FuNGI

A0A5C2RRU9

Protein Details

Accession

A0A5C2RRU9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1057-1081	ETAPARKNAKSKQPRWKKEQMTSVV	Hydrophilic
1267-1293	AEAEEEEKPKPKKRKTKGKVTLKAADV	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1065-1071	AKSKQPR
1274-1287	KPKPKKRKTKGKVT

Subcellular Location(s)

mito 25.5, cyto_mito 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR024075 DNA-dir_RNA_pol_helix_hairp_sf IPR046950 DNA-dir_Rpol_C_phage-type IPR002092 DNA-dir_Rpol_phage-type IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR037159 RNA_POL_N_sf IPR029262 RPOL_N IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00940 RNA_pol PF14700 RPOL_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS00900 RNA_POL_PHAGE_1 PS00489 RNA_POL_PHAGE_2

Amino Acid Sequences

MIPLTRRNAARAVSYSRQSLPRPARLYSTPTKKLLAQESVSSSGTSQEFPPYMAQPSASGSRPLAVAEDMHDFLHRRSPYTILPTPLPDDVATPTTDYFFADSPTQDAVAIMDACLHGLQDVPRAKEMFERVRVARQGDPILDSRVYNLMLEAYLEMATNREEINRANWLEDAWSLYYDMEHGTDSVDPTANTYAIMLQAWLRFNPESKNPVIIGGAQVLDPVALLRNIIGRQIAPSLVVADRAFTTDEEANAAIKALSRAAVEMGLSRVVTELGMAESLGRQAVDPLEDVPEVVPVVKAKTPEVEVIHQEDGTVSELRPQGPVPDGEVPFNLETLRRHLSQVVLARRVLSEEVALRQKLLEQSVYNVAVERMKHQADMLEKVGLPSKGLQSNNLRAWMWEWHQKLVNRIQAELENLVVEERVIAKMRQSSNRHRKTEDVALSPFLKLLSAEKLSLITIMEIMHLHNAGGVNDGMKTARALLSVGRAVEAEYKAEMCKKNKISMPVPTTAPARPGDKSIFTSTGYRDLYARRVAARKYMEDSEEWTSEWTQLVRVKVGSFLVDCLMDVATVQRSTQDPRTGEKITEEQPAFFHQYEYLRGHKLGVIKFNPAVAERMSRDSVVETLHPRHLPMLVKPKPWLSYNNGGYLFNRSWAMRFKESREQEVYLRHASDAGRLELVFAGLDVLGSTPWQINRRVFDVVLQVWNSGERFNKIPPAVPDEPEPERPPNMEFDNKAKTIYIERQKAWQQAKAANHSDRCSVNYKVEIARAFLGDTIYFPHNVDFRGRAYPIPPHLSHIGDDLSRGLLLFGEKKPLGVRGLRWLKIHLANLYGYDKASFDERVQFVHDHLEEIKDSAEHPLDGKRWWTKADDPWQCLATCMELKDALSLADPESYECSLPVHQDGTCNGLQHYAALGGDAVGAAQVNLAAADRPSDVYTYVANMVEKSIQDDLESGNKYAQVLAGKISRKVVKQTVMTTVYGVTFIGARDQIERQLKDRGDIPPEMCWLGASYLAKKVLASIGDLFQGAKDIQNWLNLCARLIAKAIPEERLVHSFTETAPARKNAKSKQPRWKKEQMTSVVWTTPLGLPIVQPYRAVKRKQVMTSMQTVFISDPNSPSIVNSQKQASAFPPNFIHSLDATHMMLTALECRAQGITFASVHDSYWTHPSDIDQMSAIIRDTFIALHSSNVLKSLFEEFKERYADYKVPLVAIRGQFAKSLGLSPEKLGMSTQDAQLLINSEVEEGEQSEQSEEEAAAADEEEDIEFGAEAEEEEKPKPKKRKTKGKVTLKAADVEKRLAGKFVNLVDLFPELPEKGKFDVNLIKESQYFFS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.47
3	0.47
4	0.51
5	0.48
6	0.53
7	0.54
8	0.57
9	0.57
10	0.55
11	0.56
12	0.54
13	0.59
14	0.59
15	0.6
16	0.58
17	0.57
18	0.57
19	0.55
20	0.58
21	0.58
22	0.55
23	0.47
24	0.45
25	0.47
26	0.47
27	0.44
28	0.37
29	0.3
30	0.27
31	0.26
32	0.22
33	0.19
34	0.21
35	0.21
36	0.22
37	0.25
38	0.23
39	0.25
40	0.25
41	0.24
42	0.19
43	0.23
44	0.26
45	0.24
46	0.24
47	0.21
48	0.22
49	0.22
50	0.21
51	0.18
52	0.15
53	0.14
54	0.13
55	0.17
56	0.16
57	0.16
58	0.18
59	0.18
60	0.18
61	0.26
62	0.25
63	0.24
64	0.25
65	0.29
66	0.32
67	0.4
68	0.43
69	0.39
70	0.41
71	0.41
72	0.42
73	0.39
74	0.35
75	0.26
76	0.23
77	0.22
78	0.21
79	0.19
80	0.17
81	0.17
82	0.16
83	0.16
84	0.15
85	0.14
86	0.13
87	0.15
88	0.15
89	0.15
90	0.16
91	0.17
92	0.17
93	0.15
94	0.14
95	0.12
96	0.13
97	0.12
98	0.1
99	0.1
100	0.09
101	0.1
102	0.09
103	0.09
104	0.06
105	0.08
106	0.09
107	0.16
108	0.21
109	0.23
110	0.27
111	0.28
112	0.29
113	0.32
114	0.39
115	0.4
116	0.41
117	0.44
118	0.43
119	0.5
120	0.53
121	0.51
122	0.47
123	0.44
124	0.41
125	0.37
126	0.38
127	0.32
128	0.32
129	0.3
130	0.25
131	0.22
132	0.22
133	0.21
134	0.17
135	0.15
136	0.12
137	0.11
138	0.11
139	0.09
140	0.08
141	0.07
142	0.07
143	0.07
144	0.07
145	0.08
146	0.09
147	0.09
148	0.09
149	0.11
150	0.12
151	0.16
152	0.22
153	0.22
154	0.22
155	0.22
156	0.21
157	0.21
158	0.2
159	0.19
160	0.13
161	0.13
162	0.12
163	0.12
164	0.12
165	0.11
166	0.11
167	0.09
168	0.08
169	0.07
170	0.08
171	0.09
172	0.1
173	0.12
174	0.12
175	0.11
176	0.13
177	0.15
178	0.14
179	0.13
180	0.12
181	0.11
182	0.1
183	0.1
184	0.08
185	0.09
186	0.13
187	0.14
188	0.14
189	0.17
190	0.17
191	0.2
192	0.24
193	0.28
194	0.3
195	0.3
196	0.33
197	0.3
198	0.3
199	0.29
200	0.24
201	0.19
202	0.16
203	0.15
204	0.11
205	0.11
206	0.09
207	0.08
208	0.07
209	0.06
210	0.05
211	0.05
212	0.05
213	0.06
214	0.1
215	0.1
216	0.12
217	0.12
218	0.11
219	0.13
220	0.14
221	0.14
222	0.11
223	0.11
224	0.12
225	0.11
226	0.13
227	0.12
228	0.11
229	0.11
230	0.12
231	0.13
232	0.11
233	0.14
234	0.13
235	0.14
236	0.14
237	0.14
238	0.13
239	0.12
240	0.13
241	0.09
242	0.08
243	0.09
244	0.07
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.09
250	0.08
251	0.09
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.06
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.05
264	0.05
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.09
279	0.09
280	0.08
281	0.08
282	0.08
283	0.07
284	0.1
285	0.11
286	0.12
287	0.13
288	0.15
289	0.17
290	0.2
291	0.23
292	0.23
293	0.24
294	0.27
295	0.28
296	0.25
297	0.23
298	0.18
299	0.16
300	0.16
301	0.14
302	0.1
303	0.14
304	0.16
305	0.17
306	0.18
307	0.17
308	0.16
309	0.18
310	0.18
311	0.17
312	0.22
313	0.22
314	0.22
315	0.22
316	0.23
317	0.21
318	0.2
319	0.17
320	0.12
321	0.13
322	0.17
323	0.21
324	0.19
325	0.2
326	0.21
327	0.22
328	0.25
329	0.32
330	0.33
331	0.31
332	0.31
333	0.3
334	0.29
335	0.29
336	0.24
337	0.17
338	0.12
339	0.11
340	0.15
341	0.19
342	0.19
343	0.17
344	0.17
345	0.19
346	0.2
347	0.2
348	0.18
349	0.14
350	0.17
351	0.21
352	0.21
353	0.19
354	0.17
355	0.16
356	0.16
357	0.16
358	0.15
359	0.17
360	0.16
361	0.17
362	0.16
363	0.19
364	0.19
365	0.23
366	0.22
367	0.19
368	0.18
369	0.19
370	0.22
371	0.18
372	0.16
373	0.15
374	0.18
375	0.22
376	0.22
377	0.27
378	0.3
379	0.37
380	0.38
381	0.39
382	0.35
383	0.29
384	0.31
385	0.3
386	0.27
387	0.28
388	0.27
389	0.28
390	0.33
391	0.34
392	0.38
393	0.4
394	0.42
395	0.35
396	0.34
397	0.32
398	0.28
399	0.28
400	0.23
401	0.16
402	0.11
403	0.1
404	0.1
405	0.08
406	0.06
407	0.05
408	0.05
409	0.06
410	0.08
411	0.08
412	0.1
413	0.17
414	0.22
415	0.3
416	0.36
417	0.46
418	0.56
419	0.65
420	0.67
421	0.63
422	0.62
423	0.59
424	0.61
425	0.55
426	0.48
427	0.4
428	0.38
429	0.37
430	0.33
431	0.28
432	0.18
433	0.13
434	0.09
435	0.1
436	0.11
437	0.12
438	0.12
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.12
443	0.11
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.06
453	0.06
454	0.07
455	0.06
456	0.08
457	0.07
458	0.07
459	0.07
460	0.07
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.07
469	0.1
470	0.11
471	0.11
472	0.1
473	0.09
474	0.09
475	0.13
476	0.12
477	0.1
478	0.09
479	0.1
480	0.1
481	0.16
482	0.21
483	0.2
484	0.28
485	0.3
486	0.36
487	0.38
488	0.44
489	0.43
490	0.46
491	0.48
492	0.42
493	0.4
494	0.36
495	0.35
496	0.29
497	0.28
498	0.22
499	0.2
500	0.18
501	0.2
502	0.2
503	0.2
504	0.23
505	0.23
506	0.22
507	0.21
508	0.23
509	0.21
510	0.25
511	0.24
512	0.21
513	0.19
514	0.19
515	0.21
516	0.22
517	0.22
518	0.19
519	0.23
520	0.23
521	0.28
522	0.29
523	0.27
524	0.29
525	0.29
526	0.27
527	0.23
528	0.26
529	0.22
530	0.2
531	0.19
532	0.16
533	0.15
534	0.14
535	0.14
536	0.11
537	0.1
538	0.13
539	0.13
540	0.13
541	0.14
542	0.13
543	0.14
544	0.14
545	0.12
546	0.09
547	0.08
548	0.08
549	0.07
550	0.07
551	0.06
552	0.06
553	0.05
554	0.05
555	0.05
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.07
560	0.08
561	0.12
562	0.16
563	0.21
564	0.21
565	0.23
566	0.29
567	0.28
568	0.27
569	0.26
570	0.26
571	0.22
572	0.28
573	0.25
574	0.2
575	0.2
576	0.22
577	0.23
578	0.2
579	0.18
580	0.14
581	0.15
582	0.18
583	0.2
584	0.2
585	0.18
586	0.18
587	0.18
588	0.18
589	0.22
590	0.2
591	0.24
592	0.22
593	0.23
594	0.23
595	0.23
596	0.21
597	0.17
598	0.16
599	0.11
600	0.13
601	0.12
602	0.15
603	0.15
604	0.14
605	0.14
606	0.13
607	0.13
608	0.11
609	0.12
610	0.12
611	0.13
612	0.17
613	0.16
614	0.16
615	0.16
616	0.18
617	0.17
618	0.19
619	0.28
620	0.28
621	0.3
622	0.31
623	0.33
624	0.32
625	0.33
626	0.32
627	0.26
628	0.32
629	0.32
630	0.35
631	0.34
632	0.32
633	0.3
634	0.31
635	0.25
636	0.18
637	0.17
638	0.12
639	0.13
640	0.18
641	0.22
642	0.23
643	0.25
644	0.28
645	0.36
646	0.38
647	0.41
648	0.38
649	0.35
650	0.32
651	0.34
652	0.32
653	0.25
654	0.24
655	0.19
656	0.18
657	0.16
658	0.18
659	0.16
660	0.13
661	0.12
662	0.11
663	0.12
664	0.1
665	0.1
666	0.06
667	0.04
668	0.04
669	0.03
670	0.03
671	0.02
672	0.03
673	0.02
674	0.03
675	0.03
676	0.04
677	0.06
678	0.09
679	0.13
680	0.15
681	0.17
682	0.19
683	0.2
684	0.19
685	0.19
686	0.19
687	0.17
688	0.17
689	0.15
690	0.13
691	0.11
692	0.12
693	0.11
694	0.09
695	0.09
696	0.09
697	0.1
698	0.11
699	0.16
700	0.16
701	0.18
702	0.18
703	0.26
704	0.25
705	0.25
706	0.26
707	0.25
708	0.28
709	0.28
710	0.29
711	0.23
712	0.22
713	0.22
714	0.21
715	0.2
716	0.2
717	0.2
718	0.19
719	0.22
720	0.26
721	0.25
722	0.25
723	0.22
724	0.2
725	0.21
726	0.27
727	0.31
728	0.31
729	0.31
730	0.36
731	0.4
732	0.47
733	0.45
734	0.4
735	0.36
736	0.36
737	0.39
738	0.4
739	0.41
740	0.38
741	0.38
742	0.36
743	0.36
744	0.31
745	0.3
746	0.28
747	0.25
748	0.23
749	0.21
750	0.22
751	0.2
752	0.23
753	0.2
754	0.17
755	0.16
756	0.14
757	0.13
758	0.11
759	0.11
760	0.07
761	0.07
762	0.09
763	0.09
764	0.09
765	0.09
766	0.1
767	0.11
768	0.12
769	0.13
770	0.12
771	0.13
772	0.16
773	0.16
774	0.16
775	0.16
776	0.2
777	0.22
778	0.26
779	0.24
780	0.25
781	0.26
782	0.26
783	0.25
784	0.22
785	0.19
786	0.13
787	0.13
788	0.11
789	0.08
790	0.07
791	0.07
792	0.05
793	0.04
794	0.05
795	0.09
796	0.09
797	0.13
798	0.13
799	0.14
800	0.15
801	0.17
802	0.19
803	0.17
804	0.18
805	0.24
806	0.3
807	0.32
808	0.33
809	0.32
810	0.33
811	0.35
812	0.36
813	0.26
814	0.22
815	0.19
816	0.2
817	0.2
818	0.16
819	0.13
820	0.11
821	0.1
822	0.09
823	0.11
824	0.1
825	0.09
826	0.15
827	0.15
828	0.16
829	0.18
830	0.18
831	0.17
832	0.2
833	0.19
834	0.15
835	0.15
836	0.15
837	0.13
838	0.13
839	0.13
840	0.08
841	0.08
842	0.09
843	0.1
844	0.08
845	0.09
846	0.12
847	0.14
848	0.14
849	0.19
850	0.21
851	0.22
852	0.23
853	0.26
854	0.28
855	0.34
856	0.44
857	0.45
858	0.45
859	0.45
860	0.45
861	0.41
862	0.37
863	0.29
864	0.22
865	0.17
866	0.14
867	0.13
868	0.12
869	0.12
870	0.12
871	0.11
872	0.08
873	0.07
874	0.08
875	0.07
876	0.08
877	0.08
878	0.08
879	0.1
880	0.1
881	0.1
882	0.09
883	0.1
884	0.1
885	0.11
886	0.12
887	0.11
888	0.11
889	0.13
890	0.13
891	0.17
892	0.17
893	0.16
894	0.15
895	0.15
896	0.14
897	0.12
898	0.12
899	0.08
900	0.07
901	0.06
902	0.06
903	0.05
904	0.05
905	0.04
906	0.03
907	0.03
908	0.03
909	0.02
910	0.02
911	0.02
912	0.02
913	0.02
914	0.03
915	0.03
916	0.03
917	0.05
918	0.05
919	0.07
920	0.07
921	0.08
922	0.08
923	0.09
924	0.09
925	0.1
926	0.11
927	0.11
928	0.1
929	0.1
930	0.1
931	0.11
932	0.11
933	0.12
934	0.11
935	0.1
936	0.1
937	0.11
938	0.11
939	0.16
940	0.17
941	0.15
942	0.15
943	0.15
944	0.15
945	0.15
946	0.16
947	0.11
948	0.1
949	0.13
950	0.17
951	0.18
952	0.19
953	0.24
954	0.26
955	0.26
956	0.32
957	0.34
958	0.35
959	0.37
960	0.38
961	0.4
962	0.39
963	0.37
964	0.32
965	0.27
966	0.22
967	0.18
968	0.15
969	0.08
970	0.06
971	0.06
972	0.08
973	0.08
974	0.08
975	0.1
976	0.11
977	0.18
978	0.25
979	0.26
980	0.27
981	0.34
982	0.33
983	0.33
984	0.36
985	0.33
986	0.31
987	0.33
988	0.32
989	0.27
990	0.28
991	0.27
992	0.22
993	0.18
994	0.14
995	0.12
996	0.13
997	0.12
998	0.12
999	0.16
1000	0.17
1001	0.16
1002	0.15
1003	0.16
1004	0.15
1005	0.14
1006	0.14
1007	0.13
1008	0.13
1009	0.13
1010	0.14
1011	0.12
1012	0.1
1013	0.11
1014	0.09
1015	0.09
1016	0.09
1017	0.12
1018	0.13
1019	0.19
1020	0.2
1021	0.2
1022	0.25
1023	0.24
1024	0.24
1025	0.23
1026	0.22
1027	0.18
1028	0.19
1029	0.18
1030	0.14
1031	0.19
1032	0.2
1033	0.19
1034	0.2
1035	0.21
1036	0.23
1037	0.24
1038	0.24
1039	0.19
1040	0.19
1041	0.18
1042	0.16
1043	0.22
1044	0.21
1045	0.22
1046	0.25
1047	0.3
1048	0.34
1049	0.38
1050	0.45
1051	0.44
1052	0.54
1053	0.62
1054	0.67
1055	0.72
1056	0.79
1057	0.84
1058	0.85
1059	0.88
1060	0.86
1061	0.83
1062	0.83
1063	0.79
1064	0.73
1065	0.68
1066	0.61
1067	0.52
1068	0.43
1069	0.35
1070	0.27
1071	0.22
1072	0.17
1073	0.14
1074	0.11
1075	0.11
1076	0.17
1077	0.2
1078	0.18
1079	0.19
1080	0.22
1081	0.31
1082	0.38
1083	0.42
1084	0.43
1085	0.48
1086	0.55
1087	0.58
1088	0.62
1089	0.59
1090	0.56
1091	0.61
1092	0.55
1093	0.48
1094	0.4
1095	0.37
1096	0.3
1097	0.25
1098	0.23
1099	0.15
1100	0.15
1101	0.14
1102	0.15
1103	0.14
1104	0.15
1105	0.2
1106	0.25
1107	0.26
1108	0.27
1109	0.28
1110	0.3
1111	0.31
1112	0.32
1113	0.28
1114	0.31
1115	0.31
1116	0.32
1117	0.32
1118	0.31
1119	0.32
1120	0.3
1121	0.29
1122	0.19
1123	0.2
1124	0.18
1125	0.19
1126	0.16
1127	0.15
1128	0.15
1129	0.12
1130	0.12
1131	0.1
1132	0.11
1133	0.09
1134	0.1
1135	0.1
1136	0.1
1137	0.11
1138	0.1
1139	0.11
1140	0.1
1141	0.12
1142	0.12
1143	0.13
1144	0.16
1145	0.15
1146	0.15
1147	0.17
1148	0.16
1149	0.15
1150	0.2
1151	0.22
1152	0.19
1153	0.19
1154	0.21
1155	0.26
1156	0.26
1157	0.25
1158	0.19
1159	0.18
1160	0.18
1161	0.18
1162	0.17
1163	0.1
1164	0.09
1165	0.08
1166	0.08
1167	0.08
1168	0.08
1169	0.11
1170	0.1
1171	0.11
1172	0.13
1173	0.15
1174	0.14
1175	0.16
1176	0.16
1177	0.13
1178	0.14
1179	0.2
1180	0.2
1181	0.2
1182	0.25
1183	0.25
1184	0.29
1185	0.33
1186	0.31
1187	0.27
1188	0.3
1189	0.32
1190	0.3
1191	0.34
1192	0.3
1193	0.28
1194	0.29
1195	0.29
1196	0.3
1197	0.28
1198	0.28
1199	0.25
1200	0.25
1201	0.24
1202	0.24
1203	0.24
1204	0.18
1205	0.19
1206	0.19
1207	0.21
1208	0.22
1209	0.22
1210	0.26
1211	0.24
1212	0.24
1213	0.21
1214	0.2
1215	0.22
1216	0.24
1217	0.24
1218	0.22
1219	0.21
1220	0.21
1221	0.22
1222	0.23
1223	0.17
1224	0.15
1225	0.14
1226	0.11
1227	0.11
1228	0.11
1229	0.11
1230	0.09
1231	0.11
1232	0.11
1233	0.11
1234	0.12
1235	0.12
1236	0.12
1237	0.12
1238	0.1
1239	0.09
1240	0.08
1241	0.08
1242	0.07
1243	0.07
1244	0.07
1245	0.06
1246	0.07
1247	0.06
1248	0.05
1249	0.05
1250	0.05
1251	0.05
1252	0.05
1253	0.05
1254	0.05
1255	0.05
1256	0.07
1257	0.09
1258	0.11
1259	0.14
1260	0.22
1261	0.28
1262	0.38
1263	0.48
1264	0.57
1265	0.66
1266	0.75
1267	0.84
1268	0.86
1269	0.91
1270	0.93
1271	0.94
1272	0.93
1273	0.9
1274	0.87
1275	0.79
1276	0.76
1277	0.69
1278	0.65
1279	0.57
1280	0.5
1281	0.44
1282	0.4
1283	0.38
1284	0.33
1285	0.3
1286	0.26
1287	0.27
1288	0.26
1289	0.31
1290	0.26
1291	0.26
1292	0.25
1293	0.26
1294	0.23
1295	0.18
1296	0.19
1297	0.12
1298	0.15
1299	0.17
1300	0.19
1301	0.2
1302	0.24
1303	0.24
1304	0.27
1305	0.35
1306	0.35
1307	0.38
1308	0.37
1309	0.37
1310	0.36

A0A5C2RRU9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer