Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5C2SD43

Protein Details
Accession A0A5C2SD43    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-27AVSEKPAKLAKKKSQDLKADAPHydrophilic
43-67TTPTEPSSSKPKKAKKSEDAVKKVAHydrophilic
161-183SEESVDKSKKKRKDVPSSVKAPEHydrophilic
263-284DETVKRKLEKAKRKPTDDRGVIBasic
306-327GTVTRLRLSRNKKTGKPKHYGFHydrophilic
397-421TAKAEARLLKRQEQRKRKLEEAGIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-34PAKLAKKKSQDLKADAPAKAKKTK
51-111SKPKKAKKSEDAVKKVAEPAQADAKKGKKKESAVSVEQPKAEEKAEVVGEKKRKRKAAGAA
118-202QPAKEVKKRRASVVEPAPGVEEKKVEESGDKKKKRKSVAVEDKSEESVDKSKKKRKDVPSSVKAPEPVKETAAAPAKEKKSKAKA
268-276RKLEKAKRK
401-414EARLLKRQEQRKRK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAKATAVSEKPAKLAKKKSQDLKADAPAKAKKTKAVEDVPAATTPTEPSSSKPKKAKKSEDAVKKVAEPAQADAKKGKKKESAVSVEQPKAEEKAEVVGEKKRKRKAAGAAVEETNAQPAKEVKKRRASVVEPAPGVEEKKVEESGDKKKKRKSVAVEDKSEESVDKSKKKRKDVPSSVKAPEPVKETAAAPAKEKKSKAKAAPEPEPEPEVEAEEAADAEVDADAEDFYGFESDDDDSSDEEMAEDIPGIDIGKLPTVAKDDETVKRKLEKAKRKPTDDRGVIYLGRIPHGFYEDQMRAYFSQFGTVTRLRLSRNKKTGKPKHYGFIEFDSSSVAQIVAETMDNYLLMGHILTCKVIPKDQVHPELWVGASRKWRPVPRDRVARVAHNKPRTEDETAKAEARLLKRQEQRKRKLEEAGIKYDFEAVAYKKKPKATEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.6
3 0.65
4 0.73
5 0.79
6 0.82
7 0.83
8 0.82
9 0.79
10 0.79
11 0.75
12 0.68
13 0.67
14 0.63
15 0.61
16 0.6
17 0.55
18 0.52
19 0.53
20 0.57
21 0.58
22 0.58
23 0.57
24 0.55
25 0.56
26 0.51
27 0.45
28 0.38
29 0.3
30 0.24
31 0.21
32 0.18
33 0.18
34 0.16
35 0.18
36 0.29
37 0.36
38 0.45
39 0.53
40 0.6
41 0.67
42 0.77
43 0.85
44 0.83
45 0.86
46 0.87
47 0.88
48 0.86
49 0.8
50 0.71
51 0.62
52 0.57
53 0.5
54 0.44
55 0.34
56 0.3
57 0.36
58 0.35
59 0.35
60 0.37
61 0.42
62 0.45
63 0.48
64 0.52
65 0.49
66 0.54
67 0.6
68 0.63
69 0.63
70 0.62
71 0.68
72 0.67
73 0.62
74 0.57
75 0.51
76 0.43
77 0.37
78 0.3
79 0.22
80 0.15
81 0.16
82 0.17
83 0.17
84 0.18
85 0.23
86 0.31
87 0.39
88 0.46
89 0.5
90 0.54
91 0.57
92 0.63
93 0.66
94 0.68
95 0.68
96 0.66
97 0.62
98 0.56
99 0.52
100 0.44
101 0.34
102 0.27
103 0.19
104 0.13
105 0.11
106 0.14
107 0.22
108 0.29
109 0.36
110 0.42
111 0.52
112 0.54
113 0.59
114 0.63
115 0.58
116 0.6
117 0.61
118 0.58
119 0.47
120 0.45
121 0.41
122 0.34
123 0.31
124 0.23
125 0.15
126 0.11
127 0.13
128 0.14
129 0.12
130 0.15
131 0.2
132 0.3
133 0.39
134 0.46
135 0.51
136 0.57
137 0.64
138 0.68
139 0.71
140 0.7
141 0.71
142 0.74
143 0.75
144 0.73
145 0.68
146 0.62
147 0.54
148 0.45
149 0.33
150 0.24
151 0.24
152 0.25
153 0.31
154 0.38
155 0.45
156 0.53
157 0.62
158 0.69
159 0.72
160 0.78
161 0.81
162 0.83
163 0.83
164 0.82
165 0.74
166 0.67
167 0.6
168 0.5
169 0.41
170 0.35
171 0.28
172 0.22
173 0.21
174 0.19
175 0.21
176 0.26
177 0.24
178 0.22
179 0.28
180 0.31
181 0.35
182 0.37
183 0.39
184 0.4
185 0.47
186 0.51
187 0.54
188 0.57
189 0.59
190 0.64
191 0.61
192 0.56
193 0.49
194 0.44
195 0.34
196 0.29
197 0.22
198 0.16
199 0.11
200 0.08
201 0.07
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.02
207 0.02
208 0.02
209 0.02
210 0.02
211 0.02
212 0.02
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.09
246 0.1
247 0.09
248 0.12
249 0.16
250 0.22
251 0.26
252 0.28
253 0.27
254 0.31
255 0.34
256 0.41
257 0.47
258 0.52
259 0.59
260 0.68
261 0.74
262 0.78
263 0.82
264 0.82
265 0.82
266 0.75
267 0.66
268 0.58
269 0.52
270 0.44
271 0.36
272 0.29
273 0.19
274 0.17
275 0.15
276 0.12
277 0.11
278 0.14
279 0.13
280 0.11
281 0.17
282 0.17
283 0.18
284 0.18
285 0.19
286 0.17
287 0.19
288 0.21
289 0.14
290 0.18
291 0.16
292 0.17
293 0.21
294 0.22
295 0.22
296 0.21
297 0.24
298 0.23
299 0.31
300 0.39
301 0.43
302 0.52
303 0.6
304 0.65
305 0.74
306 0.81
307 0.81
308 0.82
309 0.75
310 0.74
311 0.71
312 0.67
313 0.59
314 0.54
315 0.5
316 0.4
317 0.36
318 0.31
319 0.25
320 0.21
321 0.18
322 0.12
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.12
343 0.14
344 0.16
345 0.22
346 0.25
347 0.33
348 0.41
349 0.46
350 0.43
351 0.43
352 0.41
353 0.37
354 0.33
355 0.3
356 0.24
357 0.22
358 0.3
359 0.32
360 0.39
361 0.45
362 0.52
363 0.55
364 0.63
365 0.7
366 0.71
367 0.78
368 0.73
369 0.75
370 0.72
371 0.74
372 0.72
373 0.72
374 0.72
375 0.69
376 0.69
377 0.64
378 0.67
379 0.62
380 0.61
381 0.56
382 0.51
383 0.48
384 0.48
385 0.46
386 0.39
387 0.38
388 0.36
389 0.35
390 0.39
391 0.39
392 0.45
393 0.52
394 0.62
395 0.69
396 0.74
397 0.8
398 0.81
399 0.83
400 0.8
401 0.8
402 0.8
403 0.8
404 0.76
405 0.74
406 0.67
407 0.59
408 0.54
409 0.47
410 0.37
411 0.27
412 0.25
413 0.19
414 0.27
415 0.32
416 0.4
417 0.43
418 0.49