.14
41 0.16
42 0.14
43 0.16
44 0.19
45 0.27
46 0.28
47 0.25
48 0.29
49 0.28
50 0.3
51 0.29
52 0.26
53 0.18
54 0.18
55 0.17
56 0.13
57 0.14
58 0.13
59 0.12
60 0.13
61 0.18
62 0.17
63 0.21
64 0.23
65 0.23
66 0.25
67 0.26
68 0.31
69 0.31
70 0.33
71 0.32
72 0.33
73 0.35
74 0.34
75 0.36
76 0.32
77 0.28
78 0.33
79 0.36
80 0.39
81 0.43
82 0.49
83 0.47
84 0.5
85 0.5
86 0.43
87 0.38
88 0.34
89 0.28
90 0.22
91 0.2
92 0.16
93 0.18
94 0.16
95 0.17
96 0.2
97 0.18
98 0.21
99 0.25
100 0.28
101 0.28
102 0.3
103 0.31
104 0.32
105 0.41
106 0.39
107 0.39
108 0.38
109 0.36
110 0.36
111 0.33
112 0.29
113 0.21
114 0.26
115 0.27
116 0.27
117 0.26
118 0.24
119 0.24
120 0.24
121 0.29
122 0.24
123 0.21
124 0.23
125 0.24
126 0.29
127 0.3
128 0.29
129 0.25
130 0.26
131 0.24
132 0.23
133 0.29
134 0.33
135 0.37
136 0.36
137 0.36
138 0.34
139 0.33
140 0.3
141 0.28
142 0.27
143 0.27
144 0.3
145 0.29
146 0.28
147 0.28
148 0.29
149 0.26
150 0.19
151 0.15
152 0.12
153 0.13
154 0.14
155 0.13
156 0.12
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.09
165 0.14
166 0.14
167 0.16
168 0.17
169 0.17
170 0.19
171 0.19
172 0.17
173 0.15
174 0.18
175 0.18
176 0.22
177 0.21
178 0.21
179 0.22
180 0.22
181 0.19
182 0.17
183 0.14
184 0.1
185 0.11
186 0.12
187 0.11
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.15
192 0.15
193 0.17
194 0.22
195 0.24
196 0.24
197 0.25
198 0.25
199 0.24
200 0.27
201 0.23
202 0.17
203 0.15
204 0.15
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.09
209 0.09
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.09
218 0.1
219 0.11
220 0.12
221 0.12
222 0.16
223 0.18
224 0.18
225 0.21
226 0.28
227 0.31
228 0.38
229 0.42
230 0.42
231 0.43
232 0.46
233 0.44
234 0.44
235 0.42
236 0.36
237 0.39
238 0.36
239 0.31
240 0.28
241 0.26
242 0.2
243 0.17
244 0.16
245 0.1
246 0.1
247 0.12
248 0.11
249 0.12
250 0.16
251 0.21
252 0.2
253 0.2
254 0.21
255 0.24
256 0.25
257 0.24
258 0.18
259 0.16
260 0.15
261 0.16
262 0.15
263 0.12
264 0.11
265 0.11
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.13
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.13
278 0.12
279 0.1
280 0.08
281 0.08
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.07
288 0.08
289 0.1
290 0.11
291 0.16
292 0.19
293 0.26
294 0.27
295 0.3
296 0.29
297 0.28
298 0.27
299 0.23
300 0.24
301 0.17
302 0.17
303 0.18
304 0.2
305 0.19
306 0.18
307 0.17
308 0.15
309 0.16
310 0.15
311 0.12
312 0.09
313 0.09
314 0.1
315 0.09
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.13
333 0.14
334 0.15
335 0.15
336 0.14
337 0.14
338 0.16
339 0.17
340 0.17
341 0.22
342 0.26
343 0.27
344 0.29
345 0.31
346 0.33
347 0.38
348 0.39
349 0.42
350 0.39
351 0.44
352 0.45
353 0.42
354 0.38
355 0.34
356 0.3
357 0.22
358 0.19
359 0.13
360 0.12
361 0.15
362 0.15
363 0.14
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.11
368 0.1
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.12
373 0.18
374 0.23
375 0.31
376 0.35
377 0.35
378 0.37
379 0.4
380 0.44
381 0.45
382 0.42
383 0.35
384 0.35
385 0.34
386 0.3
387 0.27
388 0.2
389 0.13
390 0.1
391 0.08
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.03
396 0.04
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.11
409 0.1
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.06
420 0.07
421 0.07
422 0.1
423 0.15
424 0.14
425 0.15
426 0.2
427 0.2
428 0.19
429 0.2
430 0.19
431 0.19
432 0.19
433 0.19
434 0.16
435 0.15
436 0.15
437 0.14
438 0.12
439 0.1
440 0.1
441 0.09
442 0.1
443 0.14
444 0.15
445 0.18
446 0.2
447 0.21
448 0.29
449 0.39
450 0.41
451 0.42
452 0.46
453 0.44
454 0.47
455 0.46
456 0.39
457 0.31
458 0.27
459 0.23
460 0.22
461 0.2
462 0.17
463 0.16
464 0.17
465 0.16
466 0.17
467 0.18
468 0.19
469 0.24
470 0.27
471 0.32
472 0.36
473 0.44
474 0.49
475 0.47
476 0.44
477 0.41
478 0.43
479 0.39
480 0.4
481 0.33
482 0.29
483 0.32
484 0.32
485 0.3
486 0.24
487 0.21
488 0.14
489 0.11
490 0.11
491 0.06
492 0.05
493 0.06
494 0.13
495 0.14
496 0.15
497 0.15
498 0.17
499 0.21
500 0.24
501 0.26
502 0.21
503 0.21
504 0.22
505 0.24
506 0.22
507 0.21
508 0.19
509 0.18
510 0.16
511 0.15
512 0.13
513 0.11
514 0.11
515 0.08
516 0.08
517 0.06
518 0.05
519 0.05
520 0.07
521 0.07
522 0.06
523 0.06
524 0.09
525 0.15
526 0.2
527 0.22
528 0.25
529 0.33
530 0.37
531 0.41
532 0.47
533 0.45
534 0.44
535 0.44
536 0.43
537 0.36
538 0.35
539 0.33
540 0.24
541 0.2
542 0.18
543 0.16
544 0.15
545 0.15
546 0.13
547 0.11
548 0.13
549 0.13
550 0.12
551 0.19
552 0.18
553 0.18
554 0.19
555 0.19
556 0.17
557 0.2
558 0.2
559 0.15
560 0.15
561 0.14
562 0.14
563 0.13
564 0.13
565 0.09
566 0.1
567 0.09
568 0.08
569 0.09
570 0.12
571 0.12
572 0.13
573 0.19
574 0.2
575 0.2
576 0.2
577 0.22
578 0.2
579 0.21
580 0.22
581 0.16
582 0.15
583 0.14
584 0.14
585 0.12
586 0.12
587 0.11
588 0.1
589 0.08
590 0.08
591 0.09
592 0.09
593 0.09
594 0.07
595 0.11
596 0.12
597 0.15
598 0.15
599 0.17
600 0.19
601 0.19
602 0.2
603 0.19
604 0.21
605 0.23
606 0.24
607 0.23
608 0.23
609 0.21
610 0.23
611 0.23
612 0.2
613 0.16
614 0.14
615 0.13
616 0.12
617 0.13
618 0.12
619 0.12
620 0.12
621 0.14
622 0.17
623 0.17
624 0.2
625 0.21
626 0.22
627 0.21
628 0.22
629 0.24
630 0.22
631 0.25
632 0.22
633 0.23
634 0.27
635 0.27
636 0.28
637 0.25
638 0.28
639 0.29
640 0.35
641 0.39
642 0.42
643 0.48
644 0.55
645 0.65
646 0.68
647 0.69
648 0.7
649 0.65
650 0.6
651 0.57
652 0.48
653 0.39
654 0.34
655 0.3
656 0.23
657 0.2
658 0.16
659 0.11
660 0.11
661 0.09
662 0.1
663 0.07
664 0.11
665 0.18
666 0.2
667 0.21
668 0.25
669 0.29
670 0.37
671 0.43
672 0.43
673 0.41
674 0.47
675 0.48
676 0.47
677 0.44
678 0.34
679 0.3
680 0.28
681 0.27
682 0.19
683 0.19
684 0.2
685 0.19
686 0.19
687 0.17
688 0.19
689 0.17
690 0.24
691 0.23
692 0.21
693 0.21
694 0.22
695 0.2
696 0.2
697 0.19
698 0.13
699 0.13
700 0.13
701 0.16
702 0.2
703 0.22
704 0.21
705 0.2
706 0.23
707 0.23
708 0.22
709 0.19
710 0.19
711 0.19
712 0.18
713 0.25
714 0.22
715 0.22
716 0.22
717 0.24
718 0.23
719 0.21
720 0.24
721 0.21
722 0.22
723 0.24
724 0.22
725 0.2
726 0.18
727 0.17
728 0.15
729 0.11
730 0.1
731 0.1
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.09
736 0.08
737 0.08
738 0.12
739 0.14
740 0.17
741 0.23
742 0.27
743 0.29
744 0.33
745 0.38
746 0.39
747 0.43
748 0.44
749 0.45
750 0.51
751 0.49
752 0.46
753 0.4
754 0.36
755 0.28
756 0.28
757 0.21
758 0.13
759 0.14
760 0.12
761 0.15
762 0.22
763 0.3
764 0.35
765 0.37
766 0.4
767 0.44
768 0.5
769 0.55
770 0.58
771 0.59
772 0.6
773 0.65
774 0.62
775 0.59
776 0.54
777 0.46
778 0.36
779 0.26
780 0.18
781 0.14
782 0.17
783 0.24
784 0.27
785 0.3
786 0.37
787 0.44
788 0.53
789 0.6
790 0.68
791 0.71
792 0.74
793 0.76
794 0.69
795 0.63
796 0.61
797 0.5
798 0.41
799 0.36
800 0.28
801 0.24
802 0.24
803 0.23
804 0.15
805 0.16
806 0.15
807 0.09
808 0.09
809 0.08
810 0.08
811 0.08
812 0.08
813 0.09
814 0.1
815 0.11
816 0.13
817 0.14
818 0.14
819 0.14
820 0.14
821 0.12
822 0.09
823 0.09
824 0.07
825 0.07
826 0.07
827 0.08
828 0.09
829 0.09
830 0.09
831 0.1
832 0.11
833 0.1
834 0.12
835 0.13
836 0.13
837 0.13
838 0.13
839 0.14
840 0.14
841 0.17
842 0.17
843 0.17
844 0.17
845 0.18
846 0.18
847 0.16
848 0.18
849 0.19
850 0.19
851 0.21
852 0.27
853 0.3
854 0.31
855 0.35
856 0.37
857 0.36
858 0.35
859 0.32
860 0.25
861 0.23
862 0.23
863 0.23
864 0.2
865 0.18
866 0.18
867 0.18
868 0.17
869 0.15
870 0.14
871 0.09
872 0.08
873 0.07
874 0.07
875 0.07
876 0.06
877 0.06
878 0.06
879 0.07
880 0.06
881 0.05
882 0.05
883 0.06
884 0.06
885 0.07
886 0.1
887 0.12
888 0.17
889 0.17
890 0.18
891 0.18
892 0.2
893 0.21
894 0.18
895 0.18
896 0.14
897 0.15
898 0.14
899 0.16
900 0.14
901 0.15
902 0.19
903 0.18
904 0.22
905 0.27
906 0.33
907 0.34
908 0.36
909 0.37
910 0.35
911 0.34
912 0.29
913 0.24
914 0.19
915 0.21
916 0.2
917 0.18
918 0.19
919 0.2
920 0.2
921 0.18
922 0.18
923 0.13
924 0.12
925 0.16
926 0.15
927 0.13
928 0.14
929 0.14
930 0.16
931 0.16
932 0.15
933 0.12
934 0.1
935 0.14
936 0.13
937 0.14
938 0.12
939 0.13
940 0.15
941 0.15
942 0.17
943 0.13
944 0.16
945 0.18
946 0.25
947 0.25
948 0.25
949 0.26
950 0.29
951 0.33
952 0.3
953 0.27
954 0.22
955 0.23
956 0.22
957 0.22
958 0.17
959 0.12
960 0.12
961 0.12
962 0.12
963 0.09
964 0.08
965 0.05
966 0.05
967 0.05
968 0.04
969 0.04
970 0.04
971 0.05
972 0.06
973 0.05
974 0.05
975 0.06
976 0.07
977 0.08
978 0.08
979 0.07
980 0.08
981 0.08
982 0.08
983 0.08
984 0.07
985 0.06
986 0.07
987 0.08
988 0.08
989 0.08
990 0.08
991 0.08
992 0.09
993 0.11
994 0.1
995 0.1
996 0.11
997 0.11
998 0.12
999 0.13
1000 0.11
1001 0.1
1002 0.11
1003 0.1
1004 0.08
1005 0.08
1006 0.09
1007 0.08
1008 0.1
1009 0.1
1010 0.09
1011 0.09
1012 0.1
1013 0.1
1014 0.09
1015 0.09
1016 0.07
1017 0.07
1018 0.07
1019 0.08
1020 0.08
1021 0.07
1022 0.08
1023 0.08
1024 0.08
1025 0.09
1026 0.09
1027 0.07
1028 0.09
1029 0.15
1030 0.14
1031 0.17
1032 0.19
1033 0.19
1034 0.25
1035 0.33
1036 0.4
1037 0.45
1038 0.56
1039 0.64
1040 0.68
1041 0.74
1042 0.73
1043 0.76
1044 0.75
1045 0.72
1046 0.72
1047 0.63
1048 0.59
1049 0.55
1050 0.51
1051 0.45
1052 0.42
1053 0.39
1054 0.33
1055 0.38
1056 0.39
1057 0.39
1058 0.41
1059 0.44
1060 0.48
1061 0.53
1062 0.6
1063 0.64
1064 0.68
1065 0.75
1066 0.8
1067 0.81
1068 0.82
1069 0.76
1070 0.75
1071 0.69
1072 0.71
1073 0.64
1074 0.64