FuNGI

A0A5C2SSR0

Protein Details

Accession

A0A5C2SSR0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
84-105	LVNGRRARLFRTKNRPGRGLKE	Hydrophilic
1138-1157	LANCSQHRWRNDRMHRMRMH	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 11, cyto_nucl 9, nucl 5, mito 4, pero 3, plas 1, E.R. 1, golg 1, cysk 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MEIELADVSREATQWDVKRIFGAILHGEGFYDASDPKARPINFKVTLNPGQGVQNNGTGSLILPHRKVGDKLLKWVYEEHHPVLVNGRRARLFRTKNRPGRGLKEQLEKTPYLEPDVEEKREEKLRRLDLGLHVDKLQFGIFYRRPEAPMTAGRIFSNEYQVSHRDKGAGLLWFDYDHKVIRIQLGDRMTEEIGSTVAIKFDNLRKVAIGLDFGNPFVCFELLTPPMLERERFNRTLSGVDWKDQRKFRQRLDSLNEAHAVVAPYAHHLRIVLHTEADIRKFAELCQIADLKRPIWANVEAFDKGFFSPKQLYVFQTWMRQFSWPVAFQLEALVRSGLMHTEDLLVHFRQQIEKLSRSYPADAADILRHFSETLRTRDPKDTNMECFHRVLLEGGYGGKREKSYKSSAKKQKGLYDDAQPKDRDMGKFKCYHVTFTPTRMVLEGPYVSQSNRVIRQFAGYEDHFLRVDFRDEDRLQYRWAREVDGTTLLTERVGGILKKGFELGGRDFYFLAYSSSALREHAVWFMSPFQHPIRGWVTPQSIRDSLGDFTKVIKYPSKYAARLAQAFTATDPSVSITPDQWEKIEDLGTEPYLFTDGVGTISPKLGDMIWEALCNAKEDLKRLQIQPWAYQIRFLGFKGMVGIDPRLEGIKMRLRPSMDKFEALDTDSAEIEIARWFDKPGTCYLNRALVMILEDRGVEKEVFVKLQDRAVTNVVTAIDTIEQTVALLKTHNIGISFGLPWILKGLGAAGMGMCEEKALGSLKDTFLYSLIGYAQNHVLRDMKHSARIPIPDSYLLVGLADEGPAYELEGAENVYTLEKAEIFACIQEEGDEHPTYLKGPVIISRSPVVHPGDVQLVNAIGEPPADKICAFRDLKNVVVLPSVGDRSLASMLSGGDLDGDLYSIIKYHPLLPTEYAAPGDYTPVGTRARPDGQDSTVDDICDFIVEYINSDVLGLLSDRHLMIADQSSDGTNDPRCIELAQLCSQAVDYPKNGIPVDAHDSPRLLIRSKPDWKMAEDNDPRDTDYYLSSRALGDLFRAITINKPKAPAESFPDPEGPQVTQELPKREQPLSDVISTTLKPHVERQLHYFLNDDRNVADMRTVFLRYEQELRYICVTHALSDAPDIRLQEEEVAIGTILANCSQHRWRNDRMHRMRMHASELVRETKHRLYRPVDVLNPEQGELLYGLSQAWLAWDFGMRNKAVFGARSFSLVALGVVLDTLSRLGGLP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.32
3	0.32
4	0.32
5	0.33
6	0.33
7	0.31
8	0.25
9	0.25
10	0.19
11	0.2
12	0.2
13	0.18
14	0.17
15	0.16
16	0.15
17	0.11
18	0.1
19	0.08
20	0.11
21	0.16
22	0.16
23	0.21
24	0.29
25	0.3
26	0.36
27	0.42
28	0.49
29	0.5
30	0.52
31	0.53
32	0.54
33	0.59
34	0.55
35	0.49
36	0.41
37	0.41
38	0.4
39	0.39
40	0.33
41	0.3
42	0.27
43	0.26
44	0.24
45	0.19
46	0.16
47	0.17
48	0.21
49	0.21
50	0.22
51	0.24
52	0.28
53	0.32
54	0.33
55	0.38
56	0.43
57	0.42
58	0.5
59	0.54
60	0.52
61	0.5
62	0.52
63	0.46
64	0.44
65	0.47
66	0.4
67	0.37
68	0.36
69	0.35
70	0.39
71	0.42
72	0.42
73	0.39
74	0.42
75	0.42
76	0.43
77	0.49
78	0.51
79	0.55
80	0.57
81	0.65
82	0.71
83	0.76
84	0.83
85	0.85
86	0.82
87	0.8
88	0.79
89	0.78
90	0.74
91	0.75
92	0.71
93	0.68
94	0.66
95	0.58
96	0.51
97	0.48
98	0.42
99	0.36
100	0.33
101	0.28
102	0.32
103	0.37
104	0.37
105	0.33
106	0.33
107	0.34
108	0.41
109	0.43
110	0.42
111	0.45
112	0.49
113	0.51
114	0.52
115	0.52
116	0.5
117	0.57
118	0.52
119	0.44
120	0.4
121	0.36
122	0.33
123	0.29
124	0.23
125	0.14
126	0.12
127	0.2
128	0.22
129	0.26
130	0.3
131	0.31
132	0.33
133	0.35
134	0.36
135	0.32
136	0.34
137	0.36
138	0.35
139	0.34
140	0.32
141	0.31
142	0.31
143	0.27
144	0.29
145	0.24
146	0.22
147	0.25
148	0.3
149	0.35
150	0.34
151	0.34
152	0.28
153	0.27
154	0.29
155	0.29
156	0.28
157	0.22
158	0.21
159	0.2
160	0.19
161	0.2
162	0.2
163	0.17
164	0.15
165	0.15
166	0.16
167	0.17
168	0.2
169	0.22
170	0.22
171	0.26
172	0.27
173	0.26
174	0.25
175	0.26
176	0.22
177	0.19
178	0.18
179	0.12
180	0.1
181	0.09
182	0.09
183	0.07
184	0.08
185	0.07
186	0.08
187	0.12
188	0.17
189	0.24
190	0.24
191	0.25
192	0.24
193	0.25
194	0.27
195	0.23
196	0.2
197	0.14
198	0.17
199	0.16
200	0.16
201	0.16
202	0.14
203	0.13
204	0.12
205	0.11
206	0.07
207	0.08
208	0.12
209	0.13
210	0.14
211	0.14
212	0.13
213	0.18
214	0.19
215	0.2
216	0.18
217	0.24
218	0.31
219	0.33
220	0.34
221	0.32
222	0.32
223	0.33
224	0.31
225	0.35
226	0.29
227	0.3
228	0.36
229	0.38
230	0.45
231	0.48
232	0.56
233	0.57
234	0.63
235	0.67
236	0.71
237	0.7
238	0.72
239	0.73
240	0.72
241	0.64
242	0.59
243	0.52
244	0.41
245	0.36
246	0.29
247	0.23
248	0.14
249	0.12
250	0.09
251	0.12
252	0.14
253	0.14
254	0.12
255	0.12
256	0.13
257	0.17
258	0.21
259	0.18
260	0.16
261	0.17
262	0.21
263	0.23
264	0.23
265	0.2
266	0.16
267	0.17
268	0.17
269	0.17
270	0.21
271	0.2
272	0.19
273	0.22
274	0.24
275	0.23
276	0.28
277	0.3
278	0.21
279	0.24
280	0.24
281	0.21
282	0.22
283	0.25
284	0.21
285	0.22
286	0.25
287	0.21
288	0.21
289	0.2
290	0.17
291	0.14
292	0.17
293	0.14
294	0.15
295	0.19
296	0.21
297	0.25
298	0.26
299	0.29
300	0.28
301	0.32
302	0.31
303	0.35
304	0.33
305	0.32
306	0.31
307	0.29
308	0.27
309	0.27
310	0.3
311	0.23
312	0.23
313	0.22
314	0.21
315	0.19
316	0.21
317	0.18
318	0.13
319	0.13
320	0.11
321	0.1
322	0.1
323	0.1
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.07
328	0.08
329	0.08
330	0.1
331	0.12
332	0.12
333	0.12
334	0.14
335	0.14
336	0.15
337	0.17
338	0.23
339	0.26
340	0.3
341	0.31
342	0.31
343	0.34
344	0.34
345	0.34
346	0.28
347	0.24
348	0.22
349	0.19
350	0.19
351	0.18
352	0.16
353	0.15
354	0.13
355	0.12
356	0.11
357	0.11
358	0.18
359	0.2
360	0.25
361	0.31
362	0.34
363	0.38
364	0.46
365	0.48
366	0.45
367	0.48
368	0.47
369	0.44
370	0.47
371	0.47
372	0.41
373	0.39
374	0.34
375	0.26
376	0.23
377	0.18
378	0.12
379	0.09
380	0.08
381	0.08
382	0.09
383	0.09
384	0.1
385	0.1
386	0.12
387	0.15
388	0.18
389	0.22
390	0.3
391	0.39
392	0.47
393	0.56
394	0.65
395	0.71
396	0.74
397	0.73
398	0.71
399	0.67
400	0.65
401	0.57
402	0.56
403	0.55
404	0.51
405	0.52
406	0.46
407	0.41
408	0.4
409	0.41
410	0.35
411	0.34
412	0.36
413	0.36
414	0.41
415	0.42
416	0.46
417	0.42
418	0.43
419	0.38
420	0.4
421	0.36
422	0.35
423	0.38
424	0.3
425	0.29
426	0.25
427	0.23
428	0.16
429	0.17
430	0.13
431	0.09
432	0.11
433	0.11
434	0.1
435	0.13
436	0.15
437	0.17
438	0.22
439	0.23
440	0.22
441	0.22
442	0.24
443	0.22
444	0.21
445	0.21
446	0.16
447	0.19
448	0.18
449	0.2
450	0.17
451	0.16
452	0.17
453	0.13
454	0.16
455	0.14
456	0.15
457	0.2
458	0.21
459	0.25
460	0.26
461	0.26
462	0.26
463	0.28
464	0.28
465	0.26
466	0.27
467	0.24
468	0.22
469	0.22
470	0.22
471	0.2
472	0.19
473	0.13
474	0.13
475	0.11
476	0.1
477	0.09
478	0.07
479	0.05
480	0.07
481	0.06
482	0.07
483	0.09
484	0.1
485	0.1
486	0.1
487	0.09
488	0.09
489	0.13
490	0.13
491	0.17
492	0.18
493	0.18
494	0.18
495	0.18
496	0.17
497	0.14
498	0.14
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.08
503	0.09
504	0.08
505	0.09
506	0.08
507	0.09
508	0.1
509	0.1
510	0.08
511	0.09
512	0.1
513	0.12
514	0.11
515	0.13
516	0.12
517	0.17
518	0.17
519	0.2
520	0.21
521	0.21
522	0.21
523	0.23
524	0.26
525	0.24
526	0.26
527	0.26
528	0.24
529	0.24
530	0.24
531	0.21
532	0.18
533	0.16
534	0.15
535	0.11
536	0.12
537	0.14
538	0.14
539	0.14
540	0.18
541	0.18
542	0.21
543	0.29
544	0.33
545	0.3
546	0.32
547	0.36
548	0.35
549	0.35
550	0.33
551	0.26
552	0.21
553	0.21
554	0.18
555	0.15
556	0.11
557	0.09
558	0.08
559	0.07
560	0.07
561	0.08
562	0.08
563	0.06
564	0.08
565	0.1
566	0.1
567	0.09
568	0.1
569	0.1
570	0.1
571	0.1
572	0.09
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.08
577	0.07
578	0.07
579	0.07
580	0.07
581	0.05
582	0.05
583	0.04
584	0.05
585	0.05
586	0.06
587	0.05
588	0.05
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.04
593	0.05
594	0.05
595	0.08
596	0.07
597	0.08
598	0.08
599	0.09
600	0.09
601	0.1
602	0.09
603	0.11
604	0.11
605	0.14
606	0.17
607	0.2
608	0.23
609	0.23
610	0.27
611	0.26
612	0.27
613	0.27
614	0.31
615	0.3
616	0.27
617	0.27
618	0.24
619	0.21
620	0.21
621	0.19
622	0.15
623	0.11
624	0.11
625	0.1
626	0.1
627	0.09
628	0.09
629	0.09
630	0.06
631	0.06
632	0.07
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.09
637	0.14
638	0.18
639	0.2
640	0.22
641	0.24
642	0.28
643	0.33
644	0.38
645	0.33
646	0.31
647	0.29
648	0.28
649	0.27
650	0.23
651	0.19
652	0.11
653	0.1
654	0.09
655	0.08
656	0.07
657	0.06
658	0.05
659	0.06
660	0.06
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.09
665	0.1
666	0.11
667	0.14
668	0.19
669	0.19
670	0.21
671	0.22
672	0.25
673	0.24
674	0.23
675	0.19
676	0.14
677	0.14
678	0.13
679	0.11
680	0.06
681	0.06
682	0.06
683	0.07
684	0.08
685	0.07
686	0.06
687	0.08
688	0.09
689	0.09
690	0.1
691	0.12
692	0.11
693	0.14
694	0.16
695	0.14
696	0.16
697	0.17
698	0.17
699	0.14
700	0.14
701	0.12
702	0.1
703	0.09
704	0.07
705	0.06
706	0.06
707	0.06
708	0.05
709	0.04
710	0.04
711	0.06
712	0.06
713	0.05
714	0.06
715	0.06
716	0.07
717	0.08
718	0.09
719	0.07
720	0.08
721	0.08
722	0.09
723	0.09
724	0.08
725	0.09
726	0.08
727	0.07
728	0.08
729	0.07
730	0.06
731	0.06
732	0.06
733	0.05
734	0.05
735	0.05
736	0.04
737	0.04
738	0.04
739	0.04
740	0.03
741	0.02
742	0.02
743	0.02
744	0.04
745	0.05
746	0.05
747	0.07
748	0.09
749	0.1
750	0.11
751	0.11
752	0.1
753	0.09
754	0.1
755	0.08
756	0.07
757	0.08
758	0.09
759	0.09
760	0.1
761	0.14
762	0.14
763	0.14
764	0.15
765	0.16
766	0.14
767	0.19
768	0.24
769	0.22
770	0.26
771	0.27
772	0.3
773	0.31
774	0.33
775	0.3
776	0.27
777	0.27
778	0.22
779	0.21
780	0.19
781	0.15
782	0.13
783	0.1
784	0.07
785	0.06
786	0.05
787	0.05
788	0.04
789	0.03
790	0.04
791	0.04
792	0.04
793	0.04
794	0.04
795	0.04
796	0.04
797	0.05
798	0.04
799	0.04
800	0.04
801	0.04
802	0.04
803	0.05
804	0.05
805	0.05
806	0.06
807	0.06
808	0.06
809	0.06
810	0.07
811	0.07
812	0.07
813	0.07
814	0.06
815	0.07
816	0.08
817	0.12
818	0.12
819	0.11
820	0.12
821	0.12
822	0.13
823	0.13
824	0.11
825	0.08
826	0.08
827	0.12
828	0.16
829	0.16
830	0.18
831	0.18
832	0.19
833	0.19
834	0.23
835	0.21
836	0.18
837	0.18
838	0.17
839	0.2
840	0.19
841	0.18
842	0.14
843	0.12
844	0.11
845	0.11
846	0.1
847	0.05
848	0.05
849	0.05
850	0.06
851	0.07
852	0.07
853	0.07
854	0.08
855	0.11
856	0.19
857	0.2
858	0.21
859	0.28
860	0.29
861	0.31
862	0.32
863	0.3
864	0.23
865	0.21
866	0.19
867	0.13
868	0.13
869	0.12
870	0.1
871	0.09
872	0.09
873	0.1
874	0.11
875	0.1
876	0.08
877	0.08
878	0.08
879	0.08
880	0.08
881	0.06
882	0.05
883	0.05
884	0.05
885	0.04
886	0.04
887	0.03
888	0.04
889	0.04
890	0.04
891	0.05
892	0.06
893	0.07
894	0.11
895	0.14
896	0.15
897	0.17
898	0.18
899	0.21
900	0.2
901	0.2
902	0.17
903	0.14
904	0.14
905	0.12
906	0.12
907	0.1
908	0.09
909	0.09
910	0.12
911	0.13
912	0.13
913	0.15
914	0.19
915	0.23
916	0.23
917	0.27
918	0.27
919	0.28
920	0.31
921	0.31
922	0.3
923	0.27
924	0.26
925	0.21
926	0.18
927	0.16
928	0.12
929	0.11
930	0.05
931	0.07
932	0.07
933	0.08
934	0.09
935	0.09
936	0.09
937	0.08
938	0.08
939	0.06
940	0.06
941	0.05
942	0.05
943	0.05
944	0.07
945	0.07
946	0.07
947	0.07
948	0.06
949	0.08
950	0.11
951	0.12
952	0.11
953	0.12
954	0.12
955	0.12
956	0.13
957	0.14
958	0.13
959	0.14
960	0.15
961	0.15
962	0.15
963	0.15
964	0.17
965	0.18
966	0.21
967	0.22
968	0.22
969	0.22
970	0.21
971	0.21
972	0.2
973	0.2
974	0.18
975	0.16
976	0.19
977	0.2
978	0.24
979	0.24
980	0.22
981	0.2
982	0.21
983	0.27
984	0.27
985	0.28
986	0.25
987	0.26
988	0.26
989	0.3
990	0.27
991	0.22
992	0.21
993	0.25
994	0.34
995	0.41
996	0.45
997	0.47
998	0.48
999	0.51
1000	0.56
1001	0.52
1002	0.53
1003	0.52
1004	0.52
1005	0.49
1006	0.47
1007	0.44
1008	0.37
1009	0.34
1010	0.25
1011	0.22
1012	0.21
1013	0.19
1014	0.19
1015	0.18
1016	0.17
1017	0.17
1018	0.17
1019	0.13
1020	0.12
1021	0.12
1022	0.12
1023	0.12
1024	0.12
1025	0.12
1026	0.18
1027	0.27
1028	0.31
1029	0.31
1030	0.34
1031	0.34
1032	0.39
1033	0.43
1034	0.4
1035	0.39
1036	0.4
1037	0.41
1038	0.4
1039	0.43
1040	0.38
1041	0.36
1042	0.34
1043	0.27
1044	0.2
1045	0.2
1046	0.2
1047	0.23
1048	0.28
1049	0.33
1050	0.34
1051	0.39
1052	0.43
1053	0.42
1054	0.4
1055	0.37
1056	0.39
1057	0.37
1058	0.35
1059	0.3
1060	0.27
1061	0.29
1062	0.27
1063	0.26
1064	0.23
1065	0.21
1066	0.21
1067	0.26
1068	0.34
1069	0.37
1070	0.39
1071	0.44
1072	0.49
1073	0.48
1074	0.47
1075	0.44
1076	0.39
1077	0.42
1078	0.41
1079	0.35
1080	0.26
1081	0.27
1082	0.27
1083	0.24
1084	0.22
1085	0.14
1086	0.15
1087	0.17
1088	0.18
1089	0.15
1090	0.18
1091	0.21
1092	0.21
1093	0.27
1094	0.26
1095	0.3
1096	0.3
1097	0.32
1098	0.32
1099	0.3
1100	0.27
1101	0.28
1102	0.27
1103	0.22
1104	0.22
1105	0.2
1106	0.17
1107	0.2
1108	0.23
1109	0.18
1110	0.19
1111	0.18
1112	0.18
1113	0.18
1114	0.19
1115	0.17
1116	0.14
1117	0.12
1118	0.11
1119	0.11
1120	0.1
1121	0.08
1122	0.08
1123	0.07
1124	0.08
1125	0.09
1126	0.09
1127	0.09
1128	0.15
1129	0.23
1130	0.3
1131	0.37
1132	0.42
1133	0.51
1134	0.61
1135	0.71
1136	0.77
1137	0.78
1138	0.81
1139	0.78
1140	0.79
1141	0.77
1142	0.69
1143	0.65
1144	0.59
1145	0.52
1146	0.48
1147	0.47
1148	0.46
1149	0.4
1150	0.39
1151	0.39
1152	0.43
1153	0.5
1154	0.48
1155	0.52
1156	0.52
1157	0.59
1158	0.64
1159	0.66
1160	0.63
1161	0.6
1162	0.58
1163	0.57
1164	0.53
1165	0.44
1166	0.37
1167	0.28
1168	0.24
1169	0.19
1170	0.16
1171	0.1
1172	0.09
1173	0.08
1174	0.08
1175	0.08
1176	0.06
1177	0.08
1178	0.08
1179	0.08
1180	0.08
1181	0.11
1182	0.12
1183	0.17
1184	0.23
1185	0.21
1186	0.21
1187	0.21
1188	0.24
1189	0.24
1190	0.26
1191	0.24
1192	0.23
1193	0.23
1194	0.25
1195	0.25
1196	0.21
1197	0.2
1198	0.17
1199	0.14
1200	0.1
1201	0.09
1202	0.07
1203	0.06
1204	0.06
1205	0.04
1206	0.04
1207	0.05
1208	0.04

A0A5C2SSR0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer