Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SSM2

Protein Details
Accession A0A5C2SSM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
379-407ITPTSTSRSAKRKRVPPKRVHSKLVETEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
388-397AKRKRVPPKR
433-437KRRRR
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 8, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
IPR012904  OGG_N  
Gene Ontology GO:0140078  F:class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0008534  F:oxidized purine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
PF07934  OGG_N  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MATAIPTGFRALPLPLAQLSLTAVLKCGQSFRWNIYPLQPPEQCLLDANVPTHEYRLCLRDRVVCLRQSMDALFYRAVFPPTVSGDPQVREAETLAWIRDYFQLDIDLVDLYRQWSLADPGFDRVRDRFEGIRMLRQDPFENLISFICSSNNNIARITKMVKSLCLTYSPPLLTLPPPAGSGLTEEAYHPFPSPSALAGSEVTARLRTLGFGYRADFIQKTAAMLVDAHGATVNPQTNLEPSEEWLRTLRNMSTSDARTELLKLMGVGRKVADCILLMSLDKREVIPVDTHVHQIAVKHYGLRGTAKAGTMSPKLYEEVNTKLAAVWGEYAGWAHSVLFTADLKSFASYGLPSPSTPSTPLTPALTPGSISSEESPGVITPTSTSRSAKRKRVPPKRVHSKLVETEETLAQLETAIEGTLSTDGDSSLADRVKRRRRGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.17
3 0.18
4 0.17
5 0.16
6 0.16
7 0.16
8 0.16
9 0.13
10 0.14
11 0.14
12 0.16
13 0.16
14 0.17
15 0.16
16 0.22
17 0.25
18 0.31
19 0.37
20 0.38
21 0.4
22 0.44
23 0.51
24 0.49
25 0.55
26 0.5
27 0.45
28 0.45
29 0.44
30 0.38
31 0.3
32 0.28
33 0.24
34 0.24
35 0.22
36 0.22
37 0.22
38 0.22
39 0.22
40 0.19
41 0.17
42 0.18
43 0.23
44 0.24
45 0.26
46 0.29
47 0.34
48 0.39
49 0.46
50 0.48
51 0.46
52 0.45
53 0.43
54 0.42
55 0.36
56 0.31
57 0.26
58 0.23
59 0.22
60 0.2
61 0.18
62 0.19
63 0.19
64 0.2
65 0.16
66 0.14
67 0.15
68 0.18
69 0.2
70 0.18
71 0.2
72 0.23
73 0.23
74 0.27
75 0.25
76 0.21
77 0.2
78 0.2
79 0.17
80 0.17
81 0.17
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.15
86 0.18
87 0.2
88 0.17
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.14
94 0.1
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.1
104 0.12
105 0.15
106 0.15
107 0.19
108 0.21
109 0.21
110 0.22
111 0.21
112 0.23
113 0.23
114 0.25
115 0.22
116 0.23
117 0.31
118 0.3
119 0.35
120 0.33
121 0.34
122 0.34
123 0.34
124 0.33
125 0.26
126 0.29
127 0.24
128 0.21
129 0.19
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.11
135 0.1
136 0.11
137 0.18
138 0.21
139 0.21
140 0.21
141 0.21
142 0.21
143 0.23
144 0.24
145 0.19
146 0.21
147 0.21
148 0.22
149 0.23
150 0.24
151 0.22
152 0.22
153 0.21
154 0.17
155 0.2
156 0.18
157 0.17
158 0.15
159 0.16
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.08
173 0.1
174 0.11
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.1
197 0.11
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.13
202 0.15
203 0.13
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.09
220 0.1
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.11
226 0.12
227 0.09
228 0.1
229 0.15
230 0.15
231 0.15
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.17
236 0.16
237 0.14
238 0.15
239 0.17
240 0.21
241 0.22
242 0.22
243 0.21
244 0.21
245 0.18
246 0.17
247 0.16
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.11
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.09
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.1
273 0.1
274 0.12
275 0.16
276 0.16
277 0.18
278 0.17
279 0.17
280 0.16
281 0.16
282 0.15
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.14
287 0.15
288 0.16
289 0.17
290 0.16
291 0.15
292 0.17
293 0.16
294 0.17
295 0.16
296 0.19
297 0.19
298 0.19
299 0.17
300 0.16
301 0.16
302 0.16
303 0.18
304 0.17
305 0.2
306 0.21
307 0.2
308 0.19
309 0.18
310 0.19
311 0.16
312 0.13
313 0.1
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.09
334 0.1
335 0.09
336 0.1
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.18
341 0.2
342 0.2
343 0.21
344 0.23
345 0.21
346 0.22
347 0.25
348 0.24
349 0.22
350 0.24
351 0.24
352 0.21
353 0.19
354 0.17
355 0.19
356 0.16
357 0.18
358 0.17
359 0.16
360 0.16
361 0.16
362 0.16
363 0.12
364 0.13
365 0.11
366 0.09
367 0.09
368 0.13
369 0.16
370 0.19
371 0.21
372 0.28
373 0.38
374 0.48
375 0.56
376 0.62
377 0.69
378 0.77
379 0.86
380 0.89
381 0.89
382 0.91
383 0.92
384 0.9
385 0.88
386 0.85
387 0.83
388 0.8
389 0.77
390 0.69
391 0.59
392 0.54
393 0.47
394 0.4
395 0.32
396 0.23
397 0.15
398 0.12
399 0.11
400 0.08
401 0.07
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.08
413 0.08
414 0.12
415 0.16
416 0.19
417 0.26
418 0.37
419 0.47